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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s163 | supercontig | LSalAtl2s163:808582..856602 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000002845 >EMLSAP00000002845 ID=EMLSAP00000002845|Name=EMLSAP00000002845|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=142bp
MLFRVFIQQINFDVDHGSSPGRTPLEGFPGLVLQSSGLPQRRESFLYRSD SDYEVNSPRSISRASSIASEVGGRNDRTPSRDPGSFNPTTASYSRPNLTD DAFVRTAMETLEELDWCMDQLESMQXHRSVSDMASNKVNNTE back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s163:808582..856602+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000002845-698692 ID=EMLSAT00000002845-698692|Name=EMLSAT00000002845|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=48021bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s163:808582..856602+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGTTATTTAGAGTTTTTATACAACAAATTAAGTAATTATAATGTATTTC
GAACTTTATTGATCATAATATATTAATTGAAAATATTATTTTGTGTTATT
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TGATTTCATACCACATCTTAAGTCGCATTCCTTTTTCTTAAGTTTGATGT
AAAGTACATACTTCCATTTTTCTTTTTTTTTAATTTGAGTTGAACTAAAC
ACCTGCAAGCTTTCATTTTTTATACAGAACTCCCTTTATATCATACTATT
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TTTACTCGCTAGATGGATGGCTCTGAAGTTGACTCAATGTTACTTTTTAA
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ACACTTACAAAGATTTCTACCTTTTTCACATTTCTAGACTTGTAAACATT
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CCTCTTCCTCCGTTGTTTCTGCCTACCAACAGTTTTTGTTCTCTTCTCTA
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GTACATATTAATAAAAGAATTGATATAATAAGTTCTTATAATCTCATGTC
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AATATACTGGGTGGAAACTAAAAAATACAGAGTTTGCCTATTATTCTTGA
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GAGATTTTGGACACATGGCAGGGTGCTGAGTCCTGTTGCCACACCCAGGG
CCTGTCTCCGGCCTTCATGGACCTGGTAGGGTCATCCTCAACCATCTTCT
GCACCTTGTCGACAAAGTCGGTGTCCCTGACCTTCCTGTCTGCGCCCTCC
TCCTTGGGTGCCCTCTTTATGGTGGCATTAACATCGTAGGTGTCCTCTAG
CTTCTTACGGATGCGCTGAACAGTCCGTAAATTCACTCCTAAGGTTGAAG
CAATCGTTGAATTCGAGATTTCACCTCCATTATTAACCAATGACATGACT
ACCGCGGWCCTCGAAAGCTCTTCATTCCACTTATAGCTCTTTATCTCCTC
ATATGATGACGGCATGATGCTAACTGAACTGCGTATCGTCAGCTGACGAG
AATATCTTTCCTATTTGGTAACCAGTTTTTTATTTGATTATGTCGTCTTC
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GTTACAAAAATATTAGGAATTTATACAAAACTACATCCAATACTATCAGC
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TTGGCAAATTCCAAGACGAGTAATGATATTCAACTCTAATTGGCACTTAT
GGTCTTATAAAAAGTTAACCTATCTACTTATTTCCTTTAGATGATATTGA
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TCGTTCCTTGGCGGAACTCATACGTGATGATAATTTATCCCATATTTTAA
TCTGCCTTTATTGACGTCACATTTCCATGACGTTATCTACATGCTTTAAT
CTCAACATAAAGTCAGAAAGAATAATGAAGAGGATTAACWTCTTGGRTWT
TGGGTAMTAGCCACTTTTATTTCTCCCATTAATTGATATTTGTAGCCAAA
AATAATTGGGTCATTTTGACCGTGTGCTAGAAGATTACAGTAACCCCATC
