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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s192 | supercontig | LSalAtl2s192:326430..402914 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003523 >EMLSAP00000003523 ID=EMLSAP00000003523|Name=EMLSAP00000003523|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=442bp
MSIRRRFSSFREAKEITSSPASLNVPRRSLKKNHHIRPGGAQSGSHSRWC NTEGFAGKIWYLHYGGVIYALISGQPLLVVMTTAPVALYTKIIYLVAEES GFDFRTLYCFVGLFNSLYLILYSFVNASKLMRYSTRSTEEIFSLFICVAF TKDALGDAVKNFQEYYFSPACKVDDHSPISNGNMTSILLNSSVPSQLSGD GVGPSICQREVSILFLLLMFGTLWLAVTLYNFNKTPYLQAGKREVLTDYA LPVAVICFSFVGSHFFRDGTSYHWDLFVIGVLNIPFSIFCLPWMHAVLPH SPLHVRSLADVQEHVEEGHVYDIIVKVRETRITSXXXXXXXGLSIFFLGD YLXLIPVPVLDGLFLYLAVTALNGNQLFERFXLLFMEXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXTAYPPNHYIRRVPQRKIHQFTAIQ back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s192:326430..402914- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003523-699370 ID=EMLSAT00000003523-699370|Name=EMLSAT00000003523|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=76485bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s192:326430..402914- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAGCATTCGTCGACGGTTTAGCTCCTTCCGTGAGGCCAAAGAGATAAC
ATCCTCGCCTGCTTCACTAAATGTACCTCGACGTAGTTTAAAAAAGAATC
ATCATATTCGTCCTGGAGGTGCGCAGAGTGGCTCTCATTCTCGTTGGTGT
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GTGTCGCGTCCTTATTACGTAAATCTCATCTTAACCAATCTTGACATAAT
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GTTGATTTCCTTCTCTAGGAGAGATCGTAAATTGAGCAAGCGAATTTTTT
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TGGTCTGGATGCCTTAAACTCTTGTTCTTGGGTTTTCAAAGTTTTGATCT
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TGTTTGTCACGTCTTTGCTTAATCGCACAACATCTCACTAAGAAGTTGTA
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TATCCTGGCATCTACATATATATGTAACTAACTAAATAATATACGTATGT
GTGTACGCTCATATACGCAGAAAGTATTTTGCAATGTGAAACAAAGTTCA
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TGATGTATCCAGTGTACTCGCACTCGCGAAGCAGTTTAGAAATACTTGTA
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AGCGCGAGAAAGGCCTGGCCAAAAAAAATGTGCGCCCCAATAAAAAATTT
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GTGCAGCAGGCCCATGATTTAGTCTATACGTAAAAAAACCTGCAAACTTG
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TGAAAAACCTTTTCTTAATTTTTTTNAAAATTTTACCTTATGGCCATTCC
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CGACACGAAATGTTTAAGGAGTAATTATAAATTTAAACCCCTGTGATGCT
AATTCTGAGCAGATTATCTGTCATGAAGCTTTATTAGACCAGCTGCAAGA
AGCCGTAAACGGGGGAGAGATGTAAATAAACAAGGATATAGACTGGATTT
ACTCAGAGGTCGATCCTTAATTTTAATCAAAGTGCAATAAAAACTTTTAA
