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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s18 | supercontig | LSalAtl2s18:1657487..1691795 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003470 >EMLSAP00000003470 ID=EMLSAP00000003470|Name=EMLSAP00000003470|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1034bp
MALSPAEGSLIFFVLYSVLITVLLVVLLLLYRRKKSRDSQKNSRNPPHQL PYHENKSFQEDNPVIFVSNATQKRPNNQINEQSFHPEISTVEYEVQRQRN ISRGEESLASFKSVDFASVRSDSFHTLYDEVTLYSSSPKNGRLQEEQDFF NAISDNSHLKKKKVAPKPPSISKAKVLRISPSDGFIYDDPTSSENHMNQI NQPFHPKNSTPLSNSSNELLEYGILQKPSQKRNLKNVPEIITPLNNIEPD LIAESSKNKLNISSASSLSDVSNDKKLNKRLDSDTSERTIIARDTLPRKI KIVHSDSSESDLASIGDPEFVRLNFKSKDMSSPNNIKKYYPDEKGNLENK YESVDGGFSITDEGMVTSTLRDNKDTFNDSIDESIISGTRMDGNQNYNKV EGKLKMCKPVXYXSXTDTEKDMSDLENVTNISDLNKDMSIISETSTYSIH FQNFKEGSVSKKVETDEPIGYIPGYSSDTNNDSSFIEKIYTPSDPKISAN PKYEMKTNATLSTTEIKQIIPVTISSSSSSDSSDESQKYPLYTKIIPSSN AHSFESLTNSTHIDTQPLPKNEDTTPQTFTNIEQTKQFINKKMISKDEFS TTEMKQCIPRTLSSSSSSDFSSDSPKIGSKTKSSPPNNVHSFGTINNNIH EIQLNDDFSTTEIKQCIPKTLSSSSSSDSSSDSPKLVSKTKNSPLNNVHS FGSLTHPIQIDTKPLPKKYDTSPQSFTNIQATNNHVTKMKLNDDFSTTEI KQCIPRTLSSSSSSDSSSSSPKLVSKTKPGTESKSLPNPTHVDNLSYPKI YRDVTKMSTKYVPLSQIKMQMETSPLQTLNSTPDHSHFKLIKTVDINAPR DIKYSLDEASGLKYMEHDYNSLGKSRIEEKETKELSTEEYSDEHDGITNL PPNSDQRNNTKIQHCVRVSSSSESEIIHSPPDPMQVLNPNKQLSMKKNLK RSKSLDSLSSLGSDKSNTIHVDPIVDLVSSSSLSRIEKGTKSYDFNIKYP VFYSLNRNYKPVYEVESLRYKNESLKRSISTESL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s18:1657487..1691795- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003470-699317 ID=EMLSAT00000003470-699317|Name=EMLSAT00000003470|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=34309bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s18:1657487..1691795- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGCTCTATCTCCTGCTGAAGGCTCCTTGATCTTTTTTGTCCTCTACTC
CGTCCTTATAACTGTTCTTCTTGTTGTACTCTTGCTCCTATATCGAAGAA
AGGTATGAACATTCTAGAACTTTATTTAAGTAATTTTATAATATTTCCAT
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GTGATGAGACTATGTTATATCAAAACTGAAACGTATGCAATGGATATAAA
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CAGTCATCTGAATTATGAAATATCTGAGATTATAATAATTTGGGACTATT
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GTGTGATTCCTCTTCTTATCGCTTCTTGCCTTGTGGAACTTCCGTTCGGA
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ATTTGAACAAAACTTATTGTGCTTAAACTGAACACCCAATCTCACATWAA
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AAAAAAACATACGTCTGTTATATTATTACCATCTTCACCTGGAGTAAAAA
