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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1 | supercontig | LSalAtl2s1:1018362..1050616 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003686 >EMLSAP00000003686 ID=EMLSAP00000003686|Name=EMLSAP00000003686|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=615bp
MTSDNSNVIFYMKLMHELKAEYPNVPDEAVKDTIIKYCGDKELCIRELSA QSLFLSRSKRAMKEGKFSTQRGKTTTAMVSSSSILVSSSSTFLTSTTTSA KATIVQQTSKCNRSCRENPYSKIFARRKMFYQKFCETNGSLEEDSRFFSS SNLVWRRKCSLCDGNGGSGEESHSILNMKKKAPDKNANFITLNANIQPFA PFIIRHDSEGAVPGALTLLNSLNHLHHDSSGHSSMGSSLGANSDKMEMNV DGGKVHYATSTINSEEGVESHLEVSLGKTESFITTTHTDLTNNLSNSSSS IFHLQYEDGGKVLNITSNFNNSPDPKRRKPIRGNGPSFQTSRPASLNLNS LFAHGVVARPSSAYCTQLNNPTIVSPRYNSLPNLNMNGLNHLTCYYPEEF QSNPADEEKRLAYTRALLTHQMEQCLKLDQELRSERSKLNNIREEIALIE ERRNKKRLLKLNAQLKRNEGIEKDIKSLRYSCDTLAAKVTKITKGKVPLG ETNVEFYGFLSPKLSDNKKPSLQIKDAKEPLNNLSKLITSLDQDKGNNNN NNNLPINDSESSSNNIIAQWACTECTFLNHPALNHCEECEMPRFSIGCSN QENVXPLSFMGKNSL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1:1018362..1050616+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003686-699533 ID=EMLSAT00000003686-699533|Name=EMLSAT00000003686|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=32255bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1:1018362..1050616+ (Lepeophtheirus salmonis) TTTTAGTACTATTATAATATTTATTAACATAACTTCATAATTCCATTCAG
ATCCATTTGAGTACTAAGGAGTCCTAAAGCCCTGCTCCGTCTCAGTCAAT
AGATATAATTCATCTCTTACTCATTCGAGGTAATACAATTTTCTTACAAT
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ATTTATTAATATAGATTACATATATAAAAAAACCCTACTTACAATAATAG
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GTACACCAAAAAATAGCCTGAGAGTCCTCAGTTTGTTATTGTCACCAGCA
GAAAAGGTTCTTGTGTAGAAAAAAATAAATATATTAACTCAATACTGGAA
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ATAGATAATTGCAAATATCGGTTACAAATTTTCTCACTTAACCTTATAAA
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TTATATTATAATTATAATCTATTAGACTTAAGAAGTAGGTCAATCATGAA
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TATTGAATGTCAAAATAAGAACAACGAATAAAAGGACCTACATCTTACCA
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AATATATATATATTTAAGTTTATTCTATTCAATTACTATCAAATACATCA
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TTCATAACGTTTTTTTTTTTTCGGGGGGGGGGGGTCCAACAATGCTATTT
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TGACGCGGATGTTAAGCCAAGAAGAATTTCAGAAATTGTAGGCGTGACCG
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TCCTAAGTTCCTGGTGGCCAATATCAAGGAAGATCTAACAGCATCAATGC
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TTGAAGAGTAATCCGTTGACTGTGAAGATCTTGACATGCGACCTGGTTTT
AAACCCCAGAAACGACAGTTTTATATAAGCATCACTTGAGGAAGTTCAGG
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ACCTCTGATGAGATCAAAATGGATCCCTTCTTCCTCAAGCCCCATGAGAA
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CCCCCAGCTGTATGGCTTGAAGACACAAAACTTCTGCAAGGATCACTTTC
CTAATTTCTGGGACGATATCATCTGACACTCTTCTAGTTCTGATCTCAAT
TCCCTCGACTTCAGTTTGTGGAGGGTCTTAAAGAGTAAGGTTGGGAAGAC
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CTAATATGTCTGCCGACTATATTGTTAAAACCTGTGCCATGTTTCGACCT
