EMLSAT00000003231, EMLSAT00000003231-699078 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003231
Unique NameEMLSAT00000003231-699078
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1783supercontigLSalAtl2s1783:184..17454 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003231 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003231EMLSAG00000003231-685997Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000014134EMLSAE00000014134-723062Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014135EMLSAE00000014135-723063Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014136EMLSAE00000014136-723064Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014137EMLSAE00000014137-723065Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto767891auto767891Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003231EMLSAP00000003231Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003231

>EMLSAP00000003231 ID=EMLSAP00000003231|Name=EMLSAP00000003231|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=293bp
MNPFSNRNNSGSLTGGTSSNVFPNEKVQGAFDVEIFYQIEIDSEEDMNIW
CSLELPEVGQKFLFLGENGSGVEDMSGDEDQEVSGSGXKEXLILPEGFDS
EIIESVKLNEIEDEMHKVFNETNSLSEQTAEEQETTNRELVKDNYILEDE
HIDILLKEENSTLEPSDKKEDATDKKQETTNKELVKDTDIAEDEEMIVLL
KEENSLLEZTAMKKEPTNKEENGWGVEVINGDEHLNQSGSGEGQTIHETI
DSEIIQLVKENHIAENDTMDILFKETNSILKKQQTKTRQLIRN
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1783:184..17454-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003231-699078 ID=EMLSAT00000003231-699078|Name=EMLSAT00000003231|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17271bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1783:184..17454- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATCCCTTCTCTAATAGGAACAATTCGGGCTCATTGACTGGAGGTAC GAGCAGCAATGTCTTTCCAAATGAAAAGGTCCAGGGTGCATTTGATGTGG AAATATTTTATCAAATAGAAATTGATTCAGAAGAAGATATGAATATTTGG TGCTCTCTTGAGTTACCTGAAGTGGGTCAAAAGGTTCAATTGGATTACGT TTACACATTTGAAAAAGAGGATGCGTCTGGAGATGAAGAAGGTATGTTCA ATAAGTTTACTAATACCTGGAGTGAACCAAGGGTCAATCACTTAACCTCA TGTAGGCAGATGTGTATTTTTATGCTTAAAAATCAAATGGAAAAACCTAA TTCACTTTGTACTATATTACTCCCTGTTTATAGCATCAACATCAGAGATT ATATATGAAGTAATGTGCTGCAATTAAAATCTCTTCCACGAACACAACAT CTTTGAAAAAAAAATAAAACAGTTTTTGATTTTAAAAAAATTTCGCACAG TAAGTGTTCAACCTGGAATTGCTACAGATATAACCTTTGACATTTTTCTA CAAGTCAGTTACAAATAAATTACCAAAAATAATGTTTTGATCAGAGATTT TATTCGTCAAATGTAGGCAATGTTTGGCAAAGGATTTTTATACAGAATGA AAAAAACATGAGTCGAAATACAGGGTGCAGCAAAATAACTTCTTTTTATA GGGTGCTTGTGGTTTTATTCCAAAATCGATATTCTAAAGTTTTTCTTGAA AACACAGTCAGTCGCTATCTTATGTTGGAGTAGTGAGGAGCTTACTTATA CCATCAAATAAAAATATCTCCAAAAAATGGTTTGCCATAATATATGTAAT TAGTTAATTTCTTCCATTTCTAATATACAAAAAAAAATGATAGTTCCAAA TTTGCAAAATTCTTTGAACGCAAATAACTCGACAAATGTTAGAAAATTAA AATTGGTTTGAACAAATTGAATGTAATGTAAAAATTCTAAATTGTTGAGA TTTGTCCAAATCAAGTCATGTGAAACAGATTTATTCCAGAAAAAAAAATT