EMLSAT00000002683, EMLSAT00000002683-698530 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000002683
Unique NameEMLSAT00000002683-698530
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s154supercontigLSalAtl2s154:655936..690101 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000002683 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000002683EMLSAG00000002683-685449Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000011879EMLSAE00000011879-720807Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000011880EMLSAE00000011880-720808Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000011881EMLSAE00000011881-720809Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000011882EMLSAE00000011882-720810Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000011883EMLSAE00000011883-720811Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000011884EMLSAE00000011884-720812Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779155auto779155Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000002683EMLSAP00000002683Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000002683

>EMLSAP00000002683 ID=EMLSAP00000002683|Name=EMLSAP00000002683|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=682bp
MVKIEGKPRLCKIVIWPDFDGYGFNLHAEKSRPGQYVGKVDEGSPAEAAG
LREGDRIIEVNGYNISTENHKQVVSRIKSILNETSLLVVDSETERIYKES
GLVISNEDAIEISAQRDEIEIEDEDRKSLESNTSSLDKIKRLRFPMCSTG
HPGFDISYYRHNDLFAVSKIYSSAAKSAGLKLGDRIHSINNVDVSTQALL
RKDLLCLIASIPNEVILKISHAPKYQNIENFRLPSVSSSSESLTDFLSTE
RVKKHTLFELKPRLCRVIRSSKEEKFGFSLLTDKSTDTQHIGNVYPGXPA
YRAGVKPHDRIIEVNGVNVENIEHKDIVAKVNKSKRKLELLLVDNRTHVH
YKKEEIKVHGAMKELLICTEKTLEDDSALFYTHGGKIRSCHIIKNEPSES
FGFSIQTVKKENTKFIKEITPDGPADRSGLLLDDVVLAVNGEDVVEETHK
DVVDRIISRDLDTTLLVTDRDTFNHCMEQNIPLVPHPLRVNQSKGTSNMR
DEEGRVSSVTSTTIEATIEPPKIIVCEPVDTLGDVSSEEVSVDANETTTI
TPPPAYEEDLDYVQIVHVNPXASPSPVEEIVEGTKEMYLNEDIGEEKQET
QRMGSTGNSPSPRSTPSPQLSNHSPEITQDISRENEDSEYDDLNLNMTAA
EMREIISSKKKRDPRKDDRMDIRRKFEIVQTL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s154:655936..690101+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000002683-698530 ID=EMLSAT00000002683-698530|Name=EMLSAT00000002683|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=34166bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s154:655936..690101+ (Lepeophtheirus salmonis)
