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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s16 | supercontig | LSalAtl2s16:183923..308993 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000002955 >EMLSAP00000002955 ID=EMLSAP00000002955|Name=EMLSAP00000002955|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=269bp
MRISSMSQTFSLTIFVLICTSVRAGNPDAKRLYDDLLSNYNKLVXPVVNV SEAVTVRLKLKLSQLIDVNLKNQIMTTNLWVEQYWYDYKLQWDPTENHVY NFYLFPRSADGNFEVTLATKATLMASGKVEWKPPAIYHSSCEMDVEYFPF DEQTCVMKFGSWTYDGYQVDLRHIDEVMGKPEVEIGVDLTEFYMSVEWDI LEVPAIRNVKYYXCCXEPYLDITFNVTMRRKTLFYTVNLIIPCMGISFLT VLVFYLPSDSGEKVRRCIR back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s16:183923..308993+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000002955-698802 ID=EMLSAT00000002955-698802|Name=EMLSAT00000002955|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=125071bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s16:183923..308993+ (Lepeophtheirus salmonis) GTAAAGTAAATGGTTTTGTAGTGAGTGGTTTCAGGAATAAGTATACTAAT
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ATTTTTTTTGTAACTTGATTCAACTTTAATTTTTTTTATCTTTTCTTAAA
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TATTGTAAATTTGTATCTGTCATCGAGTATCAATTTCACTAATTTTCTTT
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TTTTGGCTCATAGCTTAAAGTTTGTCGTTTATTGATCTCACATATATGTT
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TTTTTAGCAAATATCACAATTCTTGTTTCTTCTAAGATGAAATATAAATG
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CTTAGTGAGGAATAATTCATCCATATCTTATCTATTAAAGAATAAATTGA
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GTACTATTCAATTTTATAACTATAATCTAAAAGATTTTTGTTAACCCATA
ATGATAGGACATTGACGTTTTTTATCTTCAAAGACTAGTCAAAAAGCTGT
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CCTCTAATAGTATAAAATTTGAATCTATAGAATTGGGGCCCAAAACTTTC
AGTAGGAATACCTAAAATACAAAAAAAGGTGGCATATATTATAGTTGTTA
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TCACTTATATATTAAGGTTTTTTATATATAGTATGTCCTACATCACAAGC
AATAACAGTATTGGCACTCCAACAAACTAATTGAGAGATAGTGACAGTGA
AGATCGCACCAATCGATGGCAGGTCATGATGACAGCTTGGATGTAGTCAA
AATTATGATGAGAAGTACGGCCGATGTTTTTCACTAAAACACTCGAAACT
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GTCCAGCCCAGATGTAGATGGTCTTTTCGCTTTCTCGGCAATGATACTAT
TGCAAAGATGATTGCACATGGCTTTTCTTTTTTTGCCTCTGGCCTTTCAG
ATGTTGGGGGTCAAAGGAGATGTACTACAAATGACCCAAATCATTAAAAT
GGTTGCAAACTCAAATTTGTAAGACATAATTATTTAAAAAAAGAAAAAAT
GTATACCTATATTGGTCAATCTATACTTATATATTAGTAGTGTAATTTTA
GAATGGCTAGTTTTAATTYAATCACGTAGAAATTAATTCATACAGTGTGT
CTTTGCCAACCGTAAAATAATTTTTTCTGACCGTTACTTGATCAAGATTA
ACCAAAATAAAAGAGTCTATATATAAAAGATTAATCTTGAATCTGGCCAC
CCTTCCCCTTTATCATGACCTCGGTCCTACGCATCCTTCACGTACCCCTC
CGACATTTTAGCTCCCCCTTCTCCTCAGCAGCTCTTAGGACATCCACATA
ATTATTCTCTTGAACAGAAAGTGTAGGGTTTTTTTTGTCTTTTCAAGAGA
AGGATATCTACTTAATCGATAAGGACTTCAAAAGCAATTCATAGGTTAGA
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CTCCACCTGACTATTTAAAAGAACATTAATAAAATAACGGGTAATTTTCT
