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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s213 | supercontig | LSalAtl2s213:360781..384037 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003989 >EMLSAP00000003989 ID=EMLSAP00000003989|Name=EMLSAP00000003989|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=720bp
MRVKKRYFLLVSFCAFLLASYWGRHRLKTGVSWKTSGRSIYDDFKLIKDY PEHPLMATLSEDCRMETCFNFTRCSVDFKVYVYPDTHSSSNPSQAYLKIL HVLRSSSYFTSDPEKACLFVLSIDTLDRDPLSLTDFVRNMPARFANLPYW NGGLNHVIFNLYSGTYPDYAEDLNFDAGKAILAKASIANLNYRPGFDVSL PLFHKFHPEKGGEEGTLKSHNFPINKKHFLAFKGKRYVYGIGSETRNSLH HLHNGNELVLVTTCRHGKNWKELKDERCDEDNREFDRWDYDSLLLNSTFC LVPRGRRLGSFRFLETLQAGCVPVVLSNDWILPFSEIIDWSTAVVMAXER LLLQVPEILRSIPQGRIFSMRKQTQILWNQYLKSVENIVTTTLEIINSRI SRFRASRESHVWNSSPGGLVTLPSYSDVLNSFPFFESSLAIKKFTKFTAV IFVPNSFNLTHIYYNSSFLHSSPLYKLIKRIVILWMSANNASSSIPSISS MSSRRQIPIHHVPVKDVSNRFMPLDLIETEAVLSLDDDSLLTTEEIDFAF GVWKNFPDRIVGYPGRSHYWDHIKKSWVYTSKWLNEISMVLTGSAFYHRY YHTLYYKASPPGTKELVNKLKNCEDILMNFLVSSITKKSPIKVTQRKQFK YAKRDSSFTSKNECFNQRQECINHFASKFGYMPLKKSSVRFDPLLFKDHV SSSRKKYRRIDLIPISSGAL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s213:360781..384037+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003989-699836 ID=EMLSAT00000003989-699836|Name=EMLSAT00000003989|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23257bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s213:360781..384037+ (Lepeophtheirus salmonis) GAATGAATTGTGAAGTAAGTAGCCTGTAGAAGAAGCAAAGAAAGAAAAGG
AAAGAGGTGACTGAATGGGAAAAAAGAGGAGGAGAACTGAGTTGAGAAGC
GAGCTAGAGAAAGAGAAGGCCGGGAATTAAGAAGGAAGAAGAGTTGGAAG
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CTCTTCGTTTCTCGCTTTCTTTGGTGGTACAACAGTGTCCTAACTGTCAG
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AAGTTGATAAAGGATTATCCTGAGCATCCTCTGATGGCCACTCTGTCAGA
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TACTTTATTAGAWAAGCAACAAMCCGCCGTGAGACAGAGGTAATAAAGAC
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AAATGTTTTTGAGGAGAACAGCTGTCATGATGTTTGATTATATCAGCTGC
AATCAGCTGTGAGGAGGAGAGAGAGGGGAAAGGAAATAAACAAGGACATT
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AACAAAAAAAACGTGCGACCTAAAAAATATACCTGATTTTCATGACTAGG
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CATTATTTAAAAAAAATTATTCCAATCTGGAATATTTTTATACGAATTTT
TATAGTAAAGTTGCCCACTTTACTTGTATGAATAAGATCTAGGTAGGGGA
TTCTACATTCTGTGTAAAAAAATTTTGACGTCGTTGATATTATCTTTCTC
TATTCCCATTCTGTTTAAAATGTGTATCTTATTCACAAGCAAGAGGAATT
