EMLSAT00000003989, EMLSAT00000003989-699836 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003989
Unique NameEMLSAT00000003989-699836
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s213supercontigLSalAtl2s213:360781..384037 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003989 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003989EMLSAG00000003989-686755Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000017309EMLSAE00000017309-726237Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000017310EMLSAE00000017310-726238Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000017311EMLSAE00000017311-726239Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000017312EMLSAE00000017312-726240Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000017313EMLSAE00000017313-726241Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776855auto776855Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003989EMLSAP00000003989Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003989

>EMLSAP00000003989 ID=EMLSAP00000003989|Name=EMLSAP00000003989|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=720bp
MRVKKRYFLLVSFCAFLLASYWGRHRLKTGVSWKTSGRSIYDDFKLIKDY
PEHPLMATLSEDCRMETCFNFTRCSVDFKVYVYPDTHSSSNPSQAYLKIL
HVLRSSSYFTSDPEKACLFVLSIDTLDRDPLSLTDFVRNMPARFANLPYW
NGGLNHVIFNLYSGTYPDYAEDLNFDAGKAILAKASIANLNYRPGFDVSL
PLFHKFHPEKGGEEGTLKSHNFPINKKHFLAFKGKRYVYGIGSETRNSLH
HLHNGNELVLVTTCRHGKNWKELKDERCDEDNREFDRWDYDSLLLNSTFC
LVPRGRRLGSFRFLETLQAGCVPVVLSNDWILPFSEIIDWSTAVVMAXER
LLLQVPEILRSIPQGRIFSMRKQTQILWNQYLKSVENIVTTTLEIINSRI
SRFRASRESHVWNSSPGGLVTLPSYSDVLNSFPFFESSLAIKKFTKFTAV
IFVPNSFNLTHIYYNSSFLHSSPLYKLIKRIVILWMSANNASSSIPSISS
MSSRRQIPIHHVPVKDVSNRFMPLDLIETEAVLSLDDDSLLTTEEIDFAF
GVWKNFPDRIVGYPGRSHYWDHIKKSWVYTSKWLNEISMVLTGSAFYHRY
YHTLYYKASPPGTKELVNKLKNCEDILMNFLVSSITKKSPIKVTQRKQFK
YAKRDSSFTSKNECFNQRQECINHFASKFGYMPLKKSSVRFDPLLFKDHV
SSSRKKYRRIDLIPISSGAL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s213:360781..384037+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003989-699836 ID=EMLSAT00000003989-699836|Name=EMLSAT00000003989|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23257bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s213:360781..384037+ (Lepeophtheirus salmonis)
GAATGAATTGTGAAGTAAGTAGCCTGTAGAAGAAGCAAAGAAAGAAAAGG AAAGAGGTGACTGAATGGGAAAAAAGAGGAGGAGAACTGAGTTGAGAAGC GAGCTAGAGAAAGAGAAGGCCGGGAATTAAGAAGGAAGAAGAGTTGGAAG ACAACTCTAATGTTAAATATACCCCAATGTTTTGTGTTACTATAGTATGT TTGAGTGTGTTGTTTTACTTTTAGACTTTAGTGTTGTTGTCTACTTCTCA CTCTTCGTTTCTCGCTTTCTTTGGTGGTACAACAGTGTCCTAACTGTCAG AGATCCAAAGTGTCCTCACCTGCTAGTCTTCATTCAGAATCTATAACAAA TGCGACTTAAAATGGGTCATGCGGGTTAAGAAACGCTATTTTTTGTTGGT TTCTTTCTGCGCCTTTCTCTTGGCCTCCTACTGGGGTCGACATCGTTTAA AGACGGGAGTGTCTTGGAAGACTTCAGGGAGATCCATCTATGATGACTTT