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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s216 | supercontig | LSalAtl2s216:1024648..1036853 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004053 >EMLSAP00000004053 ID=EMLSAP00000004053|Name=EMLSAP00000004053|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=331bp
MKLCCTRPPMLYLCITLWMLTFINCIYIFVQVLIPQCITGXYPSRPGMSQ PQIQVKLVETSEHTIFSRIRFPIRKNALLHGKVFSPTSSKKKFILGIPSM ARPETEYLNTTLQNLLSSLSHSELKLIFIVVFLADKEKKVRIDRGKRIYG YLKKHVDSGLIQIIHSPDNIYPFLNYSNIRPTFQDTPGQIEWRSKICLDF SFLMSYCSELSGATYFMHLEDDVVPLKGFINATMDFIDSQNSSEWTSLQL SDYTSIGRLYKTSDLHKLVDFILIFYTKMPVDWLMAEXDRLQVPDNLEIH KINKSLFTHSGKVSSKELFLKKRGNGGEQKV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s216:1024648..1036853+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004053-699900 ID=EMLSAT00000004053-699900|Name=EMLSAT00000004053|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12206bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s216:1024648..1036853+ (Lepeophtheirus salmonis) AACAAATAAATAACTTTTTATAAGAAGTTGAACAAGCTTTCAGTTCTTTT
TTTCTTGACTCAAGGAGTTTGGAAAGTAAAACACGTTACAAAGGGACATG
GAAATCATGATTTATCGTATTTAAAGGAAAAACGGTACTCACTCAAAAGG
AAAGGAGAAGGGGGAAGAGAACCACGGCCACTCGCAACCACTTTGAAACT
ATTTCACAAATAATTCTTCTTTCGAACAATCCTATTTGTAAGATGAAGCT
CTGTTGTACTCGTCCACCGATGCTCTATTTATGCATCACTCTTTGGATGC
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ACATTTCATAATATTAAAATCCTACATAATTTGACACGGTATTATAATAT
TGTATATTAACATTTCATTAAAAGTGTAGCTGTACACTTGTATTTCTATA
TGATACCCATAGAAATAATAAGATATCCAATATAAGTATATATATTAATG
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TTGCACGTAGCAAGGAAATATCTGCAAGGATACAAGTACGTTTAGACACT
TTATTTTATTCGCCTGGTCATTCCTTGCAAAAAAGAAATCCAAATCACGG
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ATTGAATAAAAGTTTTGTAAAATTCTGAGTTACGTACTTAAGGCTATATT
TCACTTTGATCAGACCAGATTCCTAGCCTTTGCAGGGCATTTTTTTTGTT
TTTTGTTAATAAGTTGATTTTTTTCATAAAACAAGATCGATTCCCCCCTT
CTCAAAGTATATTAAAGGTATAGGGTTGTCCATTCGAAAATGCACCAAAA
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AAAGGGAATTAGTTAAATGAAGGAAGAAGAGGATTAGATAGTTAGTCTTA
GTATGTATCTTCATTATGGTTGAAGAAGGAACATGGCAAATTAGCAATGA
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TATATACCAAAATCAGTATTTTCCCATGGTCAATTATATGTTGGAATTTC
AAGAGTGTCAAAAGGGGGTTCAGATTTTTATTATATTTACATCAAATAGA
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TACCTTTTATATATATATTGTTTATAGTAGATGGTTTTATTTTAGAATTT
CAACATACAGAAACTAAATAATAACAATTTTTTATTGGGTGTCTTTAAGA
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TCAGTACACCGGTACCACTAAGTGAAGAACCGGTATACCGAACAACACAA
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CTTTCTAAATCAATTTCTAAATGATTCATTATTCACTTAGTGCAAATAAT
CTTATGATTTTATTACCGCCTAGTCCCTATGTATTTATCGATAAATGAAG
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AATAAATATTGTTAAAACATCAAATACATATATGGAAATGAATATTAAAG
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AAAATGTTTWAGGATATATTATTATTATTAATTCCATCATACAATAACAA
