EMLSAT00000003897, EMLSAT00000003897-699744 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003897
Unique NameEMLSAT00000003897-699744
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s210supercontigLSalAtl2s210:524762..546864 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003897 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003897EMLSAG00000003897-686663Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000016928EMLSAE00000016928-725856Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016929EMLSAE00000016929-725857Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto778374auto778374Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003897EMLSAP00000003897Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003897

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TITIPIYATLCSAMCYEPDPEKIIKIHRCPYPGYRRHDPHLNLLF
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mRNA from alignment at LSalAtl2s210:524762..546864-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003897-699744 ID=EMLSAT00000003897-699744|Name=EMLSAT00000003897|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22103bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s210:524762..546864- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATCTATCATCGTCCATAATATTATGTTTCCTATCCTCATTCCTTTT TCTAACCCTTGTCAAATCCCAACGAAATCAAAGGGATCAGAGAACCATTG CAAAGTCCATCATCAACTACTTAGGAACGAATTATCTTCTTCCTGACGGA TGTCCTGAKCCAGCCTGTAACCGGAACTCAGAGGACTGCAAAAGAACTGT GGACATGGTTCGTGCCCTTTATTCCCACTGTCTGCAATCACAAGATGGGC AACACATTGGATGCATCACGGATCGGTAATTATAATATTTGCTTTACTTT TTTTGAAAGCGTGTTTTTAACGTATGAAAAAACTTTATTTTTAAATTGAA ATCCCTTTTAACTTTGAATCTATCATCATTATAAGTGAATAAAACGATTC AAGTGACTCTCTAAGAAGACCTTTGACCTTAAATAAAAACCTTGACCAAA TGGTCCGTCCTAAATAATTAAATATGCATTGACGTTATTATCAGAGTTTG GGATTCGGATTCGATTCTTTCTTACATCTTGTTAAACTGAGCCAATAGGG TCGGTTTTAGAGGGGAGAGGGCAAAGGAGGACGGTTGATGGCTCCCAACA TGTAGCAATGGGGAAATTTTGGCCACCTTCCCTTTCGAAAAGGGTGGGTG GATCCTGTTAGAGGGGAGTTTTTTTCTGGTGCTGTAAATTTGAGTTTATT TTCATAATTAATTTAAAATATATACGTTGCGTAAAAGTAGCAACTCAAAA AAATGAGATAAATAACTATAAAATCAAGGATTTGCAGTACTTGAGATGAG GATAATGCTATAATTGAATATTTCATGGATGATCGATAAATTAATGGTGT AACTACTCACTATTTTAATTCAAATTACTAAAATATATGTATATATTATG TGGCACATTGTAAAGTTCAAATTCCCACAGTTATATTACTCATAAATACA 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