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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s154 | supercontig | LSalAtl2s154:655936..690101 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000002683 >EMLSAP00000002683 ID=EMLSAP00000002683|Name=EMLSAP00000002683|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=682bp
MVKIEGKPRLCKIVIWPDFDGYGFNLHAEKSRPGQYVGKVDEGSPAEAAG LREGDRIIEVNGYNISTENHKQVVSRIKSILNETSLLVVDSETERIYKES GLVISNEDAIEISAQRDEIEIEDEDRKSLESNTSSLDKIKRLRFPMCSTG HPGFDISYYRHNDLFAVSKIYSSAAKSAGLKLGDRIHSINNVDVSTQALL RKDLLCLIASIPNEVILKISHAPKYQNIENFRLPSVSSSSESLTDFLSTE RVKKHTLFELKPRLCRVIRSSKEEKFGFSLLTDKSTDTQHIGNVYPGXPA YRAGVKPHDRIIEVNGVNVENIEHKDIVAKVNKSKRKLELLLVDNRTHVH YKKEEIKVHGAMKELLICTEKTLEDDSALFYTHGGKIRSCHIIKNEPSES FGFSIQTVKKENTKFIKEITPDGPADRSGLLLDDVVLAVNGEDVVEETHK DVVDRIISRDLDTTLLVTDRDTFNHCMEQNIPLVPHPLRVNQSKGTSNMR DEEGRVSSVTSTTIEATIEPPKIIVCEPVDTLGDVSSEEVSVDANETTTI TPPPAYEEDLDYVQIVHVNPXASPSPVEEIVEGTKEMYLNEDIGEEKQET QRMGSTGNSPSPRSTPSPQLSNHSPEITQDISRENEDSEYDDLNLNMTAA EMREIISSKKKRDPRKDDRMDIRRKFEIVQTL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s154:655936..690101+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000002683-698530 ID=EMLSAT00000002683-698530|Name=EMLSAT00000002683|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=34166bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s154:655936..690101+ (Lepeophtheirus salmonis) CGCGTGTAAAGGCGCACATATGGTAAAGACTTGATTAAAGAAGGGAATTA
AACATCGAATGTGTATATGTTTGTACTACTTTATAGTACTCGTACTTATT
AGACATCAAGTCAGTTGAGTTTGTGTCTCTAGACCTTCCTGTCACTATTT
GTCTCAATCTCTCTCTCTGTCTTAAAACTTCTAGCTTTGTGTATATTTGG
TGTGTGCTTGTGTGTGATTGTTCCTTACTATTTGTTCATATCATCCACCC
ATTAAACCCATCATCTTCTCTCTCCGTACTTAAAAAAATCGACCACATCA
TGGTTAAAATTGAAGGGAAACCCCGTCTTTGCAAAATAGTCATATGGCCA
GATTTTGATGGCTATGGTTTTAACTTACATGCTGAGAAATCTCGTCCAGG
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TCCGTGAGGGAGATCGTATAATTGAAGTCAATGGATACAACATCAGCACA
GAGAATCACAAACAAGTTGTTTCTCGGATCAAATCCATTCTAAACGAAAC
CTCACTTCTTGTTGTAGACTCTGAAACAGAGCGTATTTATAAAGAAAGCG
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TTAATTGAGCTCTTTGTGGTGTTTCACATCTACATATTATGTGAAATCTA
CTCCGTCTTAATTTTTATTTATTCAAATGTTGATTAATTCAATATCGTCT
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AAAAAATATTTCACTTCTTTTAATGAAATGATGAGCAAATTTTATGCATA
