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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s205 | supercontig | LSalAtl2s205:263075..279463 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003794 >EMLSAP00000003794 ID=EMLSAP00000003794|Name=EMLSAP00000003794|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=157bp
MNILLSLVNLIVDDSMENLEEVVRERXRAYWELEVGETGERERIKRIGSF GIEVEYNPIEHNLPYEVNEEYKNTLRLKYSCNYGPEVTEFLEHYHEVLVK KESKKKHREMRICLETLRRYPNVEDHVLQEKFPLIDIELIKRWNKIKGHH DNAQWDV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s205:263075..279463+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003794-699641 ID=EMLSAT00000003794-699641|Name=EMLSAT00000003794|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=16389bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s205:263075..279463+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGAATATATTATTATCACTCGTAAATCTTATCGTAAGATACTACTTAAA
CAGGGGGAAGAAGTTCTCTCTCTCTGTGTTTTCTCCCTCTCTCTCTCCAC
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TTTGAGACCTCCACAGCGTCCATGGAATTGGCCACATACATAATGGACGA
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TTTCTGCTTGGGCTTGAAGAAGTAGAGTTGCTTGATGTGCCCCTCACTGC
TAATGACACATAAGACCATCATGCCGGCTGGGCTCTTCGTCCTGAAGACC
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TTCTCTTCTTGTCAACAGTGAATGTCTTCTCATTTGAGAAGAATTCCAAA
TTTTCTCCAGTGTTCTTCGAGGAAAACAGGKCCTTCCTACACCTAGCCTC
TCTGGTGAGCTTCATTGAGTCTGTTAGCATGTATCTCACAGTTAGAATGC
AGTTCCTGTATCCTAAGTTATCATTGATGGCCCTGGAGATGGTACTGCTG
TGCATGGATCGGTTTTTGGCAAGGATGGACATGGATTTGCCTGGGTCCGC
TCTGATGGACCTTTTGATCCCAAACAGAGACCTGGGGGTCCTCTATCTGT
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CTCTAGATGCGTGTGTAGTCTGATGATGTCATGGCTAAAGTGTCCTGGGC
AATGGAGTTCGATCACAGGGGACCTTCTTTTGTGTTCCATCCTCATGAAG
TGGTATTTTTTTTTTTTCTGGGAAAGTTATATATATACATTATCGKCCTC
TCCAGATAAAAAAGCTACTTGTAGATATCCCTGCTGTTACTCTTGATGCC
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ATGCATTCTTAAAACAATTTATACCCAAGAAAGGCGAGAATTCTTACTTC
AGAAGGAGAATTTAATAGCACATTTAATGAAGWAAAAAGAAGATAGAGTA
CKCGCAKCAGCCATTTTTTCTTTTTTAATTTATAAGCTTAGTTTTTTCCT
TAAAAATATGTCAACTCTAGTTAATGGGGGTGGAGTGTGTGTGTAAGAAA
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AGGGATACTCCGTTTGGTGTTCAATAAATGAAGGTCCAGAACACTAACAT
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ATGTAGCAGAGAGAAGAAATAACTAAATATAAATTCCACTCCTTAGCCAT
