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Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s181 | supercontig | LSalAtl2s181:427820..487404 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003314 >EMLSAP00000003314 ID=EMLSAP00000003314|Name=EMLSAP00000003314|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=446bp
MNWLQALTALVSLLVQGVQFGGLVRGDEILQKLTEEPYHSNERVPLSDLV DSDDAFRYAKVCAKGDAICIPRNYSKFDLPNETQTVVNVGIDIKDIPKID DKDFSITLNSFFVVRWKDERLIIDQKKMDKIFKKGEDADSWIPVDVSFIK EFWLPDAEILNLKEFKTLDVLSKLEGLWLNRNFEIMYAVATRITFICPMT FNSFPLDVQVCRFQVGSFNYDISKMVFHDEFIADQSQIRSVLDYFIEIRK LPDEYQHYVALTGNYSVAGFELTLQRKVSHYIITYYLPSGMFVIVSWISF LVPPDIVPGRMTLLVTVFLVLVNIFNTITTNIPKAEGLTAIEAWVIVCVL FVFGALIEYAGLLLKIKLGSTRVRQPSNGNEGSMILNGNIDERRSNRGIM TRRRQREEMSHARLDILFLLLFPLFFLIFNVIYWLSFLYGPCENCK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s181:427820..487404- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003314-699161 ID=EMLSAT00000003314-699161|Name=EMLSAT00000003314|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=59585bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s181:427820..487404- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAACTGGCTTCAAGCATTAACAGCCCTTGTGTCTCTCCTCGTGCAAGG
AGTTCAATTTGGTGGACTKGTTCGAGGAGACGAAATTCTTCAAAAACTAA
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GCTTCTACTACTTTTTAATCTATCATAATATTGCAACAAAGTCACCCTTG
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GGAATAAACTGATCAATTTTTTTATACTTTTATTGTGACAATACATTTTT
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TACACGTCAGCTGAAGGCCAACCAGGAGTTGGTGACAAACTTCTTTGACA
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GTGGGCTAGAATCTTGTGGGGAAGGGGCCATATCTATTTGGACCAGAGTC
GAGCCATGTTATTTGTACATAACTTTTGGCACTTGGCAGAATTGTGAGGG
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CAAAATTGACCCATTTGCCTTGATTTATGTGAGGTTTTTCTTGACATTGT
CGAGCCTCCTGGTTTTCATGTCCTTTGTCGGAATGGGGTGTGGGTCCTTG
TGAAAGAAACTAATACCAAATTCTGCTTAATAGGTTTCCCGATGGTCCTT
GTAGCTACAGAGAAGTCGTTGGCGAGGCAATTCATCGACTTAGTTGGATC
CTCCTTTATATTCTTCTCCAAACTTAACAAGAACTTTGTATCCCACTTTA
AATTATGCCTTATACTCCCTCACATCTAGGAGGGATCATATCCATTTTTT
TCACGTTGGCCAACTTAAAAACTAGACTACTAGCACACTTAACAATGTCC
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CCGTTTTGCTTGTTGCTTGCTCATGATGATGAAATGAGTAAATAATTTTC
ATAGTTTCCGTACGTATAAGGACGACGGAACAGAATTTCAAAAAAGAATT
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TAGACGAATCATTGAACTTCTACCATAGATTGAATCATCGAAATGAATTC
TTCAAGGTATTCGGAATTTATGCAAATATACAATGGTGGAGCACGTCCAC
AGATACCACACAAACGACCTTCTTGCATTTTAAAATAATTATAAAAATTA
