EMLSAT00000002824, EMLSAT00000002824-698671 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000002824
Unique NameEMLSAT00000002824-698671
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s162supercontigLSalAtl2s162:193285..222841 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000002824 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000002824EMLSAG00000002824-685590Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000012538EMLSAE00000012538-721466Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000012539EMLSAE00000012539-721467Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000012540EMLSAE00000012540-721468Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000012541EMLSAE00000012541-721469Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000012542EMLSAE00000012542-721470Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto774241auto774241Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000002824EMLSAP00000002824Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000002824

>EMLSAP00000002824 ID=EMLSAP00000002824|Name=EMLSAP00000002824|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=329bp
CSCQDWEESERRGVGFVPRCVHVISAILGRAFGTNLQRNVSIDEKPVMST
EKKIGKWYFGGLSSAGAVCCTHPLDLIKVHLQTSSTEGGSILRSTVNIVK
TQGILAMYSGLSASLVRQLTXSTTRFAIYEGAKNQVAPNNEKIGLLKRVS
MSAFAGACGGXIGTPGDMVNVRMQNDVKLPPEQRRNYKHAIDGLVRVARE
EGFRKLFNGADLATARAVFVTTGQLCFYDVVKEQLLSSGYFQDNLTAHFT
SSLAAGAIATTLTQPLDVLKTRAMNSKPGDFKGPIDLLTFTAKQGPMAFY
KGYIPAFLRLGPQTIITFMILEQLKANFG
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mRNA from alignment at LSalAtl2s162:193285..222841-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000002824-698671 ID=EMLSAT00000002824-698671|Name=EMLSAT00000002824|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=29557bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s162:193285..222841- (Lepeophtheirus salmonis)