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ATCTACTCTATGAAGCTAAAAATACTTATTTATATAGGCACATGCAACAA
GTAGGTACATAGCATCTTTTAAAAGAAGTATATTTAGACCATGTAATTAT
AATCTACATTGATTTTCAATTTAAGAGAATAATAATTGAATTTATGATAT
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CTTCATACAAAACTACTTCCAAAATTGCAGTAAATTTCACACTCGTAATT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNAAATGAATATATACTGTAGTTTTTTAATAGTA
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CTGCAGCCAACATGTCCTCCAGTCTGGGAATGAAGTCCTTGCAAACCTTG
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CAGGGAATCAATATTGCAGTTGGTAGTTAGTCAATTTTTCTCAACTATGT
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TGTTGACTTATAAACATTTTTTCTACACATATACATATGCTCAACATGAC
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ATTATTGTTGCAAAATGTACATCCTTCAAATGGGAGATAAATAAAACATA
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TATAATTAAGGATATAGTTTAACAACGATTTAACTGTACAAAAACAATAT
TTTATATTTATAGCACGATAACTGTGTTGGCGTGCCTAATTTACAACAAC
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GTCCGCAGGTTGAAAAAAATAAAATGAAAAAAATAAAATATTTGAAATTT
TTTTGGAAAAAAATTTCAAATATTTTATTTTGTAGAAATTAATTTTGAAA
AATCTATGACTATTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTG
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ATCAGTGGTTATTAACCTGAGTTCGATGGAACCCTAGGGGTTCTGTGAGT
CAGTCTGAGGGGTTCGCCGGAGGTCAAAACACATGATTTGTGATGACACG
CTCCACTTGACTAATTAAAAAGGGTTCGGTGAATAGTCCTATGACAATGT
TTCGGGTTCAGTACCTCTAACAAGATTAAACACCAGTGTTCTAAACTATT
ATTATAGATTATTAGGTATCTCAACTCATACCAGAAAATTTGAATAGTTA
GTCTAAAATTGGCCGAAATAACCCTATAAAATATAAACTATATCAATATT
ATATATAGTGTAAAAAAAGTTGGAGATTTTTCTGTTTATCGATTTTTCTT
CAAGATTGTTTTTCTGTTTACTTACAACTTATGTTGTGTATTTTATTAGA
CTTTTGAACGGTTCCTTCAGGATAATAAACATATTTTTCTATTTCTGTAT
ATATAAATAACTCTACTGAGTCACTCCGAATGTAATGCCTACCTTTATTT
ATAGATATAATTAAATTTCTGTTTTCCAATTGGCTTAAAAATTAATCGAA
TATAACGTGTTTTCTTGTTTTTTCAAGTCATTAATACAATTTTAATTAAT
GTACAAACATATTTTAATTTTTTAACTCMAAGCCATGATTACTATTCCCA
TCAAATAAACTTATTATTTAATAGTTTTGTAATTTTAGTATTTTTTTATT
TATTCATTAAACTTTGTTTTCAGTACAATTTTATCTGCAAAACACTTTAA
CATACTTATTATTTAACCTTGTAACGCCCTCTAGGTCACAATTTTCTTAT
TTTTCTTCAAATTAGAACATTTGTTCACAATTAAGAAATAAGTGGTTTCT
ATAGATTTGTAAGTTTTTGGTTAGAAATTGATAAATTTTAGGAATTCAAA
GTAACTGACTGACAGTTGTTGCTGATGTTTATATAGAGAAATCAATGATT
CTCTCTACATAACACCATTAAAATATGATTTGTCATTGTTTGAAAAACAC
GTGGTTTTGTAATTTTTACTGAGGCAATACGTTTTCAATATTGGAAGGTC
