EMLSAT00000003266, EMLSAT00000003266-699113 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003266
Unique NameEMLSAT00000003266-699113
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s179supercontigLSalAtl2s179:297317..324636 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003266 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003266EMLSAG00000003266-686032Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000014276EMLSAE00000014276-723204Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014277EMLSAE00000014277-723205Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014278EMLSAE00000014278-723206Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014279EMLSAE00000014279-723207Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014280EMLSAE00000014280-723208Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014281EMLSAE00000014281-723209Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014282EMLSAE00000014282-723210Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014283EMLSAE00000014283-723211Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000014284EMLSAE00000014284-723212Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776178auto776178Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003266EMLSAP00000003266Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003266

>EMLSAP00000003266 ID=EMLSAP00000003266|Name=EMLSAP00000003266|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=324bp
MMTLILFIRMLLILEMVNSNHISDWNCEFLNSTFGTAVLPFTFGVTLADD
DIVSKGDVLGFKIRRFIHSLPDSIWPNWQIDNTNIIGLNEVHGRVSFYMN
KVSMIMAMLLPGSVILYYGDEIGMINNDLITFDETEDPYALPPYADATNY
KSKSRDSSRSPMQWSNTKYAGFTNGSKEPWLPVNHNXPSTNVEDQMNSGS
NNLRLYHQLLSLRCARDFYEGDVYFPYQGHNTFSFIRKIKESDKAYLIVV
LLGFKYHEVDFTIIFPDFPREGTIKIVTHERTNGYKVGDVVDLSKLCLKN
YIGMVIEIDFGESKALEKMERKKM
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mRNA from alignment at LSalAtl2s179:297317..324636+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003266-699113 ID=EMLSAT00000003266-699113|Name=EMLSAT00000003266|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27320bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s179:297317..324636+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAGTTTATCTATTCTTCTCTCTGCTTCATAGGTATCTTAAAAATATAA AGGGTGCTTCTAATATTTTATCCTCACGGTATTTTCCATTCAAGTATATT TTTATAACCAAGAAAGAAATTTCTGCCTATGTGCTTGCTTGATTCAGAGT TGGTTAAGGCTTTATCTTTTAACACTTAAATCTTCCTGCAGGTTATATAA TGAACCTTATAAGCTGTTTTCCTCCTAAACAAAATTAAAAATATCCAGAT TATCATGTTAATTTTTGTTTTTTTATACATGTTGTAAACAAGTTGTGATT TTGTAGAAGTTGAACTGGTATAAGTTATTTGTACAAGTTGGAACCAAAAA AGAAGATGAATAATTTTAAATGAATGATTTGCAGTAATTGGGATGGGAAT AATGCAATAATTGGATATTCCATAGATGATTAACATATTAGTGGTTTAAT