EMLSAT00000002668, EMLSAT00000002668-698515 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000002668
Unique NameEMLSAT00000002668-698515
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1540supercontigLSalAtl2s1540:59925..65765 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000002668 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000002668EMLSAG00000002668-685434Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000011818EMLSAE00000011818-720746Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000011819EMLSAE00000011819-720747Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000011820EMLSAE00000011820-720748Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto770970auto770970Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000002668EMLSAP00000002668Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000002668

>EMLSAP00000002668 ID=EMLSAP00000002668|Name=EMLSAP00000002668|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=155bp
CPNGIVDEESFRDIYEKIFPLGDAGQYAHLVFSAIDNERTGGITFGDFME
FLSVICKGTTHDKILWAFKFYDVDKNGFISKDEMVKVSDSIHELMGVNGT
TPKSGSKTVKHIEQVFDTMDLNSDGKITIEEFIIYCTSNQEVYESMTFLT
KQKLY
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1540:59925..65765-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000002668-698515 ID=EMLSAT00000002668-698515|Name=EMLSAT00000002668|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=5841bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1540:59925..65765- (Lepeophtheirus salmonis)
TGTCCAAATGGTATCGTTGACGAAGAATCCTTTCGGGATATATATGAAAA GATATTTCCACTGGGAGATGCAGGACAGTACGCTCATTTGGTTTTTTCTG CTATTGATAATGAGAGAACAGGTGGAATTACATTTGGAGACTTTATGGAG TTCCTATCCGTGATTTGTAAGGGCACAACCCATGATAAAATTCTATGGGC TTTTAAGTTTTATGATGTTGACAAAAATGGATTTATCTCAAAGGATGAAA TGGTCAAGGTTTGACTTCTACATTTAATAATACAAAATTCATATTCAAGT TGGGCCGTGGCTAGGATTTTTAACTTTTATCAAGCTAATATTTTTAATTT TCACGAAAAATTTGGAAATCTTTTTGGTTTACTTTTTTTTATTCCTCTTA TAATGCAATTTTTTTTTATTTGCATCTAAATATTAAAAACATAACTGCAT TTTTTAACAAATTTATTAAGATTTTTGACAACATAGCTTTCATTATGGAC AAATTTAATTGAACTTTGATAACTTAAATTCTATTTTTGACAAGTGTATT GATCAATTTTAAGTATATCCTCCAATTTTTGAGGGAAAAAAAGCTTAAAA TGAATTAACATTTTTACAAGATGACTGTCCTTTACATGAAATCTTTCAAA ATTGGCAAACATCATTTTTGTCAAGGGGACAAAACTCTCCTCCTACAAAC AAACAATACTAATACTTAGGATTGTGGATACTAAGCATTTTTTTTGCTTC ATAATATTTTTACATTGTTTTTATTTTCTAAAGTGTAACCACGAGTGTGT GTGATCATGAATGACAGAAAGTAACACTGAGGGTTTAATATGTAAGAGTA AGTCCTTCTTGTAGTTAAGAGTAGTCGATTTGAAGATCGAAAAGATGCCT CTACCCTAATTCGAAAAGGAGTGACAGGGGTGTCCACCGGGGGTAGGGTA