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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s227 | supercontig | LSalAtl2s227:164788..172918 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004323 >EMLSAP00000004323 ID=EMLSAP00000004323|Name=EMLSAP00000004323|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=337bp
MIVQNIFLLLLFVNGFHAENTLLNEDESKDGKVLSLFNVVTFPNDVCAGN
GARNGTCLPANECASQQGAASGSCASGYGVCCVFVIQCGSMSSANCTYIE
QTSISSAGSLSQNPCTYRLCRNNDDVCRLRLDFVTNILAQPFMGTAVANA
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LTFNLSPGSNANREWNIKATQFVCNDNDGVGGPPGCLQYFREPSGTVASF
NFDTSSTAIPEANNVLATPVTATNPSGVNRLCGRALNMITAMGSTTVCIN
FNEDEMTVTAAXATMXELAQIPGGTYGFWLDYEQKSC back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s227:164788..172918- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004323-700170 ID=EMLSAT00000004323-700170|Name=EMLSAT00000004323|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8131bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s227:164788..172918- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGATCGTACAAAATATTTTTCTTCTCTTGCTGTTTGTGAATGGATTTCA
TGCAGAAAATACTTTGCTAAATGAGGATGAGTCAAAGGATGGAAAAGGTA
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ATGCATTTTTTTTATATATACAGTTTTATCCTTGTTTAATGTTGTGACCT
TTCCCGTAAGTATGTACATATTATCTAACAGCTATTAAGCAGTTCTACAC
ATATAAATGCCTACTCAACAACTTTGTACCCATTCTCAAATAGAATGACG
TTTGCGCTGGTAATGGAGCTCGAAATGGAACTTGTCTACCAGCAAATGAA
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AGTATGCTGTGTTTGTAAGTAGGTCTAATTCACTTTTAATAACAATTCAA
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TAGTAGAATTGTATTGATCTTTAATATCCGTTCAATCCCTAATTCTAATT
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TTTCAATAATGCAATAGTAAAATACTTCTGTTTATCAATATTTTAATTAG
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CATCATGCAATCTTTCCTCTTTAAAAAAAAAACCAGAAAAAAGACCCCAA
ATCATCGGGCAATTAGTCAAATAAATCAATCATACCAACTGCTATTTATA
TCTCAAGTACTCCCATACAATCATTGTCATAATACCTCTTTGAAATGAAT
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ATTGCTGTATTTCATACTATGCATTTCCTACATAGTATTTTATTCGATAT
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GGAATAATAAATTGGGCAATATATATATATACGACAAAGGATCAACCAGA
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ATTGAGCAAACTTCTATCTCTTCAGCAGGATCTCTAAGCCAAAATCCTTG
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TCCTTGATGAAGTTATTCAACTTTATTTTCTTCTCCTTTTGAATCAGTTC
TAGTACTGACAGTCTGAAAGACCAACAACATTAAGGACTGGTACCCTAGT
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TGATAAATTATTACGGTGGGCAATCCTTCGCACTGGATTGATATGCATAT
GTCAGGAGMTTTCAAAATGTAGGAGAGGGYTAAATGAATAGCTCTTCATT
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AAAACCCTAGATTTACAAAAAGTATCTATTTTTAAAAATTAGTTCTTCGT