ATGCGTAAGAAATTTTAAATGATCAATTGATTTTATATTTATAATTGCAT
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TTCAAAAACTGATGTACTATATACAAATACTATAGGTATCACATTATGGA
GTTAAGAAGATGTATAAAAAAACAGAGATGATTTTTATTACCACAAAGTA
GTATTTAAAGAAACAAAAACAAATCAAAATATCAAATTTTTGAATGGGAT
TCCAAAGCAGGTAGAATAGATTATTATTATTCATGCAAATTCTTGGAACA
GTTTATCTGCGGGGTTTGTGCGTTTTTTTAAAATTTTATATATAAATATG
TGTATTTGTGAGTAATATCTTTTGTTCAACAGTGGGGGTCTGTATTTTGT
ATTTAGATAACGTACATAATATTTGTTTTCCTCTAAGACATTTGTTGTTG
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GCATTTAGGATGCCCATGCGTATTATTTAAAGTAGGCAATACCTTTTAAT
CCATGCGGTAATAATGTGTCTAAAAATTAAATTACCTAGTTTGATATTCT
TGTGGGATTTCGAAATGTTAATTTTAAAGAGTATTTTAAGAATTTAACGG
TTCTTAGTACGGGACTTAAATTTGTACCATCCCTCGCTAACATGAAAATA
TACATTGCATTTTATTTTCAGCTGTCGATGTTTCTCCTTTCCCCCCTCCT
AATCAGTGTTCTGAACGTTGATAGGTTGAGTTAGAATTAGCTTATTTGAA
GTTGCTAACAGTTCTCAGCTAATATTGCATAATAATTCCAAAGTTGGGAA
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GGTGGAAAAGTTTCATTATATAATAAAGGTAAAGACTTTATAAGTTCTTA
AAAAAAGTCCATAACTTTCAAGTGCTCTCACAAAATCCATTATTTTCCCA
AATATTTGGTTAGGAAAAGGTAATTTAATATTCCCCTCCCCCTTTTTTTA
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GCTGTAAAGGTGTAACCATTTACTACAAATTCTTTTGGACAGTATTGCGC
TGGACCGGTTCAGTCGACAATTATCGTACGTCGAGTATTGATGTATCAAA
GGAAGAAATTTCGCAATTTTTACACTACCCAAAAGGGAAAAACGCGTCAA
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TGTGTTGTTTAACAATGGTTACACCACTTTTCTCTCTCAATTCAGCTCTA
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TATTGCCGAATAGGAGACAACAAGCCCTCATCAGGACAACACCAGGCCGT
ACACATCTTTGATGACTCGTCAGAAGCTCCGGGAGCTCGGATAGGAAGTT
CTTATACATTCATCCTACTATTAGTCTGTACCGGGCATCAATTGACTACT
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AATAGATTGTCCAGTAGGGTTAAGGGCTTCGTCTCGTTGGCATAAAGTTA
TTGAAAAGAACGGGGTATAATTGTCTTTAATCGGAGAATGGCAACACTTC
TTATAAATCATTGAAATAAAACGAAAAATACGAAATTACTTCTTCTCCAG
CCTATTATTGTCATAAAATCTACGTCAGTTTACCAATTGAATTAGTTGAG
TATCTTTCATCCAGGAAAATAGTTTAACATTACCCTTGGTTTAGGACAAA
TGAAAGTATATACATATATTATTAATTTACAAGTTAGTAATATTAATTGA
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CGTCCGATTTGGGAATTTTGGACCAGTACATCACAAAGTATTTTACTTCT
ATTGAATGTGCTACATACCAAAAAAAAACATATGTAAATATATGTATGTG
CTATAGATAATGACTTTTTCAAAATGGAAGAGTGTTGTTGTCATCAAATG
AGAAGTGACTCGCTTCCTCTCTCATTAATACAATGAAGATGACATATCAA
TTCTATTGTTGCTCTACCGTTTAGATGAGGGACATGCTCTAAATATGTAT
