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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s197 | supercontig | LSalAtl2s197:152115..159124 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003602 >EMLSAP00000003602 ID=EMLSAP00000003602|Name=EMLSAP00000003602|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=869bp
MQFINVKPFHTCHERVNHGINWIFYQYGMIVAKYSYVFIGLSLGIFIAST
LGFIDYVTESDPTKIWLPQDSYYVQNTKKIKDLNSDAVNAATVIQVIVES
EVNILRAKELNAVYKLHSSIINLKAPSNETFKDLCFKERVTVPISTPPSE
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VGPAVLSGGISTFLAFILLANSSSIVFTTFFKIFFLVVLFGLYHGLIFLP
VLLSFIGPVYRQVQDSTKK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s197:152115..159124+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003602-699449 ID=EMLSAT00000003602-699449|Name=EMLSAT00000003602|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7010bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s197:152115..159124+ (Lepeophtheirus salmonis)
CTCTGAAGTAGTAAAGTCATTCAACATGCAGTTTATCAACGTAAAACCCT
TCCATACATGCCATGAGAGAGTGAATCATGGGATAAATTGGATCTTTTAC
CAATACGGGATGATTGTGGCCAAGTAGGTATTATTTTTGTTTTGTATTCT
TAGTTGTTGTTTGGCGAAAAATATTTATAAAAACAAATAAATATACTTAT
TTATCTGTTGATCTTTAATTTTTCTAAAAATAGTTATCATGAATCTACCT
TTTGGTTTATATAGGCTTATATATTTGAGAGTAACGTGAGTATGCGTAGG
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TTGCAGTGTCTATCTAAACGAACAATAATTGATTGATCTATCCTTTTGGG
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TTTATGACAAAAATAATACTTGCTTCAATTTGGTTTTCAATGTTTTTTCA
TCTGATATTGAAAAGTTTGAATCCAAGTTGATGACCGAAACATCATCATG
ATTTCAATTTTCATATCGAATCTTGTTTATTTTTTAGAAAAAAAAATGAT
TCTTGTTTTTTTCTGGGAAATATATTGTGCTTCTTATTTTTTGATTTTCC
CACCTAACTTTTTGATTTTCCCTCCTAAATTTTGCACCCTATAAAATATT
TATTGGAAYAGGGGGAAGGGTCAGACTKCCCCACCGCTACTGGTCACAAC
ATAAAAAAAAGGAGGACKCTTCCAAAAATTTTMAATRTTTTTTTTTRTWT
AAKAWAACTTTTTTTTRWTWTTRTTMTTWTTMWTTTAAAAAAAAAAAAAA
AAAACCATAATNAACCATAATGGAAATTAMTTTCAYAAAAWAATTTCTTA
TGTTTTTTMTAAATACATTTTTCCAAATGCATTTGAAATAAGGAAAGATT
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CTTTAGTGAGTTTTTTTTTTGAGAAATAAATTAATATTCATCTTCACTTT
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TACTTTGGGATTTATCGACTATGTCACAGAATCGGATCCAACAAAAATTT
GGCTCCCTCAAGACTCTTACTATGTTCAAAACACTAAAAAAATAAAGGAT
CTCAACTCGGATGCTGTAAATGCAGCTACAGTGATACAGGTTATAGTGGA
GTCTGAGGTCAATATTCTAAGAGGTATGGTCTTAAAAGTTTACTCATAGG
TAATTAAATAGCATGATGAGGCACGTCATTATTTGGTGTTTTTTTCTAGT
ATAAGTAAAACATTATTGGGAGGATCCAGCACCTAATTTGATCCAACATA
GCTCCAGTAAATTATCTCCTATTCTTCAAGAAACTAAAAAACAAAATTCA
