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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s188 | supercontig | LSalAtl2s188:581193..593418 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003435 >EMLSAP00000003435 ID=EMLSAP00000003435|Name=EMLSAP00000003435|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1120bp
MYSIPSRNATYAAGDKGYGGDNCELDEDECKSFPCQNGGICTDDVNNYKC QCVEGFTGVNCEKTINDCERYPCLNGGTCRNSIIAYKCDCLPGFEGLNCE RNKNDCKGEPCKNGECFDGTDAFTCKCYPGYTGQLCEHEIDQCEPSPCKH GGRCERHANGFKCNCPLGTWGQRCEEQKNECYSNPCYNGKCEDGFGIYTC ICDPGFSGVNCETPINECKSSPCENNGLCIDLIAGYKCDCPSGYYGPRCT SDVNECSPDPCLNGATCENEFNDYVCRCQPGYEGKRCEYEVNECKSNPCQ HGGKCLTHFNSYSCICPSGFTGNNCESNIDDCRLFPCKNSGLCIDQVDGF KCICSAPYTGKTCESEMNPCNEHSCAANGAVCKPTPDYKDYFCSCPLGFK GRYCSVDIDECLTYPCHNGASCVNTEGSYECKCEEGFEGRDCLLNIDDCA SSPCVNGGTCLDETAGFKCLCVDGFGGNLCEEDINECASNPCKNGAICHE YVNSYTCECKIGFSGTNCQTNDEDCTASSCMNGGKCIDGVNNYTCVCPRG YSGRNCQTRINPCDKNPCQNNGTCVDGGYNDYSCHCSSGWTGRNCDRLVD WCQQGASPCENGRCYQSGTSYNCVCEDGWTGKVCDVRKVSCRIAAKLRSV DVSDLCLNGGRCRDEWNSHVCECQDGFYGSXCQYKKDECGSSPCQNGASC KSMIGTYSCQCLRGFQGHNCEFNIDECDPNPCQNEGVCHDLIDGFQCTCP YGTVGKLCEFNINECLEGTCHHGGTCIDKIGGYECQCRPGFVGQRCEGDI NECLTSRCSPYGTQDCIQLTNAYKCQCKPDYMGKYCETKKNFCESSPCEN GGGCTNLIDGSGHKCSCLYGYSGQNCEFYGSVCQSNPCRHGGTCLEHSGG GFTCVCPPGTTGSFCEQDTRNECAYNPCQKGYCIDKIGDYDCFCNPRFVG KNCDISDPSSPGGIYFQGIAEEIDLRTEKIKCLQNGCQTKAGNNICEKEC NTYACDFDGGDCRLGINLWMNCNATVGKEQKRCWEVFQNDYCNEECNNRD CLFDGRDCDGDRTSCNSNYDVYCTDHYANGRCDESCNNEACGWDGLDCEP PSEIHRIIPGSXLCCATYDS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s188:581193..593418+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003435-699282 ID=EMLSAT00000003435-699282|Name=EMLSAT00000003435|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12226bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s188:581193..593418+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGTATTCCATTCCATCACGAAATGCTACATATGCTGCCGGGGATAAAGG
TTCTTACTGCCTGTTATACTATTCCCACGAAGGAGTTTATTGTGTGTGTC
TGACAATCAGTACCTGGATATTATCTACAGGTCAAATATTTTATTTGCAA
AAATAAAATATCCGATTGCCAATGCACAAATTATTATTATTTGATCATTT
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TCTATTTACCCTAAATGGTTAATGCAATTTATCAGTCTTCTTCTTTGTAA
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AGGCTATTTTAACTATGTTTTTGTATTATACCCTCAGCTTACTAAACATT
TTTCCTCCTTTAACAATAACAAAAAAAAAATAACTCATTTCATTTACTAC
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AAATGTGGTATGATAAAACAATAAACTTTTCAAAATTTCACTTTCCATCA
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AAAGTTCTTTACTTCGTCAATGAAGATTAAAATATTCATCCTTATTTTGT
ATTGACTAATTATTTTAACTTATTAAAAATATTAATAAAGTTTTTTTCCC
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TAATTTTTTCCCTTAATAGGATATGGGGGAGATAATTGTGAATTGGATGA
