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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s222 | supercontig | LSalAtl2s222:1015290..1022052 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004223 >EMLSAP00000004223 ID=EMLSAP00000004223|Name=EMLSAP00000004223|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=454bp
MEMASKILLYANESCDIPEDQRADFIKNLLKAKMEVDLCEQTDEVMVLSE
IFGNKLFEFDEKHSKGQISNTIELNGSTIKIGVSKRSINDNHEREILLSK
DLDHIPPISLVFEFPANYPSVSMPKFSLSCLWLNSKQILLLEEHLESLWN
ENKGSVILFNWITFLQNEVLEFLDFEKEIIIEEKDVSSLFNTPLKFIQEL
ESYDVSXKEGIFHESLFTCNICFQDKFGKECVQFKGCDHVYCKICMRSYF
ETKIQEGSESGIVCPTHECSVEALPTQIKELVSEKLYSDYENGLIEMSLR
GMSDVIRCPMRHCRVPTIIDIKSNSGECPSWFHLQXQRELMDKYNNADDE
ERKKMEKIYSQKFLLESQNEILSHDLIKDICTNCPNCFAAIQKTEGCNIM
FCTKCSTDFCYICGTKLLGSNPFEHFSVVRSPCANLLFDLINYEDELEVP
SEDE back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s222:1015290..1022052- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004223-700070 ID=EMLSAT00000004223-700070|Name=EMLSAT00000004223|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=6763bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s222:1015290..1022052- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGAGATGGCATCCAAGATATTGCTATATGCCAATGAGTCATGTGATAT
CCCTGAGGATCAAAGGGCTGACTTCATCAAGGTAGCTAGCAAACTGTATG
ATACCCAGGCATCCCTCATTATAAACCAAAAGTTTAAATCTAAGCAAACA
AGTATAGGCTCTTATTTTTCTACTGGACTTGAAAAATGATTAATAGTTTA
CTATGACCAATTTATGGCACCTATATATGTATATAAACTATAATTTATAA
GCACTTATGTATTTCTTTATTAAATAAAATAAAATGTAAAAAAAATCGGT
ACATTTATTTGCCAAAATATGTTTGGTTTCGCAACCTCGAATTCCCACTC
TCTGAAATTCTCTAATCTGGAAAGTTCTTGAGTGCAAATATGATTCCATT
ATAGAAAATACTTACTGTATTACATTATATTTAGATATGAATGCTATGAA
TATTTAAAACATGGTTACATTTATCACTCGATGTAGAGTAATTCCCCTAA
AAAGTAACAAATAAACTTATTTCTTGTTCAGTTCTATAATTGTTATTTTT
ATTTGAAAATCCTATCATGTATTGCTCGGAAATAAATGGTATTTTTTCAC
AAAAAATTAATTGAGCTGGATTGGAAATGGTTTGATTGAAGATTTCTAAT
AATTGCATCATGTTCGGTAACGTCTTAATCTTCAAAAAAGCTATTTAATT
TAAAACTTCGCTGCATGTWTTTATTCGCTCTGTAMCCACCGATAACTTAT
TTCATAGATAAAAATCTTGTAGTATTCCACATTTGATATTTTAAGTTTCT
TTGAATTATTACACTATATCCAATAATAGGACAACCTAAAATGAATTTAT
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AATTAGACAGCAAATAATTTATAAAAATTAGAAAGATCTAAAATTCTCTG
GTAAAGATGCATTTACAAAATATAATTAAACCTTATAGCTTAAAATGTTT
TAATCAACGGATTAAGGCTTACTAATATAAAGATATATCTAATCTAATAG
CATTAGCATCGAAAATCAATAAAATACAAATATATAACATTAAGAGCAAA
TTTGCTTTTAAACTAACAACTGATTTTTTTTTTTTGCTCTTTCTAAAAAG
TTTGAGTACTTTCTGCAAAGTCCGAAAATGTCTTATCGCCTTAATTATAT
TAACGTTATTTTCTTCCAGACCTCTCAGGTTTAAACTAATAAATGATCTT
GGAATAATTAATTGTAGACACTCCGAAAAAGCGTATCTAATAGTGTTGAA
TAATTTACCACAATCTTTACATGGAGTGTTGAAAAACAAAATTCCTATGG
CTATTTGAAATTGAGCTGTGGATTTTCTTGCAACAGAAGTAGAAGAAATT
ATCCTAGGCATCCAATTACTAGATAGTTTTAATTCCTTTATCCATCCATT
