EMLSAT00000004207, EMLSAT00000004207-700054 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000004207
Unique NameEMLSAT00000004207-700054
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s221supercontigLSalAtl2s221:872156..900055 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000004207 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000004207EMLSAG00000004207-686973Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000018259EMLSAE00000018259-727187Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018260EMLSAE00000018260-727188Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018261EMLSAE00000018261-727189Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018262EMLSAE00000018262-727190Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018263EMLSAE00000018263-727191Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000018264EMLSAE00000018264-727192Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779960auto779960Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000004207EMLSAP00000004207Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000004207

>EMLSAP00000004207 ID=EMLSAP00000004207|Name=EMLSAP00000004207|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=643bp
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DMAIKGIYSHWITDDLLAMARPNNDIIQKESIMQQFHEKGIKSIINLQIP
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GSVQTRRQIECVKEFEAYFLPQCIVFSNKPMGDSDKKNGRFNLDQCLKRQ
KYVLHGLEARALKNIPKIIYKICQRLLKLTNCQILHDENFPKSFITYQFD
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VASLQPLSREQSENVMRRFLASLTHQGVSINDKIFPIGKKFPKLRGGTSE
STLKFLMKLFDKVISQQAQEHLTFPEELNSSMQSVKTTSTIPI
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mRNA from alignment at LSalAtl2s221:872156..900055+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000004207-700054 ID=EMLSAT00000004207-700054|Name=EMLSAT00000004207|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27900bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s221:872156..900055+ (Lepeophtheirus salmonis)
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