EMLSAT00000003794, EMLSAT00000003794-699641 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003794
Unique NameEMLSAT00000003794-699641
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s205supercontigLSalAtl2s205:263075..279463 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003794 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003794EMLSAG00000003794-686560Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000016510EMLSAE00000016510-725438Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016511EMLSAE00000016511-725439Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016512EMLSAE00000016512-725440Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775505auto775505Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003794EMLSAP00000003794Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003794

>EMLSAP00000003794 ID=EMLSAP00000003794|Name=EMLSAP00000003794|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=157bp
MNILLSLVNLIVDDSMENLEEVVRERXRAYWELEVGETGERERIKRIGSF
GIEVEYNPIEHNLPYEVNEEYKNTLRLKYSCNYGPEVTEFLEHYHEVLVK
KESKKKHREMRICLETLRRYPNVEDHVLQEKFPLIDIELIKRWNKIKGHH
DNAQWDV
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mRNA from alignment at LSalAtl2s205:263075..279463+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003794-699641 ID=EMLSAT00000003794-699641|Name=EMLSAT00000003794|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=16389bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s205:263075..279463+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATATATTATTATCACTCGTAAATCTTATCGTAAGATACTACTTAAA CAGGGGGAAGAAGTTCTCTCTCTCTGTGTTTTCTCCCTCTCTCTCTCCAC GCATAAAACAAAGATGTTTTACAATCAAACGGATGATGCTTTTTTATTTC CCATTCCTTTTGTATACAAATATATGTATTTCTCTTAGAAATATTTAATC GGATTATAAGTTGTCACTTGCTATTAGAAGAAAAAAGTAGACAAAGAAAA AGCAGAGGGAGATGATAAGAAGTAATAAATTATTCTTGTTCCCTTCATGC ACTATGTAAGTACTACATCGAGTAATATTATTTCTTCCACATATTATATC TATGGACGACAATATTTATAACCACCAAAACAAACCCTCAAGTATTTCTT AAAGGGTAGACTTGTCGTCGAAATATTAATCTACATGCTTTTTTCCCTCT TTAAATACCGGGCCGTGCAGAATTATTAACCGATTTTTGTTCAGAACATA TCCCGGACAATAATGACATTTCGAATGACTTGAAAAACAATTTATTTATA CATTTTTAGAATGATAAAATAGTTTGTAATCCAATTTAATCAATGTAGCC ACCATTTGACTCAATAMCACTGGTCRGGCGMCGTCTGAASCTGCCACAGA CTTGCTGGATGTAATCGGCTTCCATGGAGGCCCAGGCCTTGTTCACAGCT GCCTTTAAGGCWTTTATGTTCTTGTGTCGTTTTTTTGCAGGCCTTGGTCT CCACGAGCGCCTAGATAGGGAAGTCTAGTGGGTTCAGATCTTGGCTCTGA GGGGGCCAGTAGTCCTTGGCCAAAAGTTCATGCTGTCCTTGAGCCACTCC TGAGCTTTCTTGGAAGCGTGGGTGGGTGCTCCATCTTGTTGAAAAACTCA AGGAGAGTTGCCGACTATGGATTTGATCCACGGNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGTG GGTGGGTGCTCCATCTTGTTGAAAAACTCAAGGAGAGTTGCCGACTATGG ATTTGATCCACGGAAGGACCTTGGACGCCAGAATCTTCACATAATCCTCC GCTGTTAATCTGAGCCTGTGGGGAACCATAGCGGCTTCWTGGCTTTCCCG TTGGYTCTCCAAACATCTCCAAAGCTCACAACACGGTCATTTTGCCTGTT GAAAACAGGATCGACCGTAAAAGTTTTCTCATCCTATCCTTTTTTTTCGG GGGGGGGGGGGGGCTTGGTTTAAAAAAAAATTAAAATTAAATTGCAAAAT ACATAGACATTCACAAAAAAATTTTAAAATGCATTTTTACTATTAAATTT TTTGGAAAAAAAATTTCAAAAATCCATAGCTTTTCACAAAAAATACATTT TTTGTAATAAAATTCGAAAAATTAAATTTTTGGGGGAAAAAATTAAAAAA TCCACAGCAGGACTCTGTGGGTCCTGTGGGCGGCGACCTTATACTTGGAT TTGCCAATTTAAAATAGACTTACTTTTTTCTGTAGACCGGTCCATACCGA CTTTTTTATTTGGACCTTTCTAGCCCTAACGTTTTTACAGGAACGAATAA GTCAAGTTCAAAAAAGCATAGCTGTTTCAGACCGGTCAAGGATTTCCAGA TGGAAACCGAATGCTGCAGCCGAACTCTACTAGCTAGGCTCTCTGAGTGT GGTCTTACACTTGGTGAAGAAATGTTACATAATAATATTCTTTTACTCTT AATTAGATTACTAGAATGAGTGTCTCTTTCTATAGCAATGTCTAGTTTTT