EMLSAT00000003133, EMLSAT00000003133-698980 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003133
Unique NameEMLSAT00000003133-698980
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s175supercontigLSalAtl2s175:248607..262887 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003133 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003133EMLSAG00000003133-685899Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000013716EMLSAE00000013716-722644Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013717EMLSAE00000013717-722645Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013718EMLSAE00000013718-722646Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013719EMLSAE00000013719-722647Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013720EMLSAE00000013720-722648Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013721EMLSAE00000013721-722649Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775259auto775259Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003133EMLSAP00000003133Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003133

>EMLSAP00000003133 ID=EMLSAP00000003133|Name=EMLSAP00000003133|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=678bp
MSKDTENHKDSENVKVIVRVRPLSEKELESGFQCIIDVDPIQGAITLHNP
SNNINTRETPPKQFNFNTVFPPDVRQMDVYNRVARPIVDNVLKGYNGTIF
AYGQTGTGKTFTMEGDRSVSELKGIIPNSFAHIFGHIAKQEDDIKFLVRV
SYLEIYNEEVRDLLGKDQKMRLEVKERPDIGVYVKDLSAFAVNNADDMDR
IMTMGNKNRSVGATNMNAHSSRSHAIFSITIECSEKGPDGQQHVRVGKLH
LVDLAGSERQSKTGATGVRLREATKINLSLSTLGNVISALVDGKSSHIPY
RNSKLTRLLQDSLGGNSKTLMFANVGPAEYNYDETLSTLRYACXAKNIRN
YAKVNEDPKDALMKQYQKEIGELKRMLREEESSPEDEEGSDEISDIEEDP
MNNNLKKCKIEEKRQLIEDERKKLKEAKNMAEEERDRLQTALLNHEHKLS
TLEKKIIVGGENLLEKAEAQERLLAENANQLAETIAKENNLRNKLKEKEA
ERLDIEEKYSSLQDEAAGKTRKLKKVWTMLQSAKSELVDLQQEQQREMEG
LLDNVRQLTRELRLQMLVIDSYIPSEYQALIERHVQWNEDIGEWQXRCVA
YTGNNMRKRSMPTEKKKKRKQRGTGGGHNAAGDWQNMINLELSKLYKEYE
DAVFDRPKTAGGNRRPKSSRSHRRMNNN
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mRNA from alignment at LSalAtl2s175:248607..262887+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003133-698980 ID=EMLSAT00000003133-698980|Name=EMLSAT00000003133|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14281bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s175:248607..262887+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATCTATATTATTATGTGTGTCTCCAACTAAATAAGGATTATGTCATACTA