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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s215 | supercontig | LSalAtl2s215:236939..306729 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004022 >EMLSAP00000004022 ID=EMLSAP00000004022|Name=EMLSAP00000004022|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1016bp
MEVITGPGNARRLRTLKRRKEEKKAEKKVKLERVLGLTVPSNAGLASSPA TGIVAYPAGCTVVLYNPRKNRQSHVTNLSRKTITSVGFSEDGRFLVTGEX GHLPSVRIWDVHEKNMIAEFSGHKFGINCVAFAPNNKYVVSVGSQHDMIV NVWDWKNNVKVASNKISTKVKAISFSENGNYFVXAGNRHVKFWYLEYSRS KYKDPMPLMGRSAILGEQRNNYFCDVSCGRGEMGDSTYAITKSGLLCEFN NRRLLDKWVELRVGKSHSFIFHSACIWGLEIYPSFIDGEKKNPQQKPVLP PGSFITCSSDDTIRIWNLSSNMSHNKGVGGGSVSGGGGSNGGETVVDQRN GVRCIRISLDGKHLASGDRSGNIRVHDLQFMDEICKIEAHDAEVLCLEYC GPIENSKGKYLLASASRDRLIHIFNATRDYNFLTTLDDHSSSITAVKFLP SPYIQMVSCGADKSIIFRDINVDKQKGLPEFSRGTHVVGKTTLYDMEVDH NAKHILTACQDRNIRIYTVGNGKHLRTFKGSVSDDGTLIKVVLXHSGLYA ATSCTDKTLAIYDYYSGECMATMFGHSELVTGLKFTEDCKHLISVSGDGC IFVWRLPHEMTSNMIAKLATVSRKDSSSRIYIGNNNEEYFGSPPPDMMHP TVNRDEEDDSYRFSVGKLPIWAKKQMTERKTTLSPPHSPQTGTKNSVDYP KGRWAQRVGSRGMTVKSHYDSDSKDSQDSQRSKLRLXALPSHLRPGNRNT DESSLGSFNLDNTEHDADIDEYSDGLTTQDDGGESTEPEVTERTMYFGQS EETPGVYTVNAMDVDELRRSQRRSKKPGKGIERLQQGSSSNSNTAEVLTT PSQDSDSDDSEEEDEEVSTPSADKNILSILSVSSENVDLVGRRERFLKSN FESLGSNSGLVTESNSFSNQYREGSALHRNASTIARAQSFRDKEQNRKRE ELQRRIEETKKKLQNIGYRSMIKGSQSISDLSMHIPEKDFSEGSASRPTS RNSARGNVFSIHLHHI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s215:236939..306729+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004022-699869 ID=EMLSAT00000004022-699869|Name=EMLSAT00000004022|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=69791bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s215:236939..306729+ (Lepeophtheirus salmonis) AAAAAATTGGAAAAGAGAAAAGAGCTAGAAAAAGAAACTAAAAGAAGAAG
AAAGAATTGTGACAAATGAATTTGAAATTTGATCAAGACTTTAGCAATCG
GTGGTGATAATAGAATAACTGACGGCTCATTTTTTTTCTCGCTCTTCAAG
CCACCTACCTAAGAAGTTGTTAGGAGGTTGTTGTAAGGTATATCATTCAT
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TGTAGGTGTAGAGGAGGATAAAAACAACACTTGATGATGAAGTACTATTA
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ATTACTACTGCTGAAAAAAATTATTGGAAGCTCTAGCTCTCTGGTGATTA
AGGCCCTTCACTATAGACTAAACAATATTTATTTTGCAATGGAGTTTGAT
AGATCTAACTCTGTTTCGCTGGCGTGAATCGCTGAGTAAAAACTGTACAT
GATTTTATTTATTATTCAGCCCTACATAGACACCACAAAGTTAAAATAAT
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GAATAGTATAAAGTGGAACCAAAAATGAATTAACTGACGCTCAATATACA
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TCATTTTGCCCTGGTATTAATAACTAATTCAATACAAATATAGAACTAGG
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TTTATTTCTAGCTTTTTTAAATATTTTTTGTTTTGCTTAAAATGTATAGA