CTTTATACACCTGTTGTATTAATACAACTGTTGTGTTACACACATCGTTC
CTTACAGTTCGGTTTTTTCTCTTTCTTTTTTTCAAAGATAATTATTAATG
ATATACTTTTTATTAACCCAAATAAACTTATCACTTGTGGCTTTTAAAGG
TTTTTTTAAGTCTCATAAGTATTAGCAGGGAAGCAAGCACATATAGATTT
TTTATCCACTTACAACCTCGACTGTCAAAATTATTATTCACAATGAATGG
AAAATTTTATTAGTATACACATCAATGATTGAGTATAAAATGACATCTTT
TTGAGTGCATAATAGTTCAGAGCAGTCACTTGCTTTAAACCATACAAAAG
TCAACTCATATAAACAGATAGGATCTTTGTTTATTTCAAAAAGCTGGCCG
TAAAATGGCCATGAACTTCAAGTGAGCTTTTATGTACAAAAATAGGACTT
GTACAGTGTACACAACGCGGATTGTTTGAGATTGGACAATTTATTCCAAA
GTACTTTAAATATTATAATCTTCAAACTTCAACAATTATCCTTATCTGAA
TGCAGAGGTTCTGTGATTTGAAACTTTTTGTATGTATGAGACAAAAGCCA
CGAAAAATTAAATTTATTGTGGTATTTTCACTCCTACAAGCAAGACACGT
TTTAAGTCACATAACCTCATCATTCTTCCATAGAATTAAATAGATTGCAC
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TTGTAATGATTTTCTTCTGTTGAAAGTGTTATAAGCGCAGTATAGAACTC
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TTCGTAAAATCTTCACTAAGAGGGGAATATTATATCCTAAAAAGGGCTAT
AATTTAGTTGGAGCCTAATCTTAACATTTACATACTCCTTTTTATAAATA
GCAATCCTCTTTTCGTTTAGTAATAGGATAAAAATTATTCTTTATCGCTT
ATTATCATTTCAGTAAATGTTATTGGCATGTTAGCACTTATACAAAACAT
AACCCTCATTCTTTGTGAGGTCATACACGACTTTGAAAAACATCTTGCAA
TTAAAGACATGAAATGTTTCTTCTCACAACCTTGCACCATTCTCTCGTAG
AATTCACAAAAAGTGGATCAATGAATCTCTTTATAATTGTCTGCATATTG
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TTCAATTGACTAAAATATTTTTTTGACACATTTTAAAATTCAATTTATAT
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TGATTCATTGTTTTTCAGGATTAATCGAAGTAGAAAAAAATTATAATTTT
ATTGAATCTTTCTAATTTTATCATGAGGATCACGATTTATTATTAACCAA
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AATAAAATCATGAATATTTTTTAGATTGTTCAATATAACCTTGGAACATA
TGATTATTAATGTATATATATCATTGGGATCATTATCATTAATCAATTCA
ATTTACTCCATAGTTCCATTAAATAGTGTATCAATTAAATTATGTATGAT
ATTGAGTTTTTCAAATCCTATTTTGTCCGGAAACTTTTCAAGGTCAAGTA
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GTTACGAAAATTTTACTACGAGCCTTGTTCAATTCGAACTTGGACTGAAT
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CCAATTAACGATTAATTGTTAAACGGTAAATTATTTATTAATTTTCTAGT
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TACTTTCTAGCCGTCGGAAGAAGACAATACATGTCACTGCATCTCAATTA
AAGGAAATGAATCATAATGTGTGTATTATCTTAGCTCTTTGTTAGGGAAC
TGGGATTCATGAGTACATTTTTAGTACCAAAAGTTCGTTAAAATGAACAA
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TCCAAGTATAATGTTGTTATGATTAATAGGCATAATTTTGAGTCTATGTC
TACTATGTATGAGGAAGTAAGATTTACTTAATATTTGGGTTGACGCCAAA