TAACACCTTTGAATACATAATTATTTAAGCACCTAATCATCTATAACTTC GCAATTAAATTTGTTGTCAATTTAATTTTGCATCTTTGGTATAGAATTAT TAGCCCTCTTATAACTCTTAACTTGAAAATTTATTTAAAAAGAAACACAA AAAATAAAGAAAGCACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATGAAGTCCTAGTAAAAGTTTT TCTACTCCTCTGTGATCATGACCTTCAGGGCATCGACATTCGGTTGAGAA GTCTTGTTCGTTTTACTTTCCAAGATGAATCAAACAAGAAAGTCCAGAGG CTCACGTTGGCTGAGGACGAAGTCCAGAAGTCTGCTGGCAAGAAGGCAGA CATGTTCTCCTCTGCAGAAATGCTTCATCTTCTTGGATGTGTGTACTGAG GCATCGTCTTCGGTAAACACATAATTGTTCCTGATGAACGTGCTCTTCAA CCATAGCAAGACTTTTAGCCTGAGGACCTTGTAGTAGACCTCTATGTTGA CTTTCTCGTTCACCTTGAACAAGTAGTAATGAATCTTGCTGCCATCAGAA CCACAACACCGAGGATCATAACCTTAGCTGGATGTTTGGTTCTGATGATT CCCTCAACCTGAGCTCTTGATTTAGCCAAGAAGCAATCATTCCTCCTGTT GAGAACAGCGTCTAAGTAGTGAAAATCTTCTTTGCTAGAGATGGACTTGT GCACAGAGGAGATCGCACACCCTCTGCCGTTTAGGTTGTTGCTCAGACAT TTTTGTTCGCACAAAAGCAAAACAAAAATCAAATTTCTAGCTTTTTACCT GTTCTTTTGAATGGGACCAAGTAAAAAAATTTCAAACTTTTAGAACAGAG GCTAGACATCTCAAAGAGMGGTCTATGTTTTTAGTCCTCACCCTGTAAAT TTAATTACTACGACTAGATTGTTATTTCTTAGATAAAAATATGTTTAGAA TATACATCAGGGAGCACTATTTAGAGTGACCCTAGATACTTTTTCCTACA CTCATACCGAAAAAATTTGCTTTATTTATAAGATATAAGATAATCTCAAT ATGTACATTATACACCTTTACCTAAAATATTCAAAACAAGACTAAAAATG GTATTAAGCTCACAAAAGCCTTTGCAAAAATATTAAATACATTGCTACTC CTTAACATAGTGATTGTGTTGTTCCTTTTTCGAATTTTTACTTCAATTCG AAATTATTGTTGTATTTTTGGTACAATTTGCGTTTTTAATTAGTTTTTTT TTAGATGAAAAGAATTGATTTTATATAATAATGTCAAGTTAATCATCAAG AAAACATGTCCCATTATCTAAATACTTTTTCTAGTTTAAAAGATTTGAAA CTCAATGAAATAATCGCCGACCTTCAACTGTCTTTTTTGTATGCATAGTT GATTTTACTTTTATCTTCAAGTAGATAAAAATGTTTTGTACTTATCAAAC GCTGCTAGCACGTTATTTGTTTCTTTTAACCACTTTGTTATTAAATAATG GGACATTCTATACATACATACTTAGATACAAAATGTATATTAGTGTTTGA TTGATATTTTAAAAATATTAAGCCTGCAGTCCTCACAGTTCAGTTCTAAT TAATTTTGTTAGTCCTAGGAGAGAAAATACGGATTATAAGGTCCACCACC 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TATAAAATATATTATATTTGAAAATAAGGAGGGCTAAAAACTTTTAAAAA AGGAGATAAATGTTGTTTAAATTATTTTAGTAAATTGTTATTCGAAGACT TTAGTACGTGTTTATACATTTATTTATTTCTTTTCATTTTTATCCAATAT CTACGAAGAAAAGTTTATGAAAAGTATGGATTTGTCTCCTGCATAATATT ATGCATCTCAAAAATTGGACTATATGTACATACGAATATCACTTTTAGGA CTTTAAATTCCTTATTAACACTATTTCATCGCATTTTTGCTGCAACTATT GCTTTATCGTCATTCGTGATTTTTTTATAATTTATTTTTCGGAACTGATT CTTGAGGAGAACTAAAACAACGCCTTAGAATATATAGTTCTCTCAACGCA GAATGTACGTTTGTTTCCTTTTTTTTCGGTACGACTTACTAAGGGCTATT TTTTATATTTGACTAATAGTGAAATATTAGTAAATGAAAGAGAGAATCGT ATAAAGAATGTTTTAAGAAATGAAAGAACTTTTGTGGATTATTCTAAGTT TGTTCGAACATCATACTTTCTCTTTCTATCTTGAAATCGGAGACGGCGGG AGTGGAAAATTGAAATAAAATTACCCCAACCTTTTAATGATAAGGTCAGA GTTATCAATAATTTTTTTGTTTATCTTTCAAAAAAGAAAATTGGGGTGTT AATATATTCTTKAAMTATCARCCAAAWGSCCGCCACAGCTATMTATCCGT ATCCTTTTTATGAAATTATATGTTACTTGGTTAAAAACAGTTTTTAACCC AAACTTGGTTTGATGAAATTAGTGATATGGACAACTTTAACTTWAAAAAA AAAMGGCGCTYSGAGCCACACAAGTTACGAAANCCAAATGGCCGCCACAG CTATGTATCCGTATCCTTTTTATGAAATTATATGTTACTTGGTTAAAAAC 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