EMLSAT00000004073, EMLSAT00000004073-699920 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000004073
Unique NameEMLSAT00000004073-699920
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s216supercontigLSalAtl2s216:717655..740285 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000004073 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000004073EMLSAG00000004073-686839Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000017686EMLSAE00000017686-726614Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000017687EMLSAE00000017687-726615Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000017688EMLSAE00000017688-726616Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000017689EMLSAE00000017689-726617Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000017690EMLSAE00000017690-726618Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000017691EMLSAE00000017691-726619Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779461auto779461Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000004073EMLSAP00000004073Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000004073

>EMLSAP00000004073 ID=EMLSAP00000004073|Name=EMLSAP00000004073|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=599bp
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXDVLASSS
LPASPDIGIGSYSPLKSPNARVQAIISTEAPVKMFEEKSFESFDFGNISS
DPEAFGKLWKMFQERHKIQESSGSENEKGSWEMIVLQGVLLTVLVLISVL
WAFCCKKRCFAVESMDSISDSVVALARKLSISSRDLPPSYSKVDLRSVGL
TIDDHYNPPPSYDWALEDTLIYCNPPPSPTPGHKRRFSHFSHQSSMSDFS
SILSRGNSRSSISDCNSILSRGNSRSSILSNSTSSSRKSSRVTFAPDLEM
GPTPSVMRGDSNMSLPIMTHMIPHSARRKSVKSEGYASSNSSRRVSFADE
YFPIKRKRSFIVELDPKVEDELRLKLSLLGKFDSFEPIIDGILSEGEEEN
KDEEEKGNGSTEFNLYRSFSPPPTLEIINETEEDDSSGKCCKGKACCCCC
CSKRGATICFSIIGLIMASGVIVPPVWXYLHDQDYIKLFPMFNLARKYLS
QINGDNGNQVVIFSESNKDNLTNLTSPRIEDPTDDVHFASREKYKLAIFQ
LLDDTEEQVQLLAFFSFCVGCLNVPLDVFLFLVPLFERHGPCSLGYSLP
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mRNA from alignment at LSalAtl2s216:717655..740285+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000004073-699920 ID=EMLSAT00000004073-699920|Name=EMLSAT00000004073|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22631bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s216:717655..740285+ (Lepeophtheirus salmonis)
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATGTGCTTGCATCCTCTTCA CTTCCGGCCTCTCCGGACATTGGAATTGGGTCTTACTCTCCATTGAARTC TCCTAATGCACGTGTTCAAGCCATAATTTCAACAGAGGCTCCTGTCAAAA TGTTTGAAGAGAAGTCCTTTGAATCCTTTGATTTTGGAAATATTTCCTCT GATCCGGAAGCATTTGGAAAACTATGGAAAATGTTTCAGGAAAGACATAA GATACAGGAATCGAGCGGATCTGAGAACGAAAAAGGATCTTGGGGTAAGA TGTTGGGATTTTTATTTTTCATTTCATTTCCTTGCTTATAAAGAAAACAA CGCAGATACTGCCCTTTCCTACAAAAATACATGCAACAATGGACTAGATA AGCATGGAACCTATGATAGTATAATCCTTTCATCCTCTTATCTTCCCCTC