GAGGCCCCCCAAATATGCAAATTTCCAAAAAAAAAAAATATTTTCTCGGA AAAACTATGTAATTTTGTAATATTTTTCCATTAAACAAATTTTTAGTGGT TTTTATTAAAAATATTTAATATTTGAAATAATTAAAAAATATATATATAC ATTCAGCTGCAGATATTTGAAATGTTTTCCAAAAAATAATCCTTTAATGG ATTTTGGAGGTTTATCACCAAAAACTTTAATATTTGAAATATAATTTTTG TTTTGTTTTTCTAAAACATTTAATTGTTGAGTTTTTTTGTGAATAGCTAT GGATTTAATTTCTATGAAAAACTATGGACTTTTGAATATTTTTCAGTAAA AAAAATTTTTACTAGTTTTTATTGGAAAAATTTAAAATTAAAAAAAAAAA TTAATTAAGAAAATTATTTTCAGCTACAGATTTTTGAAATACTCTCCCAA CAAATCCTTTTTTGTGAACAGCTATAGATTTTGGAGGTTTTTTACCAAAA ACTTTAATATTTGAAATATAAAAATTTAACTGTTGTTATTTTTTGTGAAT AGCTATGTATTTTCAAAAAAATCCAAATCCCCCCCCTCACCAAAAAAAAT CCTTCTGTGTTGGATTTTTTTTTTTTCATCTCAAAACCTTCATTAAATCT ATACTGTTTTTCTCTCTAACATTCTTCAAATTGTCAAGGTTACCATTTTA TTTTTTGGTTTCCATTTTTAAATATAAAAATGCTTACGATTTACAACCCT ACCTATAGTCACGGTCCTGTATGCAGTGTTGACATAGAACCAAATTAATA TCCTTAATTTTTCATTACAATATAGGTATCAGACTCGATCCATGAGCTAA TGGGTGTTAATGGAACAACGCCTAAAAGTGGGTCCAAGACTGTTAAACAC ATAGAGCAAGTTTTTGACACAATGGACCTAAATAGTGATGGAAAAATTAC AATAGAGGAATTTATTATTTACTGTACCAGCAATCAAGAAGTCTACGAGT CTATGACATTTCTTACTAAACAAAAAGTTGTTTAAATCAGCTATTAAGAA TTTGAATTTAAATATATATATTTTTTATTGAAAAACAGTATTTTTAAAAA ATGACGAGATATTAGAAATAGGTAAGAAATAATCTAATACTTTATATTGT TTTGCATACTTCTTTATTGAATAGTCTTTCTTCTTACCTAATTACTTGCT CTCAAAGTTGTCTAGATTTACTCATAGGGGTCCATATAGAGCTGTCAGGG TTAAATTTTAACTGTATTTTTTTTTTTTTTCAAAAAAGTAACTGATTTGA AATTGCAAAACATCCAGGATGATGACCTTGAGGTTATGATCAACATATAA ACGCCTATTTGTAGATATTAAAGGCATGTTTGCTGATGTTCTGACTAAGG AAGATCAACTCATACTATAAAATTTAAGAAATAGATGTGATGTCACAAGA ATAACTATTTCATCAAATCAATTTTACCAAATCACATATAAAATAGACAT TTAATTAATTTTATTCAAAGTAATTAATATTTATGTAAAATAAAATTTGC GTTTGCTAAAATATATGGATCCCAAATTTTTATTTTGTTAACGTAGACCT CTAACAGCTCTTTATGGCCCTAGGGATCAATAAATACCACTTTGAAAAAC AGTGCTCTAGAATAATAAAAATGAACTTTCTGAAACTGTTTAAATTTGAC TGTAATTTTACAAATAATTCCTCATATTTTATTTATTAACGAATTCTAAT ACTATTTTCTCTTATTCCATTAATTTACTTTCAGTTACAAGGATATTTGT TTCACCGATATTTCAAAATTGTTATGTAATTTACAGATAATTAATGACAT TATTAATGAAGAAAAATATTAAGAAAACCTAGACATCTGAGTTTTACTCA CTCCTTTATAACAAATTCAGCAACAAATGAACGAAAAAAGAAATTTTAGA AGATTTATTCGTATAAAGGATTGATTTTAATTTAATATAATTACTCTTAA AAACTGTTTAAATTTTGCTTCCAATTAAATGCATAAAAAAAAATACTTTA GTGATGATTGAATGAGAAATTTTTGGAAAAATGTTTTTATCCAGTATGTA TGTATATGAGGTTCGTCAACACAAAAGCAAGCTAGAATGATTTTAGTCAA AATTGAGCATGGATTACATTTGTATTCTTTTACGAATTATCGTCAATTCC TAATTAAAAATTATTCTCATTAACCGTAGCCAAAATAAAGTCCTGAACTA TATCTAAAACTCTTGACTATCTTAATTCATCCCACAAATTTTAAGAGAAA GCACATAATTGACTAAAATATGTTTATTAAATATTGGGCTATATATACAT GAAGTGAAAAAAATGAATTGGGATTATATCCTCCGTTTTTTTGTTCAGGA