TCTGTATCGGTTTTCGGAAAAATACATTTCTTATATTTAAAGATAACGTC
GTACAATAAATTAATTATCACTGTTATGCTTTATCCCTTAGGGAATTCTA
ATTTATTATTTTGAATTTGACATTTTCTTTTATAAATCCTCTCTCACTTT
CTGTCCTATACGACAAGCTTTTTTATCCCCTCAGAACCTCTACTCTGGTA
AAGAAAAGCGGAAAAAACAACTTATGGTAAATATGTGAAGATTTGGCAAG
ATAATGATGATGTATTGATATCACTTTCAGCCCTTTTAAATCAGAGTAAA
CTGACAAAAACAGCTGGAGAGATAATACATTGTATTTTAGTTTATTTAAC
TCTACATTAGTGAATGGGGATATTATGCACCCGAAAGTTATTAACATCCC
TATTATTTCTTTAAATCTACATTTCATAACTTTTCAGCTTACTCCTGAAA
AATAAAATGAGATTATATACTATTCTTTATTTATGTTGATAATGCCTTAT
TTAGGTTTTTTTTTGTTGTTGTATATTTAGCTWTTTTRAATGGYGGTTTW
GTGAATTTAATTAGCTTAAAAAGTCTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTGG
TATTTCTTTGGTATTATTTTCTTTTTTTAATTAATAATAGGNAGGTTTAG
TGTAATTTAATTAGTCTTAAAAGTTCTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTGGA
TTTCTTGGATTATTCTTTTTTTAATATAATAGGATTTTGTAACTWTTCAG
TTATGTAATTATAATATACACAATCTCATTAAAACTGATGAGTACTATTT
TGATCCCCAAAATTTAAACACAGAAATAAAATTTCACAGAAAATTTTATC
AAAAATAAAAGTATAATGTTTTTGCTTGAAGAATGACAAATAATATCTGG
TTGAAACCCCAAACTACTCAAGTTGTCAATATTATTTTAAAATAAGGATT
TATTGATGTTTTATATTCATTCAAGTTTTGTTTTTTTGCATTTTAATTGA
TATTTACGAGTGCAAAATGAACGGAATAATTTTAAAAAATGACACAAAAT
TTAAGTGACTATTATTAATTATAATTATTCAACTATACTGTAATTGAATA
CACTTTATTTTTGGGGTATATTTTCTACTCCGTTTACTTACCATATTATA
ACATAGATATTGACTAACAGAATGTTAAAAAAGCGAGTTGTGCTACTCTT
TTATTATTCTTTTCTTTTAATGGCCCTCTACGATAACTAAATTAATTTTC
AAATAAAATTTATCCAAAAAAGAAATTTAGCTATGAAATATTTCACTTTA
CTTTAAATTAAGCTTAAGATTTTTAGCTATGAAATGAAGTATTTTACAGC
TCTCTTTATTAATTTTAAGAAAAAATATCATTTTTTTAATTCAAAGGAAG
AAAATTTAAAATTATAAAAGGAGTTTGAAAATCTGTAAGGTTAGGCTTTG
AAATGTATTCAAACTACTTATCTCTATTTTGGACATAACGTGCTAAAAAA
ACTTTAAATCCTAAGAATGACCTATAATGACAAAACCTGATGAATGAAAG
ATTTGCCCATATTTGGAATTAGGGACTTAAATTATAATAAGTTTAGTCTA
ATTTGATTTCAAGATACTAAAACGGGGGATTTTGTTGGTCGATGTTATGG
TGTCATTTTTCATTAATATATTTTTTACATTATCTACCCTCTGTTTCGAC
AATTTTTATTTATTATTATGGTAAAATATATATATATTACTATTTAGAAA
AGTTATTTTCATTTTTTTTGAGATCCAATGATCATTGGTTAGTTATGGAC
ATCTTTTAGGACTCAAACTGTAATTTCTTTCTTCTATATAAATTGAAAAA
TCTGATAAAATAAGAAATATTGTGAAAAAAGAGGATTTTTTTTGTCTATG
CTTATTTTCTAACGCTTATGTCATTTTTAGCTAAACCACATATGCCCCTA
GGTAAAGTAGTTAATGAAATATGACTTTATATGATTTAAATGTCCACCTT
ATGCAGCTTCAAATAAATAATAGAAGGAAGATTAACGTAGGAAGTGAAGG
AAACGTAGTTTTAGGTAGAAAGTTCAAATGAGTGGCGTAAAGTTTGTCTG
GATTTTTACCTATATTTACGATTTTTTCGGCCGTGGGAGGGAATTACATT
TTTTAAGGAATAACTTTATTTCAAATTCTAACACTTATGTTTTTTACATG
CTCAGCCAAGGAACTAAATGCCGTTTATAAGCTTCACTCCTCTATAATTA
ATTTAAAAGCTCCATCTAATGAAACATTCAAAGACCTTTGCTTCAAAGAA
CGAGTCACAGTTCCAATTTCGACACCTCCAAGTGAAATTTGTAGAGCATT
AGCCAATGCAGAATGGCTGTGCTCTGCCAAAAGTATATTTGAAATCTGGA