ACATTTTGACAACGCAGAGTCCTCTTCCGAATTAGAAAAAATCCTTTTTA
TATGCCAAGGAACGGGCACATTGTGTAGCTGGGCGTGTCTCATAAGATGA
AAAGTAAACTTCCCGTTAAAAAAAAAAACCCCAGAGGGAACACCAATATC
TTGTATTTTTAGCTAATTTTTGGTGAGTGCCTCACATTCCAAAGACACAA
GAGGTACCGCAAATTCTTGAAAAAGGTTTCTTTATTCCATGATTCTTATG
AATAATATCCACGGTCGTTCAATAATCGTAAGTGGTCTAATTTTGTGTGT
TGTGCAAAATACCTTACTCTGATTTTGTTACGTACAGAAATTGAACTTCA
TATTTTGTTCAATCTACTCTTATTTTTGTAGGCACACAATTGAAATCTAA
TTTTTACGCCGTTTGCGCTTCTTATCAGCCATTGACATTCTACAGGTCCT
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TATGTTTAAAATGAAGAGAAAAACAACTTTATATAGCTATCAACGGATGT
ATTATGCTTTATTAGTGTGGCAACTAGGAACAACATAATTTGAAAGTATA
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AAATATAAATACTTCCAAATAGAGAGGTTGTGTGGTTTTAAAAGCGAATA
ATTTATATATCCAGATGTTACCAGAGCAAGAAATACAATACTATGTCGTG
GGTGTTGTTTTAAAAAAAAACCACAATAATAATAATGCATTTTCCTTGAC
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CAATATAGACACTGATATTTGAATAAATTAAAGTAATTTTCTACTGAATA
TTACTATGAAATGTCTAAATTTGTATATTCAATTTTTTTATATTTATTAG
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AACATATTTTTAGTTCACTTTAGGGCCAAATTCATAATACAATTATGCAA
TATAAATATATTTTTTCGATAGAAAGTAAGGTCCTTTTATTTGTTAGTCC
CATTTTGACATCCAATTGTTCACTATTTTCCTTAATATTAATGAAAAAGG
GTTTTTATTGTTATAAAACATGGTTGTCTAGGCTCCCAAAATGGCCGACA
TCCACAATATCACGGAAAAACACTCTATACGATATAATTTTGTTAAGAAG
ATTAAGTATTATTCATATACATTAAATATTTGTATGATATATATTAATGT
AACTAGTTCCAGAACTTTAGTAACTGATGTAACTAAGCATTTAGTTAAAA
TAGTGTGAACATATTTTGATTTCCAAAAAAGGAGGCACTTGGCTTAGGGA
TAAGAAGAGATTTAATATTTTAGAGTCTTGTTTAAAAAAAAGAAGATATT
TTTGATCTTGATTTTGAGCACATGAAGTGGAAAAAATATTTGATTGGTGT
TCATACAGCCGTTCATTTCTTCGTACTTTTTTATTGTTCTCAAAATAAAT
TTTTTACCCTAGTATCAAGGGTAAACCAAGGGGTGAAAGAACGACCACAT
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CTGAGGGTATCAAAAATCCCACTAATAAAAACTACGATACCTCCACTAAT
TCACAAATTGCATCTTTAACAAGAAAAAATGATTATGTGATGCCCTCAAT
TTTCATTTTATCATTATGACTAATCATGGTACTTTGTTGAGCATAATTTA
TAATTATTTTTTGTACTAATGACTACATCATTTGCAAAGCATACCAGACC
GTGCAAAAATACTGAAATGAAGGAATTAAACAATGATACATAATTTTAAT
ACATTTAATATCCAAAACAATTTTGTAAATATAAATGTTAATAATGATAT
TCAAGATTATTTATCTTGAATATGACCGTCGTAGGTAGCAATAGCAGCTT
CCAGGCAGCGGCGGAATTTGCTGCAGCTACTTTTGAGGKAGACTTACGAC
ATTAGCCCACTACTCATTAACATAGTCCTTGAAGGTTTCGAAATTTGGCT
GTAGTAATTTGCAGCCTTGGGACTCTACTTGGAAATATATACTATAATCC
AGAAGTTCATTTCTGGTGATTGGGGAGGCCAAGAGTTCACCAAAATAACT
GAAACTGAACTCAATGTTTACTTTTTCACCCTCTCTGCTGTCAAAAGGAG
TACTTTTTGGGTTTGTAGAGGGAAAACACCACACTCTTTGATGCGTCTGG
ATACGGTGGACCTTGAAACATTGACGTCATTGGCCATCTCCGKCATGGAG
AGATCTGGATGCTCTTTAAATGCTTTGACTACAGCTTCGGTAGTCAATTT
TTTTGGCCGACCACTCCTGGGAGCTTCTCCAAGATCTTCACCCTTATCCA
AACACTCCTAGACACGGTAAACAGTTGCCTTTGAGCCATATTTGGCCATA
ATAACGGTTTTTGGGGATATTCCGGCGGKAAGCAAGGTTGCAATCTTTCG
