EMLSAT00000002817, EMLSAT00000002817-698664 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000002817
Unique NameEMLSAT00000002817-698664
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1625supercontigLSalAtl2s1625:15599..35242 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000002817 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000002817EMLSAG00000002817-685583Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000012489EMLSAE00000012489-721417Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000012490EMLSAE00000012490-721418Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000012491EMLSAE00000012491-721419Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000012492EMLSAE00000012492-721420Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto769317auto769317Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000002817EMLSAP00000002817Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000002817

>EMLSAP00000002817 ID=EMLSAP00000002817|Name=EMLSAP00000002817|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=204bp
MSATTSGSTKSGSSSTTNGVSEETTSPSSTSSVGVISPTSGGAHSTAKDR
LRELEAIFLEGPSSQVTKCFSTETLLDILLILFHECGNSSLRKEKTFSDF
IELVKPVVNRVKSLSLSKEDFEILKVIGRGAFGEVCVVKLKNTGNVYALK
ILNKWEMLKRAETACFQEERDVLVYGDRRWITNLHYAFQDETNLVSITLC
YISL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1625:15599..35242+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000002817-698664 ID=EMLSAT00000002817-698664|Name=EMLSAT00000002817|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19644bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1625:15599..35242+ (Lepeophtheirus salmonis)
AATTTTCCTACGTCTGAAAGAGTTTGAATTTGCATGTATTTTAGCTATTT TAAGGGAACGCGTGTGTTGCGTCTTATGAGTAGAAAATATGGGTCAGAGA AACCTTTTAATCAATGAAGAAGGCAGGCTACCTTTGGTTGGTCCGTCATG TGGCCATGTGTGTATGTGAGAAGAGGGAAGGTAGGTCTTGGATCATAATA GTATTGAAAAGAAAATGAAATAGAATCAAGTATATATATAAATATATAGG GAAGAAGAAGTGTTGTAAAAAAACAGCTAAAAAAGAAGGAGGAGTAAAGA AAAGGAAGAAGCTGGATGGAATATTATATACTGACTATTGTATACAACTA CAGTATCAAAATGAGGAACTAAGGAGAATGCTGAGCAGCGTAGAAAGAGA AAAAGGCTGATAATATGAAATCATAAGAAAAGAAGGAGATGCATGATAAA GTTGAAGACGGAACGAAAAAAAAGAAAAGAGAGAGTAAAGTTCGAACCGT GATTGAGGCTCGTTAGCACCACTACATTATTTCATTCTATCAAAGGAGAG GGGGMAGACACCAAGAAAGAAGATTCTTCTTGATGGAAGCGCCAGGAGTG GAGAATCCAGGAAAGAAAGCGCAGCTACTCTCCTGATTCACTTGCCTCTT TCTTACGCACACAATTTGAGGAGTCCGTTTTTTCCTAGGGGTAAACATTA TAGACATTTCGTTCTTCTCATTTTAGTGGGAAATAATAGAATTGCCCAAT GACGAGTCAGAATCACTAAAGTTACTTCCCGTTGAATCTTCCAAGTTCCA TTCCTCTCTCTACTCACTCATTACGCATGGATCAACTCTATTAGAGTATT GAGGAACAACTACAAGAGCCAGATAATCATTGACTCCTCATCCAAACTGA AAACTCCACTCTGTAAAGCGAAGATCCATAAATCCAGTTCTCATTTCCCT