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ATGTAAACAATTATAAATGCCAATGTGTTGAAGGCTTTACTGGAGTTAAT
TGTGAAAAAACTATAAATGACTGTGAAAGATATCCTTGTCTCAACGGTGG
AACTTGTCGTAATTCAATCATTGCATATAAATGTGATTGTCTCCCTGGAT
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TAACCATATTATTAAATCTTGTATAGGTTTGAATTGCGAACGTAACAAAA
ATGATTGTAAGGGCGAACCTTGCAAGAACGGCGAATGCTTTGATGGTACG
GATGCCTTTACATGTAAATGTTATCCTGGATATACTGGCCAGCTCTGTGA
ACATGAAATTGATCAATGCGAACCAAGTCCCTGCAAACATGGTGGACGCT
GTGAAAGACATGCAAATGGTTTTAAGTGCAATTGTCCTTTGGGAACATGG
GGACAACGTTGTGAAGAACAAAAAAATGAATGCTACTCAAATCCCTGTTA
TAATGGCAAATGTGAGGATGGATTTGGTATATACACTTGTATATGTGATC
CTGGTTTTTCGGGCGTGAATTGTGAAACTCCCATCAATGAATGCAAAAGT
TCTCCATGTGAGAACAATGGTTTGTGTATTGATCTTATCGCCGGATATAA
ATGTGATTGTCCAAGTGGATACTATGGCCCRAGATGTACATCAGATGTAA
ATGAATGCAGTCCGGATCCATGTCTCAATGGTGCAACCTGCGAAAATGAG
TTTAATGACTATGTATGTCGCTGTCAACCTGGGTATGAAGGTAAAAGGTG
TGAATATGAAGTTAATGAGTGTAAATCCAATCCATGTCAACACGGTGGGA
AATGCCTCACACATTTCAATTCTTATTCATGCATCTGTCCATCAGGATTC
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GCTCTGCTCCATACACGGGGAAAACTTGTGAAAGTGAAATGAATCCATGC
AATGAACATTCATGTGCTGCCAACGGAGCAGTCTGCAAACCTACCCCAGA
CTACAAGGATTATTTTTGTAGTTGCCCACTCGGATTTAAGGGAAGATATT
GCTCAGTGGATATTGATGAATGTCTGACTTACCCATGCCATAATGGAGCT
TCTTGTGTAAACACCGAGGGAAGTTATGAGTGTAAATGTGAAGAGGGCTT
TGAAGGAAGAGACTGTCTACTCAACATTGATGATTGTGCTTCCTCTCCCT
GTGTTAATGGAGGAACATGTCTTGATGAAACTGCTGGATTCAAATGTCTT
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TGCCTCAAATCCCTGTAAAAACGGCGCTATTTGTCATGAATATGTGAATT
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AATGATGAGGACTGTACAGCTTCCTCCTGTATGAATGGTGGAAAATGTAT
CGATGGAGTCAATAATTACACTTGTGTATGTCCTAGAGGCTATTCCGGAA
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AATGGTACATGCGTTGATGGAGGATACAATGATTACTCTTGTCATTGTTC
TTCGGGTTGGACTGGTAGAAATTGTGATAGACTAGTTGATTGGTGTCAAC
AAGGAGCATCTCCTTGTGAAAATGGACGTTGCTATCAAAGTGGTACTTCC
TACAATTGTGTTTGCGAGGACGGTTGGACTGGAAAAGTCTGTGATGTTCG
TAAGGTGTCTTGTCGTATTGCAGCCAAACTTCGAAGTGTAGATGTGTCTG
ACCTATGTCTCAACGGTGGAAGATGTAGGGATGAATGGAATAGTCATGTT
TGTGAATGTCAAGATGGTTTTTATGGTAGTTKCTGCCAATACAAGAAAGA
CGAATGTGGCTCTTCTCCATGTCAGAATGGCGCTTCGTGTAAGAGTATGA
TTGGTACATACTCATGCCAATGCTTAAGAGGATTTCAAGGACATAATTGT
GAATTTAATATTGATGAATGTGATCCCAATCCGTGTCAAAATGAAGGAGT
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TTGGAAAGCTATGTGAATTCAATATTAATGAATGTTTAGAGGGCACGTGT
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TCGACCTGGATTTGTGGGACAGAGATGTGAAGGCGATATCAATGAATGTT
TGACGAGTAGGTGTTCTCCTTATGGAACTCAGGATTGCATACAACTTACT
AATGCTTATAAATGTCAATGTAAGCCAGACTACATGGGGAAATATTGTGA
GACTAAGAAAAATTTCTGTGAGAGTAGCCCTTGTGAGAATGGGGGTGGAT
GTACCAACTTGATAGATGGGAGTGGTCATAAATGTTCTTGTCTCTATGGG
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ATGTCGTCATGGAGGYACATGTTTGGAACATTCTGGGGGTGGATTTACTT
