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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s175 | supercontig | LSalAtl2s175:248607..262887 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003133 >EMLSAP00000003133 ID=EMLSAP00000003133|Name=EMLSAP00000003133|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=678bp
MSKDTENHKDSENVKVIVRVRPLSEKELESGFQCIIDVDPIQGAITLHNP SNNINTRETPPKQFNFNTVFPPDVRQMDVYNRVARPIVDNVLKGYNGTIF AYGQTGTGKTFTMEGDRSVSELKGIIPNSFAHIFGHIAKQEDDIKFLVRV SYLEIYNEEVRDLLGKDQKMRLEVKERPDIGVYVKDLSAFAVNNADDMDR IMTMGNKNRSVGATNMNAHSSRSHAIFSITIECSEKGPDGQQHVRVGKLH LVDLAGSERQSKTGATGVRLREATKINLSLSTLGNVISALVDGKSSHIPY RNSKLTRLLQDSLGGNSKTLMFANVGPAEYNYDETLSTLRYACXAKNIRN YAKVNEDPKDALMKQYQKEIGELKRMLREEESSPEDEEGSDEISDIEEDP MNNNLKKCKIEEKRQLIEDERKKLKEAKNMAEEERDRLQTALLNHEHKLS TLEKKIIVGGENLLEKAEAQERLLAENANQLAETIAKENNLRNKLKEKEA ERLDIEEKYSSLQDEAAGKTRKLKKVWTMLQSAKSELVDLQQEQQREMEG LLDNVRQLTRELRLQMLVIDSYIPSEYQALIERHVQWNEDIGEWQXRCVA YTGNNMRKRSMPTEKKKKRKQRGTGGGHNAAGDWQNMINLELSKLYKEYE DAVFDRPKTAGGNRRPKSSRSHRRMNNN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s175:248607..262887+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003133-698980 ID=EMLSAT00000003133-698980|Name=EMLSAT00000003133|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14281bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s175:248607..262887+ (Lepeophtheirus salmonis) ATCTATATTATTATGTGTGTCTCCAACTAAATAAGGATTATGTCATACTA
TTATATACAGCATTCCTATGAAGTAAGTTAGGGGCTCTTCTTCTCCTTTG
CCTTACTTCAATTATAAAAGGAGTAATATGCTGATTTTTTATTCGTGGAA
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GTTCCCTTTCACTCTAAAGTTTGCTCATTATTGGGTTAAAAAGTGAATAA
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ATACAATCCATTTGATATTGAATATTTTGTATCAACTCCAACACATTTTG
ATTTCGAAATACATACTTCATTTTTTCTTGAGTTCTTTAGAAATGATACG
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CTGGCGTTCCGTTTTATCTAAAACCATATTTTTTGAAAACGGCTTGAAGA
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AATTAAGAGGAGTTAATTTTGTATGCTCTCATTTCCCACTTCATTAATAA
GTAGACTTAGGATTTGTGGGTGATCGCCCAATCGCTCAAAAAGTTGATCA
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GAAAAAAATGATTTTGTCTGATCAGAAAATAAAATACTATATTATATCGA
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GGGTACCCTCTGCTAGTATCCTCTACAGCAATGTTTCTCAAATGGAGGTA
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TTAAAGAACATTTTACATGTGGTAGATCACAGAAGCTAAAAATGATTTGT
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GAATTTTTAGTAGATACGAGCTCTTGGCAAAATGGAGAAAGATACAGACT
TTCGAATTAAAATAAAAGTTTTAAAGACAGACAATAACTATTTTTTTAAT
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CAGGGTATTAATATCAAAAACAGAGATTGATACATAATTTAATTATAAAA
TAAAAGTTGTTCGGAATTGTGAGTTACGTACCTAATGCCATTTTTAATTC
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ATTATTGTTCTACTTCGCAATCACAATAATACCCTATGTATTTTTTTGTC
AACCGTCGAGTCCTTCTTCTCTATTGATACGTCATGCCTATTTCATAATT
TATTCTTATCATAATTATACAAAGTAATAAGTTATTCTATACTTATGTTT
TTTTTTCCAAAAGAACAGAAATACAATTTCTTGTTGATCCCTCGTCGCTT
ATTTAATATATTTATTGGCTATTTTAATAAAAAAACCAATAAAGGCATTA
TGGCTATTTTTTCATAGAAATAATATTGTAATTATATAATTAATCATAAC
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AGAAATAATATAACGGTGATAGTCTTAGCGTAGGTAAGAGATAAATAGCA