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CCTGAAATGTCTTTTTTAAAAAAGGGCCATAAAAATATAATAAAGGATTT
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GAAACGTAGAGGTGCAAAAATTTACTCATAGCCTCCCTGTGAAAATATTG
TAACTCCGCCACATGAGTAAAAATCAACTCAATCCATCCATTAATAGTTT
TATAGCTGATATTATAATATGTACATTTGTCATATACTAGTGGGAGTACC
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ATTTGATGTTGTTGTTGGCAACCTGAACAGTATTTTTTTTATTTTCTAAA
GCTGTCATCATTTTTGTTTCATTCTTGAAGAGAGAATGTATCTAAATAGA
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TCTCAAAGCTGATATAGCTAATCTAATTTAACGTGATGTTAMCTAAATTG
CTCTCATTCAAAATATTCTTCAAATTCTCAGGTTTACAATGTTTATTTTG
GTTCATTTTATATACCGAAAATAGAAATATGTACTCCTAGTGTTGTGTGA
GTCCTTATTTATTCGGTCCAGTGTAGTCTTAGGACAATTCCTTCGGACTA
CCAGTACTATAAATGATTAAAAAATAAATAAAGTTGAGTGACGTCTTCAA
GGACCTAACTTTATAAGTTTTAGGACTGAACTGGACCTGATCGAGATTAA
ACTGGACGGGACTGCAGTCTTCAGTCCTAAATAAGGACGGATACATAATT
AATTGTGCCTATTAGTGCTTAATTCAAGAAATTTTTATGAAACATCGTGA
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GTAAAGCAGTCATGCAGTACTAAGATATACAGGAGACACTCAAAAATGAC
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ATGTTATGTATGTCAATTGAATGAAAAAGGCAGATAGATTGTTTAATAAT
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CTAATTATCCCACTTTAATCATACTTAATCAATCAAAAATATATAATTGT
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TTTAGTCTTCTTTTATTCTTAAAGCCATTTGATGAAGTTGTATGAAGATT
TGTTGGAAATTTTTAATTTTATGTAGTAAAAATATAACATTGAGGCCATA
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ACTTAGAGGGAGATGTTTCCACTTAATGTCTTTGAATCCGACCTGTCAAA
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TTGATGTGATGTGTAATTATAATAAAATACTAAAGTAAAATAAACTAAGC
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ATTTTAGTCCAATTAAACCAAATGTGAAGAAGAAAAAAAGTTGTAATTTT
ATCATTTTTGCCAGCTTGCACCCTAAAAAACTGAAACTTTCACTAATTAA
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TATAATTTATAGCAAAAAAAAAAAAAAGCTTATTGTATTAATGTAGGTAT
GTTAAACGATTAATAAAAAATAAAAAAAGATTTTAAGGCAATAGTTAACG
TTATTTGATGATTCCCTTTTTCCTAATTTTTGTGGTGCCAATATTTCCTA
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ACTTTTATTTTATTTTATAACGCATATGCTGAAAAGTCCGAGGCTTCTCA
CGAATATGGCGCTATTTTTTTTTATTTTTTATTCGCCTCATTTTCAGTTA
GTATGAAGCTTCAAAAGATATCTGTAAAAAAGTCATGACTATCTGTTCTA
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AATGGCTTGAAAAATGTTATAGGGACTCTGCTCTATAAAGCAAATAATAA
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AAGCCCGGGATTTTTCACCCACTTATAACNCGGTGTTTAGAATTATNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TGAAATGACCGGATTAAAAATCATGTTAATACCCCATAAAGATTAAATTT
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GTTTTTATTGTCCTATCCCAAGGAGTACTAGGTGTACACCTAAATCTAGA