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ACCCTATATTCTTACCATTTTAATATATATTATCATAATGAATGTACATA
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AATATTAATCATTAACCCAAACAATTTTTGACAGTTTAATAAAATGTTTT
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AAGTAAATATTAGACAATACTATTAGCTAAATATCAACTTTTATCATTTG
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TATTATTACATTATAAAGTTATTTAGGGTGATCCTGTCTTTACAATAGAA
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TATTTTTTTATCCACCTCATAGTCTGCTATTACTAACTTTCAAAAGAAAG
CAGTCAAGTTTACATGACAATCAGGTCTTTAGTTTGTTAGTTATGGTGAT
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TTCGACCTTATATATTATGTATAATATTTTCCAAGCAAAACACAACTTTT
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AACTTAGTATACAAACAGAACATATCGACAAAAAATCCAGATAAATTAAT
TTGTTTTATAAAAGGTGTATTCATAAGTTAAGAATACCAAAGATAATTTT
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CACTTATCTAGGTTATGTTTAGTAAGTAGCATCTCTTGAAAGAACACACA
CCATCTTTCAGCTAGATCAGTCTAATTCAATCTGCTTGGCATTCGTTTAA
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ATCAGCCCACAAAACAAGCCCTTTAAATCCCGAAAAGGCCCCAGCTCACA
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CACCATATTATAGATTTTATGAATGATTTTCTCGGAGAAGTAACCACAAT
AGAGCGTCAAGAACGTTCAACATCACATGTTCCAATAAGGCCATTCCGAA
AATTTCGTAACCAACTGTTCTAATCGAAGGTGCAGAGTCCAACTAATGTT
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TCAGGATTACTTTCCCATTCACAAAATGTCCAGGAAATTGTGTGCGACAT
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TAGAAGAACCATATTAGGGGCATGCGATGGTMAAGCCAGTCCCCCAACCT
CAACTCCATAGAAGTTTTTATTAGTGACCAAACGTTAAAAAAGGAAATGT
AATCAAATACCCCACTTCTTACTGTAATAATGATACTTATTGTCGTGAAC
AAAAGTACTCCGTTGTACAACATATTAAATATTAACTACTCATCATAAGA
ACATCTGTTGTTTATTTTGTCATCGTAATAAATGCTGAAGAAATACAGAA
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AGACTATGATTAAATATTGACATGGACAAAATATTTTTTTATCATTTCTC
TTTAAATAAATAACACATTCTTAACATAAAAGCCCCTTAATTGTTTCCTT
TTCAGACAGGAAAGAAGTCATTATTCGATCGACATCTCAGTCATTCCAAC
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AAAAATTGCAACTAATGTTCTTTAGACTATGCATTATAGAATTGTAAAAA
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TAATTGTATTTTTAAAAGCTGTAATTATTATTTTGCATTTATTTATGACC
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TGACGGCAGCTAAGCTGCTCTCCTTAAAAGATGTATTTTGAAGTTTCTTT
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TACTGAAGAACTAAAGGAAATATAGACTATTGTATGAAAAGAACATTGTT
ATGCAATCTTAATTCTATAATTTTTGAAAAATACTAACACCATCAATCAA
TAACTAGATCCTCTAGGCAGCAGTAGAAGTATTTGGTAGGAACATGAATG
ATAAACATGTTCCATTTTTCAAGGGAAAAAACGTATGTTTGAACATAGGA
AAATTAAAAACTTCTTAATTCAAAGAAAGATAAAAATGGTGCTTTAAAGA
ATATTGAACAGACGACTTGAAAATCTCGTTGATATTTCACAAGATATCTG
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CCAAAAAAGACGTGCAACCTCAAAAGGTTGGAAAGAAACTCTTGCACACC
CTATATCAGAGGAAAAGTAAAATTTAAAAATTGCGTCAACACTTGATAAA
TATTCTTCCTTAATCTACACATGTAGATCTAAAGAAATTACCTTTCCAGC