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TTATTGTTAATATTATAAGCGAATTACCTATTTGGGTGTGTATATTTTTG
TTTAGAGTAACATTTTGATATGTTTCAAAAGATAAATAAAAGTTTTGATA
ATTTAGTCATTAAACAGAGGTACATAGTGACACTTTACAGCCTTCGGCAA
TTGTTTAAGGTAGGACGTTTTTTGTTGTTTTGACGGCTAGCCAGAAGTGT
TTGGTATAAGTTTTAAGAAAACGGCATCGATCAACGAAAGTATTTATTCC
AATATCGTAAAAAAATGTAGTGTTGCAAATTTTGTGTAGGTTATTTCTTA
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CCTTTCAGTCTTTTTATTTTTTATTTGTCAATCTTTTTTACCATTCAACG
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TTTTATTTTCTTTAGTCCCAGCTTGGATTGCATAATATAAAACAAAGAAA
ATACGGAATGATAGCTAGAATCTATATTAAGAAGTTCTACCCACACACTT
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TGATTAAGTATAAGTAAACATTATAGTATTACATTTACTCCATTTGACCT
AGGAATCTTCTTTGAAGTTAATCTAAATAAAATACATTTCCATCTCTAGG
AACGACCGGGGCGCGAACCTACCAACAATGAGTTCAAGAGAATAATTTCT
CCCCAGATAAAAATTTTCACATGTTAATCTTTCTTTTTGCTCCGTTTGGT
AGCTTTAGAAAAAAAACTTTTACGTATGTTTTAAAAAAAAATTATTATTA
TCATTATTAATTAATGAATAAATAATGATTAATCCTGTATTTTAATCTTA
ATTCTTGAAATAAATAATTTCAAATTTTGAACTAGATGTACTCCCTAAGA
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TCGTAATCGAATTTCGAAAAACAGTTGAGAAATAAACCACCTTAGTGTGC
AACCTGCTCCCCTTGCTCTCTAAAATGAATAAAATATAGTGTTATTAATT
GTAGTAAATAACATTAAATTGTAAGAATACGTGACCTTCCATTTCAAGAG
TGTCGTGACTATTGGTCCTTTGGGGAAAGGACACACACCATTGATTTAAT
TTNGTTTTTATTATAGTGACTATTGATAAATGATTACTCTGAACAAAAAT
AAGCATTGTTATATCTTTGTAYATTACTAATACATTAATGTATGTTCTTG
GAGTTATCTCTCGGGATATTGTTTTCTCTGAGTTTTACACCTAGGGGCTA
CATTATTTAAGTTTGCCCGCAGGTAATACTTTATTTTTCTATCTTGAAGT
TAGARACAGCCATAGCGGAAGGKTGAAATGTAATTATTGCAACTTCCTAA
TTATAAAAAAGTAACTTGGCGTAGAACAGTGTCGGCGTCTGAGTCACGTG
TCAGCCGTGATGCTTTGTTTTGATTTTTCACTATCTTCTGTGCGTGCAAC
CTTACACGTCAAATGAATGGGTATATAAGTATTATTGTATTAAGTAGTTA
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TGCTTACGCAAAATTTAGCCTGCATTTTTTCATCCTTTTTTTTTCCTTTT
TTTAATAATATTATCCTGATTTAGTAACTTTTTAATTTAAGAGAGAAAAA
AAAATATATAGTGAAGTGCAATAATAATAAAAAAGGAAGCGTGTGTCACC
ACTTACCTGAACCCATCTTTACACTAAGGATTTTTTGATGAGTTATCCTC
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GTAATGCCGGGTACTACCGGTTGTATTTATTAGTAACATAAAAATCCCTT
AAATCGAATTCGAATGGAAAATCCATTGATTTGATACTTTACTCGTATAC
TGGTTTGATAGAAAGTTCTCAGACAATTTTTAAAATTAAACTAACATTGT
CCTTAGTGTTTAAATATACATATTTATTGAAACAAACTTATTGATTAACA
CATCATCTTCCTTTTTATCAATCAAATCTGCCGCCTTTGGCGGAATTACC
TTCTCTAAAGGTGCTGCACGCCGTTCTCACTTAGTTAGAAAGCATTATTG
ACTTCCACGCCTTCTCAATGTTCGGCCTCAGCTCCGCTAAAAATATGTGT
AGATTTTTTGAGGACTTATCCTTCAATTTGCGCTTAAACTGGGTAGTCCA
TGGGGTTCAGGTCTTGGGAGGGGGGGCTACATCTCCTATGACCAGAATCC