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GAAAAAAAATAGCCCTGTCCAAAATGTTGTTTTGTATGAAATTACATTAG
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TTCGAAAAATAGCCTTTATTAATTATTGACTCACACTTTACCTCCTCCAA
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TCAAACTCACTTTATTGATGATCAACTAAATTAACACAAGAATAACAAGG
CTTATTTATATTATTCTTGATGGATTCAAAGTAGATCATTCAATCATCAA
TTTGATGAGGAAACAGTGGGTGGAAAATTCTCCCTCTGAGTTCATATTGG
CGATCAATCATCTTTCCTTTCATTGGATATATTTATATTAGAAAAGCTTG
ATCGCCTCCCAAATAGCTTTACTAGCCTAAAAACTCTAAAACTAGCGTAA
TGATAATAAAGTTATTTCCCGACTTGCCTAGTTGTTTTGATACATTAGTC
CACTTTTCTGGGAGGCCCATGATTTAATAATTTAAGATTAATATTTGGCT
ATATAAATTCAGTTCATACAGGCTCTTAATTCTTTGTTGGATCCAAATTG
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TTGCATATTACATTACATGGGCTTSCCAGCCAATATTAGTACATAAAATT
ATATTTTTTTAAAGTATGTCATAAAAACTAATATGTCTATATATATTACT
ACGCCTCTTTACTCATTTTCCCTTTTATTTTTTTTTGTAATATAGGCCTG
AGTTTGTATACTCTGATTGAGGTGCACTTTCTTTTTCTAAACTCAAAGTA
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TTCATGTTTTTTTAAGTAATAGTATATACTACTATGAAAAAATAACTTAG
CTCTAAGGTGCTTAAAAAAAGTTCATGGATGCTTCAAAATCAAAATAGTT
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ATAATATATATTCATACTAGCTTATTTTATTAAATTTCTTAATACAGTTT
GAAAACTAAATTGACCAAAAATCAAGCCAAATTGACCTTTTTTAATGCCC
ATTTCTTTTAAATTGAAATGTAACGTCGATTCTATAACTTCAGCTAAGAT
ATAAAGAAATTGAATAAAAAATAAAAAAGATATTCCCTTCTAAGTAATGT
CCTTCATTTTACTCGATTTTCTAGTGGCTAWATACATTTTTTATTAAGGT
AAAGTAATAAATAATTCATTTGGCAAATGCTAGATGTTTCTATTAATTTG
TTATTTACTTTGATTTAACATATATATAGTTCTTTCAGGTCGAAATATCT
TAGCTATACCTTAAAAACTTGATTTAAAAAAAAAAGGCTTTAAAGGCCAA
ATATGTAGAGGTTAAAAGTTTTAATGTTCATTTTCGTGTTCTACGGCCTA
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TTTTTTTTTTTTTTTTGCAGAACTAAAAAAAAAAAAARWTTTAACAAAAC
TAATCGAAATATTGGAGTATGATTTGTCAAATTCATATTATAAAGAATAT
ATTATTMGATTAGGAGAAGAGAGATCTCGTCTTTTTCGTGATATTCGTAC
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AACATTACTATGAATAAATAGAAATAATACTATACAAACTCGAATAGCTG
TCTATTCCTATTGTAGAAACTTATTCGATAAATTGTCGCCGATTAAGTCA
AAACTCCTGTTCCCCTACTCCAATAATATTAGGGGGGGGGGGAAGAATTT
CMTATTTTTCACTTTAATTCAATGACTCATAAGAAGTATTAGAATCATAT
GATTTAAGCGAAATATGCCCTGTTCTGTTTGATAGCCTGTTGGCAGCATA
ATGCCCTTCTCATAGAAGCCCTTGTCCTGATTGGCAAAACAATAACACAA
ACAATTTTCACAGGCGAGGTAAAAGTTGTAGCCCTAAGCGTGTTGGCCAT
AGACAGGAACAGGTGTTATTCACTTGATGCCGGGTCTGGATTGTCGGATG
GATACATAAGAACTTCCCATTCAAACTCCCGGAGCTTCTGGCGCGTCATC
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TCGATGTTTTTTTTTAAATCTAGCCTTTCGCAAATGGTGCAAAACAGTTT
ATGACAAATGTTCAGCTCCATGGGGAAACTACTACTGCTAAGATGTTTAT
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TGATCGGCGTATCATTCACCTCCACTATGCCAGAAAGAAATTCCTCGAAC
CACTCTTCTGCAACACGAACCGAAAGAATATTGGCCCCGTATACATCGAA
AATTCTCTTGGTCACTTTCGAATCATTTTTCCTTTTCATGTGATAAAATA
TAAAACATGTTGAATTTCTTCCTTTGAGAGCTCTATACTCGGCGCACGAT
CATTCACGACTGAGCCGACCAAGTGCAATACTGTTCGAAAAGCGTTTGTA
GTATACACTCCCACCTTTACAAAGCCGTGACGCATGATCCGGTATGATCA
ATAATGAATAAGACATATTTAAATTTAAATTATTGGAAGGGGTGTCGTAA
