EMLSAT00000003691, EMLSAT00000003691-699538 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003691
Unique NameEMLSAT00000003691-699538
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1supercontigLSalAtl2s1:1808433..1823347 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003691 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003691EMLSAG00000003691-686457Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000016068EMLSAE00000016068-724996Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016069EMLSAE00000016069-724997Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780887auto780887Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003691EMLSAP00000003691Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003691

>EMLSAP00000003691 ID=EMLSAP00000003691|Name=EMLSAP00000003691|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=79bp
MSGMAIAPCGVEVREAFSCFHYSEVEXKGSDCIEKFNGMQDCMKEYPDLY
DERNGGSGGSSMPTEENEDFSPPPEEGEK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1:1808433..1823347-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003691-699538 ID=EMLSAT00000003691-699538|Name=EMLSAT00000003691|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14915bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1:1808433..1823347- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAGTAAGTTTTATTACAAGGACAGTCGTCTATTTTATGGGAGCATTAA ATGAAGAAAAGAAACACAAAAATACTCTTTTAAGACAATAAATTCTTTAT TTTTTTATATAATATGTACACATATAAATGAATACCTATCTATACCGTTA AGCAAAGGTAAGAATTAAGTTCTTACAGCTAAAGTAAATATGTATACTGG GTGCTCAATTGAAAACATGAATCTATACATTTAACATTTAAACTGGGGGA GCTACATTTAATAAACTATTTTACAAATGTTGACACATGTTTTGCTGTTT CTAACCTTCAATGTAGACTGCAGCAACTTTGATAATGGTGGCAATAATTA GTGTCATGTCAATCCTTATTTAAGACTGAAGACTCCATTCACGTTCAGTA TCGGTCACGCTCAGCCTTGAAGATCAGTCCTAAAACTTATAAATTTCGAT CCTTGATGACGTCACTCAACTTTTTTTGGAGTTGAAAATAAGCTCTAGTA CTGACAGTCCGAAGCACCGACAGTATTAACGACCAGTCCTAAGAATGGAC TGGGCTGAATAAATAAGGACTTACACAACAATAGTAATAATGTAATTTGG GGATAATGGAGTTCCAATGATCATCAAGAGAAGCCTTGAAAGCTTCGAGA TTCAGTGCTTTCATCTGGTAGATCCTCACCTCGACATTCAGCCAGAAGGA AGAGTCAAACGGGCTAGTATCGGGAATGTATGGAGGMTACATTGTTTTCG ACCAGAACAGAATGTTGGTCTCTGAAAAGGGCTGTGTAACCTTTTCTGTG TCTACCATATTGTGGAAGTACCACATTCCTCTCTGGATTCATTCCCTGAT TTGACGGAGATAGAAAGATAAGATTGCGTACTAAAAAAACTTTTGAGCCA TTTTTGTGATTGTTTGACTCAGTATTGTTTGAGCACGTGTCACAGATGGA CACCAGCAACTGTCGATAAAATATGATTATATATTTTTTGTCTGTAAGAA