AAATGTATGTTCATTAACAGAGGATTAATAAGCAATGTTGACAGATTCTT
CTAAACGCAAAGATTCTAAGCCACTAGGAGCTAAATAAAAGACACAACTT
AATTAGAAGTACTTGCGGAATAATTGGGCAAGTGGGAGATTACTGATTAG
TGGCCAATTAATCAAATGTGTCTATACATATTGCACATATATAAAAATGT
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AAGATTTGTTTCCCACTTTTCCCTTAATTTATGACTCATATGGAATTTAC
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AGGTATTATCTTATGAGCTCACCTCCAAAGATTTATGATTAGCTATTTGT
GTAGATGCAACAGCTTTTTATGAGAGGGATTTGATGATCAAGTCTCTATA
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CCTTCAGTGATAATTCATTTTTGTTTACTTTTTTAAACTGGAGTTGGGTA
TTTTTTTTTTTTGTATATTTCTGGTTTTTTTTGTGTACCATGGGAGGATT
TTGTTCTAGAGGGGTTTAGGCTTCGTGTTTTTTTCAGTGGCAGSTCATGG
TTACAATTTCTGGAAGGGGGATCTTAATATTGTAAAATAACATTAATATA
AAGGGTGTTGAGTGACTTCTTMCCTATCGTCCTAATTTATCCAGACATAT
CCTCATTTTGAATTCTGTCGATGTCGTCCAGAGAGTTTTTATTGATTTAT
GATATGAGAAAAATCGAAAATCGACTTATAATAGAGTTATGTACTCATAT
AATCAAAAATAAAGAAAGCACGAAAACTACTGGATCCCCCCAAAAAAACT
TCTTTTAAATATTTATTTTTATTGGATCCTTAAATTAGTTAATGAAGAAT
ATTATCMCCCTCTCTAAAACCGATTTTGATCAAGCCACGTGTCCTCTTTT
TGAAAATATAAATATGATCACCGTAATATTTTTACATTTTTAAAATGATC
TTATACTTATTCATCTTTTTTTTGTAGTCTTATTTCACATGAATTCTAAA
CAAATAGTTCGTTTAATTTATTTATGTATATTCAAAGACGCATTAAAGAT
TATGAAAAGCTGCTGTTAACAAAGCTTATGCATAGTATACATNNNNNNNN
NNNNCATAGTATACATTATATAATTATTTGTAATTGGATTTAATATTTAG
AAACATATTTAAATGAATTAGAATGAATATATTACTTTTTAAGCTTAATT
TCTTTTAAGAGTGAATTATAGCCATTGCCGGATTTTTTTTGCGGGAGTGG
TGGKGGRGGSYAGACCYACTTGTCTCTGAAGATCTATTATAATACATAAA
TATAAAATGMTTCTATACYTCGTATGTAAATAAATACAAATTGCCCCCAT
GAACAAATTTCAAACTCCACCTATGATGATAGACCCGGTCAATCTTGTGA
ATTGACTAGAATCATAGAGAACTGTAAGTGTGCTTAAGTTATGTGAACGG
AGGTGTAATAATTGTCCTCTTGTGCAGCTGTTGCTGGTAGTATTACATAT
CACACAGGAAATCATTATACTACCAGAAAATAACCAATTGAATAGTAAAT
ACAAATTTAATTAAATATTACTTCTCAAATCAGAAGAAACTTCTTACTTT
TTCAGTTAAATATTACTCAAACCTTCTCTTTTCATACACTAATCAGCTGT
TTTTCATTTATTTAATATGAGAAATACATGTAACAACTGTGCCCTCAATT
AGTATAACAATATAATCTATTAATAATGAATTAGGATAATTATATGTTTA
ACTTTATGAAGAAGATTGGTTGTACGATGAACTAATCTTATAAATACTTT
TTTATTATTTAACACCAGTATTATACGGCAGCTCTATTGTGATTTAAAAA
CTAAATATAATATTATTTTGGATTAAATTTATCCTCATGCGTATAGGTAA
CTGCAGATTGACTTTATATCAAAATGATATCTTTAAGATAAAATTAACTA
CAGCCACATATCTCTATGCTTCACAAAACAAAATTAAATCTTTATTTTAT
ATAAATATGAATTTATTCAAATAATAATAAACTTAATAATGTTTATTTGA
CTGTGATCATTTAACATGTTTTGAAATAAACAGCCATAATAAAAAAATAT