TTTGATTTTTATTACATACGTATACATCTKCCACCGTCTTTTTAATATCG
TTTATTAGTTTTTCTTCATTGCTATTTTTGTAAAAAAAAAAAAATTAATT
AAATTTTGAATATTAAACTTTTGTGGTAAAAAGCAAATATTCCTTAATAT
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ATATTTACACTTTGATTTCAGAATGTCACAGCCTCAAATCCAAGTCAAAT
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CGAAAAAATGCTCTTCTACACGGAAAAGTATTTTCTCCAACCTCATCCAA
GAAAAAGTTTATCCTTGGCATTCCATCCATGGCACGACCTGAAACAGAGT
ATCTCAACACAACACTTCAGAACTTATTATCAAGTTTGAGCCATTCTGAA
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ACGAATCGATCGAGGAAAAAGGATTTATGGTTATTTAAAGAAGCATGTAG
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ATAGGATAACAGCTGATATGACATTTGTTGTAACGCGTAGAACTTACGTT
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TCTTCAGAATGGACTTCTCTTCAGTTGTCAGACTATACATCCATTGGTCG
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TTTATACAAAAATGCCTGTCGATTGGCTGATGGCTGAGMACGATCGACTT
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TTAGTGGGCACAATAAAAATTTTAAAGTCGATACTTTTAGGTCGAGTCTG
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CCTCCAATTAAAATTCAATTGTGAATGGAATTTGGAAACACAAAGGCGTC
TGCAGGGGTGCAGGGATGGAGGGCCTGCATCCGTCCCACAAATATCCTAA
CTTCCAAAAATTTAATTCCTAATAAAAAAATCAAATTTTTGAATATTTTT
TCCAAAAAAGTAATATTCATTATTTAATTTTGGAATTTTTGATTTAGAAA
TTTTTTCCATATATTATTTCTTTTTTTATTTTGAATAGCTGTATTTCTTA
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TAGTTTTTATAACTTTTTCTCAGAAATTTTTTTTTATTTTTTGTGGATAG
ATGCGGATTTTTGTTTGAAACTTTTTTCCAAAAACGAAGCCCCCTCAAAA
AAAAAAATATATATATATATAAAAGGTTTTCCAACAAGATTTGTTATTTT
GATACTCAAAGAAATGGCAATTTGGCTGATATGGTTTTCCATTATTAATG
ACATACATTTTACATCGAAATAAACATCCGATCTTTCATCTTTAAACAAA
ATGTCATTTTTCTTTGAATATCAAAATAACACATCCTATTGGAAAACCCC
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TATACATAGTGTTTGAAGTTTGAATATTACTTAGATCCATAAAATCAACA
AATCCTTATTCACTCATAGTGGTAAAGTCTCTTCCAAGGAGTTGTTTCTC
AAAAAAAGAGGCAATGGAGGCGAACAAAAAGTATGACAAGCTCAAAGGAG
AGAATCCATCGGCCGTGACGTAAGATTTGATCATGAAAGAAACAAATTTT
CATTTAATAACACCTTACGTATCGTATGAATAAAAATAGATTACTCACAA
ATATGAGACAGTATCAGTACTTTGCACTCAACAACTCCTATTTCCCATCA
TCCCTCTACTTTTGGTGCATTCCTTTTCATGGAGGAAGCATCGACATTAT
TTTCAATGAACCTCAGGAGATCTCTTCTGTGTCCATTGTCTCAGGTCTTG
AAAAATCTGATGGCCGTCCAGAGGGATCCGACGCTATTAAAGGTAAGCAT
TCAGAATGAAAGATTTGTATTTTCATTATTCCCTCATATCCCACACAGAT
GCATGGCTCAAAGTTTCTCCTAGAATGATTGAGCTTCACCCCAAGAGTGG
TATCGCCTCTTGTATCAACTACGAAGATGTATCTCATATCACAGAACCCA
AGGTTCACATATCATTTGATAAGGAAAAGACTCAAAAATATCAATGTATT
CGACTACAATTGGGGGAATTTCAAACTCCGTATGAGTCCTGGCTTGTCAT
TAAACTAATACGAATCGTTTTAGTTCCATCAGAGACAAATATCAACTAGT
TAATGGGGCATACACGAGTGTATCCAACATTATTTATTTTGCTTAATAAA
TTAGTACCTTATTTGTAGAGATGGGCATTTTGTAGGGAAAAAATACCGTT
TTATGATTTAAAAAAGAAACACTGTTGTGAATATTATTCTTTTTTTTAAA
TATATCCATCCGCATGGGGTTAAGATAATTTACCTAATCCACTTCCCTTT
CCTTATGTCTGAACACTATAGGAACATCTTAAATTAATAAAAAAAATACA
AAGAGAAGACAAGGGGTTTTTCGATTGGCAGTTTACCATAATAAAACTGG
GGCAAATTATAATTGTCAGTCTGCAGCAATGAACATAAGCTATGACTAAG
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