CGTGTGGATGCTGTGRTAGAGGRTGGAGGCGGTCATATTGAATAATTCAT
GCAATATTGACTGGGAAAAGTTTTTTCAATAACATTTTTCATTATACTTT
TCTAATAAAAAGTTATTAAGGCTTAGGTTTTGCTGCTTGGCGGTGAAAAT
TTTCCCTGTTGCACTTTCTACACTATCCGTAAGGTGGTGTGACAGTTTGT
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GTCTTTGTGAGGAATTTTACGTATGTTATTTTTTATTAAATAATATAATC
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ATAATATGCAAATAATACAATTAATTAAGTTTCTTTTATTCTTTTGTAAC
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GGGATAAGGAACTTTGCATCCGGGAATTATCAGCCCAGTCTCTGTTTCTA
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TAGGCGCCAATAGCGACAAGGTTAGAGCTGTTTTCATGATTTATTGTCTT
AATAATACTATGTATATTTTCTTAATCCATTTACTTATATATCCATATAC
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TATCCTTTTCAACTTAAGAATTTTATTCTTGAAGTATATGAATTTACATA
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AGAGCTTCATTACTACTACTCACACGGATTTAACTAATAATCTATCCAAT
TCATCCTCTTCCATTTTTCATCTACAATATGAAGATGGAGGCAAAGTTCT
CAATATAACTTCTAATTTTAATAATTCTCCTGATCCTAAGAGACGAAAAC
CTATACGAGGCAATGGTCCTTCATTTCAAACTTCTCGTCCTGCCTCATTA
AATCTTAATTCCCTTTTTGCTCATGGTGTAGTGGCCCGACCATCTTCTGC
ATACTGCACGCAATTAAATAATCCTACAATTGTCTCTCCACGCTACAATT
CATTGCCGAATCTCAATATGAATGGTTTAAATCATCTTACATGTTACTAT
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TACTCGTGGTAAATTTAGTTTGTTTGTTTGAACATTGTTTTCTCCTCTGG
ATGATTTCCTCGTGTGTTGTTCATGATCAGATACCAAAAGCATGTTGTGT
GACTATTCTAACTCATTTTCATTTGAGTATTCACTTTATTTAAAAATGAG
TGAATCTTGTGTCCAAACTAATAATGTCTTCAAATCCCGTTTTCTCCCTA
ATATTCATACATAATACATATGTCTAGTCGAAATGCTAATCATATAACAT
TTTTTTCTCTATAGCCTTACTCACTCATCAAATGGAGCAATGTCTCAAAT
TGGATCAAGAGCTGCGTTCCGAGAGAAGCAAACTTAATAACATTCGTGAA
GAGATAGCTCTCATTGAAGAAAGACGGAACAAAAAACGCCTTTTAAAACT
AAATGCTCAGGTAATAATTTCGCAGGAAGAAAGAAAGTTTCCCTTTACAC
GATAATTATAATTAATATATGGATCTTGTTTAATACATAGCTCAAGAGAA
ATGAGGGTATTGAAAAAGATATCAAGAGTTTGAGATACTCCTGTGATACA
TTGGCTGCAAAAGTTACAAAAATTACAAAAGGAAAAGGTATGTACATTGA
GGTAAAATTTATAATTCGCATAATTTATACAAATTATATATATATTTATA
TTTTTTGCAGTCCCATTAGGAGAAACGAATGTGGAGTTTTATGGATTCCT
ATCCCCCAAATTGTCAGATAATAAGAAACCTTCACTACAAATTAAAGGTA
GGACATGCTTTTACTTCTATTTATTATTTTACAAATGTATAAGTATGCAA
CTTGCAAATTTATTAAGTTTGTAAAAAAAATGTCCATAATCCTTTGTTTT
TTAAATGTTTAAATCTTTGCAGAATCAATTAATTATGTATTTTGAAAAAA
AAAAAAGAAGAAATAAATTTCTCAATCTATATATTTATGTAGATACTAGT
GTTGGGTTTGGGTCTGGAAATCCTAGACCGGTCTGAGACTGTTATATTTT
TTGTTGAACCAGTCTCATATAAAAATTCGTTCTAGATCGTTCCAATGGAA
AAATCGATCGAGTTCGGTCACAAAAACATCGTTCTAGCCCAGATAAATTG
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GAAGTTTAAACAGAGATAGCTGGGATTAATTTTGATCCCACCGTCTCTTA
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TAACATTTGATACCGAAAAAAAAGGTCTATAAATTGAGACCAAAAAAAAT
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AAAAAATAGGTGCATCGTCTGAGATCGAAAAATCAGTCCAAATCACTTAG
AACGAATTGGAAAAAAAAATCGGTGCTGGGCCGAGTCTCAACACTAGTAA
ATACATTGTGTTACAATTTATTACGACTGTTCAACTACATAATATCATAT
TCATTATTTGTTAAATATATTGCGAACCTTAGAATCTTCTTTATTCATGC
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TTTAGCTCAAACACAACAGCCTGAATATATTTTTTATTTTTTATACTGAC
AAAACATTGTCAACAACTTATTATTTGAGAAAAAGTAAAATTTGTTGAAA
TACAATTTGTGAATAGATTATCTTTCATAGATTCATCATTTTCTTTGATG
