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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s2066 | supercontig | LSalAtl2s2066:24788..35245 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003796 >EMLSAP00000003796 ID=EMLSAP00000003796|Name=EMLSAP00000003796|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=400bp
MSDDWEEIRRLAGDLQRIQLSGASQKLSERNIIEIVMKLQSCGLLDVLHT
SDGKKYITPQHLLKEIKEELDVCGGRIPLGELAKILCVDYVHVEIQSSIL
SKSDSSVFLVLGQLVNNDYIDRLCEEVNEVLQQKGCISIATLTKEYDLPS
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AVGQVLVDSIDASIDEVITSNFWMEARTLLPSILSDEDIRTILKKSIDER
DYSASIVGDTVVISNNFISKLKEPFTELIRKKAQEDVDSGKIASIISREK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s2066:24788..35245+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003796-699643 ID=EMLSAT00000003796-699643|Name=EMLSAT00000003796|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10458bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s2066:24788..35245+ (Lepeophtheirus salmonis)
CTCGCGGGCAAGAGCGGTTTATGAAGCCAATCTACCAGAAGACTTCCGCC
GCCCTCAGACAGAGTCCTCTCTAGAAACCTTTATTCGCGCCAAGTATGAG
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TAAAACAGATCCGACTCCCCTCTCACACCCTTCCTCCACCTCCTGAACCC
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CACCACCACCACGACTACCACAGGATCCAGTTCACAGGATCTTCTCGCTC
TCAATACACTAGCAAACGCATCATTAAACAATCTAGTCAGCACTCAACAA
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CATCTTTGTTTTACTTGTACACGTACACAGAACATATCTCATGTGACTTC
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AAAAAGAAACTGAGAATTTTTTTTTTAGTAGTAGTTAAATTATAATATTC
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TCATTTTTTATAAGAAACAAATATTTCCATACGTTCCTTTTAAGGGGTCC
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TTTGCATACCCCCGCATAATGCGGTTTCAAACACCGTTGATTTCGCATAG
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TCATATCGCGGCGCTTTCTTATGTTATGTTAATAAATTATGAAAAACTAT
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AATCCCTATATATTCATATATGTAATAGAAGTGAATAATTTTAAACGAAC
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TAAATCTTACAGTATTCAAATGACCGGATTAAAAAACAAGTCAATACCAG
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AATATGGTTCCGAATAACACCAACCCAGTCAGTCCATTTATGGCAACTGG
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AAAGTATAATTCAATGAAATTCCATGTATTTTCATAATTTAAAAACTGGC
GATAAGTTGAATCGATTTTATTTCAATATTAATGTACTAAATAACATTTA
GAATTATGTTTTCCCCCTCTCCACGCATTTCTTTAAGCGGCTTTAGCTTA
CCTTTACATAACTTTTCTTTGTTCTGCTCTTTGGTGGCATGTGTTATTTG
GCCCTTGCCTCCAATACGCCATCCCAAAAAAAGTTCAAACCGGGTGAGAT
GGGAAAAGAGTTGTGTAGGTACATATTTAGGACCGTAGGCCAATCCAGTC
CCACTTGTCGGTCCCTGAAGAAAGTAAAATAATTGTTTTTAATTATTCCT
TTACATTAATGTGATAAATTTTTATATCACTAAGTAAAAATGTAATATGT
CCTTGTTATATTGTATTATCATGAAAATATAATATTTTTTGTAAGATATG
TGCAATGCCCTTAATACAAATATCATATATCTTATTTGGCTTAATAAACC
ATCGACATTTTAAGGAAAACTGCCAAGGACTGGTCCTAAGGCTGGACTGA
ATTAATAAGGACCTCCACAATACTAGCTGGGAATTATGGTTTTTTTTTAG