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GATGGCTTTAATCAAGTTCAATGGGAAGATTCCATTTCATTGGTTTAAAC
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CATGTACAAATATCTTTTCTACCTGGAATTACCCAGGTGTAATTACGAAC
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AAGATGGCCCCTTTAATGATGTACCACAAATGACGTCACTTAATCATTTT
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GTTCCTACTTAGAACTCCTTCCTTATCAATATCTCTTACGACATATTCAT
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GTAGACTTGAATCGATTTAATGGAGTTGGAGATATTCAATTATCTAGTTT
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AAAAAAAAAAGTTGATTTTAAGAGGATTTCTTACTTCATGATTTTTGAAT
TCGAAGTATTTTATTTATTAAAAAAATTGGTATTTGAGAGAACCTTGATA
ATATAAACGTATTTTTCTTACATCCTGATTTGATTGTATTTTTAAATGGT
GTAGAGTTATTAAATATTGTATCGAGACATCTTCAATACGTATTTAATCA
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TAAGTGCCAAAACGAATACCCTGCGTTTAATTACTCGTTTGGGGTTAAAA
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ACATGTATTGAAATACCAGGGTAAATAATCAGTTCTTCTCTAGTGTAAAC
ATCAATCAAGTGATCCATTTCACCAAATTTGCTTTACAATAAATCGATTA
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AAATAAGGACCCAAAAAAAATATCAGTTATCATTTTTGAACATACCGTAA
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GATACTTGGGTGTCAGAAGAAAACTTGATTGCCACTCGGTAGAACACAAA
ACCTCCCCCTAAAATCAAATGAAATTATGTATCTCAATTTGTTCCAAAGT
TATGGTGGATTATGCATTTTTTTACTTTTTGTGTTACCTTGACATTGACC
TTTGGCCTTGACCTCTAAAATTTTTATGGACTCTTACTGTGAACATAAAT
AATCTTTGGATCAAGTTTGATTAAATTCGATCTGTAACTTACGAGAGTCG
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CAACTTGCCTGGATCCCAATATGGACATTCCATATTGTACTTTTTTTAAA
CATATTATACAAAAATATCCCAATTTTTGCAAAAGATTATGTCTGATCTG
AATCATTAAGGATCATAAAATAAAATATTGAAAGGATTTTGAATTGAAGC
TTCAAGTACTTAATAATTATTTGGTGAGGTTGATATATTTAATATCGAAG
CGACTTAAAAAAATTTAAAGTCCACTCTGGGTTTTTCAATTTAAAAAAAC
GTGAGTCAAATAGAAAAATTAACAACTCAAGTAGAATTGCAAAAAGTGCA
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TTTTCACTTTGTGCTGGCCTATTATGTAATTTACCTTTTATCATGATAAA
AAAATGAGCAATTTAAGCCCAGTCATCATTAAATTGATTAAAAAAATATA
TTTTTATTATAGGTTCTTATGAGTCAATGGTGATCAAGTCTTACTACTCA
TCCATCTTTTTATAAACACTTAATCTTTCTTTTATGACATAGTCGCATAA
TGCTTATAGTGTCATCCTTTGTTTTTAAATCCAAATATCAATTGTTTTAA
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AAGTTACAAACTATTATGTAATATTTTAATAGCCCAACTAATATGATGAC
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ATCAATATAAAGTAGTAACTAGTGCTTCCATGAGGAAAAGTTTCATACAT
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TGGAATTGGCTTTTTTTTTATTTCATTCATCTCATAGCCGCTCGCAGCTA
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AAGAGAAAGAGGGAGCTGGGCACATGGTATAACTGAATTAAGACCCTTTT
