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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s210 | supercontig | LSalAtl2s210:448630..459488 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003895 >EMLSAP00000003895 ID=EMLSAP00000003895|Name=EMLSAP00000003895|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=145bp
MTPATLLRGKPMSIVPQVLFPLSITVLMILSSTPLLVESRSVVLPSPQCH
PSIVQNMPDRYRKICDALATILDLSDAMDNYIDEKVLLEILDQYLVGGDV
DPRENDLDHLRQPPSNFKDMMPLMKSGVKRKEDVDHVFLRFGKRG back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s210:448630..459488- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003895-699742 ID=EMLSAT00000003895-699742|Name=EMLSAT00000003895|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10859bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s210:448630..459488- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGACTCCAGCAACCCTTTTGAGAGGCAAACGTAAGTATATTATTATAAT
GATAAATAATTTCCTACAAATGTCTCCTAATGTTTATTTTTTTTAAAAGA
ATATTTTATTTAGGGGAAACACTAAAAGATATGGCCTATCACAGATTATA
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ATTAATTAACTGTAGCAGAATAATTTGTCTAATTAACACGAGTAATACTT
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ATTGATTACCCAAAAAGTTTTTTGTTATGCTGGAAGATAATAGAGATGTT
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CCCCCCCTAAATATATATTTATATATATGTATATACATACAGAAGCGGAA
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ATTCTTATGATGTAAAAACACACATATCATTGCCCCAGGCTCCGCTAATA
CTAACTGGTTTTAAGAAGTACAAATTGTCCCATGTAAAGTATAGTATCAG
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ATTTTTGTAATTTTTTTCAAAAAAATTTAATTTTCTGTAAATATCTATGA
ATTTTGGAAATTTTTGTCCCAAAAATTTAATATTTGTAATTTAATTTTTG
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CTTAATTTTTATGGATATTCATAATTATTATCATTGAACTTTTGTTGTTC
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TTAAGACTCTGATACAACTGATACTGTAACTTCATACATATTAAGTATAT
TTAGAAATAGAAGATTATTCAAATCCCTTTATACCTTTTATTCAGAAGCT
GTGAATAGACTCTTAATTAAGGGTTTATCATCATCCTCCGATGATGATGA
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AGCCAGTCATGCACCTTTTTGGTTTCATCAATTCTGTTCCAGTAATTTTG
AGGTCAATGATGCACCACGCTCCGGAATGTTAACTGTCGAAATTGTTAAT
AAAGTAATGGAAGTCGTCGGTTANNNNNNAATACACTTATTATTTTGATG
TCCTAAAATGTTGAGAACAAGGATGAAAAATTTAATATAAAAAAACTTTA
CATAATGCTGATTTTGAAGTTACCCTATTAATAGTTGTGTATTTACATTA
AGTAAAGGTCATTTCCCCTCTGGAACACACAATTTCCCGCTCCCATGGTT
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CTATGAGCCATTGCTACGATCCTTTATATATATTCTAGCTATAAAGACAC
ATATATCCCGTCATCCTTATTCTTCTCCGGGATTTAATATGAATTATAAT
CTTGAATACAAATGCATACTTTCGATTTATTATTAATGGTACATTGATAT
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TTGCCCAGGGCCTCAAATGAACACGGAGGTTTGTTTTTTTTTTAAAGTTT
CGTCAAAATTTTCTTTGCCATTTTTTAAATTTCATAAACACTTTGAATTT
ATTTTTTTTAACATTTGGCTGTATAGGTATTTTTTTAAGGAAAAAGGTCA
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TCATCTTAAGACAAATAAATTGCAGCTTGTACAATTTTCAAGTTGTACAA