CGAGCGATGAAAGTAGTAAGGAGGCGTCCATTATTGCCCAACTCACGGAT
GAAGATATTTTAGATGCTTTAAGTCAGGATTTGGCAATCAGCAAGCTTTT
TCGAAGACCTTTTCGCCCAATAATTGGGTCAAAGATGTTCAATGACAATG
GGACTTTGAAGGGAGCAAAAGCCCTTCTTTTAAGTTACTCGATCAAAACA
AACAGCTCGGATAAAAATGGTAATTTTGTTTCCTTATTGGAAATACATAT
TTACATTAAATTTTATTTAGGCATTCCAATTTGGGAAAAGAGTGTCAAAG
AGCATGTCTTTAATTATAGTTTCGGGGATGAGAGCAGCAATCTGAGTGTG
ACATTGTTTAGCTCTAGCATCTTTCGAGCCGAGTTTCAAAACGGAATGGA
AAATGATGTTCAACTCTTTATTTTTGGATATTTAATTGTTTTTGTCTACA
TCATTTTTAATCTGGGCGAGATGAACACCCTGGAACATAAATTTTACTTA
GCAGTTGTGGGGATTGCATGTGTAGGAATGGGCTACGCCTCTTCTGTAGG
CATTTTTCAACTGTTGTCTGTATATGCAACTCCTATGAATTCTATCCTAC
CCTTCATGCTGCTTGGTATTGGTATTGATGATATGTTTGTCATCGTTCAA
GCTTCCAAGAATGTGAAGCAAAACGATGATGAGGAAGGAGAGAATAAAAT
GGATAGTTACATTGGTAACATCATGAAATCAGCYGGTMTAGCCATTACAG
TCACATCACTTACAGATATTTTGGCTTTTGGCATCGGAGGATTTAGTCAA
CTTCCGGCCCTTAGAAATTTTTGTCTCTACTCTTCAGCAGGAATATTCTT
TGTCTACTTCTACATCATGACCTTTTTTCTGGGATGGTTCGTAATTGATG
CAAGGAGAGTTGAAAGCCACCGTGATGCCTGTTTGCCATGTATCATAAAA
AAATCATCTTGGGTACCCTGTTACACGAGAAAATCTTTTGCAGAGAGKCT
GTTCTCATGTTCGGGTGTCCTCATTGACTCCTTATTCTTTAGAGGTCTAG
CCATTATTGTAACAATCGTTGTCTCTGGATTTGGAGTATACGGACTTACT
TTAATAGAACCAAAGTTCGATCCAAAATCATATATTAATCCAGAATCTAA
GCTCTTGTCCTATTTTAAGGCCTCAGAACAGCATTTCCAAAAATTGGTAA
GATTGTTCGTTTCCTTTGAGTGTATTTTTAATGTATTGATATTTTTTGTT
TTTCAATTTATGTTAGGGTGGAATTCCAGGACAGTTCTATATTCTCAATC
CAAATAACTCTTTGGTTGAAATAGAGAAAGTTTATGAGGAGTTAAAAAAT
TCTGAGTTTATTGAGGAGAATAGTCTCCGAACCTTTCATAAAGCTTTTTC
AAAGACCATAAACAGTACAACCAATTTTCAATACTCATCCCTCACAAACT
TTTTATATACATCAAGGGTTCCCTTTGATTGGGCAGTTAAATTCAAAGCG
AGTCAAAAGCCAGTATGTGGGGATACTACAGAGGATGTGAAGTTATCCGC
TTTTGTGCTTTATTTTCAACACATAAAGTGAGGTTCTACGTCTATTACAT
TTACATATATTATTTGACATCAAATTCATTAATTATTAATTTGACATCAA
ATAAATTTATTTTCAGGAAGACGAGAGTCCAAGACCAGATCCAATCAATG
AAGAAAATATACCAAATCGGAGAGAAAATTGAAGGAGAACGAAATGGACT
CATATTCCCACACGCAACTCAGTATTCAAACCTCATAACCTTGGATATAA
TTCTATCTGAGCTAACACGGAACATACTCTTGGCTCTCATGACAGTGTTT
ATTGCAGCTTTATTTCTTTTGGCAGYCGCACTCACCTCTATCTATGTTCT
CCTGTCCATACTCCTGTCCATCATAGATGTGACGGGCTACATGTATTTTT
GGGGTGTGAGCATCGATACAGCCTCTGCAGTTTTATTAACCGTGTCCCTT
GGATTAGCTGTGGACTACTCTGCGCACATTGCGCATGGTTATATTCATTC
AAGTAAATCCAGTAGGGGGGAAAAGGTGAAGGATTCCCTTACAAAAGTGG
GTCCAGCAGTCCTCAGTGGTGGAATCAGTACGTTCCTTGCATTTATCCTC
CTTGCAAATTCGAGTTCCATCGTATTTACAACATTTTTCAAAATATTTTT
TCTCGTGGTACTCTTTGGATTATATCATGGATTGATTTTTTTGCCTGTTT
TACTTAGTTTTATTGGACCAGTCTATCGACAGGTCCAAGATTCGACAAAG
AAATAAGGAAATTTTCATTTATCATACCAGAACCTCAAAAGTGAGGCAAT
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