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ATTATAATTACATATATATTTTTAAATCAATTTGCACCGAAGATAAGCGA
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AATTGCTGTACTTAGTTTTTCCTTCAGACGGATCCCTTCGTTCTTGTTGT
TGTCCCTCACAAAATTATCGTTTGGCCTCCGTACAACCCCTTTTGAATAA
GTTCTGGCAATAGTTAAGCACGGCCCTGAGTCCAGTTCTGTTCCATCCCT
AACTTCCGTCCTTTAAGACGTATAAAATTTTAGAGAGCCCTCAACAAGAC
TAATTTTTCACTAATTCTACAGTAAAATATCTCCGAGGGGTTGCTAAATG
ATTTCCATATATAAGAATTATTTCCAAAATTAGAGCTAGAATATATCTGC
TTTTCTCAATGCACAGTGCCCATCCGTCATATTAAGACCTTGATTCGCTT
ATAAACTTAATATCACATCCACAGCCTGTAATTTTATTTGTTCGTTAGTC
TCAATTTTGACTTTATGTATTGCAAAAAAGAGAATTGATATTAGAGATAG
GCCGTCAGAAAGTCTTGGAACGTCTCATGAACGTTGAACAATTAATTACA
CCTAGCGGCTTTCAATTAAAGTCTACAGAATTTTTAAAAATTGGAAGTTT
TTTATTGCTCATTAGATTACATATTTTTGAATTTGAGTATCTTGGCCTCG
ATCACACGCTCCACACGACTCCGAAACGCTTTGAATACGTTGACAACGTA
GTTCTTCGACATTGGTCGCCACTCTTTCTCAACCGGTTGCTTTAGGGACT
CAATACTACTGTGACGTTGTCTACAGGCATTGCCTTCAATTTGCCTCCAG
ATACTGTAATCAAGGGGATTTAGTTTGGGAATCTGCGGTGGCCAGAAGTC
CTTCGGCAGAACTTCAATTTTTTGGACATCCAATCCTGCACGATTTTTGC
CGTATTTTCAGGAGTTCTGTCCTTTTGAAAGCAATACTCGGCTTTTTTTT
ATTGCTTTGTGATCTGGGGAACCTAAGGAAGTACTTTTGTTAGGAAAATC
ATCAAGTAATGCTTGCTAGTCAATCTGTATCCAACGGGGAATCCGAGAAG
AACAAAATTCGATTTCCGTGTTACCTCAGATCATTGTAAAGCTTTTTGCA
CCGTTCAAATCGTAATTGTTGTTATTGTTGAGTAAGCAAGGGTCTTTAAA
TATATCGGAGAGACTTGCACCAGCTTTTTTTTAAAAAGTATTAGACACTG
TAAACGACTCATAGACCACTTTTTTGCCAAGTCTGTCATCGTCATCTTCG
GATTTTTCGAAAAAGCTTATTAAAAAGAAAAAAAATCCTGAATTTGGGGG
GGGGGGGGGACTTTTGCATCCGGSGTTRTTAAAATTTGTATTGGATGTAA
AAAATTTTAGACCAATAAATCCCTAATTGTTAGTATTTTTAAATGTAGGT
CTTTTCGAGATATTTTGTAGAGTAAAAAATAACACTTTTTATATAATCTA
AATTTTCTTATCTTCATCTTTATATGACACATTAGATCTTATAACTCCTC
TTCAAATATTTTATTGATTATTTACTTAATAAATACTTAAATCTTTAATT
TATGATGGAATTTGGATCATGAAGGACACATTAAGAGATTAAATTAGTAG
GCTCTCCTATGAAGTATTGATAAGAATATCTACTTAGCGCTCATCAAACA
TGATCATTTTGAATGCCTTTATAAAACCAAATTTTATAAAAAAACATCTC
ATATTCATCAATTGAGGTGTCATAATTGTACTGACACATATAAAGGCTTA
AACCTTTACCATTAACTAATAATCAGGACTGGTATAATAAACACTGACAA
GACAAATACAGAGACCTTTCAGGAGCGTTTCTAGGATTATCTTTCAGAGA
AACATTGATTATCTAGGGGCCGTAATCTCCACAAAGGGCCTGTTCACCCA
ATTTTTGGTTTCAATATTAATATTTATTTACCTTTATTATGATGAGTCAT
CCATGGTCCCTCCTATATCAAAACAGTGATACGAAGGCTCAGAAATCTTG
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TATTTATATTTATTTCACTTTTTGACATATCTCATATATATTCCTTTGTT
GTTATCACATACAGAATCCCCCACGGTCAAACAAGTCAGTCTGAAATTTA
GCAAGTATACTTATAAAATAAGTTTTTAGGGCACCGAAGTCATTAAGAGG
GCGTTTTTGACCGAGATTAAACCTTATTTCCCTTCTTTCTTTCTATATTT