GTGTCTGTCCTCCTGGCACCACTGGATCCTTTTGTGAACAAGACACACGA
AATGAGTGCGCATATAATCCTTGTCAGAAAGGATACTGCATTGATAAAAT
CGGCGACTATGATTGTTTTTGCAATCCACGCTTTGTTGGCAAAAACTGTG
ATATATCTGACCCTTCAAGTCCTGGAGGTATTTATTTCCAAGGTATAGCG
GAAGAAATTGACCTAAGAACAGAGAAGATAAAGTGCCTTCAAAATGGTTG
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CATGCGATTTTGATGGTGGAGACTGTCGTCTTGGAATTAATCTCTGGATG
AATTGCAACGCCACTGTTGGTAAAGAGCAAAAGCGATGTTGGGAAGTATT
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GTCTACTGTACTGATCATTATGCCAATGGAAGATGTGATGAAAGCTGTAA
TAATGAGGCCTGCGGTTGGGATGGACTTGACTGTGAGCCTCCATCTGAAA
TTCACAGAATAATACCTGGGTCGTTNCTATGTTGTGCTACATATGACTCT
TGAGGCCTTCAATTCTAATATTCGCAAAAGGTTTGAGCGTTATTTGTCTC
TTGAATTAGGAACCAACTTTCGTATTAAGAAAGATTTAGAGACAGACGAA
GAAATGATTTATAACTTTAATCCTGCTCTACTCTCGGGAAAGTTCTCTAA
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TATACTTAGAGATTGATAATGTGAAGTGCGTTCTTGAAGAAAGGGATAAT
TGTATTGGTGATGCCACAGGATATGCAAATCATTTTAGTGCAGTTTTTAG
TGATAATAAGTTAAGAGAACCATGGGGTATTGCTCAAGTAGGAGCAAGTG
GCAGTGGACGGGGAAGTGGATTGGGTTCTGGAAGTGGAAATTCTAATGTT
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AATTGTGACCCAAAAGAATAAAAAACGTAAAGGTGGAATCACATGGTTTC
CTGATGGATTCTTTACGAACAATAATCATGCTTCTAGTTCAAAATCTCAT
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TCCTCATCACCATTTTTCTCAAAAGGATTATCCTATTGACGGTTGGMCGG
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GAATACTCATCTGGCCAAACGGTTGTCACCGACTACGAAGAGGATCACAA
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AAACAAGAGCAAATGACAAATGACCCTGATGTTCGTGGTCCAATGGGAAT
GACACCTCTAATGATTGCTTCATTTAGAGGAGGAGGACTTGATACGGGTG
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TGGTGAGAGCCCTCTTCATTTAGCCGCAAGATACGCTCGAGCTGATGCTG
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GGTCGTAGTCCACTTCATGCGGCAATCGCTGCTGATGCTCAAGGTGTTTT
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ATGGAACGACACCTCTCATACTTGCTGCAAGACTGGCTATTGAAGGAATG
GTTGAGGATCTAATTAACGCTGAAGCAGATATTAATGCCTCTGATGATAA
TGGTAAAACTGCACTTCATTGGGCATCGGCTGMCAATAATGTTGAGGCTG
TGAATGTTCTATTAGCCAATGGTGCAAATAGGGATGCTCAAGATGCCAAA
GATGAAACTCCACTGTTCTTATCGGCACGTGAAGGATCCTATCAGGCTGC
TAGAGTTTTACTGGATCATTGTGCAAATAGGGATATTCAAGATCATATGG
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GGGAACAGCGCATCCTCCAAGCTATGAAGCAGCTTTGCTTGGACGCTCAA
TGCACGCTCTTCAAGGCGGTATGCCTGGACAATCAAATTTAGAATCTCAA
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CCCGGGGTAATGAGTCCCCCACACTCTGTGCAATCAAGTACGAACATGTC
ACCTCCACAACAAGCAATATTGAATAGTATTGGAAACAATAACAACAATC
CATCCCCTGTCAAATCATCTCGGAACAACGTTAATCTTCCAACAAGTCCC
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TGATGCATCATCATTTAACTCAGCAGCAACAACAGGTGCAGCAACAACAA
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CATATCTGGGTTCATCAGTTGAAAGTTATAGGCTATAGAGCATGTACACG
TGACGTCAGCATTGTTAATAGGGGGCCAATACAACCAAGATTTATAGCAA