TTGTTTTTATGTTGATACACCCCATGTTTAACATTTTCTCGTAGTATCTT ACATAAATTAATTTATACCAGATATTTCCAGCATATTTTTTGCTATAATA ATATGTAATATTTGTTTGTTTTTTAAACAAAGATTTTATGTCATCATATT ATATAAAAAACGACGGAAATAAATTCTTATTAAAGTCACTTAACCTTTCT TTCTTATTATTAAACTAATAAAAACACTATATACAGAGGGGGCTTAAAAC TTCTTTTTGATTTACAAAACCTATGGACCCTAGTAGTTTAACATTGGATT CCATTACTCAGTAGTCAGCAGAAGGAGGGAGGTGAGAAAAGTGAGTTGTT GGAACTGCGTGGAAAAACATTTCACTCAGTCTTTTGGATGGATCTCTCCG AAGAAGCAATAAGATATATGGATCTGCATCCATCTATCCATCCTTCCTGT AGTTATGAATATCCAATTCATACCCATTCTGATACTCTCTTCAATGTCAT GGGTCTGTTCAAGGGTTCTCTACTTTCAAAGCAAGATTAATTTAAATTCA ACCGCCGCTACTACTTCTCTCAGCATCAAGGACCCCATCTAATGCCCTAT CATACCCCCTGGTCCACGGGTTGTGCAGGTGAACTGCTGGGATTCTAATT TCCTGAGTTCGAGAATCTCATCTAATGCGCCATAATACACCCTTCCCTTG GTGAAGAGTTAATCGCTTAATAAGTTTTATTCACAGCTTCYCCCCCCCCC CCCCTCGAAAGGAAATAAATTATGCCAAAGGCTAACAAAGCTTTTGTCTA CCACTATTGGTAATTATGACCTTGCAAATGAGATCCTTTACGGATTCTGG AGCAACGACTCGACACTGAGGATAGCTTGCAAAGTTAGAAACACCTAGTT TAGACTCTCCTTGAGATTATGAAAAAAAATTTTATTAACTCTTGATTTTT GGGTTGATTCGAATTATGACTTATTTCACTAAGTTTTATGCACGGGTAGT TAATTTGAGTTAGTCATAAGACTGTATTCATAGTGCCTTTAGAGTATGTG CGATATAAAAAAAATGAAATAGTGGGCCAAGGACCTGAATATTTCATGAG AGAACAGTTGGGAACTAGAGTTTTTTGAAAATGTGATCTTACGCTTTAAA AAAAATCCCGAGGCAGACTACAAATAATGGACAACACCGTTATTAAAAAA ATTAGGGAGCTCAATCATGCCGGTGATGTAGCTCGGATAATCGTCAATGC AATTGTTAATTTGGCAAAAGATAGGGCTACAAATTCACAAGTATCTACCC ACTCTATAGCCCCAATTTATTTTAAGGAGTACCTGCAGCCTTTGCTGGAC AGCTCCTCAAATTCCAAAGTCTTGAAAGAAGCATTCTTAATGGCCCGGGA ATCGAAAATCAAGCCCCTCAAAGTCCATCATCTCTCCTGGACCTAGAAAT TTCAGAACAAAATACTTTAATGCATTCAGGTGCACAATTTTTTTTATCCA CGACGATAAAGATGGTTCTGCAAGACTCATTATTTTAACCGCTTAAGAAT ATCCCACTTTTGGCTCAGTCTTCAACTTGTTACGCAGATAAAACCTTTAA AGTTGTGTCCCAGTTATTTCACCAACTTAATACTATCAATGGTTTGGTGA ATGGGAACGTGAAATCATTTGTGTATACTTTAATGACCACAAAATCCGAA AATAAGTTACACAACACTTCTCGACAAATTGAAGGAGTGTGAGCCGAGTC TAGATCCTCTTTAAATAATGACAGATTCTGAAAGTSCAGCCATTAATTCC TTCGCCAACATTTTTCCCTATTCTTCCCCAATGGAATACGGTGTCTTTAC TTCATTTCTATCAATGTCTTTTCAAATCGATTAAGTCTAATGGTCTTCAA TCCATCTACAAAAATGATCCTAAATTTGTTTTGAAAATGCAAATGCTCGC ATCTCTAGTTTTTGTTCCCCAATGTTTGTGGAACAATACTTTGAACATCT CATCTCTTACAATAATTATCCAGAAAAATTGTTGCAAGTACTAGACTATT TTCAAGATATCTGGATTGGAAGGCAGATAGGTAACATTAGAAGACAGACC TGCGCTTCAGGCATGTCCTTTCTTATTTTCTTTCATGCAACCAGGGAGGA TAGTTCAGAAAAGAACTACTCGTTCGAAGGATGGATGGTATTGTRGGAGC CTCTCCCCACTACTTGAAGGATTTAGACATCCTCAAAAAGAACAAGGAAA GAATGAATCACTGATTGAGCAGCATGTTGTGGGAGGAGAAATTCCTATAA GAAAGAAAAATATAAAGATACCTCTCTCAGGATCCAAAGAATTGTTAGTG 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