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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s170 | supercontig | LSalAtl2s170:743180..756466 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003004 >EMLSAP00000003004 ID=EMLSAP00000003004|Name=EMLSAP00000003004|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=154bp
MIRNSRIKKELEMLXKNPPPGVSCAAPDNGNLTSLEANILGSEDTPYEGG
LFKLSIHIPETYPFQPPIVQFKTRIYHPNVDAAGRICLDLLKIPPKGSWK
ASLNISSILMSIRLLMNEPNPDDPLMAEIAEVFTKNYETYKKRARDWTQK
YANG back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s170:743180..756466- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003004-698851 ID=EMLSAT00000003004-698851|Name=EMLSAT00000003004|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13287bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s170:743180..756466- (Lepeophtheirus salmonis)
CTCAGTTCAAAAATCCTTTCAGTGTACTGTTGCTTCACTCAAAAGTCAAC
GAAATGATACGTAATTCCAGAATTAAAAAGGAGCTTGAGATGTTANAAAA
GAATCCACCACCCGGTGTATCCTGTGCTGCGCCAGACAATGGTAATTTAA
CATCCTTAGAGGCCAACATCCTTGGGAGCGAGGATACTCCTTATGAAGGC
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AATCCGCGTAATGAGACGGTGAAATGGTTACTTGGGCTAGCTTGTAAAAG
TTTGGTACAACCTGTAAACAACACATATAAAAGGTATATAACGCTTTTTT
GGACAGTATTGCGCTTGGTTGGTTCAGTCGTGAATTATCGTGCGTCGAGT
ATGGAGGTCTCAAAGGAAGAAATTTGCCATATTTTATAAGAAAAATTACG
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ATGCGCCGCGCCACGCCTGTCGTCGAAAATGTCGAGTGAATCATACTAAA
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ATGGTCAACGCTCTTGGTGGTAAAAATTTCGCCTCAATTGAGGGCTGTGA
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GGGTCTTTATAAAATTGGATTCTCATTGGYAACAAGTTATCGGAGGGRTC
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ATTTCCAATACTTTTGTCTTGAACTATTATGCCTCAGAACATTTAGCTTT
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GGGTTAGCATCGTTATTGTTTATTTTTGGTTGAATTTGATGTTCCTTTTG
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TGGTTGTTTTCTTTGGACAAAGGATGGAATTATGGTCTTTCCTTGTATTA
GGATTTTTCATCAATCCATGAGTATTTTCTAACATGAATAATCTATCATG
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TCGTTGTCCTGTTAGTTTATTTTTATTTTTGTTATTATTCTAATTTTATT
AACTATTTTGTCTATGGTTCGAACTCATTAGTTTTCGGCATAATTATAAC
GAGTGATCCATTAAAGTCTGAACACTTTGAATTTTAAACTTCTATAAGAT
ATATTATGTTAATTAACAAAATAAATACTATAAATAGATGTGTGTCTGAG
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GCTAGTGTCTTGAGTGGCTTCCCCACCCTCACAGGCTCTTTCCACGCACT
TTTTTGATAGCTCTTTGAACAGTCTGGTGTGAAATTTCGATATCTCTTGC
ATGATCCCTCATGGATTTGAGGGGATTGTCCTGAAATGTTTTATTTAACT
CATCCGGGTCCAGTATGTCCTTTTTGAGAGAGCYATTCTTTCTCTTCAAC
GTTTCGTTCTTTCTGACGGCGTAGACTGCTTGGAGTGTGTGAAGGGAAAT
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TTACTAACTTCACCTTAATTAATTATTCAATTAGTAAGCGTATAGATTTC
AATGGACCACCTGGTATCATTATTTTGCTGTAATAATTTATCTAACTCTT
GGACTCAGTGAGTAGTTCGTTTGCATACTTAGAAGTGAATTTGAGGCCTC
TAAAGTCATGCAGACGAAGTTCCCAACACACGTAATGGTGTTTGGGTGGT
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ATGACTACCTTGACGTACTAAAGACCAAAGTGAAGCGTTGGATCTGTATG
GTTGTCAATGGGAGACCTTATATGTGGCAGCAGGACTTGTCTCCCRCCTK
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GGCTATTGTAGTACACTATTCGATCATAAATATTAATAAAAGTGGGGGAA
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GAAAAATGTCCGAGCTACAAGCAAAGCGGTAGAGGGTATACTATCTCCTC
CGAGCACCAGTCGATCTCCAACAAGAAGATTTTCATATTGGACGCTGTTC
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GGAATCTTCAGGACCAAACATCCAGCTCAGGTCATGATTCTCGGCGTAGT
GGCGTCTACTACAAGCTCCTCAGGTATCATGTCTTGCAATACTTGAAGAT
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ACACATTCAAGTAGGTGCAGCATTTCTGTAGGGAGAACAAGGCTACCTTC
TGGCCGGGAGACTTCTTGCCTTCGTCCTCATCCGATGTGTACCCCTTGGA
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AAATATCGATGTCCTGAAGGCTGTGATCATGCAGGAGTAGAACAACTTAT
CGTCTGACTTCATCAAGGCCAGCTTTGCTTCTGTTCTTTCCTGCATTGAA
GCGATCATTCAGAATGGAGGGGGAGATATTGAATAAAAAGTGTAGAAAAT
GGTCGAATTTCCAAATTTTGCTTCAAAAGTTTGCCATAAAAATGGCACAA
AATAAAATTTTGGAAAAGTAAAAACGGCTTTTAAAATTTTCTAATTTTTG
AGTCCTCATCACCCTCTATGCCCTTAAAAGGGTTGACATTCTGATGGCAT
ATGAAAACGCTCATTATCGATAGTTTGCCCTACTATCGGTGGTCAAGGAA
AAACTACTTAGATAAATGATTATTTTCAAATGTTAAATCCAAGAATATCC
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ATGTATATTATATCAAAAGTTCATGTCTATCAATACTTCATAAATCAATA
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ATTTGCCTCAGGGTTAGAAAAACAAAGAAGTCTTTGTTTATCTAAATGGC
AGGCATAATTTTTGGAGATTTTTACACGCTCAAAGAATTTCCTTGATCAA
TCTCCCCTGATTAGTTTTTCATGATAATTCAACCCATGGTTGAGGTAAGT
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GTATTTAATTATTTTTCTTTAATTGAAGTTGAGTGAGGCCTTCGTTTCTA
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TGATATTTTACCTACATAACATGGACAAATTTCCAATAAAACTTAATTAA
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GGTTATTTCCACTCACTTTTTTAATAGCTCTCTGGACACTCTGTTGCGAA
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GCAATTAAATATGTTCGTATTATAAGGGAAAAAAACTAATATTTTTTGCA
AGATATGCGCAATAATCTTAATAAATATTTCCTATATCTTATTTGGCTTA
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CTTTTTCTGTTTAGTGCAAACACATCCTTGATCGGAATTAAGATATTGCT
TTTTCCTTGATTTAGAATGAAATCTTATTTCAAAATTTAACTTGTATTAT
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GCTGCTTAATACAAATAAATCCAAAAAACTCGTCAAGTCTTTTGTATTTT
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TTAATATTACACCTTCCAACAAGACATTGCACCTGCCCACAAGGCAAAGA
AAGATGTCTTGGCCACAAAATATCCTCACTTTTGGAGTCAAGGATGAGGC
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TTAATATTTTACCCATTTCTCCGAACCAAACTGTAATTTTTGATATTTAA
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