CTCTCCTCTTCTCTTTTCTTCTACATTCATTCTTTGTTTCTTTTCTTCTA
CACCCTCTGCTAGTATAATATATTTGTCAGTCAGTTTTTTATGTTATCAC
ACAAGGAATACAGAACGGTCTAACAGATCAGTCTGAAATTTAGGAATTAG
ACGTATAAAATAACCAAGCATGTTCTTATGCTATTTTTTGGGGGTCTTCT
GAGGTCATTAAGAGGCTGTTTTTGACCGCAATAAATCCCTTTTGTTATTT
AATCTTTAAATATCTCTCTTCTTCTCTTCCTTCTCAGTACCCTCTGCTAA
AATCTAACATTATGCAAATGTATTGGGAATGTTCTTAATTTTTTTAACAA
AATAATGTACAATGTGCGTGTCCCTATTTCTTACGTTAAAATTGACACAA
AATATATCTCTCTTTATTTCAATTATATCACAGACCACCTATTACATACT
TTGATTTTGTTCCAGTATCACGGTTTTTCTTTTAGTATTAATTTGAAACT
CTGCAACAGTTTCCTTTTTCTTATTTTTAACGTCGTTTGTTNTTTTATTT
TTCTTTTTGAAAAATTTGTCCATCTTTATTTTTAATAACTAGTTAGGAAT
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ATACTCCTAACATTTCGGCCATTAACCATTTAAAAAATTAAAAAATATAT
CTTATTTGAATTTTTGTTCAAAATTGTTTTTGTCTTGAAGCATCACACAT
TGAAACTCTGGACTACAAGAAAGAATTCTTGGGGCATTTTTGGGCATATA
AATTGAGGACATTCCCAAAACACACGGCCAGATAGGAGGGATCTGGCCTT
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AAATAAATTGTTTGCCATCAGGGGGAAAAAAACCTCTCAGCCTTCCCCAA
AAAATTTCTGAGGTAGTCGGAAGGAAGAAACATTTTGTGTAATTGTTTAT
GAAAGTTATTATATCGTTTTACATATTTTGAAAATTGATATGGCCATCAA
TATGGAAGAATTTTAAAATTGCTTAATATCAATTAATTCTCTGATTATGT
TGTTCAATAATTATCAACATTAAGTTGGAAAAAATATTATATATATAAAT
ATTGACATAAATATATATAATGTTTGTTTCCCACTGAATGTTGATAGTTA
GTGAATAACATAATCATAGAATTCATGGATACTAAGCATTTTTAAAACAG
GTACAGGCTATACCTCTTATACAAACACATCAAAAAATGTGTTTAATAAT
AAATAATGTAATTTAAATAACAGTGTAAATTCATGATGGCTGCATGATTA
GTTACAGAGTTTTATTCATGATATTCTCAGCGTCTCTAGCAGACAAAAAA
GTATTTTTGTAGCCAATTTAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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ATAAATGTAGACGCCCTTAGTCGCAATGGTAGCTTCCAGATGGAGGCAGA
ATGCCTAGCACCGGCTGGGGRNGTAGAGCCCTCTGGCATGGKACCCCAGT
ACTAGATGCCAGTGTCTTTGAGGGCCTCAGTTTGCTGATGACAGACACTG
CATTCTTTCCCCTCGACATGCACCACAACTATGTAGTCGAAGGGGTAGGT
AACAGAGTTGTAGTAGTGCTAAAAGTGTAAAAAAGGAGATCAAAGGACTA
ATTTAAAAGAGTCTTGCAAAGGAAGAAATGGGTTTCTTTCTTTGCTGGTG
TCGAAAATGGCATTTCCACTCTCACAAGGCTCTTTCCAACCACTTGTTTG
ATAGCTCTCCGGACAATCTGGTGTGAAACTCTTACATGGGCCTTCATAGG
CTTGAGGGGRTTGACCTGGGCTGTTTTCTTTAACTCATCCTTGTCCAGTT
TGGGCTTTTAGGCAGATCCATTTTTCCTCTCTAGCTTTTCGGACTTGTTC
CCGGGATAGACAGTGATACTGGCGACGCCCAACTGTTAGGAGTCCACGAA
TGGAAATGGAAGGTGGAACAGGCGTTCCTCTTGATGGCGCTCCAGATTCC
TTAGTCAAGAGGGTTGCATTCTGGCGAGGAAGGATGTCACATTGACCACG
AGCATAAATTTGCAGTCTTGCTGGAAAATATATTTGCCCTTAAGGTAGTT
GGCATTCGAACAGTGAATMCCATTGCCTCCATTACCTTTAAGTACATGAC
TGTACCAAGCCCTTCAGAAACCAATAAGGTGGCATCCTCTTCCCTTCAGA
TCCAAGGACGCTGAGCATGCTTTTTACCCACTAAATTCCTCTTAAGGGTC
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