AAAATTGATTAAGCTGTATTATACAAAGTTTCATAGCCCCAGCCCCCCCC
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AAAAGTGATTCTGCTAAAAGATAGCTACTTCAACCCTTTTTGCAACTGGA
CTAAAAAAAAGTGATTCTGCTAAAAGATAGCTACTTCAACCCTTTTTGCA
AATAAATCGAGAGTCTGCAAAAAATAAATCGAGCTACAAAGAGAGACTTC
ACATTCTGCAAGTTCAGCTGAGTGACTTCAAGACATCTGTTTTGGGATTG
CACGAAAGTAGTTAACATTGTGTACATGACCACTGATTTTTTGAGGAAAT
CCTACAATTCAGAAATAAAGATTGGGGATTGGCTTGTAATGTCGTATTAT
TTCATTACAATGAGAAAATAAATATAAAAAAATATGCAATGATACAATTT
TTTCATCAACAATTTATGTGCATCATTCATATAAAGAACGAACCTAAAAC
TATATAAATTATTCAAAAAATTTGTATTCTTTATATACAGAATCTTTAAG
GAATCACTCTGCAAGCTTTTCACTTTTTGCAAATGTCTTGTATCTGCCCG
ATTACCATTTGTTGAGGGATACTTTATTCCTTCGAGTTTGAATATTGTAG
CTATTCTATTGGAAGGCATGGTGTCACGATTATAATAATTATTCAAAAGT
AAGAGACACAGTGTTTTCAATTGAAAGTTGACAAGTCTATAGGTTTTATA
ATGCCTTAAAGGACTAAATGCATGCCAAACCTACTGTAAATTATGTACAA
GGTATATATAATTTGCACTTGAATATAAGTCGTTCAGGCCAAATTACTTT
ATTTTATAAAATTATTATTTATAGTCGTAAACATTCATACAATACTACGA
CGTAGTATTGATCAACGTGACGTCACGAAGCAGGAATCTTGTTTATTTAT
TTAATACAATAGTAATGAAGAAGAGCCATCTCGAATCTCTATAAAACTCC
TGGTCCATCGTNNNNNTACTACGACGTAGTATTGATCAACGTGACGTCAC
GAAGCAGGAATCTTGTTTATTTATTTAATACAATAGTAATGAAGAAGAGC
CATCTCGAATCTCTATAAAACTCCCTGGTCCATCGTTAAGCTTTATACGA
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CCGCGCAAAGCACTAGTAAATCATTAATTCTGACTGATTCCCGTTTAAAG
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TGGAGTCCCATGCGCTTCTTGCAGCAACCCAAAGGCCAAAGCTACCATTT
TGGAGACTCTTGGAAATCATGAATTAGATGTCTTAAGGTTTCGATTGCTG
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GTGTACTAATTCAAACTTTGATATTAATTCTTCTTTAAAAAAAATATAAT
TAAAGATTTATTGTGGAAAAGGGTCTATGATTGATTTTTTTTTTTTTTTC
GTCTTGAAAAAAATATTGAGGGAAATATAAGTTTTTTAAAGCCAAATAAA
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TTAAAATTTAAACACTTTGAATTTTAAAATTCAATCTGATATAATTTAGT
AGCGAACGTTATAATTTTAACAAAATTAACACTATAGATAGATGTGTGTC
TGAGCTCTCTTTTTAATTAATGTAGCCACCCTTAGTTGCAATGTTGGTTT
CCAGGAGGCGGTGGAAGGCCTTGCACATGCTGCAGATTTAGTTCTCTATC
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ATGACATACACTGCAGGCCTTTCCCTTGCCAGGCACTCAAAAGGTTTATT
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TTTCTTTGGGGTTCCTTGTCTATTTTGGCCTTTTTGACAGAGTCCTTCTT
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GCCCAACTGCTTGGAGTGCACGAATGGAAATTAGTCGATCACGTCAAGTG
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GTAACTAATTGTTTATGTTTTAATATATCGAAATATGAATTACAATCACT
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ACAGAACATTTTGCCTGTCCCTGACGGTCAGACAAGTTTTAATGTAAATC