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GTTTTTATAAAAAAAACTCAATAACTATTATTTTATAAATTAAACAGAAT
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CAGGGCCTACCTGACTGAGTCCAGCTAGCAGTACTGGGGTTCTGTAGTGA
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TCCCATTTCATTAGTTTTAGTACTGCAATAGTACAACGCGGATTTCCAAT
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AAAAGAAAGCTCATATTATGTTTAAGGTGTTTTATATCCAGAAATATCTA
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ATATATTTGGTCATATCGCAAAACAAGAGGATGACATTAAATTCTTAGTT
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TAAAGATCAAAAGATGAGGCTAGAAGTGAAGGAAAGGCCTGATATTGGAG
TGTATGTCAAAGATTTAAGTGCATTTGCAGTGAATAATGCTGACGATATG
GACCGTATTATGACAATGGGTAATAAAAATCGCTCTGTTGGAGCCACAAA
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TTTTGTACATGCTTGAATCTTTCAGATCACACGCAATATTCAGCATCACC
ATTGAATGTTCTGAAAAAGGTCCTGATGGTCAGCAGCATGTTCGTGTTGG
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GAGCCACTGGGGTTCGCCTTCGAGAGGCAACTAAAATTAATTTAAGTCTT
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AACTATGACGAAACTTTAAGTACGCTAAGATATGCTTGCSGAGCCAAGAA
CATTAGAAATTATGCTAAAGTAAATGAAGACCCCAAAGATGCTCTTATGA
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GACAATTGATAGAAGATGAAAGAAAGAAGCTAAAAGAGGCTAAGAACATG
GCTGAAGAGGAAAGGGATCGACTTCAAACAGCACTTTTGAATCATGAACG
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TGTACCTATTTAATTTAAACTAATCTTAACATGGGCTAGTAATACTATGC
GACAAAAATTTTGTTCATTGTGTGAAACCCACATTCAATACTTATTTAAG
CCATAGAATACAAAAATGAGCAGTAAAATATTCAACATTTTATAAATTTG
GCCTTTAGAGCTTTTTTTCAAAAAGTTTAAATAGAATAATTACGATTTTC
AGTCATATTCCGACGTGAAATAACTACGAGTATATAGATGAAAATTAAAC
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ATAGCAATTCCTAAAAAATGTATCTAATAAAAGAAATATATTAATTCAAA
GGATCTGTTTAAAAATTATATTTTTTCATTATTTTTCAACTGTTTTATAT
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AATAAGAACTCATTCAAGTTTAACTAATTAATCATCAACACACAAATAAG
AGGAAGATAAGTAGAACAATAGACAGCTGACAAAAATAAAACGTTAATTT
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AAAATTGAAGAAGGTATTAATTACTAATTACATTCTTATCGAACAATGAT
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AGGGTCTTCTCGATAACGTACGACAACTAACTAGAGAGCTCCGACTCCAA
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GAGACATGTACAATGGAATGAAGATATCGGAGAATGGCAGSTTCGTTGTG
TWGCATATACTGGAAATAATATGAGAAAAAGATCCATGCCTACTGAGAAG
AAAAAAAAACGAAAACAAAGAGGTACTGGAGGAGGACACAATGCTGCAGG
GGATTGGCAAAATATGATTAATCTTGAACTCTCAAAACTTTACAAAGAAT
ATGAGGACGCAGTCTTTGATAGACCAAAAACGGCTGGAGGGAATCGACGA
CCCAAAAGCTCAAGATCTCATCGTAGGATGAATAATAATTGAGGTTATCT
ACTACGGATAATATTGCATATGTATTTAATTGTTAAATGAGCACTTTATT
TATTAAGTTATTTCAAAATTTTGATCCTACATTCCATTCATATTATTATA
AATAAAATAAGTATTATTTTTGGACCCTTGAATAAATCACGGGATGATAA
AATACGGCNAAAAATATTTCGATAATTTACATACAAAATAATAATTTTAA
CCGATACAATACATATTAATCCCAGTCATAAATTTCTATTAACCTTGTTA
TATTCTAGAATTTATGTTATACTTTTTCACATCGACTTTGTGTATTTCTT
ATACATTCCAATTAAATTTATTTTTCATTAATAAATTTTTGGTTTGAAAA
GTTTAAATAAACAGGATATGACTTGCAACGATAATCATCAGAATCCAAGT
GACTTATAACTCGTTAGTAGTATTCCATTCCATATATTTTACAGCTAATT
CAAGGTATATATTTTGAGTATTTTAGTCATCACATCTCAAAACGGATGAA
TATCAGGACTGACCGTTATTCTAAGATCTCAAAAGCCAGTGGATACATTG
GATAATACAATATAGACTTTTTGGAGTATGC back to top
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