EMLSAT00000003715, EMLSAT00000003715-699562 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003715
Unique NameEMLSAT00000003715-699562
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1supercontigLSalAtl2s1:3290800..3325247 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003715 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003715EMLSAG00000003715-686481Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000016156EMLSAE00000016156-725084Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016157EMLSAE00000016157-725085Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016158EMLSAE00000016158-725086Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016159EMLSAE00000016159-725087Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016160EMLSAE00000016160-725088Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016161EMLSAE00000016161-725089Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016162EMLSAE00000016162-725090Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016163EMLSAE00000016163-725091Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016164EMLSAE00000016164-725092Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016165EMLSAE00000016165-725093Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016166EMLSAE00000016166-725094Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016167EMLSAE00000016167-725095Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016168EMLSAE00000016168-725096Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016169EMLSAE00000016169-725097Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780992auto780992Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003715EMLSAP00000003715Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003715

>EMLSAP00000003715 ID=EMLSAP00000003715|Name=EMLSAP00000003715|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=505bp
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HFTSKGSMKKRHYWRLDTKSITLFQSDSGANYYKEIPLSEILSVEASKKR
ESMKQCFELKTANLFYYVGEDSQEREEYGIGIKIAKEWEVAIRQALMPVT
HSAASIESAVSVNCQITSTSASLKLKSFEERNEETLSQLYQIFSDEILGS
GQFGIVYGGVHRQNGEAVAVKVIDKMRFPSKQEAALKNEVSILQNIHHPG
VVNLERMFETLERIYVVMEKLKGDMLEMILSSEHGRLSERVTKFVVTQIL
VALKHLHSKNIVHCDLKPENVLLSSNSDFPQVKLCDFGFARIIGEKGFRK
SVVGTPAYLAPEVLRNKGYNRSLDMWSTGVIIYVSLSGTFPFNEDEDINE
QIQNASFMYPTHPWKTIDSKAIDLIGNLLQVKSRKRISVDKALLHPWLSD
YQCWLDMKELENKLGQRWLTHESDEERWDLYRKLYVDKEHSLLNCTSKNT
EKVAF
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1:3290800..3325247+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003715-699562 ID=EMLSAT00000003715-699562|Name=EMLSAT00000003715|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=34448bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1:3290800..3325247+ (Lepeophtheirus salmonis)
AAAATAGCCACTACAATTGTAAACTAAAGCGTTAATGTAAAGTGGCGCTA CAAGTACATAAACTTTTTTTTTTTCAAACAGAAGGACCAAATGTAGTTCT TTTATAGGCGCTAGAGGGTGTTTGATGAAACAACTGTTTCAAAATAATAA CAAATATCTTGTATTATTTATAAATCATTTATTAAATGGATTGAGTTCTA GAACTCATTATGAGTCATTGCGGACGAAAGTCTTGGTTCGTGAATCGTAG ATTTTGTATTTGTTTGAACACTAGAGCAATGTTGAGTCACTGAATACTAA TGACTAGATATAATATATCCACTTACTAGTATTCAGTACACTTATGTGTT TATTCTAATTCATCCTTCATCAACTCTTCTTTACCTGTTTGAATGAAATG TTAAATGGAAAAGCGACGTCTAACGTTTAAAAAATAAAAACTATTTTATG TCCAACAACTTTTTTGTTTACTGTGCTACTTTACTTTTACAGAATCTCTC ATGGACACACCTTCATAAAATAACCTTGAATGAAACTTCATGGGAATTAT TCTTTCCTCCTCCAACACATTCTACAAATTGTCAGGGTTACTAAGTTTTT TGTTTTTTTTACATTCCCATTTCTATAGCGCATTTTCGCCTTTGTTCATC ACTGAATATAGTGCTCCTTTCCTATTGGCTAACAATCAACAGATCGTTTT TTCTTCTTCTTTTTGGGAAAAAGGTTGCGTGATACGATAAAGTAATGCCG TATTAAATAAATTTTTCTTTTTTCCCCTTCCTTTCCATTTCATAGAACCT TAGGGAAAGATTTAATTTGTCCATGAAGGAACATAGTTCATCTCTACGTC TTTTAATCTATAGTATTTACCTTTTCTCACCTATCTTGAGCTTGCCCTAG GCCTGTGTGAAGTCTTGATACTTGAGATCCGACATTAGTAGATTACTTAT 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ATATCCTCAAAAATATTAACTTAAAGAAGAAAGACAATTTCTTAAAATTG TGTTAAGTGGCAACTTATCTATTGACCATTTAGTAAAAAATGGTATGGAT TTAATAGATTTGACCTCCTAAACGTTGGCTACTATTAATATTTCAGGGTT TAAAATGTGAAGGATGTGGATTAAATTTTCATAAACGTTGTGTTTTCAAG ATTCCCAATGACTGTAGCTATCGTAAAAAAAGAGTATCGTCAATAGTAGG AAGTTCTAACTCCACAAACTCTCTTGTTTCAAGGTAAAATATTATATGGT TCATTATTTTTTATTTTATTTTAGGAAGAAGGGAGTGGAAAAACTGGCGT ACGCTCTAATTTCACTATTAAATATATCTTGAAATTGGTAGGATTTTTTT TTACAAAATGATTTGTACTCTAGTAAAAGTCACACTAGTTTTTTTAAATT TTTTAAATGTAGTTGAACAATGTTCTACCAAATATAGTTAATTTTTTTTG TATTTTTCTCAGAAGTCTGTTGTATTACTTTGTATAGAGCAAAATATGAT TTTTTTTAAACTGCCATTGATGTAAAAAAAAGTAAAAATGAAAAAAAATA ATTATAATAGAACTTTTTTTATTACAGCAAATCTTTTAAATTGTAGAAAA TGCATATTATAAAATTTTAGATATAATATAAAGCCATTGAAAAAATATTT GATGTCAAAGAAAATCCTTCATATTACTTTATTTTTGTATGATTATTTTT CAGGAACTGTATTCAAGATAATTTAATAAAGAATTTATCTTTAAAATGCT TGAATGTGTTTTATCAATTGTTATTACCTTTAATTTTAAATTATATATTT CTTCCACTTCAAAATATGGCTCTAAATCAAAATAATACTAAAAGATCGTG ATTTTAAAAAGGTTTTGAAGGCCCAACCCCTTGCGGTAGCAGGTTTTAAT 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