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TTGAATTATTCAATATNGTATTTTAAATTTTTGGAACTTRSTATYGCATA
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AGCGAGGTGATAAAACAGCTTATGAAAATAAGAAACACTCTTTAGATAAT
ATTTTACACAACTCTATACATGATTATACATATTAAATACTAGCAATATT
ATGTACACCGGCATTACTCGGAAATATTGAAAGCAATCATTCTAGCTGGC
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TTGATGAATGTGCATATTTTAATGCATGAATCCTCTTGAGACATCCATAT
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GATTTATTTGAAATAAGCTGTTATAATTATCTAATTCTTGAAAAGGGATT
TCATAAAAGTATGAAGTAAAAATTAGGGCGTGATCTTGAATGACCGGGAG
AAGGAGTTATAAGCGTAAGACGTTGTTGGTCTCGGAGCAGAATTGAGGAT
CGATATCGTAGTTATTCTAGCATATATGATTCTTATATGTATAATGAGTG
GGATTTGTGCTAATTACCTTCCTCTCATGGCTTCTTAGAGCTAAGCTGTT
CTCCTTTTAAAACATTATTTAAATTGTCAGGGTGCCCCAGTTAATTTTCG
TTTTTTTTACCATATCGGCAGGACAAATATTATGAATCACAACGTATGTA
GAGGTCTATTAAATATTTCCTAAAAAGTGGGAGAGGCTTTTTTTAATATT
TCGAGGAAAATAATCTTTTGGCTTTTTTTCATTTTTTAAAGCTGTTACCA
TTATGATTTCATTCTTGTAGACGGAACCTCTCAGTGCTTACTAATTCAAT
AATTAAGTGACTGAAATTAATTCATATTTCCATATATTAAAGCATAAACA
ATTGTTTAAAAAAAAAAACCTTAGCTCTCTAGCTTATGTACAACTTCAGA
AAATGACACTTGTACGTGTTCCACAAATTGCTATTCGCGCACTCTAAGTG
GTTTGGCGTCGATAGATCCAACATCTACGCCGTCAGCAAGTCTGAAGTTT
GGTGAGAAAGAAGGACTCTGTCAAAAAGGAGAAAATTGATCCAGAGGAGT
TAAAAAAAAGGCGAATCCCCTCAAGTCCATGAGGATCCATGCAAGAGGTA
GGTGGGTTTCACACTAGACTGTTCAAAGATCCATCAAAAAAGTGGGTAGA
AAGAGCCTAATGAGGGTGGAGAGTCCACTTTTGACAGCAACAATGAAGGA
AAACTATCTCCTCCGATGAAAAAATCTTTTGAATGAGTCTTTTGAACTCT
TTTTGACACTTTTGCCATGCGAACCCCCTCGATATGCACCCCCAAAAGGT
GCCACAACAGAGGATTACAATGCAGAGTGAATTTTGTGCTTATTTCCTTA
ATCTAAGTGCTACTTGCAGCTGATCTAATCAAACGATCTCCCAAAAAGGA
TCTTAAAAAACTTATAGTATTACTTAATAGCGATAGGACAGGATTCGGAT
TCAAAGTACTCGGACACGCTATAAGTAAATATGTATTTCAGATCCGAACA
AGTTCTCGAACTTTTACGGATCCTTAAAAGCTTATACTATTGCTTAATAC
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GAATAGTGAGATGGGCGACATCTACGTAAACATTTTCATTGCGTGGTTAT
TATTATAACAATAATTATATGAATAACTTATCATTATGTTCTAATAGGAA
TGACATTAATTTTTCCTTTGTGTATAAGAGTCAGCTATTAGTAAAAAAGT
AACCTATAGCCAGATGCTATAAGGTTTTTTTTGTTCCTTTAATTGTTAGG
ATGGAGTTGCACTGATTGATTTAGAATAAGTAAAAGTTATAGTATTACAT
TTACTCCGTCTGACTTATGAGTTTTCTTTGAAGTCCATCAACATAAAGTA
TTTTTTCTTTTCTATTAACGACAAGGAAGCAAACCTACGTACATTGAGTT
TTAAAAAAAAATATCCCGAGGGTTTTGTCCATTGAGCTACGTCGTTCCGT