ACATTGCAGCTTGTATACAACATATTTAAAGTAATTTTTAATACAGGTTT
TTAATCCAAATCTAATTTCCCCCCCAAGAACACACAAACTTCCATTGGTT
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AGTTTTGATACTGTTGCATTTCTACATTCATAAGTTAAAAAAAATACAGG
GGAGAATTAATTGTATCTTTTGTATTGTATTTGACAACTATTATTCAATT
TGTTTTGAAGGATTTGCAAGTCATTTCCTTGATACGTTACCTCGTCGATA
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TATAAAAGAACATAGTGGGTTTTTATGGTTACATATTTGATATTTCTTTT
TATGTTAAAAACACAGTTATGGATAAATTTATTTTAATAGCTGTACTTTT
GTGTTTATAAATACTTACTTTAGATTTTTAAAAGTGAGTATTTAAGATTC
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ATGTATCTATATTAAAAAAGAAAAGTACATCTGTATGTATGAATTTTGAT
ACTACGTACAATCATTTTTTAACTAAGAAATGACGATAGTAGTCATATTA
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AAAAAAGAAAGTATTTATGTATAGATGTATAAATTTTGCAGGCGTTTACG
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AAAGGGTGGTAAATTACGATTATATAAAATAATGAATATGACTTTAAATG
AGGTTTATCAATGAGCAAATGTAGCTAAAGCTCAGCCAGGGATCACTTTC
GTCTCTAGATTCAAGTACTCCTTCCCTCATTACGTCATATTGAAACAAAT
TCTCAAGCTATTAATATTATTTTATTATTGGGGAGCCAAATTCCAAGTAT
TGAGTAACTACATGCGAGTATTCTCGTAAAAAAACTGGGTGTAATACGGA
GGATTTCTTGGGGAGTTAACTTCTATATTATTGCAGAAAAGTTTGTCTGT
TCGTAGTCTCATAATAACTCCGGATAATACTGAGTTCTCCTGTTAGTAAT
TGAATATAGATTCCCCATATATTAAGGGTGTATAAAGAAAAAAAAAAAAG
AGTATAATGTATGGGGAGCACTTTATAAAAGGAATGAAACTCGCGGACAT
GTAGTTCCACTCATATTAAAAAAGAAAAACAAGTAAGTACTTCATATAAA
ATTTAAAAAATATATATTACTGGATGAGGCTTAACAACAAACTAAAGTGG
CTGTTCAAAAAAAATTATCTAGCTATTATTATTTTTTTTTTCTGGAGGAG
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AATAAAAAAAACTCTAAAAAACTCTCGCAKCCGCCAGTAATTAAATAACC
CGAATTGCAACTTGTACAATTTATTGATATAGGTTACAACTTGTGCATGG
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CTTTTTTTGACCAAACTAAGGCTATTTTTTAATTAGTGGAATATTTAATT
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ATCGGAGTAATTCTAGCAAATGTCCTTGTTTATATCCTTTTTCCTTCCTC
TCGTGACAGCTAATTGTAACTGATCTAAAAAAACGTCACGAGCATTATTC
TTTCAAAACATTCTTCAAATTGTCAGGGTTACCATGTTGATTTTCGGTTT
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AATTTGTGAATGATACCTACACAAGTATACCCTAGTTTAAAAAAATCAAA
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AATGTGTATAAATAGCACACGGCTGTTAAGAAGTGAGATGATGTCAGAGC
ACAATAACATATGTACACTCAATGCATTATCTTCTTCTGCAGACAATCCC
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AATGAGTGCACACGTTAGCAGGAATGATCGATGTTTATTGTCGCTATTAG
AATCATTATAATTATTCAATAAAAATAAAAAGATGTGTAAAACTCTTGTT
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ATGATTTCCGGGGGAGTGGGGGAGCAGCCATTTGGAAATTTGAGGGTTTT
TTTTCTTTCCTCACTGTCTCTTCAACAGTCTCCGAAGTCACGTCTCCTCC
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TATCCTATTCCACTTTTAACAATTTTTTCCTCTCTTTTCTCTCTAGCAAT
GTCAATAGTTCCCCAAGTCCTCTTTCCTCTGAGTATCACAGTGCTCATGA
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ACGACAACCACCAAGCAACTTTAAGGATATGATGCCTCTCATGAAATCCG
GTGTGAAGCGAAAAGAAGATGTGGATCACGTGTTCCTTCGATTTGGAAAA
AGAGGCTGA back to top
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