GAAACGTCTATAAGATGCAAACTTTTGAGATGCCATAAAATAACACTATG
AATTTAATTATTGCTGCTTGAACTAACATCCTTTTCTAATTTATGTGACA
TTAGATCAAACGGCTTCGATTTCCAATGTGCTCCACGGGCCATCCAGGTT
TTGATATTAGTTATTATCGACATAATGATCTCTTCGCCGTGAGCAAAATA
TATTCCTCTGCTGCTAAATCAGCCGGACTCAAACTAGGAGATCGAATCCA
TTCAATCAATAATGTTGACGTGTCTACTCAAGCTCTTCTCAGAAAGGATC
TCCTTTGTCTCATTGCCTCAATTCCCAATGAGGTCATTCTCAAAATTTCA
CATGCTCCTAAATACCAAAATATTGAGAACTTTAGGCTTCCAAGTGTATC
TTCATCCTCGGAGAGTTTAACAGACTTCCTATCGACAGAACGGGTACAAC
ATGTGTGATCAAATCCTGTCATAAATAGTACATACTAATTTGTCCCAATG
ATTATTATCTCATTAATTACTATACTGTGTCTGTCTTTATTTGTTTGTAT
TATAGAAACAAAACAAATGGAATCATTATATTCTTTTTTGACTCCCAGGT
GAAAAAACACACGTTGTTTGAGTTGAAACCTCGACTCTGTAGAGTTATTC
GGTCATCAAAAGAAGAAAAATTTGGTTTTAGTCTTTTGACGGATAAGAGT
ACTGACACACAACACATTGGTAATGTCTAYCCTGGAMCYCCTGCCTATCG
TGCAGGAGTRAAGCCTCACGATCGAATTATTGAGGTGAATGGTGTTAATG
TAGAAAATATTGAGCATAAAGACATAGTTGCAAAGGTTAACAAGTCCAAA
AGGAAATTGGAACTCCTATTAGTTGATAATCGAACCCATGTTCATTATAA
AAAGGAAGAGATTAAAGTGCATGGTGCCATGAAGGAACTCCTCATTTGTA
CAGAGGTACCTCTTATCCCCGTGGTCCTTGTGTTTGTCCATCAATTGTTC
AAGTTAACCTATTTTTTTATCTTTGTTCAGAAGCTACATAGTTGCAGCAC
GTATCTCATATTCCGTATGTGTTCTTCATTGTTTCGTTTAGTTGAAAGTA
TGTAGACATTCACCTTCGTGTGAGTGATTCAAAGTCCTTTGCATGTGTTT
CATACAATCCCTTTTTCATGACAAACATGTGCCTATTTTAATGCCTACTA
ATAGTAGTAGAATTCTAATAGTAAATGTTTTGATATTAAATACATTCATA
CAGTAACAATGAAAAAAAAAATGTGTAAAAATCAACTTTTTATATTATAC
TTACATAGAAAACACTTGAGGATGACTCCGCCCTCTTCTATACACATGGT
GGCAAAATACGAAGTTGTCATATCATTAAAAATGAGCCTTCGGAATCCTT
TGGCTTCTCCATTCAAACAGTAAAAAAAGAAAACACTAAATTTATCAAAG
AAATAACACCAGACGGTCCAGCGGATAGATCAGGACTCCTTCTGGATGAT
GTTGTTCTGGCAGTGAATGGAGAAGACGTCGTTGAAGAGACCCATAAGGA
TGTTGTGGATCGCATTATTTCAAGGGATCTGGACACAACACTTCTTGTCA
CGGATAGAGATACTTTTAATCATTGCATGGAACAGAATATCCCATTGGTT
CCACATCCATTACGTGTTAATCAGAGCAAAGTAAGAACATCATATTCTAT
AACCTTGTTTTGCACTTAAGTATATCTCAAAGTAACAGTATTAGTATTAC
CCATCTTTTGCCCAAAATACAACATACGTGTGTGTTTGTTTAGTAATGAA
CACCCTTAAAATATTAATACAATGTACTAGATAGGTTGCGTGCCGTTAAA
GTAAGGTAAGTCATGTGTGTTCTGTTTGTGAGTGTTTATATAAAACATAT
TAATGATATTTATGCACACAAAAGTACTTTTTTATGTATGTTAATACATA
TTATATGATAGAAAAATGATTTCAAAAAGTTCAATGCCAATGTTTTANCC
TACCTAAAACGATTGTTATTATGATAAAGACATTTAGCGGTCTTTTATTT
TGTATCAATGATGAAGATCAAGGTTATATGAATATAAAATAATTAAAAGA
AAATTCGTGAGTTAAAGTATTGAAATTATATATATCTTATTTTATAAGAA
AGAAAAACAAAATAACTTTTATTTTTATTCTGTACTGAACGTCTTTTTCC
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