AAGTTGATAAAGGATTATCCTGAGCATCCTCTGATGGCCACTCTGTCAGA AGACTGTCGAATGGAAACCTGTTTTAATTTTACGCGTTGTTCAGTTGATT TTAAAGTCTATGTCTATCCGGATACCCATTCCTCTTCAAACCCCTCTCAA GCATACCTCAAAATATTACATGTACTTCGATCCTCCTCTTATTTCACGTC AGATCCAGAGAAGGCATGTCTTTTTGTTCTCTCTATAGATACATTAGATC GAGATCCACTCTCCCTTACGGACTTTGTTCGTAACATGCCAGCACGTTTT GCTAATTTACCCTACTGGAATGGAGGACTTAATCATGTGATTTTTAATTT GTATTCTGGAACATATCCTGACTACGCGGAAGATCTCAATTTCGACGCTG GCAAGGCTATTTTAGCTAAAGCATCTATTGCTAATCTAAATTACCGCCCT GGGTTCGATGTGTCACTCCCACTTTTTCACAAATTCCACCCTGAAAAGGG AGGGGAAGAAGGAACTCTCAAGTCTCATAATTTTCCTATCAACAAAAAAC ACTTTTTGGCCTTCAAAGGGAAAAGATATGTGTACGGCATTGGATCCGAA ACACGGAATTCCCTCCATCACTTACACAATGGCAACGAACTTGTTCTCGT TACAACCTGTCGCCATGGTAAGAATTGGAAAGAATTAAAGGACGAAAGAT GCGATGAGGACAATCGAGAATTTGATCGGTAAGACTCCTACATACTTTTT TGTAATTCATGGATGAAGACTAGAATAAATGTTAAGTAGATTCATATTGC ATATATTATTCATATGTGTCTTAAAATATGTTAATCTGCCGTTCCTTATA AATAGGTAGTAGAATACATATGAAGATATAATCAATATTTAAGACTTTGA TCAAATGTATCTACCTCAAAAATAGACTTCAAACTCTTTAGACGAGATTA TATACATATACAAATTAAGAGGCACACAGGAATAGGGATGTAACAATTGT CGAAATCCTTGTGTTGTGTCGATCTTTCTTTAGGACTGCAGTCCCGTCCA GTACAATCCYCCAAAWCAGTTCCAAACTTATAAAGTTTGGTCCTTGATGA CATCMCYCAACTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTCAGTTCTAGTACTGTCTT AAGTCTTAAGGACTGGTCACTGGGACATATATGTTAGTAATCTGCATGAC ATTAGTGCTCTTATGAATTATTTCTTCCTATTTTCAACATTCTGACGTAT TAGCGAGCAAGGACAACTATAGTTTATTTAGTAGTCTTTTTCCGTTGATA GGTCGTCCATCAAAGTTGCCAACATTTAATTATCTGTTTGATTTATACTC ACGAAGATTTAGACAATTACCACATCTCTACACTTGAGTAATAGTAAAAT TACTTTTAGAAAAAAAATTACGCTCATTAATTTTTCTGGTTTATATATGT AGATCTATTTACATCTATCCAGATATAATAGTCATACAGTATGTAATATT TTGTCCTTGGCTACACTTGTGTGTCAACATAAATACAATCTTGAACAAAA ATCAAGAAAATGGGAAAATCCAACTTAATTTTTTTAATTCATATATTTCG TAGTCGTATTTCAGTCAATTATAGGCTTATTACTCACATTTGTGAGATGA GTTAATATACTCACGAATTTAGGCTATCATTTATAACTTTAATTTAATTT AAGATATGGCCTTTTAATTAAAATACGTCAATTTTTCATTCTTTTATTGT GACAATCAATTTTGGATACATTAAATGCAATTTGCCACACACCCAAAGGA TTAGTCAGAATAATTTGTTCATATAAATTAACGATAATTCGTTGAAGAAT ACAAATGTTATTCACATTCAATTTTGAAAAAATAAAATCCTTATAGGTTG CTTTTGTGTTGACAAATAACACTTGATCAATATATTATATTAAGTAATTG ATGACACACTCTGAAAATACGTTTTGAATAATAATATTAATTAATACAGA CCATTTTTAAAAGTAGAGGGGTCAACATCTGTTATTTTAAAGATAATATT TTTTTTGTGCAATAGGTTGCGTGTCAACAGTACTCTTTTTACATCGCGGC CAGAACGTCCTATAATTTTTTATAAATTCATTAAATGTCCGTTTTTATCC AGGTGTAAAATGAGGACGGTTCGTCTCCCTTAGTTACTATACAATACCCC AAAAAAAAAAAATTAAAGAACATGATTCTCCCAATTCCGATCCCGATTCC ACAGAAGMCACCCGATTCTCCCATTTCTATGAATCGCCCCATTACTGTTA ATTAGTCAACAAGTGGTTTCTTGTGATCACTGTTTAACTTTTATCTGATT AAATGCGATACTTTTTTGTCAAAATAGAAGGAATTGTACATTTTCAAATA GTTCTTTAAAAGAAGAAGCCATTTTTTTATGTTAAGTTCAATTTCAAACA CTGTCTACTATTTAAATAAGTCAAGGAATATGTTAAGTGTCAAGGACTTA TTCAATCTTGTATTTTCTATTACCAACTTATATGAATAGTCTAGGATTAG TTTATTTTTATTCTTCAGGAACTATATACATAATGCATAGTTGTATAAAA TATGACCTGTGGGTACGTAAATGATAAGAAACCGAAACTTAACGGAGTAA