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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1 | supercontig | LSalAtl2s1:858197..864771 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003729 >EMLSAP00000003729 ID=EMLSAP00000003729|Name=EMLSAP00000003729|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=109bp
MKRRDEGAGELPTPVDVYKYSTLLLISFSSSSLSVKAGWMLMAKANMIKI
YKNLFNEDVMLVKKYVHATRYPNVDVAILHVMKALDSLKSRGYKVLPLFS
VRKRIVTAR back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1:858197..864771- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003729-699576 ID=EMLSAT00000003729-699576|Name=EMLSAT00000003729|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=6575bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1:858197..864771- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAAAAGGCGTGATGAAGGTGGAAATTTATATGTGACGTTTATTTCAAC
AATATTCTTACTTAATTATTGGTTTTGGCCTCTCAGAACAGAACATGGCG
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GAAAGAAGAATAAACAATCAAATTTTCTTAGAATCAAAACTAATGTTGCT
TTTTGATTGGGGAGAAAACTTATTGTTATTACCATGTGTTACGATATAAT
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TGATTTATTGAAACATCCCTATTTTTCTTTGCCATGAAGGTGAGGGGGGG
GGGGGGTAGGAATGTTAATTTATGGAAATGTTTTCTAATAATCACGTATC
TTGGAGAGAAAAAAATTAAAATTTCATGATATTTTCATCTTTGTATGACA
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TGACATCCAAATACACAGAAATAACTAAGTATTGCTCTTAATGATAAAGA
TCCAGTGTTTTAATTAGGGCTGTATTGATACTAAATAGGGGATTTAAAAT
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TTTCATAATTTAGTATTTTGTAAAAAAATAACTGTTTTTTTTTCAAAATA
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TGATGTCATTTAGCAATGNNNNNNNNNNACAAGATAGATATATAATGACG
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GTCAAAGTTTTTGAATCCTATATATTCCTCGTTAAAAAAAAATAAAAAAT
AGAAATTCTCAATGGAAAAGCTTTATTTGCAATCCAGTTGGGATCTTTGT
ATTTACTCATAGCAATAAATTTCTAAGAAATTTTGTACAATAAAATACTT
AAAAAAATAAACATTATAATTTGTATAAAATGAAGTAATTATTATATATT
TATAAAAAGAATTAGCAATCCTTCAAAAGTTTTTTAAGAAGTTTTCCGAA
AATGGATCCCTACTCAATTTTTGTTTCCATATTAGGAAATCATACCTTGT
TATATCTATTAAAAAAAGAAGCAAAATGGCGGATATGGTCAACATACAAT
GTTGTCAAATTTATTGATTAAAAAAGCCACAAAAAAGTCATAGATTTTAT
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AAAAGATCATCTAAAATCTGTAACATTCTTTCAAATAAGTCACATTTTTT
TTTTTTTATAAATTCAATGATTTTTCTATTATTAATTCAATTTGTTCCCT
CGGCAGACTGGCTAAAATGAATGGGAATAATTTATTATTTCTATTAACAT
TATATTTTCAATCTGTAGTCGACTCTTCTCCTTATCAGCTTTTCCAGTTC
GTCCCTCTCAGTGAAAGCTGGCTGGATGTTAATGGCCAAGGCTAACATGA
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TACGTTCATGCGACCAGATATCCCAATGTGGACGTGGCTATCCTTCACGT
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ATCCGTGAAGGCTCTCTCCACCTTCCACCAGAGATTGTTCTATCAACTCT
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ACAGTCAAAACAAAAACTAATATGTATGAAAATGTATTTAAATTAAGCCA
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CAACGGATGTTGTCGAAAAGTACATTTATTTTGTCATAATTTTAATTATT
CCATATCAAAAATGTTTTTCTTTTACAAAATTCAAATAGATTTTTTACCC
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CCAAAAATACAAGATATTTAGATTAAAAAGTATGATTGATTCTCAAAAAA
ATAAACAAAACACGCCTTTTATTAAAAAAAGTAGTTNCAAAAGTTGCTAA
AATTATAAATTGTTTTATTTTCAGAAAGTACTTCCTCTTTTCTCTGTAAG
AAAACGAATTGTCACGGCCCGATAG back to top
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