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GGCCGGGAGGCCGCCCTGCTGGAAGACTGTGGGGGGGGGGGGGTCYCCTA
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TTACCACAAAGGCGGKAACCCGTGGTCGACCACTTCTAGGTTTGTTGTCT
AGTCCCTCCCCTCACTCGACACTCCCTTTAACAAGGTAGACTTTGCTTCT
TGCTGCCCTCATTTGTTCGCAGAGTGTGCAAGAGAGTAGCGGTCTCGATC
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TTTTTGAAAGTTGTAACTTATATAAAAGTAAAGAGACGTCATGTATATGT
ATCTAGAATATTTTTTCTTATCTCTAATTCTGATTTGTCTGAATTCTGTA
TAAATGCATTTTCATCTCTTCCGCAGTTCATTGTTATATCACGTATTTTA
ACTAAGATTCATCTAATGTAATTTCATTGAAGTTAACGTTTTGGACAGGG
TAAAGTATTTTTCTTTAGAATAAACCACTAACATAAATTATTAATTGAAA
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AAGCAAAAATACATAACCCTAATCATCAACGTAGGGGGTTAATATTTTAT
ATTTTTTTGATCGAGGTTCCGTGAATTCCGAACATAATTCATATATGTAT
ATAGTTTTTGTTTACTCTTTATTTCAGCCATCTTGTCTCCTCTTTCCTTC
TTAATCTCTTTAATACTAAGTACTCAAATTCATAATTATTAACCGATTCC
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AAGTCAAAATTTCATAATATCCCTTAAATCGAGGCTCTACTGTGCATAAA
TTTCACAGTATTTATTATTAACTTAGGGGATACGGAATTTTTGTGGTATC
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TTATCATTTACGTTTAAAAAAGATATCATTCATATTAATGAGGCTCTTGG
ATTTTATAACTATGATAATCATGGGATATCCATCATATTATATAATACAA
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AGAGGTAGGGCTGGAAGGACTACAGCCCCTCCAACCCAAAATTATGGAAT
GTTTGCAATTTACTAGAAAATGTAATATTTAAAATTTAATTTTTCATTTT
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AGTACTTGTTGGGCCTATAAGTAGTAGGTTTTTTATTTTTTGGAGAATAG
TAGAATTAAACACTATCTTATTCATTGTTATGTTGTGGCTGGAGAAAAGA
CAGAGGKCCGAGTTGAGGGKAATTAAGTATATTTTAATCCAAGGATTTAG
GTCCTTACTCCTAGTTTGGGGATTTTTTTGTTATTTAGATCCTTTAATAT
TAGTTGGAAACTTATTAAAGTTAGGTTAATTTCTTTCCCATTTATGGAGC
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GTTGTGTCCATGGTGTCCAGATTGGTCTAAAAAAATGAATTCCGGCATAC
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GTCTTAGGACCGGTCCTAATCAGTCTTTTATGGTCGTTTCACCTGTTGAA
GTTTATCATAACCTCTTTCAAAGAGACTAAATATCCTATGTTTAAAGTTC
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AACAGCTGTAAATTTGTGAAATTTGTTTCCGAAAAATTCAATTGTTCAAT
TTTTTTTCCAAAAAAAAATAAATCATTTTCTATGAACAACTATGGATTTT
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TATTGGTTGCTAAATAGAGGTCGCACTCTCTATAATTTATTAAATTATAT
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TATCGTTTTACCTTCTTTTAAGGACTGGAAAGTGGCACTTGATTGAACCG
TGATTGTATATCAGGACCGGCTCAACACTATTTCTTGGCCATTTAGATCT
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ATACACCACACACTGATTCAAAATATTATCTACATACAACTACAACAATG