TGTTCCTGTCAAGACTGGGAAGAGAGTGAAAGACGAGGTGTGGGCTTTGT TCCTCGATGTGTTCATGTTATTTCGGCAATACTTGGAAGGGCATTTGGAA CTAATCTGCAACGGAATGTGTCGATTGATGTATTTGTTCAGACCATTGCG AACATGGATTGATTGATTGATGTCTCATTTATGTATAAATATATCAGAGC TATTTTCTAACAAGTAATGTTGGATCGATTCGTCGTTCCTTATTTTCTTT ACTTCTGGCTAGAATTGAAGAATATCATAGGGTTACCTCACAAACAAAAA AATATACAGTGTACTTTATTGTCACCTCTCGATGTTTCTCCTTCTTTTCT CCTAACTAGTGGTCTGAACGTTGATTGGTTGAATTACGATTAACTATTGT TAAGCTGAGAACAATGGCAAACAATTAGTGTTGCGCCGGTCCTTATTTAG GACTGAAGACTCCTTTCCCGTCCTGTTCAGTCCTCCAATCAGTTTCTAAA ACTTATAAAGTTCGGTCCTTGATGACGTCACTCCACTTTATTTCTTCTTT TTAAATCAATTTTATAACTGAACGTCCGAGGGATACAATGAAGGAAAGCC TATGATACAAAAACGAAGAAAATAATTATTGATAGGTGGAACGTATAATA ATAATAAGATCAAGCCACACACCTCCTACTTGAAACTTCAGGTATCTTGT CTCTATAAAAGAGATTATGATGAAACTTCAACAATTGAACTGAAGTTTCA ATGTTATTATAGTAAATAAAAAGTCATTTCGGCTTTTGTAGTTACGATAA AAGACCGATGAGGACCGGTCCTAGTACTGATAAATTTTATTACCACTGGA CTGATAGGACTGTATTCTTTTAAGACTGATCTGACAGTAGTAACATGTAA ATGATATGGAAATACTTTAAAAAAATTAAAATATTTTGAAATTGGATATG AAAACATTCATGCATGTCTGATACATTTTGCTAGATTCAACGGGAGATAT CAGAACATTTTCCTTAAACGTGTGTACAAATATAATATTTGAATAATTTT ATAGGTATTGACGAGTCCTTACAATTTAATTCCCTCTTTTATTAATGTAT CAGATATATTTTCAATTAAGATTATATTCATGTAAACCAAAAATAAGCCC AAAAAATAATCGTTATTTTCTTCTATATTTTATCTACATATACTATTTCA AAAGCCCTTTGATGTTGTACCAATTGAAATACTTAGTTTCATATATATTC AATGAAATAAAAGTAAGTTTATTTACTATTTACAAAGTGATTAAAATGTT TTTTTCACTTTCTTGGAATATAGACAGTTTTCATAAGTGGTTTTTGCTTG TGATTATACCTTATTAGGTGTGGCAGACCATCACTATAATATCTATTAAT TACTTTATGTTTTGCTTAAGAGCAGGCTATCTTTTATAGAAATTTTAGTT TAGAGTCACTGTTTAATGTCCGGCGCGACTTGTTTGGAGATACAAGGTGC AAGTATCGCAGCAAAACACAACATAATTTTAAACGATAATTATGAATGGA AACGCAGTACCTTATCACGTTAACCCTTTCCTTGGGGTTGAAGAAGAAAG GCTGCATAACCTTACCGGTGCTGCAGATGATACCCAGGGTAATCACAGAG GCCGGGAACTTTGTGGTGAAGAACGCAGGGKCCTCTTCTCTCTCCTTGGC AAGCCKCCTGTCATTCTGGACGTTGTAGCTTCTGTCGACAGTCCGGTTCT TCGCGTCGGAGAAGAAGATGATTCTTCCTCCACGGATCTTCAGGTCATTG AGGAGACACTTACCGTTGATGAACCTGGTGGCCGTCATGGATGCCGTGAG GATGTGTTGTTTGGCCATTCGGTGTGTCCTGTACCCGAGGMCCTCATTCA TAGCCTTGGAGACCAGCTGCTTGCTCACTCCACGGTTCATGGCCAACCTG GACAAGGAAGTCCCCGGCGAAGCCTTGATGGACTTCCAGAGGCCTTCAAG GAAGCGGGGAGTGCGGATTCGGTCACTTCTTATGTTGTGGGTCTTGCGGC GGACCTTCCCCTCAACCTCCCAGGCATTGAAGACCCGGTACACCGGGGMC TTGGAGTAGTTAAGAAGCTTGTAGATAGCAGAGGGCTTATGTCCTGCGCT AGCCAATTCGAGGATGGCGTCTTAGTATGACTTAACCCCGAATATCCACA TTATGGATCTGGATGAAGTTTAAAGTAGTTCCAATTTATCGTGGACACTC TGTATCCTATGGAGTAAAAAAAAATTTCGACAGAAATTCAACTTCCCCTT AGTGTATAAAATTCGAGTCCTATTAGGTTTTGATTGGATAGAGTGTGCTT