TTATATACAGCATTCCTATGAAGTAAGTTAGGGGCTCTTCTTCTCCTTTG CCTTACTTCAATTATAAAAGGAGTAATATGCTGATTTTTTATTCGTGGAA GTGAAGTAACACATTTAAGGTATTATAAGAAAACAAAAGCAACAACAACT ATGACATTTGACTGCAGGAGTAAAGTGTTTCAACATGAAGAGGGACTTCA ATTTGTGGACTAGGATTCATTCTTCAATTACTTATAGAAATAAGGAGGAA ACATGAGTAAAGATACGGAAAATCATAAGGTAATCAGTATTCAAGCAAGT TTAGGCATTCAATAATTTTAAGAGAGGGCGCTTTGTGTTTAGTTATAAAT AATATACTATAGTGTTACATTCCCTAAACGTACTTACAATAGCTAGATGA TAGTACTACGTATTTAAATAATTTGTCAAAATGTCGTCATTTTTTTAAAG AATATGCACAACTTTTTAGTGAAATGCTCCTATTATAACAGTAAATTGGG ACTAACTTTCGAAGTCTCATGATTCTTTTTCTGTAGTACATTCAAATACA TGCTAATTAGATTTATATGTTCTGCAAATCCATGACATGTGTTTAAGACG ACTAATATATTCATGCATAACATATTATACTCATTCGTGTCAATCAGTGT TCTGTCAATCGATGTTATCCATATTTGTGTACTAAAAATACAAATGACAC ACTTATTAAAACTAAGTTATACACGCCTTAGAGATGATGTCAACTTCTCT TTCAAATCAAAACAAGAAGTTGAAAGAGGGTGCGGTTAAGATTCAGAGTA TATTCATTCTGTTTAGTAAGATTTGTGTTTTATTTGCCTTTAAATATAAT TTAAAATCAATCAAAATATTTTAAGTATATCTCTGTGCATAAATAGAGGA TCTTTGATGATATTTTGTCCTTACTTAAATACTTTTTTTTCCAATTTGCT CTTCTTCAAAAATTATAATATAAGCAGCAGGTACATTTTGAAACTTTTGT CCACAGTAGTACATGGCTTCATTACAAAGGTGGGCGTTTGGAATTATGTC TGTATTTTAAAGACTTGAGACTTAAAATAAAAGACTTGACTTGGACTCGA AAGCTACGACTCAAGATTTTACCGGACTTGAGGTCTTTTTTAACACTATT ATCAATTTTTTCACTTAATATAAAGTACTCTTCAAAGGAAGTACCTTTAA TAGACTAAAAACTCAATTTGAATAAGTAGCAAAATATTACTTAATAATTG AGGTTTGGTTCTAGGCATTAATTTTGAACTATTAATACAATATAACCCAG TTAAGAATATTTTTTTATAATTACATTTATGAAAATCCCAAATTAACAAT AATAGAGAATATAATAAGTTAAATACGATGGATTTCTTTTATAGCAGTAA TATTTCGTCGGTCATTTGACCCTTGATTGAGATTCGGCTTAAGTGGGTTA TACTGTACTCATTCATATAGGACTTAACAAAATGAATTAATACTCAAAGC AACAAATAAGTAATTATTCACTTGACTTGAGACTAGTTACCAAAGACTTA GGGCATATAATATATGGACTATATCCACCCTCTGCTTCATATAATTGCAA TGTAGATTTAACAAGCATTACTTATTAACACAGTCCTAATTCTATGTATA TTATACATATACATACATGTACAAATGAATATCTATATATGTAGTTACTT AGTCGGTATTATGACACAAAATTGATTTTATACTCTATGTATTTTTATTA TGTAGCTTATTGATCCAACTTTTTCTTTTTTCTAAAAACTTCAAGTAACA TGCAGAAGATTACACATGTGTATGTTTTTTTTAAATGTTTATAGAGCTCT TTCCTGGACACACTTATATAAAATCCAAAATAGATTATATAGTATACAGT GGTTCTCAAGCTTGTTAATTTACGTACAAATTGAGAATATATCCAGAGCT TCAAGTCAATTATTATTTGAATTTCACAATTTTTGATATCATGTTATGGA ACAAAATTTGGACGACCTATATCTTATATATATTTTTTTTAATAAAAGAC GAAGGACTTAATGACCTTTTTTCTATATAAAAAACATATTCAGGGCCGGT ATTAACATAAATGGAGTCTGGTTCAAAGATAAATGATCCTTTTTTTCATC TTTTTCAAAAACTAATTTAATTTTCCTTTTCACAAATAACCTTTTTTTAA GTATTATCGACCTTTTATAATTTTTTTTATTACTGTTTTTTTTAGAAAAG GTCGATAGGGCATGGACAAACTAAAAAGTATATATTATCCACAAGGTGGC