TTATAAGTTCCCAACAAGTCCTTAGGGTTATTTATGGACTTATGATTTTT
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TTTTTTCTGAAAATTTTACATTTTTTTAAAATTGGCATGAAATAAATATC
GAAAGTTTGGGTTCTAGTTGGATTATACAACAGCTTTTGAGGATTATTTG
AATATTTTTGAAGGTAAAATATGTATATGATGAAATAAGAGTTATGATTA
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AATTTGGGGCAAAATGGATTGTTCAAAAATCTCCATAGAATCTTCCAATA
TATGATAAATACTTTTGTACCAAATTGCTCAATTCTGGTATCTAATTTAT
GCAAATGGTTGGATGTGATGGTGATGATGAGATGCCTCCATCTAACAAGA
CTCCAGAAGATTTTGTCAGCTTCAAATTTCATTCAACTACTAATGAGGAC
GTTTTTTAGTACGTTTAAAACAACCTATACTGATCGAACAAAATTTAGGA
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TAAACCTTTATTTTTCTTCATATGCAAATTGCTCAATTTTTTATTTTGAA
TGATCATTTTTCAAAATTTTAGCGCTCTTTTTTGCCAAAAAATTGCTCAA
ATATCATAAGTGTACTCATCAACTATCAACGTTTAATCTGATTTCGTATA
TGTATATCAATGATATTTTGTATTTAGTTGCTATACAAAAGACATAAAAA
ATAGACCTGATTATTATCCAATCTCTTGTAAGAAAACAACTAAAAACACC
AAAGTTATCTATTGGGGAATCAAGTAAATGAATATTTCAGTTTACTTATT
TAAAATGTGTTGCTTTAGTAATTTTGTGTATTGGTTTTACTATAGCGCTA
ATTGAGGCTAAATGAGGTTCGCTCTTAAGGTATTAAATTTCCAATTCTAA
AGCTTATAAAAAGAAAATTTACTCTTCAGTTTGCCAATTTAAAAAATTGC
TACAAAATGCAACTGGTTTTCATCACTATGTATCTATAGAACTATATTTG
CAAAATGATATGATGTAGGCTAAATACCAATTATAGTCCTTCCGGAAGTT
CATGCCTTGTCACACCTCTGGATCTAAGACAAATAGACCACATTGAAGTT
ATAAACAAAGTTTAGATACTCCAAAAAAAATTAACTATAGCATGGAATCT
TTATTTGATTTAATAGACTTATATGACACGTTTTAAATAAAATATGTATA
CTTCTAATTATTTTAGTGTAATAATGAACTTTTCTTGCTTCAAGTGATAC
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ATATTGATAGGCCTCATTTTGATGTATCATCAAATATATCAATGTGTTTT
TAAAAGAATGAATAGAAATTTCCAAATAATTAAAATTAATTAAAAATTAA
GAGCTATGAAAATAACTATTTTGTATGAATCGATTAAWKTTCTYTTTYTT
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GGCTCAATCATTTTTTGTCTNCTTTCTCTTTCTTTCTTTTTGGAGCGAGT
GAGGGGAAGAAATAGATGGGAAGCCAATCCAATGGGCTCAATCATTTTTT
GTCTACATTTTACATAGAATGATAAATAAGAAGCCTCATATTTATTGGTC
TTGTACAAGTTGCAATCCAAGAATGATACGAATAATTTTATTTGAAGAAT
TTTGATGAGATTTGTAATATAGATAATACAATAATTTTTTCTTTTTTTTT
AAATATCCAACAAGTTATTCATATTTAAGCCAATAATATTGCCCTGTTTT
GGGTTTATATCCACAAGGGCGACGTTTAATTTCATCCTAAGGGGGTATTA
TCAGTTCTTTATATATCATAATATTTAACCTGAACATGTGTTTTTAAAAA
TGTAATTGTCTTGAGGAGAAGATCTGTCAAGCTTAGTTCACGAAAACAGA
TTGATATTTCCTGGAGGAAAGGATTTTTTTAAAATTTGAATATAAAAACT
ATGGCATCCTTTTAAAAACGTTGCCACATGGACAATGCTATCAAATAACA
TGGAATAAAAATTTTCAATAATTTCTAAAATAATTGAGAAGAAAAAATGA
GTTTTCAAGACATAATGAAAATCAATCCTCACCTCTAAGTTGTACAACAC
GCACAACTTTATTGCATTAGGAAACTTCTACTCAGACAGAAACAAAAAAA
GCCTAAAAATAAGTTTGTTGTAAGCCAATTTCTTCCAATTTTAACATTAT
TATTCAATCATTCCAAGAAAATCTTTACGGATTCACTAGATACACATTCA
TCTTCAACCAATCACAATGCAGAGTACTAATTACGAGAAAAAAAGTGGAA
ACATCGACAGCTGATAACAAAATACATTGTATATTTTTGAGTTAGTGATG
TCATGCTGTGAAATAGTTATTCATACAACAAAAAGTGATAGATATATGAC