TGTGGGGTTACCTCCATATTCTTTAACACATAATAATTAATAATGATAGC
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TTTTATTTATTTATGTTAATTATGCTTAAAGCTAGGCATAAATAGCAGAG
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TTTTTTTTAAATACCTTTATTTAGATAGCAAATAATATATAAGAATGATA
TAAAATTTCTGATGAAGATGCATTTGAAGAAATATAATTAAACATTATAG
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GTCTTTCTCAAGTCTAATTTTTCACATTTCTGAGCCTATCATCTCCCAAA
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CGGTGACGTGTCTAAGCTGTGGTCGCTGCTGAGGGTAAATACTTCGAATA
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CTGAGGGGGCCAGTAGTCCTTGGGCCAAAAGTTCATGTTGTCCTTGAGCC
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CGCCAGAATCTTCACATAATTCTCCGCTGTTAATCTGTAGCCAATGGGGA
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CCACATAGCGGTGCTTATCTTGCACATCTCCAAAGCTCACAACACGGTCA
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AATGATGATGCGTCCAGATGAGCTCTTGATATCACTCAAGATTTCCTTGG
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GTACGCCTCAGGGACTTTCTTCCAGCCCTTTTCAATGCCCTTGAAACAGT
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CACTGCCGGTATATTAATAAAGCAAAGTTTGTCTATCTGTATGAATTTAT
GAAAACCAGTCACCGGATACACTATATATAGTGCTCCATGATGTACTGTA
TACTATTCAAATTCTTTTGGGTGATCTTGTAAGTGTGGCACGGTGGTCAT
CCTATGTTCATACCCAATTTGCAATCCCATAGGTTGCGTTGAGGGTGAGA
AACACCTTCTTGGCCAAGATAATTTTATATCCATTGACGTTTAAGGACCC
TTTTATCCACACCGGTGGAAACACCTTACGGTCTAAACCAATGACGCCGA
GCATCATGGTATTGGCTGGGMGTTTCGAACGGCCGGMGYATTTTATCTCG
GAAGGGGCGTCTAGGCGATGTAACTATAGCTGCAGGAATTGCTGACTGGG
TCAACTGTGAACATTTTTCATCCGAAAAAGTGAGGACTTTCCTATTGGGT
TTCTTCAATTTATTAAGGAGGATCTTCGATCGTGTCACCCTCTTTTGTCT
ATGTGAAGTCATCAAACTCTGAACTTTTGTTACTGCCCTATATTTGAGAC
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TCATCGCCCATTTAGCGGATATTATTACGAGGGTTTGCGTTTATCTTTGC
CTTGACACTCCTTATGAGGCTCTCTGTGCAGACCGATTTTGGTCTTCCCG
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TTGTTTACAGTGGTCCTACTGATCCCGAAATTACATGTAATCACGAAGGG
GTTGTCACCGGCTATTTTTTGACAAAGTTTTTCCATTTCTGTATTTTGGA
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TTTTTTATTTCTCCCTTTTTATGAAACGTACGAAATTGAATACAGATAAT
CTGTATAAAAAGTGTACAATGACGCATACAGTTTATCATAAACATATTTT
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GCATGTTTTACAATAGCACTATTTCTGTTTGTTTTTGTGATTGGTTTGCT
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CACGACATATGAGTTGATATAAGTATTATTGTATTGAGTAGTTACGTATG
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ACTTATATGGCTATCAAAGCAAAATTTGTATTTCGGCCGACACCTAATTA
CTCTGTGCAATCCCCCTTACTACCGCTAGTAAATAATAAAGTGATGGTTG
TTTATATTTTTATGTTTTTTTACAGCCACCCTGTACATACTACTGCTTAT
TTGGAATATTCTGAAAATGTGTAATTTGAGTTGCCCATACTTAGGCGGAT