GATCTGTGTGTTAGTGTACCTCTTCAGTCCAGGAAAGGATTTCTTTGCTC AACACTCAAGAAACTACATTTTTTTTTTTCCAAAAAAAGAATTATCTTTT GCTTAATACTTCATTTATATATATATACATATATTAATAAGTTCAAAAAC AGTTAAAATGATTCTTTCATAGTCAATTGAAAAAGTAATTAGTGATTACA TACTTGTAAGGAATCTTCCGTATACACGAGAGATGAAGAATAAACTCCAT TATTAAACATGTTTCAGAAGCATTCATTTTTATTATTATAATGTTTCCTA GATTGTTTTTTGATTCTTTCAATGCGTTATGCAGAGCTGATTGAAAAAAT AAAATATTTAATTGTTGCTCTTTTGTCAACTCTTGATTCCCCCCCCCCCC CTTAAGTAAATTACAAAATAGACAGTTGTAAATTTGTTAGTGTTACGCAT TTATTTCTAGWAAAGAATGTGGAGCCGTATCTGACTGAACTTGAGCTTTA CATACTTAAATAGTTTTATCACATATTCACTAAATGAATTGTAAATACAC TGTACTCTATATTTTTTAACATAAATTATATTGATGTTTCAGAAAATGGA CAAGAAAGAAGAACCTCGCATCGTGGTGCATATTATCTAAGAAGTTTTTT GATAAAAAAAGATTAAAAGACACTACTGCTTTCCTTCGTGAAGTACTGTT TATTTTTCAGTCATTAATTATTACTTTTGCCTTTAATTCCGTGATTATAC GTATTGAGAAGACTTCCTTTACTTTCTCAGCTGATTTCCTACTCCCCACC CTTCTTTTGGCAGCTTTTCCCCGTATTTAACCGTCAATGAATCGTGTTTT CCTGCTACTTTAATATTTTCCCCAAGAAGTTAAAAAAAGAAGGGCCTTAG AGAAAGCAATCGGCTTAAAAAGCTTTCTTTCTACAATAATAATCTGCGCT TGTCTACTCTGAAAAAAGGAAAGAAATAAGGAAAGAAACTTATCAAAACT CAGCTGCATGATAAGTTTACGACAGCTGAAAACTTTAAATTTTATCGAAC TGTTTCAAGCCGGATTTCTTATTATCAACAAAGAAAGAACATGAAAATTA ATAAGTTGACGAACCAGTAATATTCATTTTTTTAAATTTACAAGCAGAGA TATAACCTGTGCCTTATAAGTGATTTTTACATATTTATACGCCTTTTTCA ACGATGCAAAACTTTTTGTTTTTTCTCTCATCCTGCAGAGTCTCAATTTT CGGTGGAAGTGTTTAATTAATATAATCAGTGTTATTACAAAACCTTTTGA TATATGTCTATGTAAATGAGTGGATATTTGTTTGCGTAGATACCTACATA TATATTCATGATACAGTGATGCATTAAATCCTCTCTTCCAAGTATAATTA ACTAAGAAAAATGAGTGCTACAACGTCAGGCAGCACTAAGTCTGGCTCCT CTAGTACAACCAATGGAGTGAGTGAAGAGACTACATCTCCCAGCAGTACA AGCTCTGTTGGAGTAATTTCTCCAACATCGGGAGGAGCTCATTCTACTGC TAAGGACAGACTTAGAGAATTAGAAGCAATATTCTTGGAGGGACCTTCTT CACAAGTGACTAAGTGTTTTTCAACAGAGACGCTACTAGACATTTTGCTT ATTTTGTTTCATGAGTGTGGAAACTCTTCATTAAGAAAGGAAAAAACTTT TTCGGACTTTATTGAATTAGGTAAGACCAAACAGATTTAGGATTATATAT TTTTTTTAAAGGTGGAATGTCATTAATTTTACATTGCACCTACCTTTGTT TTATTACAAAAAAATATCCTTCAAATTATATGTGTATGTACTTAGATGTT AGTATGCGAGTTTGTGCTTTCACTTGCATTAACTGTCAACTTTTGCAAGG CCGTGCTTAAATAATTAAAATTTCATTTACTCTATCCTGACATTAACCTC ATTTTGAAGGTTAGCCTTAAAAATACCCTACATTTTTAAATAAATGACAG GATTTAAATTATCATTTTATTTTGAACGAATTCATGATGGAGGTACACAC TCTTGTTCACATTAAAACCCTTACTAATACTATTTAAATTTACTTATGGA TATGATTTTATTTTAAAGATTGTTTTCCAAAGTTTCAATAACGAAAGGTT ATAATATGTAGGGAGTTATTCACTTAAATTGTCTGAAAAGGCTCCAAGGG AGTATTGAACTCTTACTTTTCAGTTCATATTTGTCTAGAGCTTTCCCAAT ATGAAGAAAGTCCCACTTTATATATAAACCCCTCTTAATTGAATTACTCA AAATCATCGTCAAAGTGTTCAATTTCGAGGCTGCCTTATAACATGTGTTC ATAAAACTACTCTGGTTCTCATTTAATATCTGATACAAGTGACTTAAATT AGTAGTTACCTCATAGGAATCTTATTTATGGTGTTTTCAGTGATTTTTTT CTTTTAAGGTATAATAGTAATGATAAATGAATGTCATAGATGGCAAAATC ATTTTAAATACCTTCATTTAGCCATCATTGTTGATGCAAAACTATTCAAA