TTTTTTTAACTACCAAAAAATGCTTCGAATTTACAGCTCTATAAATGATA
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AGTCTATGCAAATGAAAGTAGACTTTTTTTCTTTAATACAGAACTAACAT
TGCAAAGCATTTCATGTTTTTGATAGCAATCATACATTGTTATATATGTG
TATGCTTGTGTGCTTGTATATACCTATGTACAAGCAATATTATGTATACG
AATGCATTTTTACATATATACATACATGCAAAAAATTTTAATACATCTTT
ATTGTAATGTTAAATTTGTCCATTTCAAATTTTTTTTGCTTTGGGAGAGT
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TCCGATATTCCATTCATCAATATGTATATCTTCATGTTTTGTTATCATAT
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ATGTCCTATCCTTTATAAACTAGTGGAATGTATCCCATACATCTTGAAGA
TTGTTATTCAAACTTGATTAAAAACCAGTTCTTGAAGACAGTTAAGACAA
TAAAGTTTATCTCCAGTGAATTTTAAACAAAAATCGACATTTTTATTCAA
TATGKCCTCCTTCAGCCTCAATGATGGTATCCTCCTTAAAGCCTGCAAAA
ACCTGACGTATGTAGTCTTCTGGTAASCCAGCCTATGCAGCCTTGATGGC
AGATTACAAAAATCTATGTAGTATTTTTTAAAAGAACAAAAAATTAAAAA
AAATACCCTGATGTTTCCTCAATCCTTTTACCTAAAACTTGATATTACTA
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TGAATTTGGTGTACATACATTCGATGTTCCACTCTAATCAATTTATCTCT
TTTTTTCTCTCTCCTTACTTTTTTGTCAATGATTTCAAAGAGAAACTGGA
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TTCATTAAAATTCTGTGACGTTCCCTACTCCTTTTTATTTTAATAATACG
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TCTATCCTGATTTATTTATTTTGCAAAATATTATTTATGCGGTTCTAGGA
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TTTTTTTTAACTCCAATTTTAAGATAAAATATTTCTTAAACAATTTATCT
CTGATTTTATATTTGCAAAGATGGGTTTTTCATGAGAAGTACTCAAGTAC
GTTATAAGTAAACTTGTAATATCGGAAAAGATCCGTGACCCAAACCGGCA
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GACATTCATACAGACAGGCATACACACTTTGCTTCAATAATATAGATATT
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ATGACATTCAAACGTGATCGAGGAATTTCCATTTGTGTACTCTAAGCAGT
TGCCGTTTCCAGGACCACCGTCCAATCCATCACAAAGTCCAAAGCGCTGG
AGAGGAAAAAGGGCTCTGTCAAAAAGGTCAAACTGGACCCAAAGGATTTA
ATGAAAACCGCCAATGCCAATCCCCCTCAAGTCCATGGGGGCCATGCAAG
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GGGAGAAGGCTTGCATTGCCCTTCATCCAAATACCGAGGCCCTCAAAGCC
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GGCCTTCCGTCATCTCCTGGAAGCCATCATTCCCGCTAAGGGCGTCTATA
TTAATAATTAAGAGGATACACATCTATTTATAGTATTAAATTTTGTTGAG
ATTCCATTGTTAATTAATAAATTATATCTTGTTGAAGTTTAAAATTCAAA
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TGCATATAATATCTATTTGATAAATGGGAAAGGAATAATATCTTTTATTT
TATTTCTCTTCAAAATGAGGACTTACTTGCCTCATCGCATCTTTTTCTGC