AAATATACGAATAAAACCGAGTRCTTTCCAAAAAATATAGTTGTGAAACT
CGGTTCAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTGTTGGRGCATATTTG
ATTTTCTCTAGACATATTTGGACCGGTATTTTGGTCCGTAATGTAATTTT
ATACTGTATACCGGAATTTAATCATTTTGTCATCGTGGACTTTTTTTTTG
TTTCGATATAAATATATTTAGATTATTTTATTCGCTACATTTCCTTCCCT
TTCTTGATTTATAAGTTGTACCAACATGATTTATACATATTTTTATATAT
AGACATTATWTTGCCTATGTTTAAAATTTTGAAACACAAATGACGTCATC
AACCATTAATCTATCGAAAAAATAAAACTGATCCAGAGTGAATTTTATAT
TAGGACCGATCTAGACCGAATTTTTCTAAGAGAACAGTTCAAACCGAACT
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GAATTTACCTGCAGGGTATCTTGTTATGTTCTGTATCCTCAGGTATAGTG
TTGTGTTGGTCCAGTTCGATCCAATTATAGGACAGGTTCTTAAGATTGTC
GATGTTTAGGTATCCCAATACATATCTGATTAAAAGAAGGAAAAATGAAT
TTGACTAACGTCTTCAGAGATAGAACTTACTAAGTTTTAGAACTATACTG
GGCCAGRCAAACACTCAACTGGAAGGAACTGCCGTGTTTGTTTCTAAATA
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TGGAACACTTTTTGAAAATTACGAAAATTGTTATACTTCAAAATTATCAT
CCAATTTGGAAAATTTAATTCGTAAATACAATCAAAAACACCATGTTTAC
ATTTTCAGTCTTTTGGCTTAGTGAAAAGTTCCAGCTTGGRGRAAAACTTR
GTARAGCAGTTCTTTACAAAGATTGGCTCTAGGTTGGCTCAAGCAGAGAT
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CTTCCCATTGAGGTTTCCAAAAATAACCAATTTCATGGGGAACAGCTAGG
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TGCACCGTGTCACACTTTTTACTCGTTCCGTAGGCTTCAAACCCTAAAAA
GAAGTTTTTTTATAGGCATTAAGGCTTAAGACTTGCTGCACCAAGTGGTT
CATGGTAGTCTGGTTACTATCAAATTCAAGAGCGAAGTCATTGACGGTCA
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CAGCAGAGCAGTTACAGTCCAGCACTTTATATATCTCTGATGGTGACTTT
CGAGGAATTTAGATATATTCAGAATTGCAGCTCCGCGTTGCTCCATGTTT
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GCTTTTTTGGCAATCTGAATATCTTTTTTTTAATTTTAAATAGCTGATAT
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AATTCTTGTATGTAATTTTGAATAAGTAAATTTTTATTTAAAAAAAAAAT
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TGTCGCAACTGTTTTATTAGAGCTCTGCAGTGAGCATGCTACAATATTGT
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TTTTCTTCTAATATAAAAACATTGTAAATTAATTTGGAACTGGCATAAAA
AATGTTCAGAGGTAACTCAATGGCTCCAAACTTTTGACATTTTACAATTT
TTTTCAAAAGAGCTTTTTTACCTATATACCATATATGCCCCACGTGTTTC
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ATATGTTATAGTTGTTTTTACTAATATTTAGAGATATTTGGCAAAAAAGA
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TGCTCGTTAAAAAAATACTTTAAGAGTGGTAAAAACCTTTTTATAGGTTA
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GAATGAATACTAATAGGTCCTCAATATTACCACTGCTGTAGAACTCAAGC
TTTATAATATACAAGAAGTAAGGCTTCTAACAATTATGCCCCACCTAAAG
ACAAGCTCACATGTGATGAAGCACACATATACTATTCGTTTTGTTTGGAC
TATCAACTCCTTATTTTAAAGCTCTGGAGTAATTTAAAAATTGAGATATA
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GAATCGCTACCTCATCAATATATACTAATAAGTCGAATAATTTAGATGAG