TTGCTAATAAATATTTATTTTTATAAAGGAGCATCGCTTGGTAGATTTGT
AGATGATTAGTAAAGAGGAGACGGAATGAATATTGTTACATATTCAAATA
TTTTTATTTAAATAGAAAGGAAAAGGCTTGAAGTGAATAATTTCTCCTAC
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AGGTAACCCTATGCTGTACCTACTTTTATTTGGTGTAAGTGTAGCGGAGT
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GGGGGGAAATATAGTTTTAATACGCATGATATATAATATTAAATTTGACT
CACTGCTTTTGTTCCTATTTCTCAACTAATCGTGATTTTTTATTCATATA
TGAAATTTAGTCATTTCTTTCTATAACTCTTATTGTGATGTGACCTTATT
TTGCCAACATTATGCCCCTAGTAGGGACATATGATAATATTTTATTTTTT
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TATAATACTGACAGTCTGAAGGACCGACGGTCTTAAGGATTAGTTCCAAG
GACTGATAGAACCTGTTCTAAGACTGTACTGGTACGAATAACAGGACTGA
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ACATGTTTTCAAATTGTAAACACGGTACAATGACGTCATGTGAAGTTTAA
ATAGAGATCGGCCGTCTCTCCTGGAATTTGGAACTCCGAATTCGAGCATT
TCTTATGATGAATGTTCAAGTTAAAAGTATATTCCTTTGATTCCCTTTAT
CTTCCATTGGTTCTAACTTTTGGAGAATACAGAAGTGCAATTAACCCGGT
GATACCATAAGGTATATTGACAAAACTTGCACCAATGTATTGTACTATGT
GAGGGCATCATATAAAACCATGACTGACAAAAAAATTAGGTCGGGAACTT
GTGGTCAGACTCCCCAATTCGTCTCAAAAACGTTGAATTTACGGTTTATT
TCCCCCCATTAAGTACATAGACAAAAATTGCATCAAGGTATAGTACTATC
TCAGGGGCTTATATAAAATCAAGACTGATCACCAATTTCTGTCGGGGGGA
AATTAAGTCAGAACCCCCAAAAAGTATCATCATCCCCCCCCCCTCTAAAT
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GTTTTTGTGTGACTTTATCATTATAGATACCTGTCATCTTGTATGAGGTA
TGAATAGTATCTCTTGCTCCTTTTCTACTTTGGAAAATGGTGGATAATTA
TTATTGTCGTGTATTTAGATGTCATACTTATGGGATAGCCCAACATATGG
ACTTAAACATTCACTTCCCATCTATCAAAAATATATCTCTCTTAATTATA
TCCCAAGGACTAATATGTATAAAAAATAACTTACTTTTTATTAATACCGT
GTATGGCGAAAAAATCTTTACACTTTCGATATAGGAAATTAATCAAGATC
TATTTCAGGAACCAGTTGTAAGCATAGGGTATGTCAATAAAATAAAAAAT
AACTAATATTATACCTGAGCTACCCTAATCATCGATGTAGCCCTCCTTGG
CATCCATGATGAAAGGTCTTCCACCTATTGTGAATGTAGTCCTCAAATAT
GGCATTCCAGTGCTGGTTGACTGTTTCCTTGAGGTTGTTGATATTGGGAT
GACTGACGGTGCKGGCCTTGGACTCAACATGCACATAAAAAGTGAAGTCA
AATAGGTTGTCATCTGGTGGGTAAGGGGGCCACATTTTATTCAGCTAGAA
AGCCAAGTTGCCCTTCAACCACTTCTGGGTCTTTTGGGCCTATGTGCAGG
CGCACCCTCCTGCTGGAACACCACGTTCATGTCTGGGTTCTTGTTGGAGA
TCACCAACTGCTTTGCAATCTCCCTTGGTTTCTTGCCACTGTCCAAAAGT
GGGCGGACCGAAATTAGTTGGTCACGTTCAGATTGCATTTTCTCGGTTTC
GAAGACACTTTGGAAGATCTAGTTTTTTATGGTATTTTTTGTTCCTTTTT
AGTATTTGACAGGAACAATTTTACTGCATTCACAAGAACCTTGATCTATG
TAGCAAAAATTAAGTGTCAAGAGTTTTCGCCGCTCGAGATATTGTTAAAC
ATTACAACTAGTGTGAATTATAATCGTGATGGTAAAATCCTCGTGAATGT
AAATTAAAAAGAAAGGTATATGTTGGTAACTTTAATAGACGTCATTGGTC
GTTAATACGTTTGAATTTTCAAAATAACAAGAAATGTATATTAATAAAGC
AAGTTTTGTCTGTTTGTACATTGGGCGTATGAAAGTACACTCTTGTGTAT
TTATAATGACATTATCTTTTAGTTTCTTCAATCTAAATGGAAGTTTCTAT
TAAAGAGTATAATGCATTTCATTATGTGACCAGAGATACAATTTTAGTAT
TCAGGTAGTTGAAACAATTTTAGTATTCAGGTAGTAGAAACAATTTGACT