GTCGAATCTTTATCTTATAATAGTACTAATATTAATCAACTACTCAAATA
TATTTGATAAAGTATTAAGTTTGAATATATTGCTCATTAACATTTTTTTA
GTAAGTCTGATTTGTAATGGGTGTTGTTTTTTCTGTATTTATTATAATAT
TGATAAACTAGGACGTTCCCGTATTATAATTTTATTTCAAATTATTTTAT
TAATGCTTAAAATATCATCTGAAATGAGTAAAAGTTGTCAATTGACAACA
TTTGAAGTTTTTCCATCCCTTTGGTCATTATCATTAGAATAATTACAATG
TGTTCCTCCTTCAACCATAATGAAGAAACATACTAGAACTAACTTGCTAC
TCATTTTCTTCCTACATTTACTTTTGTAATTCGAATTCAATATACGTTTT
CTCTTTTTCTGTTAGTGCAATATTTTTATTTTTTGGTGCATTTTCGAATC
TACAGCCCATACCTGAAAAGAAACTTATTAGCGTAAAAATTAAGTCGGGC
TTGTGTACGTGAGCAGCTGTGCCCCGTGGTAAGTTAAATCTAYCCGCCGT
TGCTTCACTGTGCATCAAGGAACCCTTTGATATAAATGACAACGAAATTT
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TAATGATATTGATTCACAATTATATTACCCACAAGGTGTTTGTCTCCCAA
TGATAATGTACGCAACGTTATTACCCCATTGTTTTTGTCACCAACTATTT
TACCTTCAGTCATTTTATAGTGAACCCTTTAGGTATGTAACTCAGAATTC
TAAACAACTTTTATTTTATGTATTTATCTGTCTCCGTTTTGGAATAAAAC
CCTATGCGTTTATACCACTATAATATTATACATATTATAGTAGATAAGGC
ACTCTTCATTTACATGCATTTTATTTTAAAGCACACTTGCAATGAACGTC
AATAACAGAACTCAATTATACATTCATAATACATATTTATTGTTCAAGAC
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ACATCTGTTTAGAATAGAAATGAATGAAATTAATCCCTTCTATGCCTTAT
GCACTATTTGCTAATTATGTTATATTGTTCAAATGACCCCTTAAGTCTTA
ATAGATGTATGTACATTTAGTGGTAATATTTGGAGTTATTAGGCGTCAAC
AAACATAAATACTTGCTTTAAAAACACAAGGGAACATTCATTTTGCAAAA
TGCACTTGGAGTGCAGAATCCAAAACTGATCTCAGTCATCTAAATTCTAA
AATATCTGGAATTATATTAGTTTCGGGACTAATATCGTTCAGAGTCATTT
TTTACCCTTAAACGAGTCCACAAATTAAAATTAGGAGTAATTAAACTGTT
GTAAAAGGGTTTTTGTTTATTAAAAAGGTTTTTATTGTTTTTGTATCCTG
TTATGAAGTCGATATATTTGCATTTTTGGCTGAAAAATGATGAAAAACGA
AACTCATCATTTCAGACCCTTCTAACTAATTCATAATACATAGTGATCCA
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AAGATATATTTAAAAAATATGCATCTCCAAGAATTTTTCTTGTATTTGGT
ATTTATAAATTATGCCATTTTGAATTATTAAAATTATCTACTCATCGCTT
TATTGTTTCAATTCTCAAGTATCATTCCCAAGGAAGGAGTCCCCTCTACC
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CCTTGCGGAATTCGGAATTCGAAGACGAATATCTTTTGAGGTGGATGATC
AAGTTATAAGTATCTCCCTTTATTCCTCCATCTTCCTTCTACGAGGTATG
ACGTCATGAACTTGGCATAGAAATCGGAAAAAATATGATTATAATGTTGA
CTATTAGCTAGTACACCCCTAGCTAGAACAAAAATCCTTGAAGATGCATA
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CATTTTTCAGCCTAAAAATGGAAATATATCGAGTTCAGAACCAGATACAA
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GTATTATTCCTACTTTTAATTTGGCGATTGTTTTAAGGGCAAAAAAATGA
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GAAACAGGGGGGAAAGGTACAACATATCAGATTGTAGTGAGTCAATTCCA