GCTATAAATTGCATATTCTGTAGTGAGAAACTCAAAACGTCAATACACAT
TATCTACGATTTTGATAGGATGTATCCTTTAGTACGAATGTCTGAACAAA
ACAAAATACAATTTATAAGTCAAGAGCTTAAAAATAGAATGGGTAATGGC
CAGAGATACAGATCTTCTTAGAACTTTTAAGGTAGAGACTATCATAAGGA
AAATACATGAAATATTTTATTCCAGCAGACGTCACAGAAACCCCATGCCA
ATAAATTTGGAATGTGTAATATTGAAAAAACTTGGCGTTATAAACAAAAA
GAGGTCAAGAAATAAATTTGGATTTTCTCATTTTTTTGATTTTTGTTCAA
TATTATTTTCAGGTTGACGCATAGCATTTATAATATACACACCGAGTTGA
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TATCACCTTAATTATCTTTTTTATGTATTCAATAGCTTTGACAACATAAA
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AACAGAGTATTAAATGTGTCTAGTATTCATTTAACAAAGGATATACTACG
CCGTTACCTTGATTGTATCCCACAATCTTTCCTCCGAAAATAATTTTAAA
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AATCATACTAATTAAATTGTTCACAGCAAAAAAGATCGTACTGTAATTTA
ATTAATCATCGTTCAAGGCATTGATTAGGGAAAAAGAAAAATCGACTGCT
GACAAGAAAATAAAGTTTAAATTTTTGTGTTAGTGATGTTATTTTAACTT
TTATACGGAAATTTAAAATTTATTATTTTGTACAAAATATATACAAATGT
GCAGTGAGCAATTTGGGCATGTCAAAAAGAAAAGAAACCGGAAATCAAAA
TGGTAGCCCTCACAATGTGAAAACAGTTTTTGAGCAGCTTAACTATCATG
ACTTTTATTAGATCAGCTACAAGGAGCTGTGATGAGAGGGGTAGGTGGAG
AAGAAAATAAACATGGACATGTGCAACAATTACTCAATTATAGTCTAAGT
CCAACAAGGACTTCGAAATACAACTCCACAATCAATCCTCAAAGTTATTA
TCCGTCTTTAATGAGAACACACAAATATTAAATCCGTTTTTGTATCTAAA
TTATAGTAGAAAAATAAGTTCATTTCTCAGGAATTCAACAAGAATAAATA
ATAGCAGCTATGTAAAATGTAACAAACATCAACTACAAAAAAATTTCCAG
GCTAATCTGATTAATTTCTCATTCTTGAGCTGGGAACAACCAATTATGAA
TTTTATGTGCTCATTAAAGTACACATTTCTCAGGGAACTATAAGAGTTAG
TCCCTGTTGACTTGGACTATAATAGAAGATTACTTCAGATTAGTTGACGG
GTATGCGTTTACGAGAAAGTGAGTGGGATTTGTGTTTATTACCTTCCTTG
CACTCTAAAAGCTGCCTGTAGCTGATCTAATAGAACTTCATGATAGGAAA
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TTTCGTTTTTTTTTTTTTTACATACATTCTGATTTTTTACAACTCCCATT
AAGACAGTCCTTTAAGACATATATAACACATTTTAGTTTGAAATGGTTTT
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ATGATTTTTATAATAAGGAAAAATTGTTGCATGGAAAATATATTAGTAAA
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CAGAAAAGAAAGTTAAAGAACCCCTTGATAAACTGTCTGAAGCTATGGAT
AGTCTCCGGGAAAATTGTTTAAAGATCCCCTTGATAAACTGTCTGAAGCT
AAGAATAGTCTCCGGGAAAATTGTATTGAAACAATTAATKCTGCCATAAT
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TAAGCCAGGAAAAGATTTTCTCATCTCAAAGGTATTCAAAGTGAACGTGA
CAATGAAAATCTAACATCAAAGATTGTATCCAATTTTGGATCAGAAAAGA
AAAAGAAAAGAAGGAGATTCACAAAACATGATAAATTCAGACGGCTACAG
ATGAGAAAAGAAAGGAATATATTTCAATCTTCCATAACTACTCATCTTTG
AATTAACCAATGGAATGAAAAAATTCGTGGAAAAAAGATTGTATTTCGAT
TACCCCTACGAAATTGAATCTCGCCGATATTCTGGTTGACTTCCAAAAGT
TTGAAAGTTCCACAAAGTGGCGTGAGTTCTTCTTTAACATACGTAAAAAA
GAAGGAGAAGATGTTAGTGAAGATGAGCATGTACCACCTGTTTTCAAGAT
ACAGAAATCTAATCTTTCAAATAGAACCCCTAAAGAAGTCGAAGGATATT
TATCCGTAATCAAAGGTGAACTCATCAGAACACATCCCAAACTTATTCAT