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GAGTCTTGTGCACGACTCTGATGCCATTCTTATTAGCTCCATTAAAAAAT
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ATATAGATATATGTTAGTATAATGAGTGTGAATATATGTTAAAAATAGAG
CCTAAATTGTCCATTCTATCAACATAATCGGCAGTAAACATGTTATTTAA
AATGTAAATATGTCAAAATGTTTTGAGATATACATAAATGTCCAATTATA
CTTTTTATTGTGGGTGTCACTGTTCAATATTATATGGACATGAGAATTTG
GGTCATTCAAGAAAAAAAATGCACCCATTCTCCAATTGTCAAATCGTATT
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TTTTTAAATTATAAATATGTGTACAAACAAAATNTCAGGTCAACTATGGC
TATTAACATATATGAGCCAATTTTAGAATATCAGTAATTCTCCAAAATTA
CTTATGTTTACCAGAGGTGGGAAAAGTTTATATAGTCCAAGTACAAGTTG
AGTCAAGTATTTGCATACAAGTCCAGGTCCTTGAATATTTTAATCAATTC
AAGTTCCAACAAGGGAGGGATAAATAATTATTTATATATTGAATGTTAAT
GATTGTTTTTATTAATGTTTTATTTTATTTTTAAGTATTTTTAATCCTAT
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TTACCTATTATTTGAAATATTTAAGAATCGGCCGCAGGATTTTTTAATAA
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AATAAACTCAAATTTTCAAAATACGGAGACATCTTCTATATTAATAAAAT
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AGTGAAACATCTTTTCTTTTGCAAAAGAAAGTGCTAAAAAATAACATTAA
TTAAACTTAAGAGCCATCAAGTGAGTAAAAATGTGTATTGTATATAGTGA
TCCCTGATGTATATAATAAAACAATAATTATAGAGAAAAAAAATTAGTAT
AATAACAGGGAGTATTGTATAAAATGAATGAAATCAGGCAGGCCTTTAGT
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AAAAAAAAGGAATTCAACGTGAGGTTTAGGAACGAGCTAAAGTACTCCCT
CTGACTCATCAAATCATTTTTTTTTTTTCTAATCTGTTAATTTAATTTTT
TTTTCCGGTTAAAATAATTTATTTATATTCTACAATACAAACAGCTTAAT
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GGACAATTACGTTTAAAAAAACATAAATGAACATTATAGTTCATATTTAA
TGTCTTGAAGTAAAATAACCTGATATAATATTTAAAAAAAAATTCTAAAC
TTCTAAACTTTCTAAACTTATCATTGACTTGATGAGATTATAATATTGCA
CGGACCTCGAAGGAACAAATTTGATGATATTTCCGGCCCATGCCCACGAC
GAAGATCATGACAGAGGGGTTTTGATAGGAAGAGCTGAATATCGAGTAGC
TGCGCTTATCATTATATCTCTTAATTCTTCCACATGTAATGGAGAGTCAA
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TAATATATTTGCCTTTATATAGTTAGAAGAAATATCTTCTGTCAAACAAA
CGTTGAATTGGATAAAATATTTGACTACTCTCAACATTGGGCAATCAGCA
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TAAGAAAATTTGATATTGTCAGTGGAAATTTGAAATTGTGCCGTAAATTT
GGTCCTGTCTGAAATTCCAGAAATTGATCGGTGAATTCTTTCTTCCCATG
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TTCCACTGAGGAATTTTGGCAAAAGCTTATTTTTAAAAACGATAGTTTCG
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ATGGAGAGCAGAGTAAAAACAGATTCCCAAACTTATTAACAAAAGTAATT
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AGGCCTTCCTTTCCATAAAATTCTCTGAATAGACGCTAGAAGTGGTGAAA
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AATATTTAAAGAACGTGAAATTCKCCTTCCAGTCTCTCAACGGATATACA
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AAGGCAAAGCCCACCGCCTAATTTATACTTTGGACGCTTTAAAGCAGGAA
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ACCGCCTAATTTATACTTTGGACGCTTTAAAGCAGGAATATAATTTTTAT