GTGATAGCCTGTTGTTTGTTCTTTTTAAAAAAAATGCATTCTGAAAAGTG TTTTTAGAGTGCACTCCTTGTAAAAAACATACACCTATATTTATATTCAA TAATATTTAATTATTTAAAATTCCAAATATGATATATTTTGAAGAAAAAA AATATTTTAGAAAGTAAATAAAAGTAGCTTCAGACTNGTATATAATATGA ATATTAAATTAATATTGCGATCTCTTATTTGAATATTCTTTACATATAAT TAATAGATACAATTTTATGTATTCAAAATATTTACATAATCTATAGAAGT AAAAAAACTATTTGAATCGCATGAATTGAATATTTAAAAGTATATGGCAT ATAATTTAATAGGTTACTATATTATTTGAACAAGCATTGGATTACATATT TACTTGAATAAAAAACACATTGCTCAAGTATTTATGAATTTGTGAAAATT GATTACTGTTGTCAGGAAACCCATATTTTCGTACTGGTTCTGATACCAAA 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AAAAAAAAATCGAAAAATTAAATCTTTTTGAAAAAAAAATCGAAAAATTA AATCTTTTTGAAAAAAAAATTCAAAAATCAACAACTTTCACAAAAAAATA CATTTTTTCGAAAATCATTTCAAAAATCCATTCATTCTGAAAAAATTATT ACTATTTTTTTTTAAATATTCCAAAAATCCACAGCTGTTCACAAAAAATT TCATTTCAAATATAAATTTTAAAAAACAATCAAATATAAACTTAAAAAAA GAAATCAAATATTTCATTTTTTGCACAAAGGTATATTTTAAATCTATTGC TATTTACAAAAAAATTTTTTTTTTTTTGAAATAAATTTCAAATATTAAAT TTTTAGTAAAAAACCTAAATTTCTTAATTTGCGATGGGTCTTTAGCCCCA CCAATCCACGTCCGTCCGGACGCCCCTGGCTTACAAATTAATGAAATTAA ACAGAGCGCATTCCCCATTGGTAGTAAATATCCAATTATTACCAAATGTA GGGATGTTCTTCATTTAATAGTTTTAATGAACCGTTGACAGCTTAACGAG AAATTCATGTTCAACGATTAAACGTTCAGATCATTAGCAATTAGTAAAGA AAAGTTTAAAATCGACAGCCAACAAAATAACATAGGAGTAGTTGATGCTT CGGGGATACACCATTGAGAGAAATCAAGTGTGTTTTAGCTAAAAATATTT TATTTTGAATATTTAATTATTATAGGTTTTAAAAAAATGCGTTTCTGAAT GTTCCCTTTCACTCTAAAGTTTGCTCATTATTGGGTTAAAAAGTGAATAA TCTACTTTGATTTATTTAGGTATACTTCTTATATATTCATACAAACCATC TATTAATTACAAATTATATTTTTACTTGTTTGTAACCTATTCATGATTTT AGATAATTTTTCCTGCATGAGGAAAATTGATTATTTTACATAATTCTATG 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TTCTTCCTTCATTCTTTGTTTCTGTTCCTCTCTATTCAGCCCTGCAGCGC GGGTACCCTCTGCTAGTATCCTCTACAGCAATGTTTCTCAAATGGAGGTA TGCGTATTCTTTGGGGGCAGTTGGAGGTACTCCAGGGTGTACCTGAGGTT TTAAAGAACATTTTACATGTGGTAGATCACAGAAGCTAAAAATGATTTGT ACTGGTAAGGGGGTACTTGTGTTAAATATATATTTTACAAGGTACATCAC CAAAAAAAAAAGTTTGAGAATCCCTGGTCTATATTATAATAGAAATTGTG GAATTTTTAGTAGATACGAGCTCTTGGCAAAATGGAGAAAGATACAGACT TTCGAATTAAAATAAAAGTTTTAAAGACAGACAATAACTATTTTTTTAAT CCTACAACAGATATACAGATTATAGTTGTATGTCAGCTGATAAAAACGCG CAGGGTATTAATATCAAAAACAGAGATTGATACATAATTTAATTATAAAA TAAAAGTTGTTCGGAATTGTGAGTTACGTACCTAATGCCATTTTTAATTC TGAACAGACCAGATTCCTGGTCTCTGGAGAGCAAGTATTTTGGGTTTTTT TGCTAATAAATTAATTTTTTTCATAAGACAAGATCTATTCCCCGAGAATC AACTTCATTTGAGGTAGGGGTTGTCGCTTCAAAAATGAACCAAAAAACTA ATTATTGTTCTACTTCGCAATCACAATAATACCCTATGTATTTTTTTGTC