CAGTGGCTATTCTTGTACATCAAAAAGTTCCTGTAAACATCACGCATAAA TAAAGAAGGGATCTGTGAAAGGAATAAATTTAATTTACCGATTAGAAAAG GGAAAACGTTTGTTGCGTGTACTTTTTCTTCTTTTTAGTTCATTATATAT TAAGTCGTCGTCGACTTAACATCTCCCCCTAATGTAAGCATACTCATCTG TCTTTCGTGTAAATTGTTTTAAAAATGCTTTCTAAAATAAATATATATAA ATTTAAATATAATAATATTTTTTCTGCACTAATGCTATTTTAAATGTTAG CAGTAATTCATTTCCCCCCCCCCCCCCCGCCAAAAAAAAATTATAATCAT AATAACAGGCACCTGATGTTAACAAGGGTTCAATTCTGTATTATCATATN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNTTATGACTGGTATTTTCCCTACAAAAATAAAAAGACGGCTAA AAGTCTTAAACTTACTGAGATTTTAATAAGGGGAACAAAATTTTTTTAAT ATAATTTAGAACAAAGGATCCTTAACTTTTTTAGACCATGTGTCATTTTT TTTGTTAACTTGTTAATTTTATATGTTTTGACAACTTACACAATGATTAT CACTTCGATAAAGTTATTTTTAAACTGGGCAATTGTAATAAAAATAGTTT AGAAATTTTTTTATTCAAAAATAAAATAAAATAATACGAATACATAATCA TATTGGAACGAAACAAATCAAAAGATAAGAAGATTATTATCTACATAAAA CAACAAAATAATAATGAATTAATTATTTATAGAAACAGTAAGGTTTGATG CTATGATAACAATTGGTTTTATTATTTCATCAAAAGATTGACAAACAACC ACGCTAAACCCCTTTCTACGAGGTATAATAATGGAAAAACCATGAATAAT CTTTATGTAATAGTCCATAAAGTAGTGAAGGTTTTTTTAAACCCAAAACT CCNGGATACGCCTTCATGAACTGAACCTTCAGTTTTTAGTTACTGAAAAT TCAGATCAATTCTTCTTATAATATGCCATCTGTGTCTTCATTTTCATCGT AAAGGGGCATTTAAATGTTGAACGTAGACCAAAACGTTATCATCTTTGAC GTTTGATGATGACAACTAGTTACTTCTTTATACTAAGATATTCTGTCTTC AAACATTAAATAAAAATGATTGCATCCTTGGAAAATTAAAAAAACTTGTG CAGATTGCCAACTACAAAAGCTGCTGCTCCCTTTCTCTCTTGCATATTTT ATACCCCTCTGACTATTTTACAAGTTAAAAAACTACATTAGTCTACATAC ATCATATACAGAGTTGAAACGTAAATATTATGCCAATTTTCAACCCTTCT GTTAAACTCTCAAAGCAATTAGACTTGTTTAAATCTAACGTAGAAACTTA CGACGTCATTACATTTGGACTGGTATTAAATTTATGTCTAGTTGTATCAA CAAGGCTTTCAGAGTAGCATTAAAAAATACAATTTATTAGCTAGCTAATT GCAAACTGTTTGGATTCTATTTTTCGTTCTATTATTTTGATAGAAGGATC AACGTGTCATACTTTTTCTTTTTCATAATTATGTTTCAAGGTTGTTTTTT AAAGGCTCATAACTTTTTTTGTGACGTAAATTGAATTCAATTTATGATCA TTCTATAATTAACAATTATTTTTTCTTCTCCTATATTTTGGATAGTTTTT TTAAATATATAAAATGGTTGATATGGTAACATTGACAAACTTACTAGATG AACCATTCTTACTTTTAATATATAAATTTATCCGGCATACTAATTATAAT TTGTTTAATTTAATAGTTCAAAATTGCAACTGAAAAATAAGACGTATAAT TCACTCGTACTTGTAGTGTGGACTGTTGATAATACAATAATGGTTTATTC CTGAGATAGTAGATATATTGATCGAATAGCTTTAACTTTTTTAATGAAAA TGAATTATTGATGAGTAGGGTTGTTTAGGTCCTTATGTATTCAATCTAAT CAAGTCTGATGAGTATGAGCACTAAAACTGATTTTTAAAAAAGACAACAA