TGAATGTTGCGTCTGTCAAAATGGGATCAATAAATAAATGGATTTGACCT
TTAAACTGGTGTCCGGTACTTTCACCTTAAACTATTTCCCCCCAATATAT
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GAATTTTTAAATTCAAATATGTAGTGTTTATACAATAAAAATCAGTGATT
TGTGGTTTTCTGTTGGAATAAAGAGGGTATAAAATTTCAAACCATACTAG
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GAAGTGCTTATCACAAGGAAAGTCTCCGTTATCAATTATTGTTTTACATC
ATGGATTATTATTACGAACAAGCATAATATGAGACAATAGCTGTGATTTA
CACTTTGTTATGATCCAGAATGTAACAGAAGAAGAGGCCGCGGGCTGATA
ATTATCACCCAACCTTTGAGTGCTTTCCCGAATCCTTTCAGTGGTTTSCC
TCKCTRCASCCAKCCGCCACTTCTTCTGACACATTCTGGATCACAACGAA
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TTATCACTCTATTGTCCAGTTTTATTGTATATCTGATTGAAAACGTTTCT
TGTTTGTTGGAGTGAACCATAACGCATGTACGACATATGTTTGACTTCCC
CCACGCTTTTAATATTGACGTCATACTATATGAGTGGTTGCGTTTTTTGT
CAAAATCTGTTTTTCCTGTCCAGCAGTCGGTACTTTAAATTGAAAATTAA
AGCAATAGTAATATCATAAACTATGAATGGTTGCGTGTTTGTCAAAATCT
GTTTTTCTTGCCCAGTAGTCGGTACGATACATCAAATTGAAAGTTCTAGC
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CCGACTACTGGGCAAGAAAAACAGATTTTTAAAAATACCACAGAACTTCT
ATAATTTTGGAATAAACCAATGTACGGTATCTTATTCTTAAGAAAAATGC
ATATTATAAATTTCAAACAAAAAATAAAAAGGTTCATTTACGTATACAGT
ACACGCATGATAAATGAGGAAACTCACCTTTAGGTTATAACTTATTAGTA
TGTATGTACATTTATACACATAATGTGAGCCCATTTTCAATCTCACAAGT
ATAATTATTTTGATATATCCCTTGATATATACAGAGTGTACAATCTTAAT
TAATTAGCAATGGATTTATGACGTTCATATACGAGTTTGTTTGAGTACTA
ATCACATATAACATTCTACGTCTAAGAGACGTGAGTTCATTTAGTTTTAG
AGGAGTTATTACAATAAGCAGCTCTCTTGTGCATCCAGTCTCTAGGATTG
CGATGATTAAAGAGCGGAATTTCATTTTCAGTAGTCCTATTGTTGTCGTC
CTCCCCATAAGAACCACTATAAGGATCACTATATACACCAGAAGTCGTCG
TAGGGGAAGAATACATATGATTGTTCCTATAGGCAAACCGGATATCGTTA
TATGAGTTGTACATATATTTACTCCTCTTGACTTCCCCTTCTTCCGGTAA
AAGGGAAGTCATTTCCAATCCTCATCTGTTCTTAGGTCCTTCCAACTTCC
AGGTCTCATAAGTGTCCCACTCCATGCCGTCATGAGGAAGTTTTGACTTC
ATAAAAGGATTAATTAGTATTACTTTCCAATTTTCTCCAAAAACCTCCTT
CAGGTTTTGAATGGCCCCAATATTGTAGGTATTGATTCTTCGATTATTCT
CGAATGTTGTTCGTCCTCGTAGGACCAGATGAGCATGATAAATGAGAAGA
ACACCAGTTAAAAGTAGGGCTGCAGTATGTACACTCCAAAAAAAAATGTA
GAATTGTAGCCAGGAGAAATCAAGTCCAGTGATGAGCATGACAAGAGGGA
AGACAAACTTGAAGATTTGTGCCCAAGTTAAGTTCCCTGATTCATCCAGG
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GGCCCACGCAGTAACCCACAAACATACAATGATGTTCTCGTTTTAAGATA
CAAGTATTGCAGACGGAACAGTGGAAGGATCTATAAATATGAATATCCAT
ACATATAAGTAATAATTTTGTATCTCTCTTTACCTTGGAGGTGTGACGGC
CTCACATGCAGCACAGAAATTCCATTTCTTTCGAATGACTGTAGGAAGAA
CCACGAAGCGAGTAGAAGTATCGATGAGCCATAGTCCCAGAAAATTACCA
AGAAGATTCATAAGTATGAAAATCCCCAATAGATTATGGATATAGAACAT
GACGGAGCTCTGTGAGTACAAAGAAGGAACCACAATGAGGGTTTCATAGA
AATAACTGCATGGGATCATAAAGGAAACGAAAAGGAAGGCCCCAATATCG
GAGACTTGACGAGGGAACAAATGGTTACGACGGAACCGGACCATTGTCAT
ATTGATCGTCTGCAGTTGTTTGAAATAAGGGAAATAATGCAACTGAAAAG
AATAAGTGTTGTGTATGGAAGGGAAG back to top
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