GGGAAGTCGTATCAGTGCTCTAGGGTCGTGAAGATCAATACTGATAAAAA
TCTTCTTGTTAAATTCGTCCAACAACTAAAGTATGTCGTATTTTGTCACG
ATTTGAAATTGTTCATTGTTGTCAAAAAAAAATCCTAGTAACTGCCTGCT
AACCATAGCAGATATTTTTTATAGACATAAATGGGACAGTGTCCTGCAAC
CACACCCAGAGATGATTTTCCACCATTTCCTGGGTCTAGGGTAGTACCAC
GGCCTCCATAACATTAAGATAGTTGACATAAGACCTAGTCTTAAAGATTT
TTTGAAAAGCTTTGTCTCCCATGACCTTTTTTACGTCCTGGGGCCTCATG
GTAATCCGTCTGTGATTCTGCTGATTAACTTTCTTGTCTTATCAAACAAA
AATATACTTTTAACAGATCTTCCTATTGGTCATTTAGTCCTTTGTATTAA
GCAAGGTAATAACTCCGGGGTACGTTGCTCCTCTTGGTTGAAATTAAACC
CATTTAATTTATCATATGTTGGTGGTGAATCACTAACTAGATTATTTTGT
AATGCTTTTTATTTGGGGTATGAATAATATATTATTTATTCTGTTACGCA
AAAATCCAAGCCCTGTATTGAAATTTTATATATCTATTACCGCCTTATAA
TATATTGTCACTCTGTATAGGTCTTGAATCAATTTAATGGACTTAACTTG
GGGGCATCATCCAATGGTTCTAATGGTATAGGAAACCTATTGCCTAATCC
CCTTGCTCCTCCTGCTGCAAAAACTGATTCTTTGGATAATTTGGATATGT
GGGCCGGATTTTAAACAAGAGTCGCAGACGCAATGATGTTACATCTAGTA
TCATAAAGAAGAAAAGAAAAAAAATTATAAACTAATGCATTTCTGTTATA
CTATTATTATTCATAATTTTTGATCGCATTAACTAAAATTATATGAAGTG
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TTCACAACAAAATACTTATAGACAAAAAATCGAACACGCTCAAAAAAAGA
GTATAACAATTKGTAAATCATGCTATACGAGTACTAGAGTCCTTAGGAGG
TACGTATCCATACATGAAAATGGAAGAGATCACTAGTGCTGCACCAATGA
CGAAGGGAAATGAAATTTGAAAACCAAAGAGAAAGATAGATGCAATGGAG
GAAATTATGATTGCTAGAGAGCATGCGAAACCCTTGAGGATATTGTCCGC
ATACTTCACTACCACTGCAACAAGGAGTCCTCCAGTAGCATTTAAAACAA
CCAAGTACCAAACAAAAAAGTCATATCCATGGAAAAACCCTTTGGAATCA
ATATCCTCAGAATGTCTCCAATAGGACGTGAGTAMCCCCAGAGGGATACT
CAGCATACTCAATTGAAGATTACGCATCCATACTGTCACATCTGAGCCTT
TGAGAATCTTTTCAAAGTAAATCCCAGCGAATCCTGAAAGAACCGTAGCA
GTCGTAGCAGCGAGGAATCCCTTGATGCGATTTTGCTCTGTATGAGCCTG
TTGGTTCTCTTTGGCATCTGAGAGCTGAACCGTTGCAACTCCAATAATAA
GAAGAACCAAACTCAGCCATTGCGTTTTAATAAGTACTTTTTTAAGAATG
AAGTATGCAAAAATAGCCGTAGTGAAAATCTTCAATTGATATGTAATTTG
ATAAGTGGCAACATCCAAATTCTCAGCGGCCACGTAGAGGAGTGTGTTTT
GTATCAAATACACGCAGGATGGAATGCAGACTTTAAGTGTGTCTCTGTAA
TTAACAATGATAGTATTCCAAAGACATTTTTTCCATTCACTGTAGCTCCT
ATTCCCTTCRCCGTTGAAAACAAGCCAAAGGCYGGTCATCATTTTAACGA
TCRCAGCCATGAGAACAGCCGTGGACTCAAAAAACATGTCTCCTGAACGA
GTTCTTCCATAGCGCATACTTAGGCCTAGCAGAGCGTTTTGCCCTGTTAG
GGTTATGAGACTCACATATTTCAGAGTWCGAAATTGGGCATTTTGGTCCA
TTATTGGATTCGTATCTGAAACAGAAGAGTGGACTTGAGGTAAAATCACA
GATGCGGAGGAGTCTTTGCTCATCTCTCCTAGCGATATATTAATGATACA
TCKAATNCTCACATTATTAAATTACAGGACTCCTAGATCGGTCGAACATA
GTAGGCATACAATTATTTAAATATATAGCTTCATACATAAATTAACAAAA
ATAATGTTCAATTTACTACTTTGCTCCGAATTTGCCAAAAAGTGAAAATT
ATTTTAATAAGTTGTCACGTTAAGCACGGGGTTTTTTCATTTGACTACTC
ATGACGACGATGACTTATCTAAGTTGGCCATAATTAAATTCAGGTTATCT
AAAGGGAAATATGAATAAGAGGAGGAGTGACGTCATGCCACGTAGTCAAA
ATTCAATCAGTAGGCAGTCCGAGGTATTGAAGCTAGCTCCTTCTTGCCTT
CAAGAGGGTGAGAGCGCGTTGCTTTACACCTGTCAAATCGATTTTATCAG
GAACAAAGTTGATAATGAAGCGAATGGATCCTTTTCTCACGTCTTCTAAT
CGATCATATGAAAAATTGAGGCTCCTTTTCACGAGAGGATGACCTCGAAG
CTCCTTATAGGACGAAGGGAATCCCTTTGACACGGATTGAATAATTTTCT
GCAACTTGTCCATGTTTCTTTTATTCTGCAAATATAAAATGACGCCCTCT
ATGTTTCCCCCCCCCCCTTTACTTWTTGGCTATATATGCAATTGATCACT
