EMLSAT00000004472, EMLSAT00000004472-700319 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000004472
Unique NameEMLSAT00000004472-700319
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s232supercontigLSalAtl2s232:350320..360099 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000004472 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000004472EMLSAG00000004472-687238Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000019449EMLSAE00000019449-728377Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000019450EMLSAE00000019450-728378Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776711auto776711Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000004472EMLSAP00000004472Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000004472

>EMLSAP00000004472 ID=EMLSAP00000004472|Name=EMLSAP00000004472|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=77bp
MVKYGIYNIGEQPAVDAQVKEICSPEDSYDAASGNTSFNLYHIPPYSYNT
HTLIVKLKKFGFFSFTSKVYFNFYKKH
back to top

mRNA from alignment at LSalAtl2s232:350320..360099+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000004472-700319 ID=EMLSAT00000004472-700319|Name=EMLSAT00000004472|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=9780bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s232:350320..360099+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGTGAAATATGGCATCTACAATATTGGGGAACAGCCTGCAGTGGACGC CCAGGTGAAGGAAATTTGCTCACCTGAGGACTCATATGATGCTGCGAGCG GAAACACGTCCTTCAATTTGTATCACATTCCTCCATACTCTTATAATACA CACACTCTTATTGTGAAACTCAAGAAGTTCGGATTCTTTAGCTTCACTTC CGTGAAGATAAATATCGAGTTTCTGACGAGGCTGATGATATTATTCAAAT TGACGCTTCTTCTGATCTACATCAGGGAGTTATTATTTCCCTAAAGAACT AAGACAAACAATTCTCCACTCACATTTTGGACTGGATTGCATTTGCTTCC CCCTCCCCTTTAGCGTTCCTTTCATGCTCTGGTACTCTAGCAAGTCAAAA TATGAGAGCATTATTCCAGGATCCAATAGGGATTAAGTCAGCAAAATATT ATTTTATCCTTTTTTTCCTTCTTCTAAAAATACACTCACGCCCATTGTTA AGTACACGAACATATTAAGCTCAACTAATAAGTACTTATGATAAACTTTG ATGAAATTTGTCTGCTTTATTTACTCACAACATACAATAAGTAACTTTTT CATTACATTAATAAAATATGATTAACAATCAAAGCTTATATAGAAACATG ATTCAAAAATAAATTTCACCTAAATAGAAGGAAAATAACTCAATAAAGAA TAATATAAGTCACAATGAAAAATTGCTTTGGTAAAATACATTTGTATTCA TACTCTTCTTTTTTATTATTTTTGTACGAATATGTTGTAGTTAGAGGTAT ATAGACTTGTATATTCTAAGCATTTACACACTTTTTTTTTATTGTAGTAG GTATTCTATACAGTCTTTTAATTTTTCAAAATTGTTGTCTTTATTCTTTA ATTATTTGTAAAGAGTATTTAAGTATTAATGTTTACAAGAATGGATATGC TCATAAGAAAATGAATATTTTACACTCGTAAAAATGATTTTTAGAAGGCT