TTGACTGAATCACTGGATGGATCTTTCCCAAAACAGTATACATAATTTTC CGTATTGTTTAAATTTCCATGAAGATAATTGTTATTCCAGCCCATATTTT TTATATTGTTCTTCTATTTTGAAGTTATATACTTCTCTCTACAATTATAA AACAAAATTTATTCACTTTCTGATTCACTTTGATCTTTAAATGCAGACGT ACATTAATATACCTGAATTTGCTTTCTTTAATTTGCCCTTTTATTTTCTT TTATCTTTTTATGAATTAGCAGAGTTTTTTTCATTAATAGCAAACTTTGT GGCTTTATTAATTATCATATATATATATATACTTTTACAGTGTTAAGTAT TATCATTTTTGAATGATCTCATTCTACTTGTAAGGAAAATGAGCAGTAGA TTTAGTAGACTTTTATTAATAAGTAGTATTAATAACTATTCCATATTTAG ATAATCTTTGAATAATGGCTTGTATTGTTTTTATCTCTTCTAAAATATTT ATTTCAGTTTTTTGTGAGGTCTTAAAGTTATTCATCCATGGACCACAAAA TATTTTTACGATAAACCCTAGGACATTAAGTTAGTAGATAATTCCTGGAT TTATTTAATTCATTTGTAATGGNATTTCTTTAAGTCTCAGAAAGATGTTC TCGTATTAAATAATACTTAACATTTTTTATTAAATTTCAATTAATTTTTT GGTTGTATTAAATATTACATGTATACAATTGCCTCAATTGGAGGAGAAAT CAATTGCAACCCCTTCTCCTATGTTTTAATAATTTTTATTAAAAGTTTGA ACCTTTACAATGAACAATAACATAAATGTAAAATGTTATTACAAATTACA ATAAATAATGCTTTCAGATTAAGTTTAAATATTTATTCTTTTTAACAATA CCTTGTCGCATCTCAAAAACAACATAATGTCTCCTCATTATTTTTGAAAA AATGTACAATTCTATTAAATAATTTAAGAAAAATAAACATTTTTTAATTT GATATCCAACTACTCTATTTGATTAATTAAAAAGCTTATAAATATAATAA AAATTTCTAAAGATAAGAAAAACTTTAAATGTTTAGTGATTTAAATTTGT TTGTTCAATTGATGTCTAATTTATTAATGCTCTATTTAGGGGTTTCAATT ATTTTTATTAGTTATTCTCCTGTATTTGAAATCTTAATCCCGTCATTGGT TATGTTAGTAAATTTTTAGTGGGTCTTTCCTGAATAACCTTGTTATGATA ATATTGGTCCTTAGATTCATAGTCATCTATACAGTATTGTATTACTAGTG GTCGTCCCGGCTTTTCCAAGAGTAATTAGGCGCTGGATAAAATACAATTT TTGTTTTAGTAATACGAAAGATAACTCCCTAAGAAATCTTCAGTGTTAAT CTTCGTTTTTCATGAGCACACTCCCACGTAACTACTCAATATTTATATCA ATATATATGTGTCCTGTCCTAAATAATGAAAGAAAAATAAAAGGAGTTTG ATTAATTTTTGTTTGGGGAGGGGGGGGGGGGGGATGACTGATCCTTACTT TAGTCTTTAGAGCGTTTACTAATAAAAAATAAACAAAAATTCATTTTAAC ATAATCGTGTTTATATTTAATTCAAATCTAAAACTGAAACAATAATTATG ATAAACATACAAGACCTATAACAAAAAAAAGGAGCAAAAACAGTGCTCTT GATAAACAAATACATGCCTGTAATATTTCATTAACACGACTAGTGTTGTG TTAATCCTTTATTTTGTTCGATCCAGTAAAGTCTTAGGACGGATCCCATC AGTTCTTGAGGTCGGTCATTAAGACCGTTGATCCTTCGGACTGTCAAGTA ATAGAATTGATATGTATATATAAAAAAGAAATACGGTTGAGTGACGTCAT CAAGGACCCTATCTTTATCAGTTTTAGGATTGATATGCAGGACTGAACCA GACAGAGACTGAACTGGACGGAACGGGAGTCGTCAGTCCTAAAGAAGAAT CGACACTACATTACTATTACTTAATTGAAAATATTTACAGGGTGTCCACG ATAAATTGGAACTATCTTAAAGTTCAACCTGCTTGATAAAAATGGAATTG AGAGTGTATTTGTTAATAKGAAAAAKTTAGACATGATAYCAAACAATAAA TTTATTCAACATGYCCYCCCYCASCAGCCACCATCTYCTCCCTCCTGCCN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTGTTTGGCCATTCGGTATT ACCTGTACCCGAGGTCCTCATTCACAGCCTTGGAGACCAGCTGCTTGCTC ACTCCACGGTTCTTGACCAACCTGGACAAGGAAGTCCCCGGCGAAGCCTT GATGGACTTCCGGAGGCCTTCAAGGAACGGGGAGTGCGGATTCGGTCACT TCTCATGTTGTGGATCTTGCGGCAGRCCTCCCCCTCAACCTGCGAGGCAT TGAAGACCCGGTACACCGTGATCTTGGGGKAGTTAAGAAGCTTGTAGATA GCAGAGGGCTTGTGTCCCGCACGAGCCAATTCGAGGATGGCGTCTCTCCT TGCTTGTTCCATGAAGACTATTGTTTGTTGTCTAAACAATTGTGGTGGAA GTTATAGTGTACTGTTCATGCAACCTTTTATATTAGTATGATTTAACCTC GAATATCCACATTATGGGTCTGGCTGAAGTTTAAAGTAGTTCCAATTTAT CGTGGACACCCTGTATATAATTTACATCAGGCAACACTATATACAGAGCT TCCCGTATACACGTTTGATGCTATATACACACGCTTGCAATATTTCATTA ATATGACTAAATTTTTATTTGTCAGATCAAAATATGTTAACAATATAGAT GAAGGAGCACTTTATACAGTTTACCCGGTGACTCTTTTTCATATATACAT ATATTCATACAGACAGAAAGACACACTTTTCTTTATTAATATAAATAATT CTATATATCACAGGAACCTTTATTAAATCTTGTAAACTTTCATCTAAACA GAAACAGGGAAAAAATACGAAACCAGTTGGTATTAGCCGATTCTTCTCAC ACTGTGGAATTTTGATCCAATGGATATTGAAAATTGTTGATATGTTAAAA ATAGCGAATTTGAATTCGTCCAATCAACGTTCAAAACACTAATTAGGAGG AAAAAAGCTGAAATATTGACACCTAACAACAAAATATATTATGATTTTTT TTGTTGATAGGTAACATCACGATCAACGATCAGAACACGAATAATTTGAA AACAATTGCTGTCAAAAATACAAATTAATTAATTGTGACCCAGATAGGTT TTAGGTATAGAACATTCCATAGAGGAATTTATCAATGTTGTTTATAAATA GTAAAATATCCTCCAATAAAATGATCAACACCATTAATGAAGCAATATTT ATGAGGTACGTATTGTGCACCCAATATTTCCCTCAAAATTATTATACCAA ATTTATTTTTACATAAGGATATGAGGTCTATGTTTGACATTTGAATTTTA GTTTTTCTGATGTCCTTTTAGGTTCTTTTAATAAAAAATTTCATTATTGA TCTTTTTTATTTAATATGTAGTTTCAATTGCAAACAAAATAGTCTACACA ATCTCTTGAAATCTGTTCTTTTCCTCTATGAACATTGCAAATTATATTGT ACAGGGTCTAACAAATATATTTGGTCAAAGTTTGACTAAAATTAATAGGG AGAATAACATGGTCAAGGTCTACAGACTTTATTTAAACTGTCGTTAACTT 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GTAATTTTATATTTTGAAACTTATCTTGAAAAAAATACCTGTATATCATG TAGGTACTAGTTGGGAGACGGGCCAGTGTCTCAAGATCTATCACATCAGA AATCTAAAGCCACAAAATAAATTCAATTACATTTTTTTATGATATAAGGC AGTTGTTTGTGAATAAATTAAACAATTATTTTAAGCGACTGTCTTTTAAG ATTTTGGTTAAAACGGATTTTGAGGGGTAGAAGTTATTTTTTGGGAGGAT CAACATTGTTTTTCATAATAGAAAACTTATATCATTTGAATTATTGATTA GTTTGCTATCAGTTGGTATAATTTTATCAAAATTCAAAACTCACTCATTG AGGATAAAATTGAGATAGTATGAAGCTCTGAACAATTGAGTGGATTGAAA GAAGTGTACCAATTTTACTATCTTTATTATTTACTTGAGGTAGTACGTGC CAGTTACCCCGAGTTATTCGGGTTTGGCAAACAGACACACATTTGATTTA ATAATATAGAAGATTAGCAAAGGGTTACCCGGGGTTATTGGACCAAGTAA GGAGCGGATCATCACATTGACAAACTTCAAAATAATTAAAAAAATATTCA GAATTATTCTATTAAACTAATAATCATAATATGAATGTTTCGTTGTTGTC GAGAAAGATCCTGATAATTCTAATTCTCTTCCTATGTTAATAACGATGGA