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TTGGAAGAGAGAGAAATATACTCATGATAAAAGAAATTTTCTAACCAACT
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CAATTGACTAAATGTACCTAAAAATTTGGCTAAGCACAATATCAAACCTT
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TTGTCTTGATGATGTCTTTTTCTCTCCAATTTGTTCGATCACCAGCTTCA
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TTGGTCACTTTCGATGGGTTTTGGTTCTCAGGTAGTAAAAATGTAAAATA
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GAGGTTGAGGGGAAGGTCTGCCGCACGGCCCACAACATGAGAAGTGAACT
AATCCGCACTCCCCTCTTCCTTGAAGGCCTCCGGAAGTCCATCAAGGCTT
CGCCGGGGKCTTCCTTGTCCAGGTTGGCCAAGAGCCGTGGAATGAGCAAG
CAGCTGGTCTCCAAGGCTGTGAATGAGGACCTTAGGTACAGGTCATACCG
AATGGCCAAACAACACATCCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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GCCTCCGTGATTACTCTGGGTGTCATCGGCAGSACCGGKGAGGKGATGCC
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AGGGATTTCATATTCCAACAAGAAATAGCACCCGCACACATCTCCATGAT
GACCACTAACCTCTTCAACTCCCACGACATTACTTTCTGGGATCGCAACA
TCTGGCCCTCCAACTCAACCGACCTCAATCTGTGTGATTACTACTGGTAG
GGGAAGTTGGAGAGKGAGGTGTGTAAGGTCAGCCACAAGAGCATCGCGGC
TCTGAAGAGCTCCATTACGAGCAAGTGGAATGCTGTTGATTCCGCAGAAG
TCATCCGGGCATACAAATCCTTTAGGGGCAGGATGGAAAAGATGGTGGCT
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TTTTTCATATTAACAAATACACTCCAAATTCCATTTTTATCAAGCAGGTT
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TATTGCGATCTTAGTTTTGTTCTTGTAAAATTCAAAACAATATAGTTTTA
ACTTTTGGCACCATTTTCATAAAATAATTCAGTATTTTTTTTTTTTTTTT
GCAGAAGTAATTTACAATAAATAAAAGTAAAAAATAATAATTTTCATCGT
TTCAATCAAAAATTCATTCGTTTAGCCCAAAATTAATACTTCAAATACAT
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TTTGTTGAGATCGTTCTCCAAACTTTTAAAAGAATTGAATTATTTTTTAT
GGCCTATATTTGAAAATTTAAAATAAATTTACATATACGGCTGTTTTTGA
AGAAATGGATATTTCATGTCCAATTTTTCATAATTTTGTTGCTTTTAAAA
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GTAGGATTTATGTTTAGGGGATAACAAATGATTTATATATTAAAAATTAT
GTAGAAATTTATAAAATAGTAAAAATTCGGTTAATAAATTGGAATTCATT
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CTATTTTTTTATCAAATAAAATAATGAAAAATTTGGACAGGAAATATCAA
TTTCTACAAAATGGCCTAATAAATTTATTTGAACTTTCAAAATCGTGAAG
GAAAATTAAACTACTTTCAAAAGTTTTCCGAAAAAAAAAGTTATCTTTTT
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TATTAGAATATCGCACAAAAAAAATTATATATGTAAGCAAATGACTTTGT
ATTGAAATGACTTAATAAAAGCTTCTTTTTTCCTTTTTAACATTTGCAAT
AATCATTGCAGTTGTTTTATTCTATTCACTTAAAATGTACTTAATTTTTT
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GAATATTATTTAAAAGTTTTTGGAAATGAAATAATTTTTTATGTAAATGT
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ATAGCTGAAAGAGGTATTTTTTAAGTGAAACTCAAAAGGAATTGAATTGC