TTTTGACTATTTGAATCAAAATGGCGGATATATAAGTATTCTGTCCCACA TTATAAAGTTCAGTTCATATGCCCATAGTTATTTTATTCATAATTACATA ATACACATGGAGTCTTAATGGATAAAAACTAAATGCTATCAATATATAGT TTTATTAGAATGACTCATGCTGTAATTAAAAAATGTAACTTGTACAATGG GGTTATACAAGTTGCAACTCAGAAAGACATCGTTAAAAAAAATATATATC ATGAAAAAAATTCCAAAATTTAATTTAAAATATTAATTTTTTTTGAGAAA ATCTCAAAAATCTAGAATTGCACACAAAAAATTAATTCTTTATAAATGAA ATTTCAATCATTAAATTTTTGGAAATTCTTTTCAAAATCCAAAGCTATTC TTAGAAAATTAAATTCTTGGTAAAAAAATTCAAACATTAAAATAACATAA AGAAATTCAAAATTTCACAGCTTTCCAAGCCCATCATCCCCTACAGACGA CCCTGATTATAGATAATATAATATATATAACAACAGATTAGTCTAGTTAC TATAATAACATTTAACTTTCCGTTAATTAATTACAGGGATAAAGGAAAAA CTTGGTTACATAAAAAGTCTTGGAGTTAATGCCATTTGGTTTTCACCTTT CTATAAGAGTGGAGGAAAAGATTTGAGCTATGATGTAATAGATCATAGAG ATGTGAATCGACTATTTGGAACAAAAGAGGATCTCGACGAATTACTCACT ATGATGGAAGAGCAAGGGATGTACGCCATATTGAGTTTTATTCCAAATCA TACGAGCTGTAAATCTGAATGGTTTCAAAAGAGCCTAAAAGGGGATCCAG AGTACAAGGACTATTATGTTTGGAAGAATAAAACAAATAATTGGGTAAGT CCTAAATATAGTTCTTTATTTTTTAGGGAGAGGGGCTTTGTTTTTTACTT TATTGCTATTGATGGTGAGAAAGTATTTATAAATACTTAAAACGATTCAA TTTGAGTCGACTAGTGAGTAAAAAATTATACATGTATGTTGGTAATCCGT AGAGTCATTTTGGATCTACAAATAACAATATATTCATATTAATAAAATAA CGCAGTCGTTTTACATGTAGCCTCAAGCAGACATTTCATCCTACAGAATA GTGTGTAGCTAAAGCTTACCCAGGTAGTGCGTCAGAGAATAAAATACTCT TTGTCTCCTAAGGTTACATTACAATTATTAATATCAAGCAGTTATAATAG TTATTTCAATCTTGAGGAGATAACATTTAAGTATTGGGTAACTACGTGTG AGTGTGCTCACACAAACTGGAGAGTCACAATGAGGAATACTTAGGGAGGT ATCTTCTATATTATTAAGCAATATACGTCTGTTCATCGTCACCTAATAAC TCTGGGTAATTCCAGATAATTCTGGGTAATACCGCTAGTGCCTACATATA TTAATAAAAAAATCCGTCTGTTTTTGTGAATGTCTGAATGTATGAAACAT AGTCACATAGTTCACTGTATATAGTGATCCCTGATGTGTATCATATGAAT ATTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAAG AAATAACTATTTACCTATAATACTGAAATGTTGTAGGGGTGTGCGTGCAT ATGTAGTACTGTTTCACTTTGTTTTTGATTATTACTCGCCTACATTTATC ATAATTCACTTGCATTGGCTGMATATGTTAAGAATTGAATAGAATATAAA YGCTGGMATGTATGTAAAAATGAATTAATTCGCTCTTTTTNTTTAATATA CGGTGAGTACTGCTTTGTTTGTTTTTGTTGGTGAGCGCTCTAGAGATTAA AATACTAATCCGAAGTCCAATTCTATTCATTCTTTTTTCGCAAACTATTA TTATTATTCTTTTATTCTGGAAGACAGAACATGTCCTATGAATTTGATCT AAGTATTGATGAGTTACGAGTGAGTGAGGTTATGAAAATTGAGAATAACA CCGAGGATTTTTTGAAGAGTTATCCCCTATATTATGAAGAAAAAAAATTG TATTTTAGTCAATGCATAATTACTTCAGGTAATACCGGGTATTACCACTG GTAGAATAATATGATCGATTTAGTAAGCCTCGTCCCAATAAAAAGTACTC ATACAGGTCTATGATTACATGTGTAAAAAATACAAAATGTGGTTGTCAAA TTCGTCAACAAGATGTCATTTTTTTTGTTACCCTTATGAAATAAACAATA TTCGTTGTTCTAAAAAAAAGCTTTATTCTATCAAAGATTTGCCATCAAAA AATATCAAATCTAAACGTCAAAGGACCTATTTTATAGGTTTTTTTAAAGG AAAAATAATCTTGATTTTTCACTTGTTTTTACAGCAAAAGATTAAAAAAT ACAGGGTTTCAAATTTTAGCACCTTAACCCTCATAAGTTTAAAATTCAAT TTTTGTTTTACCATATTTAAGTTGAACTAAACCTTTTATAAATAAATAAA TACAGAATTCATGTAGTTAATTTCAATTAAAAGACTCAAAAGCTTTTAGC TTTAACGATAGGAGTGAGGATATCAAAGGGGCATTAATTGGGGTAACCAA TAACGCGTGCGAGATTTATTTCTTATTTTTAATCTAGGTAAAGTTTTTAT