TACGTGATTTTTTTGCATGAAGCATTCAAAATAGTAATTGAAGATGTGAG ATATAACCAGATTCTTTGACTTATATATATACATATACTTTTTCAGATCA AAGATTTCCGAAAAATGCAACGAAAGAATCTGTATTGAAACATTTCTCCG TGCGATAACTACTCCTTGGGAGATCGCAAAGCAGCTAGGAAAAATAGGGC GACCGTTCACAATGTCAAAAGAAGAATGTAAGCTAAATAAGACGGAATAA ACATCTTACTTTTGGAAAAAAGCCTAGATTAAACCCTAACACTGTAAAGG AGGATGTCAATGCCTCCTCACTGAAAAGTATACGAGCCCATGCATGACTT TCAAAATATAGAAAAAGTGTCCTCGGGATGTTTCGCTCAATAAATCCAGG CAAAATAGTTGTCATTGGAGTAAAAGTGTCTGATAGAAAAGTTATGTCCA ATACTAAATTAAGACAGGAGGAAAAGTGGTTACTGATTACATATGAGTCC TTTTCCATATTTGTTTTCTCTGTACTCGTGACAATTACTCCAATAAGAAC TATATATAACAGTAAGACGGTGCTCCTTGTCKCKCCGCTATWAAAATACA GGAATGCRGCTSCCGCCAATTCAAAATTTATTGGACAAGTCAAAGTTAGT ATCTCTTAAGCCCAAGAATTAAAGTTTTTGGCCTCGTATCAAGGCTGTTC TAAAGGTCAATAAAATTAATGGATAAACGAATGTATACTCCTTATAATTT TTGTTAAAAAAAAACGATTGGGTTATTTTTTATGCTAAATATGTTCCAAA ACAAAAGTTAAATTTTGCATTTCTCTCTCCCCACTCTGGATTTTTAATTA TACCTAATTGTAATTATAAAGAACATTTGTATATTATTTACAAAATACAA TATTACACAATATGTATCCAAGCTCATTTTTGCAAATGAGTAAGAGCAAA TCAATTTTCTATCAAAGTGTCAGGGTATCAAAAATCGTTATGCAGTTATA AAAATCTACTCAGCACTTTTTTCAATCAAATTAAATCAAAATACTTGAAA TCTATCAAAAAAAAAAAAACTATTTATGAAGCGAGGAGCCCTTTTCATGT AAAGAAAAAAGGAAAATTGCTTCACAAAGTTTTTCAATTTCTAACATTTT GTACTAAATTTTGATTAATTTTGGCAACTTCATTTCTTCAAACATTGCAA AAATTGAGGCGCTTGGATGACCTAACGAGAAAAATAATTAAAAATTGAAG AAAATAATGGATTTCAATAACAATGGTGGTCTGATAAGAGCAAAAGGTGA GCTGGTTAAAAACAACAACTTAGGTAAAATGCAACTTTAAAGGGATGAAA AAATACTCTTAAAGTAGAACATTCAAAGATTAAGATTACCCAAAGGCTCA GTATCCAACGATCCCAAGATCGTCTTAAAAACTGTAGACCCAGTTTTTTT TTAATTATATAAATGCAAAGACTGCAATCGATAGTTGAAGAAACAGTAAC TCCACCTATGNNNNGAAATAATAGATACTCTACTTCGGGGATCAGAGTAA GATCCATTTTGAAGGGAATATATGGGCAGTGACACTTTAGAATACTTATC TACTTTAAAATAATCATAAGTCAGTTGGTTTATCAGGACTCCCTAACAAA TTGTATAAGAATTTTGCTTCTGACTTAGATCCTGTCCTTCAGGGTTTTGC TATATATTTTACAGGTTTTGGGAAAGCGTTTGACTGGTATCTTATAGTTA TATGCTTAGCAACTAATCAGAGATGAATTTCTTCTCTGGTTTGTGATTAT GATTGTCTTCTCTTTCGTCGAGCTCCCTGAAAAATAGAGATAGGAAGGMA CTTCTCCTGGTTACATAATACAAGAGGCTGTAGATTGCTTGTCCCTATTT CTTATTCTTAATGGTAGTCAATAGTCTACAAAAAGGAATTAATGAGAAAT TACCAGATAATAGATTTCAGATAATTAAACAAAACTTACAAATAATTTTG GTACGCCAACAACCTCACACTGATCTTTGAGAGAGCTTAGCCTAGTCTTT AATTAAAGCTTTCATAACACTGGATAAGTTAAAAGATGAATTAGGTCTAA GAGTGAATCTCAAAAAATGGAAGCTCTTATGTCTAATGAACAACTATTTT GGGGTTAAGGATTGACGTTTAAGGGGAGGGGAGGGCCTGTTATAGAAAGA AATGAGACTAAAGTAATATCAAAATTAGAAAATCTGAAGATTATTTACTC ATCCCTCCACCTAATTCTCTTAGACTAGGTAAAGGTTTGGAATTCTTTAT