AACCGTCGAGTCCTTCTTCTCTATTGATACGTCATGCCTATTTCATAATT TATTCTTATCATAATTATACAAAGTAATAAGTTATTCTATACTTATGTTT TTTTTTCCAAAAGAACAGAAATACAATTTCTTGTTGATCCCTCGTCGCTT ATTTAATATATTTATTGGCTATTTTAATAAAAAAACCAATAAAGGCATTA TGGCTATTTTTTCATAGAAATAATATTGTAATTATATAATTAATCATAAC TGCTCTTGTAATGAAATATTCCTAAGCAATAGTATAATACACTTTCGAAT AAAGTACTATGTAGATTTTAGTAATATTTAACTCATTTTAAAAAAGGAAA AGAAATAATATAACGGTGATAGTCTTAGCGTAGGTAAGAGATAAATAGCA GGTGGTAGGATTGACTTATTTGGCTAACTACCAAATGAATTCGGGCCTTT TTTCTGTTTCTTTTTGGAGGAAAGTCTGCGTGAAACAGTAAAGTTAACGA CGTGTCAAAAGAAAAATCGAGAACCTTTATTGAATTTTTGATTGAATACA AAGGAAATTGACTACGACAACAACAACAACAAAAAAAAAAAAGATTAAGA TATTGAGGTAGAAAGATAAACTATCTTTTTGCTCCAGCTTTGTTATTTTT GCATATATTGTAAAAGTTTATTTACTCGACAGTTTTTAATTGTATATAGA ATATTTATTATGTAATAAAATATTTTTTTCATCAAAAATTATCTCAAGAT TTTTTATTTTATGGCTGAGATTTTTGTAAAATTCAGGGGTTTTTTCTTGT GTTTTTATAAAAAAAACTCAATAACTATTATTTTATAAATTAAACAGAAT TGTTTAATAAGGGATTATTTGATGTCTTCAAAAAGCCTGTACTATCTAAA GCAACCAAGTTATGAATGGTTTTTGGTTTGTGCTTCAAATAATCAAATTT TATTATGTTTGCCTTAAACTTGTGGAAGTAAAGTATAAGTGCACTCCCCT CAGGGCCTACCTGACTGAGTCCAGCTAGCAGTACTGGGGTTCTGTAGTGA AAACCTAGACCTGTTTGATACCGTTATGATTTTTGCTAGATCGGACTGAT TTGGTCCTTTAAAAAGTTTTAATCTAGAATCATAGAAAAATTATTTATTA 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ATTTCATAATACATATACATTTTTATTTCTCAGATCAGACAATATTTATG ATATAAATCAGGGAGCATTCTATACAGAGCACCCTGTTACTGTTTTTCAT ACACACAGACAAACAGATAAACTTTGCTTCATTAATAAGAAGATATCCAT CTTAAAATGCCCTCCTATGTAGAATTAAAGAAATCATGCAATTTCGAATG ATAAATTATTTTAAGTTATAAATGTTTTGGTACTAAATACGTCATTTAAA TAATATACAATATTTTATCACTTTGTCGTAGGATTCCGAGAATGTCAAAG TTATTGTACGAGTGCGTCCACTTAGTGAAAAGGAGTTGGAGTCTGGATTT CAATGCATCATTGATGTCGACCCCATTCAAGGTGCAATCACMCTCCATAA YCCATCCAATAACATCAATACCCGAGAAACCCCACCTAAACAATTTAATT TCAACACTGTATTCCCTCCAGATGTTCGTCAAATGGATGTGTATAATCGA GTTGCACGTCCAATTGTGGATAATGTACTCAAAGGTGAGTCTCGTTATGA ATAATTTAGTATAACTAAGAATAGAAAATACTTTAGTCATTGATTATAGA TACTTATATAATTAAAACCCATCCACATCATTTAAGGTTACAATGGTACT ATATTTGCATACGGGCAAACGGGAACAGGAAAAACTTTCACGATGGAAGG AGATCGGTCGGTTTCCGAACTCAAGGGAATCATTCCAAATAGTTTTGCTC ATATATTTGGTCATATCGCAAAACAAGAGGATGACATTAAATTCTTAGTT CGAGTATCTTATTTGGAGATTTATAATGAAGAAGTACGAGATCTCCTTGG TAAAGATCAAAAGATGAGGCTAGAAGTGAAGGAAAGGCCTGATATTGGAG TGTATGTCAAAGATTTAAGTGCATTTGCAGTGAATAATGCTGACGATATG 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GATAATACAATATAGACTTTTTGGAGTATGC
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