GCGGAAAATTATATTATACTACATATAGTAATCAAAATATCAATCCAGTT AAGTAAAGTAATCCACAATGTATCATCATAGTAAGGTGGTGGATTATAAA GGTGTGTCGCTATATTACTAATGTACTATAAGCTTAAAAAAACCTACCCA ATATATATCCATAAATTTTTTTTCATGATGATGAGACCATTTTTTATTTT CGTCAAAAAATTGCCGAATCGAAGTTATTAAAGAAAATCATAAAAAACTT 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CAGCCTGTATTAGTACATGAAACTGTTTTAATTTAGAAGTATGTAATAAA AACTGATAGATTTATATGGGTTATCTTTAAATAGGGGAGAACGGAGTAGT ATGGATGTGTAGGTAAAATGAACACTCTATTTCTTTTCAGGAAGATAGGC ACAAATTCCACTTTTTTTCTTTTGCAACATAGTATCATTTCCATTTTCTA GAAAAACAACATGTTGTACATTTTTTTTCTCTCCGAAAGTAGAACATCAT TTTAAGTAAAACAATATTTTTCTGTGGCAATGTAATTGGGGTTATATTGC ATAAGTTTGCCCGCACGTCATACTTTTTCTTTCTATTTCGAAATTGAAGA CAACAACAGTAGATAGTTGAAATTCAATTATTTCAACCTTTTAATAATAA GAAAATTACTTCGCAAAGAGAAGATTATATTATTGGAATAGGAGAGGAGA GGGATCTTGAATCAATCAATCACAAATTCTCGAATAAGTTTCCAAGAAGG ATCAGAGAATCATTACAGTTTGTATTTTATATTTATATTTAAGCATGTTT ATAGTAGTTTTCTGTTCCAGGAAAAACGGATTTGATAACAAAAGTTTATC TCTCTGCTACCTATTACCTTCATCCAATAATTATACTAATGGTTCATGGT TAATACAAGAAAAAGTATCAGTGCTTTACTTAATGAAATTTAATCTCCTC CCTTAGTCTACAGTTCGACTCTGAATCTCTCAAAGCCCCACTCCCACATT GAATATTTCGTAAGAAACAAAGTCTTGTCAAGGGTGTCCACAGGATTATA TATATATATTTTTTTTGTGTGGGAGGGGTTTTGGTTTTTGGGAATCATTA AAAAAAAAATTTTCAATAAATTAAAATTAAAAAAACTTTTTTTTGTATTT AATTTAAAAACATAAATTTTTAATATAAATTTTTTTGAAAAAAATCTCAA 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GTAATTTTTCGTATGAATTTAAAATACTTCATATTGAGTTGATATTTGAG TTATATATTATGTTTAACGTTACTAGCTGCAATCAAGATTAATATTATTT CTATTAATCTTGGCTGCAATGTATTTTTTCAATGTTGCCTACATGTCGGG GTTTAGTTCAAAAAGACAATAACATTTTATATAAGATAAAGACTCTTATA AATAAAGGTTCAATCATTCATATTTATAAAATGAAAGGCAGTATTTATTA TGATATTGCTGTCAATTATTGACGTTGAATTTAAATTTCTGGATGAATTG AAATACCCAAAAGTGTTAACTGTAGTTTAAAAACTCACTTTTGTCTACTT GACTTAAATTGGCCCAATATTGTCTTCGAAATATAATTTATTAATTTCCT AATTCTATAAATGTGGCGGMGAATTTTGGCTACTTTAAGTACAATTAACA GTGCCCCCAAAGGATTAATCATAATTATTTGTTCATTGAAATGTAACGAT AATTTGTTGGAAAATGCATTTTTTTGTTCAATTTTGAGAAAAATTTGGGT TGACGTGCAAAAATATTCAATAATAATACAATGACTTAGTACTATTAAGA GTTGGTTATAAGTGATATATAATAGATTTTAATCATTCATAATAACTTAA TTCATCTATATTTTAATATGGGATTAAGAGAATATCGACATGAATCACAA CGGACATGAAAATAAAATATTGTTATTGATAGTAGGTTATGAGTGTTTTG AACTTTAGTTTGATTATTTTTTCTATGATTCCCATAGGCATTTCGGACAA AAAAAATGCTTTGGTGTCCCAAAACATACATGAAGCAGTTCTTATTTTTT CTACATTCAATAGCAATACCATCCGGTGTATCCGAGTTTTTTATACCTAA ATCAATATACAACTTCATTTAACGAGCGCACTAGTGTATGTATGTACACT 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