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TAGAGGTCACTACTCCAGAAATTATTGATAAAATTTATCATATTATGATG
GAACTATTACAAGTGCATATTATTCATCCCTATTGGACCGTTTAAAAACT
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GCCCTTGGTCTTTTATTTGTTCCCCAATTTTAAGAAATGGCTGGGGGAAA
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TCAGACTTGGACAAATCCTACTGTTCGGAAGGGATATGCAAACTAAGGCA
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TACCCCAAACAATTAAGTAGTTTTTATTTTTGTATGGACTTTTCATATGA
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TATTATTTTCTAATTTATTAAAAAGGCCATAATAAGGCTTGTTATTTTCT
AAAAAACGTAAATCGATAAATATAACTTTAGTATTTATCAAGAAAAACCG
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TGCCCCAAGTCCGTCTCACTGTAAAACTGGCCCATTTAAAAAATAAACTA
ATTTCATATTTGAGTCGGAAAAGTTAATAACAAGGAACCCAAAAAAATCC
GAGTGATTGACCTGTGTATAATTAATTCCGAAGCTGTGTTGTGATTTATT
GAATAAAACTTCCTTATGTCTCATTCATTAAAGTGATAAAAAATGCACCT
TGGCAAGTCTAGTAGAGCTGAGTAATTGATCAACAAATGGACAAAAGGAA
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TGTTGAACCTATTCRTATAGCATATTTTATAAACACAAACACATAAATAT
GTATGTATAAAAACAGGATTGATCTTATGTAGTGGTACACATTTTATTTT
TTTCAAATTTTTCAGAAGTATAATTTTAACAAGAGGTTTTATGATGACAT
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TATGTGAACCCTAAGCTCTAATAATTGCCTCAATATGAAGCCTAAATCCC
TGGTAGACCTTGACTATGTAGTCAGACTCGAGTTGGTCCMCTCCTTCTTG
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AGGAGATTGGTCAGAATTTGAGGTCCCAAAAGTCCAGAGAGTAATCTCTC
AGGAAGGTCTGGGTCTTAGCGGTCAGATGACATGGAGCTCCGTCTTGAGT
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CTTGACAGATTCCACAAATAATCCAGAACTATAAAGGGTTAGTCACAGAG
AGAACTAATGTCCCCAACGTATTTAAAGCCTAGTTTTCGGTGAGCATTAT
TGGGAGCAACGGAAGTGTTTTGCCTCCCATCTTCTTTGAGCCAAAGGGAG
GGTGGATGCCGACAGTTGAACTCCTGTCTGACCAAGTGATACCTTGGATG
AAAGCTGAGGGCAATGGTGTTGAGTTCTTGTTTCAAGCAGACTGGGCTCC
ATTTTACAAGGCCTACAAGACGTTGTGAACTGAGCTGATTCTCTCTATAA
GATAGAAATATTTTGTATGTTTTGAAAAAATCAGAAGCCATTTACTAAAA
ATCCCAATGAAAAAAAGACATTAAACTTTTCGATCCTTAAGAGTTTAATC
ATTTATGCTCAAAAATATTTGTATTGTTTTTCAAAGTATTCTCTAGCATG
ATTTATACACTTTTACATGCGCTCAAACCAATTGTCGAGCTCTTTTTCCA
CTCCGATTGAGAATCCTCCAAAACATGTTTTTTAAATGCTTCAAAAGCAT
CTTCTGGCGACGAAAATCGGTGGCCATGCATTTTTTCTTGATGTGCGGGA
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ATCAATTTGACGTTTTGGCCGTTGAAAAAGGCACTGGTTTGAGCCAATGT
GTGAGAGCTTGCACTGGCATGGTGAACAATGATTCGTCTTCTGTTGTTCG
TTTTTCGAATTTCTCTGAACACTTCAGGCAAACAAATTGTGATGTACCCC
TCAGAATTGAACGTCCTACGATGCTCAAGTGGAACAGTCGCCACATGACC
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GGACAACATTCGTTAGATTTGGCTCSTCTTCGAAGACCCACAAGGTTGAT
TGTTGTTTTGTTTCGGGCTCATATGCATAGATCCATGATTTTTCACCTAT
GACGATCTCATAAACGTAGTTTGAAGCACTGCGAGTGTATTTTTTCAACA
TTTCTTTGCATCAATCGACACGAACCTTCATTTAAGCGATTTTCAAATTG
AGCAGGATCCAACGAAAAAAACCTTTTTTAATGCAATATCGAATGTATGC
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AGAATTTGCATTATCATTTCACGCACAGCATCAATGTTCTCTGGCACAAC
GGCCGTTTTTGGACGACCTTCACGGAATTCGTCTTTGAACGAGCGTCTGC
