EMLSAT00000003919, EMLSAT00000003919-699766 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003919
Unique NameEMLSAT00000003919-699766
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s211supercontigLSalAtl2s211:1196677..1209403 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003919 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003919EMLSAG00000003919-686685Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000016996EMLSAE00000016996-725924Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000016997EMLSAE00000016997-725925Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780520auto780520Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003919EMLSAP00000003919Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003919

>EMLSAP00000003919 ID=EMLSAP00000003919|Name=EMLSAP00000003919|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=61bp
MQHFFITGLFLSVLPSGSLGMDYQTAPKDIAAVVSIAVLFHTLRHGRNFP
ATPTWDVRALN
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mRNA from alignment at LSalAtl2s211:1196677..1209403+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003919-699766 ID=EMLSAT00000003919-699766|Name=EMLSAT00000003919|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12727bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s211:1196677..1209403+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATAAAGAAAATAAGAAAGAGAAAGAGTGTGAGATTGGAGACTCTGTACTC AGTCGAGTACTTCATGTCTTGTCCACTGTATCAATTATACATAATTGTTG TGTGTAACTAATAAATCTATATATTTATATGAATCGTTAGTTTGAGTAAT CTAATTGTTTATAGAGACTCATAAAATGACCGATTAAAGCTCCTCTTTTA AGAGACGAACACGAAACAATAAGAATTAATCCATTTTATAAAGTTTATTA CATAATTAGTGATTATCTACAATAATTAACAAGGATGCAACATTTCTTCA TAACGGGTCTATTCCTCTCCGTCCTTCCCTCTGGATCTCTTGGGATGGAC TATCAAGTAAGTAATTTTCTTACACAATTACACCCCTTGGGTTTTATTCA CGTGCATTCGGGATTTAGTAGAAGAGTTCACAAAAATGATTTTGTCTTCT TGATTTTCAAGCAATAGATGATTTTTATTTGATGTCGGTCATTTTGGAGG CCTGCACAACGTATAAAACCTTTTATTTCATAAAGGAAAATAGGGAACTA TTGGATGTCAAAATGGGACAAAGAAATAAAAGGTCTTAAACCTTTACCCT CTATCAAAAATATATACCTCTATAGAGTATTTTCACGTTACGTCAGGATT GTTATTGTTGGCCATTTTGCAGTCCCAAACGAACAAGATTTATAGCAATC AAACCACTTTTTTCATTCATATTAAAGATACTAATGAACTACTTTAACCT TTACCCACTATCAGTTATATATATCCATATAGTATTTTTAACTGACGTCA GCATAGCTGATCTCACCCATTTTGGGGGCTTAAATAACTAAGTTTTATAA CTATAAAACCTATTTTTCTATGAATATGAAGAAAAACAGTAAACTATTTG ATATCAAAATGGGACCAACAATTAGAAGGTCTCTCTATCAAAAGTCTATT 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ATAAACCGTTGATATGGAGCATAAGAGATTCTGTAGGGGGTTCTTGAAGG GTCAATGGTTGTTTTTATCCTGTCTCCAGATCTTACGGTTATCTTACACA AATCCTGTGTGTTTGGAGTGCAATTTGGGAAATTAGAAGGATTATTTGGG CCCATGTGCATATGGGATAAATATCAACGGATCCTAAAATGGTAACTGAC CCAATTATAGACGGAACAGATGAATGACTATAAATGCAGTATAATTGTGG GCAATATCAATTAAATATTGCCCTTAGGAAATTGTATGAAATTTTAATAT ACCGGATGGTCTATTCAAATCTTAACACTTACAAATTCAATAGCTAATGA AGGTTGAGTGATTGAAATTAATTCATATTTCGTATATTCATATTAATAAT TATATTTCATATTAAAGCACAAATAATGACTTACAAGGAAAAACAAACCT TAGCTCTCTAGCTTACTTACAAGTGGATAAAATGCCACTTGAACTTGAAT TTCCATTCACGCGCTCCAAGGACTACCGTCTACACTCTCAGCAAGTCTGA GACATTTGAGAGGAAGAAGGTTTCTTTCAAAAAAGCCAAACTGGACCTGG AGGGCTTGAAGAAACAGCCCATGCCAATCTCCTCAAGTCCATGAGGGCCT ATGCAAGATATCTCGGGGTTTCATACCAGAATGTACACAGAGCTGTCAAA AAAGAGGGTGGAAAGAACCTTTTGAGAATAAAGAGGCCACTTTTGACACC AGCACTGAAAGAAACTCATGTCCTCCGCTGCAAGACTCTTTTGAATGAGT CTTTAGAACTCTTTTTTGACACTTTTTGCCCCTAACATCCCTTATGCCCA CCCCCTCGACTACACCTTTTGGATGCATTTAGAAAAGAAGGCCTGCAGTG TCCATTATCCAAAAACCGAGGACTGCAAAGCCATTGTCGGCCAGTACTGG GACGCCATGACAGAGGACTACATTTGCAGAGGGKGCTAGACATCCAGCCG CCATCTGAGAGCAATCATGGGTGTATAAGGGTGGCTACATTAATGTTTAA TAAAGCTCAGACACACATCTATTTATATTTTTAACATCTGCTTCAAGAAC CAGAAAGGAACCCTCCTAATTTCCAAATACTTTTAYCAAAGATAACTTCG WTAGCCGCAATCTACGTATAACGGTTCAAGGGTTATTTTATTGTTTATCT ACTTTACATGTCATATGTTATGTATCTCTCTAGAGTTAGGTCATTAGACA TACGAATGTATTTTCAAAAAAATACCATTACTCCTTGTTTTATTTTTATG ACCCACCATGAGTTGATTTATTAAGTCTAAACTTGTTTATTGCAGGCATG TATTGATGATTCAGATTGTGTAGATTTGGGACACAAATATGCGTGTTTTA TGTACATGTGCTATCCTTGGAAGGAACCAGACTCAGAGGAACATCCCACA TGTACCTCGGATTGGGACTGTTGGCTCAACACTGGGAAGTGCTTTCGACA TCATAGGTAAATACATGTACAGATTAATACACACAAAAAAAACTTTGGAC AAAAATCAAGAAAATGAAAAAATCCCAATATATTTTTTATTTCATATATA CATACAACCCACTATTTCAGTCCCTTCGAGGGTTGAGGGGCAAATTGCCG TAACTCAAAATTCAAAAATATGAGTTTTATTGTCTATATGCCACTCTAGA ATTCTAACATTTAATGTTAGCTAGGTGATTAAGAAATTAGAATTAATTCT AAACTCTTCTGCATATTTATAAAACAAAAAATAAAGACCAAGAATGATTC TTGCTGCATGTCGATATGTATCTTTGCAACACTTTTTTTAAAAGGAGACT ATATAGGAATGCTATAAAGAAAACGAAAATCGATATGGTAACCCTGACAA 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