TTTTCTATTTATGTTTAGACTTACAAATGTTACTTTGCCTTTACAACTAA
CAGTCCATTCAGTTTTTTTTATTATTAACTCCTTAAAATAATAATGTCAT
TTTTATGTTATGTCATCATGCCTTTTGAGGTTGTATTTAATGTAAAACTT
AATAAATACGTTTTGCATAATAGTCTCTTTATATTCATCATAATAATTAA
AAGTTTTATGTATCTTTATACCTATACGATATACATTATTTAGATTATCT
ATTTTTCAGGTTGATATTCCCCCTTTCCCTTCTGTGAAAAATAAAAAACT
GATTTTCGAAAAGTCAGGCTATTTTTGGTGTAATATAGGATTTTAATTTA
AAAAGTGGGATTTTTGGGTCAATTTTAAGTCAGTTGTATCGTCTCAAATA
TGATTATGCAAGTATGAGTCAAAAATGGTACTCTTTACTAGTATTAATAT
TCGGGATATCAGTAAAATATATTATGTTTTTAATCATATTAGGGTCTACT
ATGTGCTCAATAATTTGCAGGTTCCCTATTTTGTCAAAGAATAGTGCTAG
TACTCGGCATTGTCTAGAGTAATTAGGCGTCGGCTGAGAGACTAATTTTG
CTTTAATATTATAAAAGATAACTCCCCAATAAATAATTTGTGTTACTCTC
TGTTTTTGATGAGGGCGCTCACACGTAAATACTCAATACTTATATTAATT
TATAGGTGTTCTGTCCTCGAGAATGAAAGATGAATAATAAGTGCTTGAAG
AAAAAAAATAATAATAGGATGTGATGACAAATGAGCCAGGGAGTACTATA
ATCCATCTGAGAGCTCACTAATAAAATCAGTTCTCCCTGTATATGCACTC
GATACTACATGCAAAACGCCTGCGATATTTCATTAATGCAATTATATTGT
TATTTTTTCTTGATCAAAAATATGTATAGGATATTTATCAGGAAGCACTA
TATATTGTTTTCCCTTTATACATTCTCGATGCTACATGCAAAACGCCTGG
GATATTTTATTTATACAAGTAAATTGTTATTTCTTTGATCAAAAATATGT
ATATGATATATATAAGGGATCACTATATACAGTGCATCCGATATACACGC
TCGATGCTACATGCAAAACGCTTGCGAGATCTCATTAATTTGACTACGTT
GTTTTTATTAGATCAAAAATATGAATATGATATACATATCTGGGAGCGCT
ATTCTACATGCTGAACAACTGTGATATTTACATTTAATAGATTTTTATAT
CTTGAGATGATATTCCTCAGTTTTGTTCCAATACAATCATTTCAATTCTA
GTTAAATTTTGCTAATTTGCGTCTCTTTATAAAAAAAGAAGGTACAAAAG
GCTTAAAAAGGACTAATTTTGACTAAAAAATTCCATTTTTAGTCAAATTT
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GAAATATTAACTCAAATGCGGTATACTCAAATATACGTACATATGCAGGT
GTATTTTTATTTTTGCTTCGTTTCTGTCTATACATTATACATATTATAAA
TATCGTTGGACTTTATTTGCTTTGTATACACTCAAAGATAAATATTTAAG
TTTATATTGATGACGTGAACAGTTGTGCGTACATATTTAATCGTCAGACA
TGATCATTTTTTTAAGTGGGTTCAGGTGATTAAATTGGAACATAATAGAA
CTGAATGAATTGTATACAGATAATACGTCAAATTAAAAGCAGTCTTCCAT
AAAAATTAACATAAAGTCATAAATATAAATGGCCCTATATTATTTTATAT
AGGACTGTTACTGTCAATTATGGGTGTATACTCAAATTTATGTGTTGGGT
CGAGAAAAACTAGAAATTTACCTATTTGGTTAGATCAGGAGCTCTCACAC
TAACAGGTACGTGAACTCCCTGTAGGTAGTGTTGTCNTCAGTCTATTTCT
TTTTTTAATCCGTTTTAGTACTGACAGTCCAAAGGACCGACATTCTTAAA
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TTGTATTTTTAAATATAGGTTCTTTGATTTGTAATTTGTAGCACTTCCAA
AGGGTTCATCATATTATTTTTTTTAAATTTTGAGGAGGATGATAACTGAT
TTATTAATTGAATGATGCTAATCACTGGCGGKTTGGCTCMATATTYACAA
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CCCTGTTTTCTTGATTTATGAGTCGGATGAATATGATTTATACCACACAT
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AAATGTACTCTAAAATTAAATATTTATAACAAAAAAATATTTTTAATTAT
ACTAATTTTAAATTTCACAAATTTGATAATTAGAAAAAATGTAAAAAAAA
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GTTCTACTAACATAAAAATGTCTTATCGAATGGCAAAACTGGATCCGCAC
GAGGNCGCCCGGACCTGCCAAATCTTCCGGCCCCGTGTGGACGAGGTTTT
AAAGGAAGGCAGATTTCATTATATGTCCTTAAATGTAGCTTTCAAATATT
GAAAAAATTATGTTTCTCCCCCTTCTAGTTCGTTTGTTATAAGCCTTTAA
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CATATCTAATGCCTTTTCAATTTATTTTAAACAATTTTAAACATATTACT
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TAAGCAAAAATGCATAAAATATCCGGTATGTAAGAATAAAGGAAACTGTA
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