TTTAAAAAATAAAATAAGAATCTTTTAGTATTATGTAGTATACAACCTTA
TCATCATCATCATCATTTGTTTAACAGAAGAAGGAGGAGGAGGTGGAGGA
GAAGATGGGATTTGTCAATCAAGATTTATTCTCGTCTTGCTTGAGTTGAT
ATCTATGTATGTGTATTTTTGCCTTCAATAAGGATTTCCTATCGATCTAT
TATCTTCATCTTCTTCTAAGCATATTATGTCTGTACTTATATTTGTGGCT
TMTCAGCAAAAKAWCAAYCCTGAAAGATTTTTATCGCAATTCATAATGGA
TTATGTTTATATTCATCTACGAATATTTGTCAATTTTTCTATCAACAATT
CATTATTTTTAAACCTTTGGGTGTGTCACAATTTGTACTTAAAGTAGTCA
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GTGTTCGAAGGGTGAATTTGTTGCACTATTACGATGAAATTCTTTTTCAT
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GTTTATAGTACATCTTTAAGCCCTAAACTTTGCTATCAAGAAAAAAATAT
GGCTTAAATATTTGGTATCAGGTAAAAAATTATGCTTAAATATCGCACAT
ACTTTATAGTACGTAAATGGAGGATGAGCTAAAAAAATTGCTGTTTTTTT
ATGCTTGAAATTGTCTTCATATTTCTTTTTAACTCAGGAAAACTGGAGTT
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TACCGATGCTGTGAATTTTCCACCAAAGAACAAACTGAGTTGATCGAGGA
AAATAGAGTTATATTTAGGAGGGATAATTTAGAGAAAGTTAAACCTTTGC
TAATGTTGGCGTCAAAAACAATCATAAAATCGTCAATAAAATGAAGAAAG
GCTAACACAAAGCTCCTAAACATTCCGATACTTTCCCAAAAAATTTTTGA
ATAGGAAACCGTCAAGGATCAAGAATGAGATTGGATTTAAAGTTGGACAG
TATGATTCCAAATATATTCAGACACTTATAAATATTCCAGTTGATTTAGA
CGAAATAAAACAATCCCTTGATTTTCGAAAAAAAATTCATTACAGAAAAA
ATTTGCAACAAAATTGTTGAGAAGACGAAAAAAAGGGCTATGATAAATAA
TTCGCTTTTTCAGTTGATGTAATTATGATCAGGGATAGTCATACCTTCAC
TAATTTGAATTGCTATCTGACTGCATTTCCTAAAAGGATGTACTCGGAAG
CTAAAAAAGATACGGGCAATAATTTAGTAAAAAGATGTATCTCCAGATCC
AACCATGGAAAACTGATGAGATATACCCACTTCAATGGCGATCCAGATAA
TGAAAATCTCTTTTGGAAAGTAATCGACTATAAATNAAAACAGCAAAAAA
ATATGTAGATCGATCTTAATATATCTCGGCTGATGAATCAATGGTCAAAT
ATTTTGGACCTCATCCCCTCAAACAATTTTCCAAGGAAAGCCTGAGCGTT
TAGGTTTTAAAATCTGGTGCGCATGTACTCCAACCGGAGAGCTCCTCCAT
TGTTTGCTTTATGGAGGAAAAAAACAAAAGTAAAATAGAGAAGACTTGTA
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ATGGATTACTTAGGATCTACTGGGTTAGGGATAGTCAAGACATTGAGAAA
AATTAAGCTCAATAATCTGAATCAGCCAACTAAAACTGAACTGAATAAGA
TGAAAAAGAAGACATGAAATCCGTGTATATTGACAATGATTTATGTGTTA
CTACTTAGAAGGATTCCGGATACAGAATCAACAGTTTTTCAACAGTTAAT
TCCTTTGCGTACTTTAAAGTACGATTTATTTCATGTTATAATTGAAAAGT
AAGAAAAAAATACTATATATATTTACAGGCCTTATTCTAGCGCGTACTTA
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TATAAATTATATTTGTAATTCTTGGATATATAAACTCATAATACAAATTT
GAATATAATGCCAATAATGGACTGAAAATAGGTCCATGAAAATTTGGGGT
GTATGTATACAAATATGTTGCCCGTCAACATAAAAACAAGCTAAAATGAT
TTTTCTCAAATTGAGTGAGGATTCCATTTGTATTCTTCGATGATGAATTA