GAACTGAGTGAAATAACCTTCCTATTTATCGTGTAAAAAAAGTCTTTCAA
AAGTAACATTGATTCGACTTAAAAGCCATCTAGCGAGTAAAAAATAAAAT
GTATGTATATTATATGTAATTTGTACAGTAATCTTGCTCATCAAAAAAAA
AAAAAGGAAAGAAGAGCTAAGTAATTGCATTAAAAAAATAAATAAATGTG
ATTTTAGATGAAGTTTAGCAACGAGCATGTGTAGGTAAAGCACAGATGGT
GAGCGCTCCACTTATCTAGTTAAAAAACCATTTGGAATAAAATTGATTGT
AAAAGTCTAACCTTTTTAAGAGATAATACTACTACGTGTATATGTGTGTA
TTGTACAATATTAAAGTATTTTTAATGTCAAAGGACACAAAATTCCCATA
AAACTCAACAGACAAATGAACAAATAAGTAATTGGTGCCCTTGGAAAGCA
ATGTGGATTATATTTCATAGAGATTTTAAAATCTATTAGTTTGACCTCAG
TATCGTGGTTTTTCTTCAGTACTAAGATGGAAATTATGTAATATTTTGTT
AAATACCTTAGTCTCCAACATGGTGGTATAGTATGAAATCTATAACTTTA
AGCCTACACTTTAAGCTTTTTGTTGCACATATGCAACATAGCAAAAAAAC
CGCCTTTTTATATATATTATTCAACAAAAATGTGTCAAATTGCAACTTTT
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GATTTTTCTTCACTATATTACTTCTATGAAACAATCAAACTAACAAAATA
TAAGCATTTAAGGTTTAAAAATGTGATTTTATGAGTACAGCCTTTTACTA
ATAACAGTTATATGTAAAGCCTATAACTCGCACTGGGTTAAGTAAAAATG
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TCGGTTCTAAGATGTTTCGCCCGGATATATATTATGGCAAAAATATATTT
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GAACTCCTTGTAGATTTCCACATTCTACTTGTTACTCTGAGAAGAGGAAT
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TACTGTGGTCCCATTGAGAATTCAAAAGGAAAGTATTTGTTGGCTTCAGC
CTCAAGGGACAGATTAATTCACATCTTTAACGCCACTAGAGATTATAACT
TTTTAACCACCTTGGACGATCATAGTTCAAGTATAACTGCTGTTAAGTTC
CTACCTTCTCCATATATTCAAATGGTATCTTGCGGAGCGGATAAATCTAT
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CAAGAGGTACTCACGTTGTGGGCAAAACGACACTCTATGACATGGAAGTT
GACGTAAGTTTTTTGCTTTTACCTTTAAAGTCTTAAAATATTATACATCT
GCATCTCTGTACTTGTGCATTTCAGCACAATGCAAAACACATTTTAACAG
CTTGTCAAGATCGAAATATACGAATATACACAGTGGGCAATGGAAAACAT
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GGTGTTAGMCCATAGTGGTCTCTATGCTGCCACAAGTTGTACGGATAAAA
CCCTCGCCATTTATGACTACTATTCCGGGGAGTGTATGGCTACCATGTTT
GGCCATTCTGAGCTAGTAACAGGACTCAAATTTACAGAAGATTGTAAACA
TTTGATCTCTGTTTCTGGGGATGGTTGCATCTTTGTTTGGCGATTACCTC
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GACAGTAGTTCTCGTATCTACATTGGAAATAATAATGAAGAATATTTTGG
TTCTCCACCTCCTGACATGATGCATCCTACAGTAAACCGAGATGAAGAAG
ACGATTCATATCGCTTTAGTGTTGGAAAACTGCCTATTTGGGCAAAAAAA
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TCGGCTCTCGTGGAATGACCGTCAAATCTCATTATGACAGTGACTCAGTT
ATACCTTTTCCTAAGAAATTTGATTCTAACTATAACAACAGCAAGGATAG
TTCACTGGAGACTGGAGAGTATAAGCAACAAAAAGTAGGTCATTCACATT
TATATATGAGGTCCGTTCATCAAAATAAAAGCAAGCTAGCATAATGATTT
CTTTTTAATATTAGAATGTACATCTGCACTATTCAACTAATTAATTAATT
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TGCAGAGCTTTTGAAAGGTATTTATAACTTGCTAAAGTTAAACACTGAGC
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