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GTTATTATAACAAGATTAGCCAGCAATGATGTTCAGTTCTTAATAAAAAT
GTATTCTAGCATAAGGGATGACTTTACTCAGACGCCCAAATACAGGAATA
TAAGGATGGAGAAGTTTTGAAAAACACTTTGAATGCAGCGTTGATAAGGA
AAAGAATAAGTGGAAAAACAAATATAAATGATTAATTTAGTAACTTTTTA
TATAATAGATGTGCCCAATGACGTCACCAGAAAGAGTGTTACTTCCGCGT
TTGCCCCTACGATTTTCTTGTTGTAATAACAATAATACAGCTGATATTTT
TGTGTTAGTGAGGTAGAGGCATGAGTGTTGTGTCAATCCTTATTTAGGAC
AGAAGACTGGAGTCATGCCTAGTTAATTTTCGGTCCAGTCCAGTTACGTC
CTACATCTCTTTCCTAAAAACTGATCAAGTTCGGTCCTTCATGAAGTCAC
TCTATTTTTGTTCTCCTTCTTTTCTAGTATCGACAGATAAGCAGCTTTTA
AAAGAGCTAATTCAAATTCAACCAATCAATGTACAAAACACTGATTAGGA
GAAAAGAAGTAGAAAAATACACAGCACACAACAAAATACACCGTATATTT
CTACGTTAGTGATGTAATGCCCTGAGAAACAAGCACCCATCATCTATTTA
TAAGTCAATTCCCAGAACTGCTACGTGAATGTTTGATTTTGAGCATTTCA
ATGAATGTGTCTGTTTTTTGCATTGGTGTTAATTTCTCACTCACTCGTAA
TAAATGTGTTTCTAATTTAATTTGTTTTAAGTATGTGTATTTTATGTTTT
TAAAGCAACATCAAAAGATAATGAATTTTTAGTATGTGTATGGCGTTATG
CATGCATATGATTGAGGCTCTATTCATTAGTGTTGAGACATCGTGGACCG
ATTTTTTTCCGTCTCAATCTATGGTYTATGCGGWTTTATGAGCTGTACAT
ATATGATTTATGCACACGACTGACTATCTTTTCTATCCACTCTCAATCTA
GACCGTCAAAAGGTAATATAAACATTTGTAAAAATATATAGCTTGCCTTC
TTCTATAATTTTTGTTTTGACAACTGTTAATTATTATTATTCAGAGAAAA
GTTATTAATTATTATACATACTGAATTGATGATCTTGTCAATGACTAAAT
ATGAAATGACAGAAATTCTAAAGGAATGCCCGTAACGGGTATAAATTAGT
ATAAAAATCAAAATCCTCAGTAGTACCTATTTTGAGTTCAAAACGTGTAG
AGTCTGTTCCTTTAAATCATACAAGAGTAAATTAATGGAAATAGCTTAAA
GGAAAATACAAAACATCTTTTTTAATTTCAAAAAGCCAGTCGTGGAAACA
CATTTAACTTCTTATTATGACGTTACTGTGCCAACGTTCACTATTTTGAA
ACACATATAATGTTATCAAGAATGTACATATAGAATCTGTTTAGATTGAA
TTTAAAATGAGTATAATTTTTTTAAAGACTGATTAAGTGCGAATTTTTAT
TCCAGACCGAACTTCAATAAAGGAACGAATTAGTTTTGTTCCACTAAAAA
TAATAACAGTCTTCGACCGGTCTAGGTTTTTCATAACGAAATGAATCTCG
AGTATTTAGTTCCAAGTGGACGCTCAATTATTTAAATGAACCATTTCAAA
TATCATTTAAAAAACTATCATGCACTATGGGATTTATTAGTACAAGTATA
AGGAAAAATAGACAGTGTTTACTCAACGCTCTTTAGCATCCTTATTTATC
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TTGTACAAATTAATATTTTAAAATAGTATACAGGGAGCGGGGATCAAATT
GTCGCCAAAATATTTTTCTACAAAAAACAACACAAAATATACATTTTTTA
ACTTTTTTATTGAAAATCAAAACTATGACGAGCATATAGGTATAGANNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCATTCG
ATATAATCACCGTTGGCATCAATAACGGCCTCAATACGGCCTCTGAACGG
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TGATGGAGTCCATCAGGCTGGCCTTGGTGCTATGGGGACGTCTGTTGGTA
TGTCTTTCGACATAGCCCCAGACAAAATAGTCCAAAGGATTAAGGTCGGG
AGAGTTAGGAGGCTACAAATCCTTGGTTACGACGTCATAACAGTTCTCGG
TTAACCACTGCATGGAGATTTTGGACACATGGTAGGGTGCTGAGTCTTGT
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