GTTTTGTTGTTGTTCCCTCATTTTGTGCCTATTTAATACGCGTTTTCCCT TTTTTCGTTGGTACAATAATTATTTTTTGGGTGTATTTTCGAAAAAACTA TTCTCAAAGTTAAAATAAACTTTGAGACACGGGGAATCGATCGTATTATA TGAAATAAAAAMCAATTTATTATGAATAAAAATATTGCTCCCCACAGCAT AGGAATAAAATAGAGCCTACGCTATGGAAATCAGAATTCTAAACAACTTT TTATTTTATGATTGTCTATATGTCTCCGTTATGGCCAAAGTTCACGATTT GTACAAATGCCTCAATTTTTATTAGAATACGATCATATTATATTTTGACT TAGTTATATAATTTAAAAAAGGAAAAATCCCCACAATGACGTCACGAGAG ATAAAAAAATGATATAGTGACGTCATCCGTGGTATTAAAAAAAGGGGCAT CGCACTCAAAAATATAATTCTACGACCATGCATCTAATCAAGTGAACTGG CGTTTTTTGCATCTTTATTTTAAGCTTTAGTGCGAATATACTTATGTAGT TATTGATTTAAAAAAAGGATTTCATCTAACAATATTAATTTATATATTAC TAGGTAGACGATAGTATGGAAAACTTGGAGGAAGTGGTTCGAGAGCGGYA TAGGGCTTATTGGGAATTGGAAGTGGGTGAGACAGGAGAACGAGAGCGAA TAAAAAGGATTGGTTCCTTTGGTATTGAGGTGGAGTATAATCCTATTGAA CATAATTTACCTTACGAAGTGAATGAAGAGTACAAAAATACCCTTCGACT CAAATATAGTTGCAATTATGGACCTGAAGTAACTGAGTTTTTGGAACATT ATCATGAGGTTCTCGTCAAAAAAGAATCAAAAAAGAAACAGTAAGTATTG GCACTTTAAAACTTTGTATTTACATATCAAGGCTGAATCACAGGGGTGAG GTCCCTAAATTTTTAAATCCATAGAGTTGAGTAGTCTGTAAGAAGAAAAA 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ATGTAGCAGAGAGAAGAAATAACTAAATATAAATTCCACTCCTTAGCCAT CAAGGACAGAGGCGGGAAATACTAGGATTTTTTGTGAGAAAATTTTAGAT TTGAATTATTCAATATNGTATTTTAAATTTTTGGAACTTRSTATYGCATA CWTTTTGTAATATTTGCCAAAATCAACCAGTTATAGATGGAAATTTTTTC AACGACATTATTTTTCTATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NTTTTTCTATTACTTTTTTTTTTTTGCAAGTACAAAATAATATTGGTAGG TTAGTAGTGTTCCTCTTTGCAATTCCAATAAATGCATTTTAATACTTTCC TAGCAAAATTAGTACAAAACGTTTTTGTTTTTTTGAAATTTTTTTCCAAA TTTCGATTCGACAATTTTTGACAAAAAAAAAAGAAAAAGAAGATGAACTT CATATTTAATGATTTTTTTCATGATTATATGCTATTGGTAGCCTATAACC CATTTTTGTTAAGATTAATAATAAAACATATATTAAAATCCTCGCCCGCA CCGAAGGTGTCTAAACCTTAAGAAGAAATAAACTTGACCATTGTCTATGT TTTTCCCCGCCCACTCCTTGCCCCAAGCAAAGCCGGATAAACCTTTGTTA CTATAGAATATAACTACGCAATAAATCCTCAGTAATACTCTCCTCTCACT AAAAAATATTTAGGATCTCAGTCCTTTACTTTTCTTATTTATTAGATGTG CTGATCTATATCTACACACACTCATTATAAAAAAATTAGGGGTTTGCAGA CAATCAACTGACAAACAGACATACATTGCTTCATTATTATATTATAGAAG ATGTACTTCCTTTTTCATTTGACGCACTGAGCAATAGTTGTAGACGCTTT 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ATTGTTTAAAAAAAAAAACCTTAGCTCTCTAGCTTATGTACAACTTCAGA AAATGACACTTGTACGTGTTCCACAAATTGCTATTCGCGCACTCTAAGTG GTTTGGCGTCGATAGATCCAACATCTACGCCGTCAGCAAGTCTGAAGTTT GGTGAGAAAGAAGGACTCTGTCAAAAAGGAGAAAATTGATCCAGAGGAGT TAAAAAAAAGGCGAATCCCCTCAAGTCCATGAGGATCCATGCAAGAGGTA GGTGGGTTTCACACTAGACTGTTCAAAGATCCATCAAAAAAGTGGGTAGA AAGAGCCTAATGAGGGTGGAGAGTCCACTTTTGACAGCAACAATGAAGGA AAACTATCTCCTCCGATGAAAAAATCTTTTGAATGAGTCTTTTGAACTCT TTTTGACACTTTTGCCATGCGAACCCCCTCGATATGCACCCCCAAAAGGT GCCACAACAGAGGATTACAATGCAGAGTGAATTTTGTGCTTATTTCCTTA ATCTAAGTGCTACTTGCAGCTGATCTAATCAAACGATCTCCCAAAAAGGA TCTTAAAAAACTTATAGTATTACTTAATAGCGATAGGACAGGATTCGGAT TCAAAGTACTCGGACACGCTATAAGTAAATATGTATTTCAGATCCGAACA AGTTCTCGAACTTTTACGGATCCTTAAAAGCTTATACTATTGCTTAATAC ATAATCCTAGTTTAAAAAAATATGTTGAATGTAGTATCTCTATTTATATT GAATAGTGAGATGGGCGACATCTACGTAAACATTTTCATTGCGTGGTTAT TATTATAACAATAATTATATGAATAACTTATCATTATGTTCTAATAGGAA TGACATTAATTTTTCCTTTGTGTATAAGAGTCAGCTATTAGTAAAAAAGT AACCTATAGCCAGATGCTATAAGGTTTTTTTTGTTCCTTTAATTGTTAGG 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TTGTTATACTTATGTATTTATTAATTGTCTATTTTCTTGAAATATATGAG TTACGCATTGTTTATTGGAAATTTAGCCATCTTGGATACATTATAAACAA CCTAGCATAAAAATAACTTAACATATTTCCATCTAAAATGTTTGAGATAC CGGTTGGTCACCTCCTCTCTTTTTATTAATAATTCGAAACAGAATGTTGA AGTCCACACTGTGCTCCTTCTTTAAAGATAACATCCGAG
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