CGCGTGTAAAGGCGCACATATGGTAAAGACTTGATTAAAGAAGGGAATTA AACATCGAATGTGTATATGTTTGTACTACTTTATAGTACTCGTACTTATT AGACATCAAGTCAGTTGAGTTTGTGTCTCTAGACCTTCCTGTCACTATTT GTCTCAATCTCTCTCTCTGTCTTAAAACTTCTAGCTTTGTGTATATTTGG TGTGTGCTTGTGTGTGATTGTTCCTTACTATTTGTTCATATCATCCACCC ATTAAACCCATCATCTTCTCTCTCCGTACTTAAAAAAATCGACCACATCA TGGTTAAAATTGAAGGGAAACCCCGTCTTTGCAAAATAGTCATATGGCCA GATTTTGATGGCTATGGTTTTAACTTACATGCTGAGAAATCTCGTCCAGG TCAGTATGTAGGCAAAGTAGATGAGGGAAGTCCAGCAGAAGCTGCTGGTC TCCGTGAGGGAGATCGTATAATTGAAGTCAATGGATACAACATCAGCACA GAGAATCACAAACAAGTTGTTTCTCGGATCAAATCCATTCTAAACGAAAC CTCACTTCTTGTTGTAGACTCTGAAACAGAGCGTATTTATAAAGAAAGCG GATTGGTCATTTCCAATGAGGATGCCATTGAAATATCAGCACAACGGGAT GAAATAGAAATAGAGGATGAGGATCGCAAATCCTTAGAATCAAATACTTC CTCTTTAGATAAGGTATTTTTTACATCTTAATGAAAAGATCTATATATTT TTTTAAATTTTAATTTGGTAAAAAGAGGCTTTGGAGATGTCCTAAATTAT TTTAATTTGAGAGTAGGGTATCGTGAATAATGGATTTTTGGATGATGAAG AGAGCATCCCAGTCACACTCCTTCAGGTTGATTCTTTGTACAGTTGTTGA GCTTGAGCTTGGTGGAAAAACCACAGAATACCTAAAATTTACACAGTATA CGGAAATTCGTATTAGATATCTATAAATTATATGCATACACATTATAACC AGATATTATAAATGTGGTATTTGGACATCTCCAAGTCCAGGTATAGATAT ATATGTATACATGATAGTAATAAATGAATTTCCTACCAAATKCTCCTCTC TATATATTTCTACTCTCTACACACTTCTATTCGTAAATAACGAAAAGGTG TGTATCTATACAACAACTACATATTCAATGACTGTGTTGTATGTATGCAG TATACACGTATGAAAATAAAACATAAATATACATATGTTGACGAGTTGTG CTTTATAAATTTGTCGTAATGAAGCTTGAATCATACTACTTAATCATGTG AAAGCATTCGAAGAATCTCATTAAGAGAGACATCATCTCCCAAAGTAATT AACTCATGTCATGTTTCCGAAAATGAGGATTAACATTAACGTGTACATAT ATATACATATATATATATGTATTAACTCCTGCCTTATCTCCCACAAGTTT ATTTTGAACTATTTTCACACACGATGAAAGTACGTTGAAAAACTCCCACT TGTGTTTTGAAGGGTTGAGTCTTTTGATAAATGAGATATACTTTGTGGCC TTATAAATCCTATCTCTCTTGAAATTGTTCTGTCAATGTCGACAAATGGT TAGGAGAAGATCTATTGGACTTTCGTTCCTATTTCTTTGTTAAATCCAAT CAAAAGGAATAGATAATAATAATTCTAATCAAATTAGGAACTCAAAGAAA CACATTCTTTTAAATATTTTAATCCCCAATACCCATGCACAATTTCAATA ATTTATAAAGCTTAAAAGTATTTTATATTGGCTTATAATTTTGAGTTTAA AAATGGTTTACAACTGCTTTTGAAAAGTTGGTTTCCCTTTAAATTATAAT TTATTGAATGATTACATCTGGTTATCTTTTTTGTTTTTTAAACTACACAT GCTAGTAGATAAATTAAGATTTTTATACATATTATGATTTATGCAATGAA GAAATCCCGTAGAAATTGCTCAAAAATAAACCATCCTTATGATAGATACA GGGTTGACCTTAGACCACAGCATTTGAGGTCATTTGAAAGGTCTTCTCTA AGGAAATGCCACAATTATATTTCCTGAATAAATAATATTACTCGTTAAAT TCCTGGCCATTCCTATCCAGATGGGATTTCTGTCCGTTTTTAATAGGTTA TGTAATAGTTAAGGCGACCCTTGCATGGATAAACACATAACTTATATATC AATAATATGTAAGGGAATGATTGGTCAAATCAGTTAGTAAATAATAGTAG CTGTATTTCATATCATTTATTAAAAGGATCAGAGTTAGGAAGTTTGGTTC GGTATAAGTTATAATGGCAATGTATTAAATAAAGAAGGACTGGGCTCTTC TTAGTAGTATAACGATAATAAGATTTTTTTAAATATTTCAATTTGACATT TTGTTTCTACAAATAATTGCCCTCTGTATGGATCGGACTGAATTTTTGTA GAGAGTATATGACTACATAGTTTGTACTGATAGATGCCTTCTAATAGCAT TTAATTGAGCTCTTTGTGGTGTTTCACATCTACATATTATGTGAAATCTA CTCCGTCTTAATTTTTATTTATTCAAATGTTGATTAATTCAATATCGTCT CTCATTATATTAACGTACATTTACAAGTTTTTTCTTTGTATTTTTATGCT GATGTGTCGAATAATGCTTTAATCTTGTATATTAGCAAGTAATACACACA AAAAAATATTTCACTTCTTTTAATGAAATGATGAGCAAATTTTATGCATA TACCTCTTACAAATAAGAACAAATAATTCATTGATATAGGTGCCTTAAGC ATCTACTCTATGAAGCTAAAAATACTTATTTATATAGGCACATGCAACAA 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