TCAAAAGAAAGAGGAAGAAAAAGTCAATGTCCTCAGGATAATATCAAGTT ACCGTTATATTATTATAAGAGGAACTTATGAAATTAAGCCAGATTTTTAT AGACATTGTATCATTTTGTACTTATAAACAAAGTTTAGTTAGATATTTAA TCATTCTAGGCCAAAAGTGTATCTTCTTAATTGAAGGTGACGCCCCCTTG GGGCTCATAACTGATATTTTTACTATATAAAATAGACAAATTGCCCATAA ATCTTGTAGAACCGTCATCAAATGATTTTAAAGATTAAAAAAGACTTAAC ATTTGCAATAAATACTACTTGATGACAATAATAAAAAAAGATATTTTAAT TAAATCAAAGTAAAGTACCTATAAAAGGAATAGATTTATGCAATGATTAC TCATTTTTTGGATTAGTAAGAGACTCGAAAAGTCGGATATTTGGAGAAAA AACATGTGATCATTGCCATTGTAATTAATGATTCACACAGGAGGCCGGCA GCCCCCGGATCACGGGCAATATCGTCCCTTTATTGAATTTTGACCGTTCC GCCATCTTATCATGGGCAATCATCTACATATAGTCATACTAATCCAAAAA GACAGTTGAGAGCCTTCAGAAATTTCCTTCTCAGTACTCGAAATATAAAA ATATTGTAAGTAACGATAAACTGATGATGTCAATGTTTGGAAGTTTGTGA ACAACTTTTGTCCAAAATGAAATACACATAAGTAATTTGATTTTTTGCTC CTGTCATCGACAAATATTTCACCTGATATAGAAAAAATATCACAAAATAA GCAGACACTTGTTTCTGCTTAAATAATTGTTGTTGTTTTTTAAATAGATT TTTCTTTTAAATTACATTTCTTTATTTTAATTCCTATAGTAATAAAACAG AGTATTATTTAAATAAAATTAATTTGAATCTTTGTTTCCCTAAACACACA GAAATTCATTTACATGGTTTTCAACTATGACTCTGCAGCGATAGATATTT GGCCCGCTGCCATGACAATACATTGGCCCCTACTCTCTAAAAGGTTGCTG ATCTCCGATCTACACTATGCAAATAATAATGTATAATTCTAGCATAAAAT ACATATTGATACATATATATGATAAATCCTAAATTTAGCCATTAAAAAGA TTGGTTATTTATTGTCTAAACCCTCAAAACTCAAAGACACTACAATACAT AGTTTATCATTTTTTTAATCTTAATTAAACAAAAGGGCTTTATTCTGATA AAACTTAGGTCTCCCAAAATGGCCGGCATCAATAATGCTGACGTCACATA AAAACAATACATTGGATATTAAATTACAGAAATGTTTTTCCCATATATAT ATTTGATAATATCTCGAAACCTATCTCTATTATTGATAAATTTGTTTATT CATATAAACAAATTACATCCGAATATAAATTCTTTAACAATTCCAAACAA ATATAGATATTTATATTTTATAACATTTAACAGTAAAAACTGCTTGTCTA GACGTTGACTTAAGTCCAAGATATACAACACTAACTAATTGAGAATCTAT CTCGGCTCTTAGCTAGAGTATGCTTTACTAGTATGGTATATTATTAGGAT AAAATACTGTAATTAAATATTTAGCTTTGCAATCATATTACAATTAAATG ACAGTATCTTTTGCGAATTTAAATAAAAGCAAAATAACAATAATAAAAAA ATGGGTTTGTTCCGTTTCCTCCTTGTTAGCATGGTTCAAGGCCGTATACG ACTATGTTTGTAGATACACTTATTTATAGCAATGTGAGCACTTTTATACA GTAAAAAAAAAAGATTAAAAAATATTGGTTGAGTAGCGGGCACAGATGAG AAATAGGTCATTTGATAGTTTATATAAGCATAATTATGACCTTTCAAGGG AATGTCTTGGTTCTCTACGTAATGCACAGTGTACAGACATCCCATGTCCA TGAAACAAATTATGAGTACAAATGTATAATGTGTATCACCATTGTTTGAA GAGGAATCAAATGTATATTTGATCCGGTTATAAGACCGGCTCAAGGGAGA ACAAAGGAGTCATTGCCCTCCCCATGCATACCTTCCTGCCCCATTTACGA TACTTATTTGCCTCCTTGTCCAAAGCCGGTTTTAGGAAGGGCACTTGACA TGCCTGGCACATGGATTTTAACTCATGACATGAATCAACAACAGGATAAA TTTCCTGAGAGCCAGTGTTAGACACAAGTATGTTATGAATAAGGAATTAT CCTTTTTATATAATGTCCGCTAACATTTGGAAGAATGAAATTCAAAAGGG TTTTCGTCAAACATAGAATTATCCACTCGTATGCCTCTAGTTTCACCACA GGGTGGGCAGGGCTCCTTTCTTGGATGTTTCACTGCCTTTTTTAATTTAA AGGAGAGGGAGTCTCGGTCACTGTGGCCAAAATGTTATCATAGAAGTAGG ATCCACACACATTCCCCTCAATATTATCCCAGCCCTGGACATTTATCTTA TCAGAAATTTTTTGTTCCTTTCATTTTAAGAAACGTTCGAGTAAGTTTTT GATTTTCTATTCACTTTGGTTAAAAAAAAAACAAACCTCAAACTGTATTT CTTGAGTCGCCAATCAATTACCTACCTTTCACCTATTCCTAAGCTACGCC