AAAATTGTGTAACGTCATCAAGGATCGAATTCATAAGTTTTTAAGATTGA TATGGAGGAGTGAACAAAATCGGAGCGAGACTGACTTGGATGGAGCTACA GTCTTCAATCTTAAATAAGGAGCATTAGATGACTATCGATGAGTAGAGTT GACATGCTTGTAATGAAAAAAAACATCTTTAAAAGTTAGGAAAAGAGAAA 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GGTAGTACGTATAACGGTTAAAAATCCTCAGATTTGTATTCCCAGCTTAT GAGGGACGTCCTTACTTTTAATTTATTTGTTTACTATAATGGGGGAGGTA AGGAATGCTCAAGAAGGCGTTGTTAATTTAAAATTAAGTAAACTAAGCTC GGCCTATTACCTTCTATCCACCTTGGGGTTGTATTATTTGAAGCTTTGAT TGCAAACTAATATAATTAAATAGGGGTTATGACCAATAGTCAGGGTGACC ATATTGATTTTCGTTTGAACCTCCCCAAAATACTACTGATTAGTCTCATT CTAAATAATTATAGAATGTAAATATGTGAAAGTTGTATCCTTTGTTAAAT TTATTTCTTTGTAAATGATGACAAATTGTGAGATATTCCAGAAATGATAC TAGCAGCAATGCTTAGACCTAATCTTATAATATCTGCAATATGAATTATG TATTTATATAAATTTAATGATAATTTCGTATTATCAATTCATAGTCGTCC TCCGAAAATAGATTCATCTTTTTAAATGATTAATTGGTATATACGTTATA TATACAATACATACTTAGGCAAACAACGTCATTCTATATATTATTGGTTA CCCGTCACTTTTCTGTACAAGATAACAGCATTTATACCAGCAAAATTCAA AATACTTTAAAAACTTGTAATGACCTTTTTGCAAAATACATTTTAAGAAG TCAATCTTTTGCCACTATTTACAAAAAAGTCTTGAAATTAATGCTTTTTT GGCAGCCTTCTGCTCAGAAGATATTTCTTTGCGAGAACGAGTCATAGTTT TTAAAATACTGCTAACCAAAATTTAATATCAAATTTATCAGGCTTCTTAG CCATATATTAAGTAAATAGATATTTAGCTTTTGTTGTGAATAGTTTTTCA CCTGGCCTGTACGCTAACTTATAATTATCGACTGATCGATTCCATAGTGT TGTAATTAATTTTGAACTTGTCGTTTTGGAGTCTTTGTAATCTTGTGGAA CAAATATCATAGCGGATAAATCTCACTAATATCTTATATCTGTCACGAGG CATAATATTCCAAAAGAGATTGATTCCTAATTTGATTTACCAAATGACTT CAGTCGGCTGCCCTTTGGCTAATATTATTCTCCCATACATTATAGCAATT AATTAGAGTATTTGTCGTTTACTGGTTGTCCATACATCAATCCAAAATTT TGAACAAGTCTCAACTATTGTACATTTTATAATTTGATCAATAATATAAT TATGGATCAAAAGTTCAAAAGCTGATAATGTTGAATCTGTAATTATGTTA CGTTTTGAAAAGGATGATGGACCTTGGACTTCCTTCAAAATGTTTTCTTG TCTAAAAAAGGTTAAATTCTTTCTACCTCTTATTTTTTTGTTCCAGATTG TATTATTCTTACCGATAAACAATCATTCTCCAAATGAGTCGGTTGCTTTA TGTTGCTTAGAAGACAGAAAATGAGTCGTCACTTGATTGTGTCCTAGTTT TTTTTGAAATTTTGAATATACCAATTAGTCGCAAACAAATACATATAGGG TTGAAACTGTATAGTCATTGCAAAAATTCAAGAAAATAATATACGGTTTC ATTAAATAACTTAAAATGCCTCGGAATTGGCTTCGACGTTTTGGGACAGA AATTAACATTCTAATTAATATATATATTAAAACCTAAGGAAGCTTGAACA TTTTTCCATTCATTTATGAAAAAAATGTATAAATTGATAGACAGAATCAG TTTTTATGAGATGAAGTAGTTTTTAGTCGCTAATATATAGAAGATGTAAT