TGGATTGGAGGAAATGATTGGGCGTTTATGAGCATTATAGACTAATTAAT
TATATTTTACAGTATTTTTCTACTGTCTTTTAACAATATATAAAAATCAA
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TTTTCTTTTGTACATAACAGTCAGATGTTTACTTATTTTTTAATAAAAAT
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ATATTATTTACATATAAGAAAAAATTGTAGGGTAATGGGGTTATTTATTT
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ATTTTAACTACATATAAAAATCTATTAGTGATGTGACGGCAAATTTACTT
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TGTCATTATTTAAATCTGTTTCAGATAAAATATTTTTCCTATATTTTGAG
AAGAATTATTTTCATTTACTTTGTATGTATAAAGATAATTATTGAAAGAT
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TCATATCATAAATTTACCAAATGCTTGTATATAAACCTTTTTTATTTTCT
GAAAAGAGTTTGTCATATATATTTACGTATTCAATTTATTAGGGAGAATA
ATACTTTGTATAAAACTTTGAGTTAAACACAAATTCTGGAATAAATGTTT
CTAGTTTTAAAGAATGTTATTTCTAATTCCAACGATGAATATAAAAATAG
GAAACACGGTTGGGAGATGTCTTATTCCATACAGATCATATCTTATTTGA
TATTAATTAGTTAATTTAAAAATAATTTACCCACGAAATTCAATAAACTC
TATCATTTTCTTCTTTAAAAATATTTTTTAATTATAAATTCACAGGCATT
GAAATTTTTTTGTAGTAAAGTAATTAATTTTTTACTGTTAATTATAATAA
GTGTCCTATCGAATACGAATAAAAAAATGTATATAGGATTGGGTAGCAAT
ATGTTAATTAATACTACTTTTCTCATTAATATAGAAAGGTTTAGTGATCA
TTTTTTAACTATGACTTGTTCAGTCATCCTTTGTACATGAAAATACATTG
ATAAACATTTCTTCACTTGTCATGTTAAGTGAGCAGGAAGCCAAAAGTCA
GCACATCTCAGATCTCCTAGATGCTGAAATGGAGGTGGCAAGCATTATCT
ACATTTTGATGTGCTCCAGGAGTATGGTTTTGAAGTTTTACCACACCAAA
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GTTTCCAGGTTCTTCGTGTAGGACAGGCAAAAATCGCCAAAGAGGCCTAC
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GGTAACTATGTGGGGACTTTCTCACACCTCTGCCAAGGGCAAAAAGAGTC
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AATGATCTTTTATAAATACAATGAGGCTACTAATAAAATCATGTCACAGT
TGTTTATTTTATTTTTTTTTGCTTCACTTTGACAAAGAGTAATGATCATT
GGATGACTTCTTTTTCGAATGAAATGTTTTTTGTTTCGTTTAATCATAGC
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TTAAATGTTTCAACATCAAGTTCAATCTGTACTTTACAACATTTGTAACA
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TAATTTAATAAGTTTGAGTTCCATAAAAAAGTTTGTGGAACTGTTTGAAT
TTTTTCCCAAGCCTTGTACTTATCTTTAATAAAAATGTACAGTTAAAAAC
GAATCGATAATTTATCTTTCCCATACTTGATCATATTAGAAAAGTACTGG
TCCTTAAATAGGACTTACCCCTTTGTCAGTAAACATTCTTNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTTACATGATATG
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TATAATAAAACTATAAAACCATAAATCAATGAACACAACCACACAAACAG
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CATTCCATGTTGCACTTGTGCTCTTCCATTTTCTGAGGTGACCTAAGAAA
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CAGACTAGACAAGCATCACAGTGTTCAACAAAATGAGATGACAACTCTAG
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CAAACATTGTGGATATTTAAAAAATTTGAGTAAATGGCATATTATCTGAA
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TAGCAAAATTGTGGGCTGAAAAAATTTCCATTGAGTGTTTAAATAAGCTA
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GCTTAAAAGGGAGCACTGGCTTTAACGAAAAAAAAAAATCAACAACATTM
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