ATCGTTTGAACCTACATACCTATTATGTAGAACTTAAATATATACAAGAG GGCAAGACTACTCAACTGACAGCTCTAAGAATGAATCTGGACCTTCTGAC TGCTGCAGTTAGAACTCAGGTACCAAAAGGACAAAATATAGTTGAATAAT ATGTACAATAAAAATAAATCCATTATTTTTCTGATAGAAGATAGATTTAG TAATCTGGATTTCATGTTCTATCAGGTTAAACTAGATGGGATAAAAAGAT AGAATTTCGTATTAAAAGTACTTCTTACCCAATTTTATTATTTCTTGACT CAGTATTGTTTAATCGAGCATCAAAGATGTACACAAGCAAAGATAAAATC CGTTATATTTTACAGTTTTTCTTTGATAAAGGCAAAAACACAGGCCAACG GCAAAAAATATAAAGAATGTTTAAGCTCCNGTATACTTTAGCAGCCAATC ATGTGCAATTTTGGTTTTGTCGATTCTGTTCTTGTAATTTTGATGCCAAA GATGCACCAGGCTCTGGTAGATCAATTATCGAAACCATCCATAAAATTAT GGAAATAGTTGAATCCGGTCGTAATATAAGCACTGTTTCAATTGCCTAAG 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GTGGAGTGAGGAAGCAGCTGGTCTCCAAGGCTGTGAATGAAGACCTCGGA TACAGGTCATACCGAATGGCCAAACAACACATCTTCACGGCATCCATGAA GGCCACCAGGCTCACCAACGCTAAGCGTCTCCTCAATGACCTGAAGAGCC ATGGAGGAAGAATCATCTTCTTCTCCGACGAGAAGAACTGGATCGTCGAC TGAAGCTACTACGTCCAGAATGGCAGGTGGCTTTCCAAGGAGAGAGAAGA GGKCCCTGCGGTCTTCACCACAAAGTTTCCGGGCTCCATTACGAGGGAGT GGAATGCTGTCGATTCCGCGGAAGTAATCAGGGAATGCAAATCTTTTAGG GGCAGGATGGAGAAGATAGTGGCTGSTGAGGGAGGACATGTTGAATAAAT TTATTGTTTAATATCATGTCTAACTTTTTCATATTAACAAATACACTCCA AATTCCATTTTTATCAAGCAAGTTGAATTTTAAGATAGTTCCAATTTATC GTGGACACCCTTGTATGTTGTAAAACCATATATGTTAAAATGTGTTTTTA AATTGGTTGTTTTATTATTATAACTACATGTTATAAATATTTTTAGACCT ATGCATTGCATACATTGGAACTGGTCTAATTGGACCTTAATTACAAGAGT TGAGTTGCTCTTTTTTAATATTCAAGAACGAAAACAAACTAACATTTAAA GAGTCAAGACGGAGCTGACAATTGTTACTAGTTATTGGAACTCCGGCTCT TTTTATAGAACCAGCTCTTTCTTTTTTATGGAAAAAAATTTAAAAAATCC ATTTGACATTTTTTTCAGAAAAGAAATCCTTAAATTTGGCATAAACAATC ACTGAACTGAACATATTTTTTTTACAAGAATTATGAAAGAGCATAATTAT AACTGTTAATTCTTTCTATATATTTGAAATTGGTCTCTTCTTCGACTTCA 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GTCTTGATTAAGTTGTCAGTCGTAGGAGGGTCCTTATCGGTCTATTAGGG TAACTTACAACGCTCAAAATAACTCAGTTGCTAACTACGTTATTTCAACT ATTGAAGTGGCATCATATCCTCTTTCAAAGAGACGAAATATCAGGCATGT AAGCGTTCTGCTATTTTGGCGTTCCCTTCAATTATTTTTTTCATCGTTCA GCCTTTACCTAATTTCGTACTCGAAATGAGATTGCTAAATTAGATTGAAT GTAGAAAAACGAGAGCGCTTTCTGGGACACTACGTTTTGTTGTCTTTTTT GTATGAAATGTCTATGCGAATCAATAAAAAAAAAAATTAAACTAAAGTTA TAAACACTTATAAGAGACTAAAAATAAAAATATTTTATTTTCACAGAAGT AGAATAGTTGTGATTCATATCGATATCCTCTTAATCCCATATGTAAATAT AGATGAATTAAGTCAAAAATAATTATTAAAGTCCATTATATATTACTTAT GACTTAATAGTTCCGAGTCAATGTAATAAAATTTCCTATTTATAGCACGT CACCCTAAAAGGAAGCTAGAAGCATTTNATATAGTAAATATAGATGAATT AAGTCAAAATAATTATTAAAGTCCATTATATATTACTTATGACTTAATAG TTCCGAGTCAATGTAATAAAATTTCCTATTTATAGCACGTCACCCTAAAA GGAAGCTAGAAGCATTTTTCTCAAAATTGAACATCGAATACATTTTCCAA CAAATTATAGTTCATTTCAATGAACAAATGATTCTGATTAATCCTTTGGA GGCACTGCAAATTTTACTAAAAGTAGCTAAAATTCACCACTGGCATTTAT AGAATTAGGAAATTAATAAATTATACTTCTAAGAAAATATTGGGGCCACA TTAAGTCAAGTAATTAAAACAGAATTTTGAAACTACAGTCAAAACTCTGG 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