CCAAACATTTCAAAAGACGAGAATGTAGCCTTGAAAGAACTAATTAGACT
CCAAAAGAACCAACAATTGATCGTCAAAGTGTCAGACAAAAGTATTTTCT
AGCCAATTTTCATAACTATTTGGAATCTTGCAATGAACATCTCTTGTCTA
CAACAGTCAATGGCAATCCATACTACAAAGAAGTCACGGAGAAGGAGTTC
AAAAATGCCAAGAAACAAATCAAAGAAGTCTTGAATGATGATATATTGAA
AGGCTTCATCGATAAAGATGAATTTTTATGTATAAACCCAGGAAAAAGAA
CGCTGCTAGATTTTATGAGATCTTTTTTAAAATTCACAAAGACCATCTTT
AATGGAGTCTTCCCCCAGGGCGTCCCATCATATCCGGCAATAACTACATC
ACTGAGAAGTTAAATGAGTTCGTGGATTTTCATTCAATAGCTTCCGTAAA
GTGTCAAGAAACCTTCATCCAGGATATTCTAGACTTCTCGAGATCCATCA
TGGAGACACCTATCTCCATTTATGCTGCTGGTTTATATAGCAATATTACC
ATTAATGAGGGATTCGACACATTTAAAGAAGGTCTTGAAACTGGAACCAA
CAAATCAATTCCATCATCGTTTCTGATATCATTGTTGAAACTAGTTTCTT
GTCTGAACATATTTGAATTTGATGGGTAGCTCTTCATCCAGTTGTGGGGC
AAGGTCATGAGAAACAAAGTTACACCCACGTTTACCAATATTTTCATGGG
CAAAATAGATAAAATTATCAAACAGATGGCAGCACAATCTTCAAATCAAA
AAGTTTCCAATCCTTTTTATTTTCTACGTGGGTTCATTGATGATTTGTTT
ATTATTTGGAATGGAACAGAAGAAGAACTTGAAAATTTCATCTCATATTT
GAATTCAGTTCATACCGCAATAAAGTTCACGGCATCTTTATAAAATAATC
TACTCATTTTTTGAACACCATTACTTACATAAGAGACGGGAAAATCCATA
CGGATTTTTACCAAAATAAGCTTGTAAAATTATGTATCTTCTCCCCTCGT
CTATCCCACGTGTGTCGGAGTTCTGTCCTTAAGAATCTTGAGAATTTACA
GCAATGAAAATAAGCGAGAAAATTGTTTTCAAGAACCTAAAGAAATGCTG
ATAGTACAAGATTATCTACCAAAAACTATGGATGCTTCCATCGATAAAGC
AAAGTTAATGGAAAGGAATGAATCAGTCAAGAAAACCAAATCCAAATATA
ATGATTGCCAAGTGTTTGTCATAACTTATTATCCACAACTCAAGCAAATT
TCATCTGTACCTCACCATCATGGGAGAGTATTAATGCTGGCCCCTAGAAT
GGAAATAATGTTTCCAAAGCCAGCTATAATTGCCTACAAAGAAAAAGAAA
ATCTCAGGGATCTCCTTTGTCGTGCAAAAGTTTTTCAAGAAACTCTGAGT
AGGTCATTCGAATATGAAAGTGCAGGTGCTAGAACAAGCCTGACCTCTAA
AATCCGATACTAATATGATACAGTTACTTTTGGTTCGAGAAAAATGGGGA
ACAACCAATTTCAGTTAAAAAACTTCTTCTTTTTTTAAAATTTATAATTA
CGAATTTATGTAAGGGTACGATCCTATATTTTGATATTTTATTATTAATA
CTATTTGTGTATATTATTGATATATTATTTTATGTATTCTTAGTTTTAAA
TTTTAATATTTTTATTTTTTGTGAAAACTTAAGAATTTAAGAATATTGTT
ATTTTGTTATTTCTGAAGAGGTCTCCAATCGAGACAAAATCGATTATCCT
ATAAATAGCTATGTTTTATAGTGTTAGTTGAGTCAAGGCCGTCTTTTATA
AAGTATTCGTCAACATTATAGTATAGCAACTATTCTATCTGACCATGTTG
AATTGTGGATAAAAAATGGAGTACTTCTTACCTAAGTTCGTTCCTGATAC
CTAGGTTTATGTATTTTATCTCACAATTGCACACAAATTATTTAATGGAA
CGTCATGGCAGCTAATCTGATCTCCTCTGAAACAAAATTAAAATTATCAA
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TTACATTGATCAAGGTCTTGTAATCTAGATAAATCAGTATTGTTTGCCTT
GAATAGTATTCTTGAAACAATTGGTCCTCTAAAAAGCAACGTAGACAACT
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CTTTCTGATATTGGATAAACACCAAGTTCCCAATCCCTTTCTAATAGCAC
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TTGCAAATCAGGCTCGGGATCTTGGAGCCCGACAGTCCAAGAGAAATAAC
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AAGACGTTCTCTATATAATCTTATAAAGGTAAAATTTATATAAAAGCCAA
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