CTCTGATGGATTGAATTATGTTTGGGAGGAGAGCAGCTTAGATGTCTTAA TACTTTATTAGAWAAGCAACAAMCCGCCGTGAGACAGAGGTAATAAAGAC TAATCACACTCCGTATATTGCAAGGGCATAGGCAGGAATTATGTCTATGG TGGKGATCCTCAATTCTACTCTGTGTCTCACGATAATTTACTAACAATAC TAATTTGAAGTATTTTTGGGGAAAAAGCCGAAAATCTATGGCAATTTGAA AAATGTTTTTGAGGAGAACAGCTGTCATGATGTTTGATTATATCAGCTGC AATCAGCTGTGAGGAGGAGAGAGAGGGGAAAGGAAATAAACAAGGACATT GGCAAGAATCACTCCGATATCAATCCTCAATTCTACACTGGCTCTAAAAA TGACTAACAATTATAACTTTGCAACGAATCCTCAAGGCTACTCTACGTCT TATATGAGCACACACGAATTTTTAATCAGGTTTAGAATGTAGTAGAAAAA TAAATTGTTCACTCGTAAACGAGTGAGTGTTTGGTAGGGTAGGATTTTTA TATATATATATACATTTATCTATGACAGCACTGGGTTGTGATTGGAGGAA CATTAAAAGGTATTCTCTTAACTTCTTTTGCATTAGCGAGTATATTTATC AATGTGCAATTTGACTTCCGTGTGATAAGAATAGAATATAATTTATCTAA AGAAAATATTATAGTACACATACTATTAATTAATCAACGTTCTGCCCAAA CAGTAAAGAAGGGAAGTAGAGAAGTCGAAGGTGCTCTAACAAAGATAATA ATTACAACAGCTTAGGAAATTCTTTCATCGATTTGCCAACTCAAAAAAAA AACAAAAAAAACGTGCGACCTAAAAAATATACCTGATTTTCATGACTAGG ACTTACATTTTATAACTCCTCAACCAATCATCAGTGTTACTCTCCGTCTT TCATGAGCACATGCACTACTATTGATTACTTTATACTAAATGTTCTCTCT TCAAGAATTAAAGAATAATTATAGGTAAATACTCAATTACTGATAGCAAT CATAATACCGTCAAATAATAATAAATGCTTAATGTACATAGATAAAATAA CCCTATGTGGAAGTGAGGTACACTTGAGTTTTTAACGGATTCCTATATAA ATATAAGAACATTCTAGAAGCGAGAATCAAGATTGGAGTGAGATGTGTAT TTATTTCCTTCCTTTCAACTAAGCTCCTCTTATCCCAAACATTTTTCAAA TTGTCTGGGTCACTACGTTAATTTTCGTTTCTTTTATTTTTACAACCAAC CAGGTAAAATTTTATATCTTAACTACAATCCTATACTAAACTTAATTAAT TATTGATATAATATTGAAAAAGAAAGAAATAATTATTTTAAAAAGATTCA TGATTGATTACATTTTAAACTATCAGTACTTCTTCATTGCAAGTTAATTT CATTATTTAAAAAAAATTATTCCAATCTGGAATATTTTTATACGAATTTT TATAGTAAAGTTGCCCACTTTACTTGTATGAATAAGATCTAGGTAGGGGA TTCTACATTCTGTGTAAAAAAATTTTGACGTCGTTGATATTATCTTTCTC 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TGCTGCCCTCATTTGTTCGCAGAGTGTGCAAGAGAGTAGCGGTCTCGATC TGTTTTACCAAAAAATTTGTAGTCTTTGTTAATCAGTGCCGATTTCTTAT TTTTTGAAAGTTGTAACTTATATAAAAGTAAAGAGACGTCATGTATATGT ATCTAGAATATTTTTTCTTATCTCTAATTCTGATTTGTCTGAATTCTGTA TAAATGCATTTTCATCTCTTCCGCAGTTCATTGTTATATCACGTATTTTA ACTAAGATTCATCTAATGTAATTTCATTGAAGTTAACGTTTTGGACAGGG TAAAGTATTTTTCTTTAGAATAAACCACTAACATAAATTATTAATTGAAA ACTTAGTTTGAATCATAATTATGGTCTAAAAAGTTATAAAAATTATTTTG AAGCAAAAATACATAACCCTAATCATCAACGTAGGGGGTTAATATTTTAT ATTTTTTTGATCGAGGTTCCGTGAATTCCGAACATAATTCATATATGTAT ATAGTTTTTGTTTACTCTTTATTTCAGCCATCTTGTCTCCTCTTTCCTTC TTAATCTCTTTAATACTAAGTACTCAAATTCATAATTATTAACCGATTCC ACAATATGCTTAAGTTGTGTATGTCCAAGAACTTTCTGTCAAGCGGTCTA AAGTCAAAATTTCATAATATCCCTTAAATCGAGGCTCTACTGTGCATAAA TTTCACAGTATTTATTATTAACTTAGGGGATACGGAATTTTTGTGGTATC CCGAAAAATGAGAGACCCCAGTATATCCACTTTTTAGAAGTATGAATCAT TTATCATTTACGTTTAAAAAAGATATCATTCATATTAATGAGGCTCTTGG ATTTTATAACTATGATAATCATGGGATATCCATCATATTATATAATACAA ATCTAAATCTCATTTATGATATTTTGTTATATCTTTGAAATTTTAATTAT 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