ATTCATGCATCCTTCATTTATCATACATTCTTATGAAAGTTACTCGCGTT CAAGTTGCATTTATATAGCAATTCTTATTTATAAATTCATTGATAACATT TCACTATTTGTTCAATGTTTTGATATTCCGACTTAGTAGCTTTATTATTA TGTTATTCCTATTTGATTAGAATAATAGATAAAGTCACTGGGATATTGAA GGACAATTTGATAATTTTATGTAAAATATGGAATATATATATAAAGCAAA ATTCACTACTAAATTAAATTGCTACCATTTATACAGAGAGTTCTAAATAA CGAATATATATATAAAGTAAAATTCACAACTAAATTATAGATAAATATAT ATATTTATACAGAGAGTTCTAGAGAGCGAATTCTTATTTTTTTATTGAGT AATTATGTATATAAAATTATCAATGTATTTTGACCGACTGCAAAATATAA GCAATTAATCATTGTTCCATTATAATCCAAATAATTGTTATTTTTGTAAA TTTTTAGTAGAATGAACGTGTGTAAGGTCAAATCATGTCTAATCAAATGT AATCTGACACTCTCAAATTTGGATAAATTTTGCCACGGATGCTCAATTCA TGAGTAGATTAAGTGTAGTTCATTTTATCTCAAGGAATTTAGCCGTTCCG GATATATAACATTCTGATAGTCCTTATTCATTCGGTCCAGTCCAGTCTTA GGACTGGTCCTATCAGTCCTTGGGACCGTCGGACTCTCAGTACTAGAACT GATTTAAAAAAAAGAAGTAAAGTTGAGTGAAGTCATCAAGGACATAACTT TATAAGTTTTAGGACTAATATGCAGGACTGAATTGAACGGGACTGCAGTC TTCAGTCCGAAGTAAGTACCAACATAGTACTACTCTTTACTCTGTGCCAG CCCCTTTTTGGCCCAAAATCACTTTAAAGTTTTATTTCTATACGATACTG TTTCTTGTATATTTTTTTATCCAAAAAGGTTTACCTCTAGAAATTTGGCG ACGGACTATTTTAAAGGTTGAGGATTCCAAAAATGATAAAAATCATTAGT AGAATATTTAAACGTCTTTACACCTCAATATTATAATTATAAATAAATGA CGTAAAATCTAAGGATAATCATAAGTAAACTAGGTTCTTTTTTATTCGAA AAGAAATTATTATTCATTAAAGTTTCATAATGAGACGATAAAAAAATACT ATTTCAAATTCTAGAAAACGACGACAAAATACTACCAATATTTAAAGTAG 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GCCCTCAATCCTTTTGGGAATCTTCAAGTAGCCCAAGCTTTAAAAAGAAT GGGGATCCCTGCTCTAGACTAAAGTACTCCCTCCCCGTCTCATCACGTCA TATTAAATAAAAATATCTTGCTATTATTAGTTTTCTTCCATTCTTGAGCA GAGAACATATAAGTATTGAGTAACTACGTGTGGGTGTGGTCATGAAATCG GGAGTGTATTTCTATTATTAAAGCAAAGTTTGTCTGTTGGATATTGTCTA ATAACTCCAAATACTACTGGCTAMTMCCGCYAGTTTAAAATTAATTTTAA AAACAAGCCTATATTTTTATGTCCCAAGCTTTTCATTTATTTGTCAGASG AGCCAAGCCTAAGCTTATGAAGATATTTATCAAGCCTTAAACCAACCCTA GCAAAGGCTTGTTTAATACAATACAATATTATACATGATTTCTTTAATTT TATTAGACTATTAACTTTTTTAGATGAGTGTAAGTAGCTAATCAACATTA TTTTGCTACTCACCTTGTTGTTTTAACAGAAAAGCTACCCTCTTTTTTGT TTCCTTTCTCATAGCTTCCTCACTTATCTGCATTCAATTCTTTTAAGTTA TTTTGTAGATATTTATATATATATATACCCCTGTTACCAAGTCTTATTAT ATAACATTTTACCTCTCTGAAAACAAAGTTTTCCTTTCTCCCAATGAGGG TGGAAATAAATATATGTACCAATAAATTCTACATTCGATTACTCTTTAAC TTATACATGTGTACACTACAAGCAAAAGATCCTACTTAATAGGAAGTTTA TGATGGCATTCTATTAACAAATATGTAAACTATGAATTATAATTATTCTA CAAGTTATATTTATATATGAATCAATACATTGTGTCACAATGATTCACAG TTGAAAAACATTTAATTTGCATTTACATTAGGTTTTTTTCTATTTTTTAA AAATTGATAAATGTAAGTAACTATTGATCTCAGAAAACCAATATTTTCGA ACCTGTTACGGTAGTAATATTTGTATCACTAACACACAAATATACAATGC ATTTTGTTGTCAGCTATGGAGTTGTCTGCTTCTTTTTATCTAATCAGTAT ATTGAACGTTGATTGGTGGAATTATGATTAGCTCTTCTTTAGCTGTAAAG ACTTTTAACAAATAATTAATAAAAATTCTTTAGTTGGGGAATAATTGGCT