CCTTTTTTGTTCTTGCAACATGATCAAAAGCTCTAAAGAATTTGTTTTAA
ATTTTAAGTGTGTATCTATAAAGTAGATTTATATTAAAAGGTTAGAAGGG
GAAAATAATCAAATTGTTGTTTTATTATTTTCATTACGTTTTAAAAATTG
TTTCAAAACTTTTGCACGACCCGGTAAATCGTTCAAAATTTATAACGAGT
GATTCTTCAATATTAATTCAACTTATAATTTAATGAATTATAAACAATTA
TATTTGGGTTTTCTCGAGAATTTCGCCTATTAGAAAAATCCGGAGTAATC
CAAGGATTTTGGGAGAGAAACCCTTGTACGTAAATTTCCATTAAAAGTTA
CAATTCCAAATTAAAATGCAACAAGTAATAATTAGTTCCAACATCCTTTA
TAAGATAATTATTAATATATATTTCTAAAACCTCAATTGTTATCCTTGTT
GTAGATAATTAATTTTTTCATATTTGAGTAACAGTTATCAAAAAGAAATA
AAATAGGGATCAGGATTATTTAAAAAAAAAAAATTAATTTTTGGGACACC
CTAATGTGCTTACGCACTTTTTGAGAGGTTGCGATAGAAAATATTCTGTT
GAATCATAACAAACAAACGATTTCAATATAAATAAATGAATCCGACATGA
AATACATTCACACTAGTACTAAATGATTAAATAGAATTTGCATATACTAA
TTCTAAACTATACATAATACTTCATTTTGGTTTTATGTTTTAGTTTTACT
ATTGAATTTAGTATTTACATAAATATAAGATGTTAACTTGTTAGTTGATG
TTAATATTTTTATATTTACATCAAAGTCATTGTGTATGCAAGAACTTACT
CAAGGCTAAAATGGAAGTGGATTTGTGCGAGCAAACGGATGAAGTTATGG
TTCTATCTGAAATATTTGGAAATAAGCTTTTCGAATTTGATGAGAAACAT
TCCAAAGGTCAAATAAGTAACACAATCGAACTAAATGGATCCACAATCAA
AATTGGAGTTTCCAAACGCAGCATAAATGACAAGTAAATCCACATTTATT
TAAGATGTTTCTATAGAATAATAATAATTGACATTTGCACTGTTTAGTCA
TGAAAGGGAAATCCTTCTTTCCAAAGATTTGGATCACATTCCTCCCATAT
CACTTGTATTTGAATTTCCAGCCAATTATCCTTCGGTGTCTATGCCTAAA
TTTAGTCTCTCATGTTTATGGCTCAACTCAAAACAAGTAATTATTACAAA
TACAATATTAACCAGGAGAATAACAAATTGGACTTTTATTCAAGATACTT
CTTCTAGAGGAGCATTTGGAAAGCCTTTGGAACGAGAATAAAGGATCTGT
CATACTTTTCAATTGGATCACATTCCTTCAAAATGAAGTTTTAGAGTTTC
TAGATTTTGAGAAAGAGATTATAATTGAAGAAAAAGAGTAAATAACTCAA
ATAGGATTTCTTCTTAATTCAATTTATAAAAATGYATTTACAATTCTTTA
TTTCAGTGTTTCTTCCTTATTCAACACTCCCCTTAAATTCATTCAGGAGC
TAGAGAGCTATGACGTTTCCWGGAAGGAAGGGATTTTCCATGAGTCTTTG
TTTACTTGCAACATTTGCTTTCAAGATAAGTTCGGAAAAGAATGTGTTCA
ATTTAAGGGTACTTTATTCTTAGAGTAYATTTTAATGTTGATGAGGTACT
TTTATTTCCTTTCTTAATCTCAAGGCTGTGATCATGTCTACTGTAAAATC
TGCATGAGATCCTATTTTGAAACCAAAATACAAGAGGGCTCAGAGTCCGG
AATTGTTTGTCCTACACATGAATGCTCAGTTGAAGCACTTCCTACCCAGA
TTAAGGAGCTTGTATCTGAGAAACTCTACTCTGACTATGAAAATGGACTC
ATTGAAATGTCGTTACGAGGCATGAGTGATGTTATTCGATGTCCTATGCG
TCATTGTCGAGTTCCTACCATAATTGATATAAAGAGTAACTCTGGAGAAT
GTCCTTCTTGTAGATTTGTGTTTTGTTCCAATTGTTTGTGTACCTTCCAT
GGACTCAATCCTTGCAAGTAAGTCATTGTGTTATGTTTATTTTAATCAAT
TAAATTATTCTTCCAAGGGTTCCACTTGCAAAANCAACGAGAACTTATGG
ATAAATACAATAATGCTGATGATGAAGAGCGTAAAAAAATGGAAAAAATA
TATAGTCAAAAGTTTTTATTAGAATCTCAAAACGAAATTCTCTCTCATGA
TTTAATTAAGGACATATGTACGAATTGTCCGAATTGTTTTGCAGCAATCC
AAAAGACTGAAGGATGTAACATAATGTTTTGCACAAAGTGAGCATTTTTT
TATTTTTTTTAAATTATCCATTAGAAAATCATTTAATTTGATACTCGAAC
GTTATTTAGGTGCTCAACAGATTTCTGCTACATTTGTGGTACAAAATTAT
TAGGTTCAAATCCATTTGAACATTTTTCTGTTGTGCGTAGTCCGTGTGCC
AATTTACTTTTTGATTTAATAAATTATGAAGATGAGCTGGAAGTACCTTC
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