TTTATATGTTTATAGATTATAATCTTCTGTTTTTGGACTGATATTTTAGA
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TATTTGGTCTTCCAAATGTACTTAATCATTGGGGGTTTCACTGTTATACC
GAACATCACGGAGAAAATTTTTGTCCTAGTTATAGTTGTTGAACAAAAAA
TAGAAAAATAGCTTTGATACAACAAAACACAAGTTATTCAGCACGTCTTA
AACAATTTTTATCTCATAATATCATCATGAGTGTATTAGCTCACTCATTT
TTTGTTTGGAGTTGGCAAACTGAAGAATAAATAAAAACATGATTATACGT
GATAGTTGTTTCTGTGATGACTTTTTTATGGTATTTTTTTTTTTGAACTT
ATTGTTCTTATTTTGTAGACATTTTTTTTTTCGTATCCATTGGTGCCCTG
ATAAATATGCACCCAAGGTGGATTTTAAATCAGCAAAAGTTTAGCATAAT
GTACATATACTACAAAACTAATCAACAGCAATTCCCAATTCATTAGCATG
TACATGAAAGGGTCAATAGTAAAGTCTATCACTCAAATCATCCTACCTCC
AGCTTCAATCACAGCCTCCAACCATACACAGGCCTTGATGAGGAACTCCT
TATCCATCTTGGACACTGCCTCGAGAATAGAAGCCCGCATGGAGGCATCA
ATGTTATGCAAAAAGTTATTGGACACATAGTATTTAAAAGGGATGAGATC
TGGCTAGCTTGGGGCAGGATTCCCTTGGCATTGGCTTCAGGAATTCTGTA
GTGKATTTTTTACTATAAGAAGAATCATAAGCGTTCCGTGCTGGTTTTCC
CGATACATCAGACTTGACAAGATCGTAGCAGTTAATTTTGTAAAATTCAA
TAATCTGATTGGGCATGTGCAAGGAACAAAGGGACACAATAATGGCTGSA
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AAGTTTTGTAAATTTGATCTGAGGAGCACACTTTCATAAACATACATCTG
AGGGTTGCCAAGATATTGTAGCCTAAACTGGGTCCGAATTTAAAATCCCC
ACCCTTTATATGCGACATATTTTAAATATTTTTAATTAAAGCCCATATAG
CATTTTTAAGCGAGGTTTTGTTATTTGAAAAATATTTTATTAATTAGAAA
CTAGATACCAAAATGAATGGAATAAAAATGTTTTGACAACTTTTTGCAAT
TCTTTCAGCACGATATATATGTATATTATGTTAACTTAACATAAATTTTC
TCTCCAACACAAATAATGATTATAATTATTTGCACAATTTAATCCTAGTT
ATAGATTATTTATAATAAAAAAAAGTTGAACATTATTTTTGATACAAAAA
GGGAAACTATTGAGCATATTTTAAACTCCATAAATTATTTTTTTTCAAAA
GGTGCTTAATATTTTTAACTGATGAACCAAATAATAAAAAATAATCTAAA
TACCATTTATAACTCATAAAAATATAATAAATTATGTAAATTGGGTATAA
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TTTAGTTTCATGATTTTTTTTTCTCTCTCTCTTGGCCTTTACTCGGTATA
TTTCTAAATTTTAAACAAAAAAAAAAGAGACAAAAACAAAATAAAAATGC
AAATAAATAATAAACAGACACACTATACACTCGTGTACAGCTTTTCAATG
TTTAAAACTCATCTAGTGTCTTTCTCTTTTCTTGACCTTAATGCATACAA
AATATGCTGTGCTTTTGTAAGGGCAAGATTAACTTTTTGACTGTCTGTCC
CACTAAAAAGGATTAAAAAGGCATTGCTTGGGAGCTCGTACCCAAAAATT
GTCATTTAAAACGGAGAAAAATTATCTATATATTTTATTTAAAACAGGAC
ATTCCCACAATAAAAGATTGGTAGTCTCCATTAAAGAGAAAAAACGACAT
TCTCCACTTTTGTCTTCATAAAATTTACCTTTTTGCATTATTATTTAATT
CCTGAGTAGGCAACTTCCTTTTCTACTCCATTCAATTATATTTAAAGCCT
GATGGAATATTTTGTTTGTGCCCATAAAAGAGGGAGACTAACCTTAAGGT
ATTGTTGCAGAATGATAATTGAAATCCTTGTTGTACTCAGACTAGAATTA
AGGATCAGTATCGGAATAATTCTTATCTTTGTCCTTTTCTATTCAGTTTT
ATGCCCTCCTCCGCTACGTACAGCTGTTTGTAGCAAATCTAATCAAACTA
CGTGACAACCAAGATGCATTCCTCGAAACCATTCTTCTACATTCCGGATC
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