TGAGGTGAACTTCGGAACTTATTTTTCAGACCTTCTTTCGATTTTACGAC
CAGAGACACATCCAAAAGCTTTAATGTTGGCAGGCCTGATACAAAGATAA
ATATGCTGGGCCCATTAGCTACTTACTCTTTCTTTTTTTTTATTGGAATT
ATTTTAGAAAATAAAATGTGGGACCATCTTGAATTTTTTTTTATAGAAAG
AAATTTCAATTTCTTACTTATTTTTTTCGACACATTTGCTACCCTATAAA
ATATTATTCTCTAGGGGCGAAGGATTCCTTTGCTCTTGCCACTACGCCAC
TGCTTCCTTACCTTACCCGACATTCTTCTTCCTTGGTTGGATATTTTTTT
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TTTCTTAGCTTTGTAGGAATAACGATGACGTTTGCCGTTTGCGCCTGGAC
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TGCTGCTGCTGTAGGCGTTGGCGGATCTATAGGAGATTGCATAGATGATA
CAATGACTCTTTCATCACCTGGAGGTCAAGGGTCACCTACTATTTGTGGA
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CAAAATACATACTAATCGTTTAATTATATGTATTAAATAGTAATTGTAGA
CATGTCCGATCTGGGATGTAATGAATTGACATTCAACTTGAGTCCTGGAT
CCAATGCTAACAGAGAGTGGAATATAAAAGCGACTCAGTTTGTTTGCAAT
GATAATGATGGAGTGGGAGGTCCTCCAGGTTGTCTACAGTACTTTCGTGA
GCCCTCTGGTACGGTTGCATCCTTTAATTTTGATACTTCGTCAACAGCAG
TGGCGCCAACTACAACACACTTATCCTCTCAAAAATATAACGTGTGCTTT
AGGTTTGTATTTGAGAGAATACTTTTCTTTTCCTTTGTGCCATCATCAGG
GGCGTCCACAGGATTATAAATATATATATATATTTTTTTTTTGGGGGGGG
GGGGGGGAGCTTTGTTCTTGGATTTGATTTTTTAAATCCGAAAGTTAAAT
TTTTATAATAAAATTTGAACAATTATTTTTATTAGATAAAATATTCGAAA
TTCCACAAATGTTAACATAATTTTTTTTACTATATTTCAAAGGTAAAATT
TTTTGAAAAAAAATCTAAAAAATTAATTGTTTTGAATAAATCATACAAAA
ATCCATAGCTATTCAAGAAAAATTCAAAAGTTCACGTAAAATTTAATTTT
TTGGAAAAAAATTTCAAATATTATTATTTTTTTAAATAAAAAAAAATAAA
CAATTCAAAAATCCACAGCTGTTAACGTAAAGTTATTTTGAAAAAAAAAT
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ATATCTTCAATTAACAACATGGCTAAATCCGTAATCGGCTCCAATTGCAA
CACAGATTGGATAACAGTAATTTGTTCAAGATTTTGAGTATTATAATTAG
TCTTATGTTTCTGTTTTTTTAAGATTCCAGAAGCAAATAATGTGTTGGCT
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GGCTCTTAATATGATAACTGCTATGGGTTCTACAACAGTCTGCAGTAAGA
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AGCAGTTTAGCTATTAAATATATACAAAGGTGAAAATCCAGCGGGGAATG
GGCATGTTAAAAAAAAAAGGAAAACTGAAAATCCTAACAATTCGAAGAAT
GTTTTGAAGGAGAGAAAGAATACTGCTCATGACGTTTCATTAGATCAGCT
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TTTGCCAGTATTACTCCGATTTCAATCCCCAATTCTACTTTGAGTCCAAC
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TCCTTTGTTAAGGATAGTACAGAAATTCTACTTCGCATCCCTCAAAGATA
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TTGGCAATTGAAAAAAACTCACACGCTAAAAAAATGCATAGAATTTACAA
CTTTACTTATAATTGTTTCGAAATTTTATAATTTCCATTTTTTTTTTTTA
GGTATAAGCACGCCATTTATTCTCGGAGTCAATTTTAATGAGGATGAAAT
GACAGTTACTGCGGCGGYTGCAACTATGAAWGAATTAGCACAAGTAGGTT
TTGTACATAAATTCAAAATAAATCTCTCTCTACTCTTTTATACTTGACTA
AAATACAATATGAATTTACTATTTCAGATACCTGGAGGAACTTATGGTTT
TTGGTTAGACTATGAACAAAAGTCCTGTTGA back to top
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