CACGATTGAATTCATTAAACCAGTCTTTCACAGTGCTATAGGATGGTGCT
TCATTGCCATACAAAGATTTAAGTTCATCAATGCACTCTTGCCGTGATAA
TCCACGTCGAAAGTTGTCTAAAATCATTGCACAAAAATGTTCACGACTTA
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CATTTATGAATGAAAAAATGTACCTGGAATTATACAATTTTTGTTCGAAA
TTGCTTTTGTATTGGCCCATCATATATATTAAGAGGTATCATGAATAATA
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TTTTTTTAATAGATTTAATTTAATATTTATGAAAAATTTCGCTTGTTAAG
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GCTATTTCTATAATTTTTGTAAATAAAAAGAAAGCTTGGACCATTTGATT
ATAATATGTTATTATATGTATAAGAATAATAAGTCAAGTCGATGATCAGG
AATGAAATTTCTTAACATGATTGTTTATAATGAAAAAGTTCATGAAAACA
ACCAAAAAAAAAAAAAATAGATATACAAGWAAAATATCAACTGAATTGGG
GAACTTCTAAAATATATTTAATCGTCCTGAAATTTGGCATTGAATTATTG
TCTTTCATTGTATTTTAAAACCTCGTATACCCTATTATATATTTCATGCC
AATGTAACTGCACTTTAAATATAAAAATAATTAAAAAAAGCGTTTGCATT
TCTTCGTTGGGTTACTCTTTTTGTTTTGAACTTAGTATGCCAAGAGTTAC
TGGCAAATTAAAAAGCTTTGTAAAATCGTTGTGCCCATTAAAAGTCAAAT
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TTTTCCATAGCCAGCCACCCTTCTGTCTTCTTCGAATGGTCCGTAAAGAA
AAGTCAACTACTTCTCCTGCAAAATCCAAACTTTCTAAAATCTTTGTGGC
ATGCTTTCGAAAATACATTATTTTTACTCAATATATGTAATTGTATGTCC
ATTTTTCTCCATTTAAAGTTGCATAACTATATTTCCGGCAATTTTTCGAT
GAAATAATTGCACAATAAAGACTTATTATGGATATAAGTCATAAATTTCT
ACCACTCCATCATAACATTTCAAATTTCCTCCCACTTGATTGTACATAAT
ATAAGCTATTGCTTTGATTTATTATATAGTAACATTCGAATCGAGAATGT
TCTCCCTTTTGGCTTTCCACGTTGTCGTTGTCATCTCCCTAACTACTACT
TAAGAGGCTGAATATCTAGTAAATCACTTTGGTAATTTGATTTTGTTCAG
GTGGATATTACCAAAAGTCCCATTTATATGTATATATAAATGAAAGTATG
TTGTAGATTAAGGCGATTTGGATTCCGATGAATGTGGAAAAGTTGTCATC
AGGTAAGGCCTATGCAAACTTTTATTACGCAATGATGTCAACCTTAGGTC
GAAAGTGTTTAACTAAATTATTAAAGAATTAAAATAAGAAATTATTCGTT
ATTTTATATAAAACAATTTTGATAGACATCTTTCTAAAATTAATAATAAA
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TTATTTCAATTTTTATTTACTAACAAATAATTCATTTTTGGCCTTTTTAA
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TGATCTGGACTGTCCTCACGGTCACACTGACAACGTTTGAAATTCTTTTT
GGATCAACAACAGCATCGAGAAGGTCCAAGACCCTTTGCCTTTTGGATTC
CTGTTCACTCATTTTTTGTCCGATTTTGGTCAAATGAAAACAGTGTGCAA
GAAAAACAACACATGAATCGGAAAATTGATAGAAATGTTGCCAACAACCT
GAATTAGTGTAAAAAAAGAAATAATTTAAATGACGTGGAAAATTTCCATG
TTGCACTCTGTATACAGATATGACATAGCTCTATCAGTAAATGTTATAAT
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GTTTACATATCCAAAACGTTTAACATACGCACACAAAAACATAATGATAT
TAATGTGTGTAGTAAGGGGGAAAGAGTTGATCACGACCTTTTAGCGAATA
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GAAAAAACCAATATATGATTTCATTTTTCTGAAAATTTAATGTACAAGTG
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GCTAGACGTAAATAGTATTTTCTTCATTTTTTATTCTAAAACCTGTTTGA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCATTTYCTTTTGGCGTAGTTA
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GTATGGATCAGTTAGAGTCGATGCAGKCACATCGATCCGTGTCTGATATG
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