TCGTCCATTTCCATCAACAAATTATTCTAATAAGCCCTCTGAGTGTGTTG
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AACTTATTGATTTGAAATTTATGGTGGTTTTACTACAACGAGAAATTCCT
TCATTWGATTATTTTTTAGAATATAGGGTCCGGTAACATTGTTATGAATA
GCAATCAGGCTGTATAAGTAGTAGTGAGTAGGCGTGGTTTCATTATAGAG
GCAAGATTCTAAAATTTTCTTGTAAATACAATAGTTTTGCCATCATGCGT
TCGAGTATTGNNNNNNNNNNNGAACAATTTAACTAATAGCAATTTATGTC
CTAAATTTTATTGGATGTGATTTATATAAATCAGTGAATTGCTTCTATTT
CTTATATACTAAAAACAATTTTTTCGATTCATTTTCATAATTTTGAAATT
TGTAAAAAGAATTAAATAACAATAATTCGCCAATTCATTTAGATAAAGAG
CTAGAATGGAGGATATCAGATCTGTTGTAATGCATGAATTATAAATTGGT
GCAATATGTCCAAATGGAGTTTTTGGAACCGGATGTATAACGGAAAAACA
TTTCTAAGACCTTTGTGGAATCGCCAAATACTTATTACCTAATGTACTAA
TGACCTACAATAATATATGTTACCACTTAAATTATGTATCTACGGGCATG
AAATAATTATCCCCCTAAAACATCTCAATAAAAAGTCATTTAGAGATGAA
CAAAAAATGAAGTAATCACCAGGTATTAAAATACAATTTGGATGTTTTAT
TGGTTTATGTTGACGCAGTACATATATACTTTTTTCATACTATAAATAGT
GGAGGATTTCTTTTGTATGTCCCCAGTTGCACTCCCTCCAACTCATACAT
ACATACTAAAAATGAGGTCACTATGAGAAATGCTATAAATAAAAACTTAT
CGAGTGTATAAATATGAGAATATATTATTATATATACTTAATACATATAT
GTATATACGAGTACATGCTATATATTAAATTAATTTATTTCATTCCCAAC
TTTCTCAAACCATAATTTATAAGGTTAACACGGCGTTATCCTACTAACAT
AAAGAAATTATTTGCATCATGAGTATATGAAAAAAAATTCCGGGAAAATG
TTTGAAAGGAGAGCAGATTGGCTCTGAATAGTTTTATTAATTAGATACAA
GGAGTTATATGAGGAAGGAAATACACAATATTCCAACTACTTAATATGTA
GCAAGGACATATGGACTGGAATTACTCCGATTACTCCGAGTCTTTATTCA
TATATAAAAAAGTTTTATACTCTATCCTTTCAAACCTTTCTGCTCTCTTT
CTTAAAAAAGATACCATTCACCCTTTACTTTTTAATGACTCGGATCACAA
ACGTCTTTTTATTTATGATCGACTCTAAATAATATATATAGATTTATGTA
ACTCTATACTGCTTATAATATGATAGTCATTCAATTATGTACTTAATGCT
TATTATATATATCTATTTTCTTCTCTCTTTTTAGTCGAGAAATGCGCATA
TGTCTAGAAACACTTCGTCGATATCCAAATGTAGAGGATCACGTACTCCA
AGAAAAGTTTCCGCTCATAGATATTGAACTAATTAAACGCTGGAATAAAA
TCAAGGGCCATCATGACAATGCACAATGGGATGTTTGAGGAAGAAATAAA
TGATGAAAATAAAAATAAATCTCTTCTTCGCCTACTTTTTTATTTTTAGA
CATTTTTAAATTTCCCAAGGGACTGTCCCTTCTGAGATATATTTATATGT
ATGTTCTAACAAACAGGACAGGATTTCCTCAGCCATACATAGTATGGTGG
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TTGTTATACTTATGTATTTATTAATTGTCTATTTTCTTGAAATATATGAG
TTACGCATTGTTTATTGGAAATTTAGCCATCTTGGATACATTATAAACAA
CCTAGCATAAAAATAACTTAACATATTTCCATCTAAAATGTTTGAGATAC
CGGTTGGTCACCTCCTCTCTTTTTATTAATAATTCGAAACAGAATGTTGA
AGTCCACACTGTGCTCCTTCTTTAAAGATAACATCCGAG back to top
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