TACTACCAACTGATTTTGAGCCGTTTTCCCGTGTTTTTTTTTCTGCATGA AAGGTTGCATGATTCAATAAAGGTCGTTAAGTGGGGTATTTCGATATTTT TTAACTAAAATGTCTGTAAGGACCTGCATCGACTATTGTTGTGTCGTCCT TAATTAGTCCTGTCGGTATTTTTTATAAAAATATCAATGGTTTATTAACC CAAATAACATATATATATATTAAGAACATTGCATATATCTTGTAATTTTT TATTATAATGCAGTATACAATAGTCATATTACATTTTTACTGAGTTACAT AATTGATTCCATTACGTAACAGAATAATTGAAAAAAAGAAAACAAACGTC AATGACGTCACGAAGCATCGATTATACTTTCTTTAAGGACAGACAAGTGT GACTAGACTCGACAATGGTATTGAGAGTGGTCTCCGCAAGTCTTTTGATG GGAGTGAGAATGACCCTGTCACAAATTTTTGTGGACATGCTTGGCTAGCT CTGAAATTTGAGGGCTACTTCATATATTTTTATGACGTCAAAGCTCTGCA GCTTCCGGATCTAATCCTAGTTTTGTAAAGTATCGCTTTAAATGTGTGAC TRCTAGTGCTGAATGTGGCCCAGTTMCCATCCATAGATAAATGCACCTGA GAGGTCATTATAAACWTTGTASCAGCCTCGCTGTATGTGAGGCGCCTATA AGCTACCTATAGTATTTTATATCTTGCAAGTTTATGTTATAGGCACCTAA TCTAACCAAATGTATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTATTATTTATTTATTCTAAAATWCCATT CTCGCACTCACCTTCTACTTGTGTTTTACAAAATGCCAATTGTCAATTAC TACTGAGTGCTGATGATTAGTGTTGCGTCGATCCTTATTTATTCGTTCCA GTCTTAGGACCGGTCCTATCTAAATATCGATGGTTTATTAAGCCAAATAA GATATATGAAATATGTGTTAAGGTCATTGCACATATCTTGCAAAACATAT TATATTTTTCATTATAATACGAACATATTATATTGTTACTTAGTAATATA ATTTATTCTATTTAATAACAGAATAATTAAAAAGAGGAAAAACACCCTCA TTGACGTCCCGAGGGATCGATTTTACCTTATAGGATTATCATTTTCATAC AATAATTTTAATCAACTGATTGTATATTTAACTGCATTAAGGCATTTATA AATGATGATGTACCCAAATCGTTCGTAAAATATTTTATGTGCTAGAAAAT TACATAATATTTTGAATTACCCATAACACTCATTTAAAATTATTACATAA TTTTTTTTTTTTAATTTAGTCGGCTCTAAGGCGTCTAGACGACTACATTT TTTAATGCCGATTTTCAGCATTAGTCAGATAGGTATACTGAATAGCATCT TGTGGAAAATAGGAGTGCTTAGACTCTGTCTGAGATTTTTTCTTGATAAA 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AATGCTGGTGGCATCTATTGAAAACGTTCTATAGAGCGTTGTCACTGACG TCATAAATTACATCATATTTGAAGGTGACACCTTTAATTTTACTAGATAA AATAAAAACACATGTTTTATGAATAAAATAAGACTTATCAATTGTATTAA TTACTTTCTTACTTTTTATTTATTAATTCCTACTTGATGCCAATAATAAG CAGTGATATTTGACTATAATTGAAATTAATATGTACTAATAATCCCTATA ATATGGCTAGATTTGGTAAAAGAAAAAAATGTTGATCGATTAGGATCGAG AAAGTTATATTATCCGTAAAAAATATCTTATTTTTCCATTTTCATAGTTA ATTTTTATCAACACTATGGAAATAAGATTGCATAACGATAAAATAACAAA AAGTTTAATATGTTTTAGGGTCTGATAAATAATAAAACTGGGCATAGAAG GATATATTATTGATAAATAGTACGGTTGAATTCCTTTTATTTATTGGTCC GATTTTGACATCCAATAGTTGATAATTTTCTTTAATATTAATGGAAAAAG AGCTTTTTATTCTTCTAAAACTTGGTTGTTTAGGGCCACAAAATTGCCGA CATAATTAGCGATGATAAACATCAAATATAAACGCTCTATTCTATTTTGG AGTGCATAGATATTATTATTCCTGTTTGGATAAAAATAAATATCTTGGAT GAGTTTCAAGTTGCACAATCTAAGTAACTACATATCTTCTACTTTTCATC ATAACTAGATAAATGAATGTTAATTTATTTGATGGCAATTTGCAGAAATA AAAGAGAAGAGGTATTTGTTTGTTGTATTAAAAAAATTTGTCTGCGCTCA TACTTACTGCTTTTAATGAAACAGAGTTCGTTTAAAAGCACTAATAATAA AATAATTGTATAAATAATACAATTTTATTATCTGTCATACTATTGTATAC 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