GAACTGCGGATTTGCGTGGCAGTTTGGGGCAAAAAATCACCCCTTCCAGT TGAATAAGAAAAAGTTTAAAAACACCTAAGGAAGCTGGAATATTTTTCTA TTCATTGTTGAAAAAAGCTTTAAAGGTTAAATATATGTTTGTTGATCATT CTAATAGTCATGTTCGTGAACTACGGCGCCAACAACAATAATAATTGTGG GTTTTAGCCATGGGCATTCCAAAACCTGAAATTTGTATATAGTTTTGTTA TTAATGTGATTCTTTAAATCTGTCTTTGTTTGAAGGTCTTGATATCATCT CTGTCTTGACTGCAGGTATGGTATTTTTAGGACTTACGTTGGGCTTTGAT TTTTTTTGGGGCGCTTCATAATAATTATATTCAACCATGAGTGTGATGAA GTCAGAATTTTGTCTGTTATAGATTAATCTCAAGTCTGTGAACACAGTCT TAAAGTAAAATTAATGTTTTTTTTAGAACTGTATTAGTCTCAGGCGTATT ATTTCATAAGAAGTAGATAAAACTATCTTTTAATATGTACGATATTGAAG AAATCTGGGTAAAAAGGAATTTTTTTTTAGATATCAATCCAGAATTGATT CTAATTTGCTAAAAAATAAACAAATACATTAATTATAACTTAGAGTAAAA TGATCAAACATTTTCATATTATATGATTTTAAATCCATTATTCTAGCTAA AAATGAATTTTTTTTTTTTGTTTATCAAACACCATTTTAGATAGGAATTA TAATATGGCAAAGTTAAATTGACTAAAAATAGCTCTGATATTGCATCTCT CATAATTGTTTTTAATCACCTTTCCATAGAAGCAGGGGGAAAATTATAAA TATGTGCTAATATTAAGGATGCAATAAGTAGCGTATTATTCATATTTTTA TGTGCTTAACATAATTTCATTGTTATTTTGGGTAAATGCATTGATTAATA ACTTACATAATATATTTCTATTAAGTAGTGATACTTCATAATGTTTGTCT AAATAATGATTATTGTCCAAGGTTTGGAAAGTGAGGATCCCCTTAAAAAA 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TGTTTCAGTTGTTTTTTCCATAACTTTTGTACAAACAGAATAAAAAATTC ACACTTTTAGATAAATTCCTGGTTTTAGKTAGCCATATCTACTAATAAGA AAGGACTACAAGCTTGATTTACGTATCATTTTATTAAAAAAAATTAATAA GCTTTAAATTGATACCTAATTTATACAACTTCTTGTGCAGGGACATTAAA AAAAAAATTACACCTACTCCCTAATTTTATTCAAGTGTGAAAAAAATTAT GTCGGTCATTAAAATGGATGGTACATAAAAAGGTTTGGAGCAAGATACTT TAAAATTTGATCGTTTGTACCTGCAATAGTATATTTTAGGCTGATGTGTT TATATTTCTCCTACCAGCTTTCATATTTCCGATTTTTTTTTTTTTACAAT TTACGCATTTAAAATTTTATGAAAAATTTTGCATTACAAGAGTTCTCAAG CAAAATACGGAATGAGCGATATTCGTGAAAACTTAATCAGTTATGTCTCT CTATGAAAATGATTACCAATTTAAGTCAAACTTCTTAATACTTCTGGAAT TTTTTTTTTTTTACGAAACAACAGAAACTCTATTTTTGAGCAAGATATCA ATATTTCGAAACGCGTCGGATCTCAAAACCATGTCTTGACAAGTGTATTT TAGAAATTGTCGTATGGAACAAAAAACGAAAACAAGTTAAGAAAATTTGA TCATCTTTGTATAGTGTTCATCCTTTTTTTACATTTTCAGAAAGGAAAGA TCAAAATTATATTATCTTATTCTCTATTTTTGCTCCATAGGGTACATAAT AAAATAAAATTATGTATATATTTTTTATTGATTAGAATAATTTCTACATT AATATATTAATTCAATATAACGATTAATACATTATTTTAATTCTTATGGA CAAAATAAATATATTTTGCCTCCTTTCAAACTTAGAACTAGATGTGCTAC 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