TTAAAATTTCAAAAAAATGTTCACCATAGGTGGGAATGTTTATYTATATA
GATAATATACATTTAAATATTATAAGAAACCCGATAAATCAATATAATTA
AAGAAAATTTGGGCCATCTATTTGACCCAAAAAAAATAATTCAACGACTT
GATATTAATTAATAAATAAATAAACACCAGAATAGATAGCTTAATAGGAC
GTTGTTGGCTAGCTATCCGGCTATTTCCACATAAAATCTAGCTACAAAAA
ATTCCAAATCACTAGTTGACTCTGCTGTTCATTGATGACGTATGTATTAT
GATTTTGTTCGCCTTTAAACCTTTAAGTTATACTCATAACTGTTTTATAG
CATGGAGAAAACGCGGGATGGCTCTATTTTTAATAATATTGATATTTGAT
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TATTTCCGTAGGTCAAATTTGAACTCTTTTGGGAGGATTTTTTCGTTGCT
TATAGTATTCAATTGTTAGGGCAATCCCACTGCTGGACGGTGGATTAGGT
TGAGAACAAATTTTCTATAATGTCTAGAAATGTAAAACTCTGTTGAGCTA
TGTCGAGTATTGAAGGAGAAGGGAAAATAATATTTTCTCTTCGAAGTTCT
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TCCTTTTCTTAATTATTCTTTCTACTCGTCATAACATTAACAACAAGGAC
TGATTTGAAGTCTAAGTGTTTTTATTTTTATAATTATCTAAAGTAGAGAC
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GCAGAGGATCCAACTGAGCGGAGCCTCTCAAAAACTGTCTGAACGTAACA
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TGTTATGTTATGAAGCATGTTATTAATAAAAAATCCTTAACTTTCTGATT
TTTCTAATATATAAATTTAAAATTGTAACATAATCTATTAATGATTTCTG
TAGAGAGATCAAAGAAGAGCTCGATGTTTGTGGAGGKCGGATACCCCTAG
GAGAACTCGCTAAAATACTTTGTGTTGACTATGTACATGTTGAAATACAG
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ATTGGTCAACAATGACTACATCGATCGTCTCTGCGAAGAAGTGAACGAAG
TCCTTCAACAGAAGGGCTGCATTTCCATTGCAACTCTAACTAAAGAGTAT
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TGTAAGTACGGGTTACTCAATCACAGATCGTAATCTTACTTTTACAAAAC
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CTCCTTTTTTGCTACAAATTCATACTTGGAATATGATGCACTTTCACGAT
TAGGCATTCAGGATACAAAAAGTTATATCAAGAAGCGATTCAAGGATTCA
GACATAGTGTATCTTTCCTCATGTGCCGTGGGTCAAGTTTTGGTGGACTC
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CACGCACTCTTTTGCCTTCTATTTTGTCGGATGAGGACATCCGAACCATT
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CACAGTTGTGATTTCCAACAATTTTATTTCTAAGTTGAAGGAACCATTCA
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GCATCAATTATATCTAGGGAAAAATAAAAGTAAATTAACCATTAACGAAG
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GKCGGCGGKGGKACTCAGGGKCGTGAAACTAAAACAAAATCCACCAAAAA
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CTGTAAAAAGCCAATTAGAAAAACATCTCGTTAAAACTATTTGTACGGAT
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GTGGACGAGTTTATTGAGAGCCTGGAGGATAATTTTGAAGAAGGTGTGGG
AGTTTCTTTCCGATCCAAACCGGATAAGAAAAAAGATCGACAAGTCTTGT
TTTCTCACCGTCAAAATCTTTTGGAGCAATTGAATGCTTGTCCTGAAGAG
GAAGAGGCTCTAATCCTTCATTTGGTTGTCCTTATTTCCTTTCAACTTAT
TCATAATCAAATGATTCATGCGTCTGGGAAATTTGTTCCTCAAATTATCA
GTTTATTAAATGAAGGATTAGACTCGGATGCACAAATTCTTCTTGCTAGT
TATCAGTCCAAAGTCATTGAGCTTTTAAAAGCTAAKGATGAGAGTGAGAA
AAATGATATCAAGGGTTTTTTTGGTTGAATTAACGCCTGCCGTAAAAAAG
TTGCCATCAATGTTGAAGAAGACTGCGGATCCAAATGCATAACTCCCAAC
CTACCAACCAATTTGTTTTTTACTTTACTTAAGATCATTTGTTATTTTTA
AATTGTATTTATGAATTTTATATATTGTATTCTTTGTTTTGTACATCAAA
CAAAAATT back to top
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