TTTTCATAGTCGTTGTCATTATTATTTAATTCTAGAAGAGAAAACATCTA ATTATAAAGTAAAGTATTGGTGTACTCATGAAATACTGAGAGTAATATAG ATGATTTATGCGGGAATTATACAGCAAGATTATCAATAGTGTTAAAACTC GGCCCAGCATCGATTTTTTTTTTGGTACGGTCTTAACTGATTTTTTCTAG ACCGATAAGGACTGATTTTCTTTAGGTCTCATTTTGTAGACCGATTTTAA TTCGGTGTCAATTTATGTACCGATTTTTTTCGGTCTAATATACATATTYT GWTATAAKATTTATTTTCTAGATCAACTGTCATTCATTTTTTTGAAAAAA AATCTCAAAAGTACAATATATGTTCTAGAACAAATATTGTATACNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAATCTCAAAAGTAC AATATATGTTCTAGAACAAATATTGTATACATATAAGAGACGGCGGGATC AAAATTAATTTGAGCTATCTCTGTTTAAACTTCATATAACGTTATTGTAC TTGMAAAAACATATGATGTCATGTTATTATCAATTTATCTGTAAAATCGC TGTAAACGGATTTTTTTGGGACTGAACTAGACCGATTTAGACTGAATTTT TAAATGAGAACGTCCATACCAAATTTTTTCGGTCCAACAAAAAATATAAC GGTCTAAGACCGGTCTAGGATTTCCGGACAGAAACTTAACAATAATTACC ATACATTTTTCGTAGTCATCTATTTTTATGCGAGTGGGGACCCAGAACCT ACAAAAGCATTAAATTACGATTGTATCCACGTTATTATTAATTTTCAGGT TTCATTACGCACCAAACGATATTTAAAACAAAAATATACGATATATTTTT TTATCATCTGTAAGCAGCAGCAGAAAAGGTAACATGAACTCTGTCTCCTT TGTACTTGTTTTAGTATCTAGAAGACTTCAGATATCTCCCTACAAACTGC CTACAATACCAAGAGTAACCAAAACTTATGCAGTACAATATTGCTGATTT CTGMCCTGCCTCCATGTGGCTGTGTAGAAGCCCTGACCTAAACCTCCTGG ACTTTGTAGTGTATAGTTTCTTAGATAAAGAGGCCATACCTACTTCTCAT ATAAAATTGGATTCGCTCCTTCCTGATTTATGAGCACATGGTATGTTACT CGTCMCGGCCATAATTCTGAAAASCTGCCAATCTTTTCGTCGATGTGTCA AAGCTGTCATTGAATAAATAATATACCTAAATATAGTATTTAACCATATC ACTAACTGGTTTTGATTTATATTTTCTCAATTTATGACTTTTCTTTTTAA GTCATGCTACTGTAAGTAGTTTTATATTAGCAAGTCATCAAAAAAACTGT TAATTGATAAATTGATAATTTGGTATATAAAGTCTGCAATTTACTTCGCT ATTGATAAAAAGAGTAAAAAAATACCTAAATGGAGCTGGCTATTATTTTT ATCCATTAGCGTTTTTTCATCTTGAAGAAATTCTGCTTTGGTAATGAAAA GTTACTCATTTGGCGCTCCTCCTTGTGGCCTTCATGATTTACAATCCATT TTTTTAATGTTCCTGTAATTGGTTAGATGGAGTTTCACTGATTAAGTATA TGTAAAAATTATGGTATTATATGTACTCCATTTAAACTAGTAATGTTTTA GTGAAATCCATATACATGAAGAAACACGCCACGTAGAATTACTAACGTAA ACTGAATGTCTTTCAACAAAGTTTTTATATAATATATAAAAGGGATGTCA ACCTGTCTTGTCTTAAAAGTCCTATAATACTCCATCAAAAGTCTGCGTCA ATTACGAACCATTAATTTTTGGGTAAAATAAATAAATTAGTTACATGCTA ATAAGTTAAGAATTTAAAACGAAATATGAATTCAATAAAAACATATAATT TCAAATACAGATTCTTATCACCGAGAGTTGTCCTTGTACGTAGGAAGAAT ATCCCTAACTCCGAAAGCCGATTTCAAGCGGTCGATTGGCATAAAGTCGG TTCGATGTCCAAAGTCTAGACTAAAAGTTCTGTTCAACTTAGACAGGACT TTAAAAGAGCCTAAACGATGGTTTAAACGGTTTATTTCTCACCAAAATAT AATCCAAATTCTTATGAGCTTCCAACGTGGCCCTCACTCTCGCCGGGTCG GATGCTCGGGGATACCTCTTGGGGGAGCATGCTTCATCTCATTGAAGCTC TGAAACAAGCTCTTATCGTTGGGTACACCAGTATGTTCGGTCAACGATAA CGGTAGCCTCGAAGCTGAACCYAAGATGTAGCGCATTGGAGAAAATATTG CTCCTGGTATAGCTAAGGTGGTAGAACGTAGGCCCAACATCACTAATTTA AGAGTGTCTACCCATGAGTTACGTTTCTGATACATTCTTGAAGCGAGAGA AGTCTTCAAAGTCCTGTGAAACCTCTCAATAATGGTGTTGGACTCAGGGT GATACGAGATGGTGAATAGGTTACTCGAACCGAGTAGTTGTCCCAAGCAT 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