TCTAAAGCTTATAAATCTGCTGATATTAATTCCGTATAAAGAAGACGCGT GTCAAAAAATAAATCCTGTTCATATTCTTCAGGAGTAAAATAAGACCGTT CATATCAAAATGCCATTCACGATTGGGGGTTAGGATGTTTTAACTCTGAA TTTCTATGGAAATCCTTAAACTACTCGTGTTTTTCAAGGCTCTTGAAAAG CGAGGACCTTTGGGCTCTAAAGATAAAAAATAACTGCTGTTTCTGGTGAC AGGATATCAGTGGAACGAAATCTTTCAAATGGGCCCNNCTTGAAAAGCGA GGACCTTTGGGCTCTAAAGATAAAAATAACTGCTGTTAGTGGAACGAAAT CTTTCAAATGGGCCCTGTAGAATTAACAAAAACAATAAGAACATTAAAAA AATTCTGGGCCACAATTTCTCCCTTATAAAAAGTCAAGATGGAAATTATA TTGAGGAATGATTAAATTCTAGCTACCAAATAAAGCCAACGTATAAAGAG GATATCTAGCAAGACATTCTCTTTGTAAAATTTATAGAAATATATCGGAG CCCTCAGATCTCTATATCAATGGAAGGAAATATCAATGTTCTAATAATTG TTGTATTTTTTTCAGGCATTTGTGAATTAAATATTCTTGACTCATACTTC TTATCAATCTGATTATTATTTTTTCTTCATAGCATGTAAATATTGAATAC AAATTACGGTGTTAGATCACTAACATAAAATTATATAATGCATTTTATTG TCAGCTGTGAGGTTTCTGCTTCTTTCCCCCTAATCAGTGTTCTAAATGTA GATTAGTTGAATTAGAATGAACTTTGTTTAAGCTGTGAACACATTTCAGC AATAATTGAAGAATAATTCTATACTTCGGAAAAGTTGGTCTATAATTAGC TAACTACCAACTTATTTTGGGCCTTTTTTGTCTTTTATTTTGGTATGAAA CGTTGCATTTTTTTTTCCATTAAGTTTGTATAGTAATTATTTATTTTAGA ATTCATGGATTGTGATTAATTTCAAATTAGTTGATATAAATTTATTCGAT CACTTGATTTAATATTATAATGTTTTCAAAGATTAGGTAGAATGATCTTG TCGGTATTTTATACATTTTATAATAGGTATGTAAACAACTTTGTAATTGA GAAATTTATAGTGCATTAAGGAAAGAGAAGGTGATGTAAAACAGTACACC ATTAAATTAAACAATTATTATAATTATTTTTCCATCTCAAAATACAACTT AATGTGTGCGCAACAGTCATAATTTCTGGAACAATCAAAAAGAAAAACTC ACTAAGAATAATTTTGAAAATGTTGGCTGCATAATTGTAAGTAGATATTT TAATGTGATGAATGAAATAATAATTCATTCAAAGTAATGAATATTTATTG AGCTTTTTATAAGAGTATGTGTGTTAAAATAATGAAAAAATGTCCATTAT TTAAGTACGTTTTAGAATTCGGAATTATTCATGTATTTCAAATGGAATGT TATATAAAGGGGAAAAAATATATAATTAAAAAACTTATTGAAATTAAACA ATCTCAAATGCCAATCAAAATATTAACAAACTTCCTACCAAAGTCGAATG AAAAAAATCAAAAATATATCCAATTCTAGTCAAAAAAATTATTTCATAGA ACTCTTTGAAATATAAATAAGAAAATTATCCACAGATCGATTTCTGGTGG AGCAAGGGGCACTTTGCCTCTTTACCAATTACTCCACCAAAAATTGACCT AAAAGACTCAACGACAAACGATAACAACAATTGAAGAATGTCCATAGAGC AATGAGTAATAGTTCTACTTTTCCATTGCTCCATTAAAAATCGAGCTCTT ATTTATAATGGACTATAATATTTGTCCACAATGTGAATATATATATAAAT GGTTTTTTCATTGGGGACGTTTCAATTTTTTTTCCGTTCGGGAAAAAACG ACTCCCTATTTCTTTTCTTCCTTTGAAATTTGAAAATTTCATTATTATAG ATTTAATCAGCGATTGCTAATCATCCAAAGTTATTATCAAAATAAACTGT CATTTTCATTGCAAAATTATTTTCAGTGATGACGCTTGTTTTGGGCTCAA TGGCTTTGTTAATAAGCAAAGTAAGGATTATTAATCAGGTAGCAATCACC AAGTGCTTCATGAGATATCATTGTATCGCGAAAAAATTACTGTTTGGTTT TGACTTCAAGCTGGGGCATCATTGGCGATATTTTTTCGTTGATGATGATA ATTGTCACGTTACTCTAAATGGAAATGGCTATTGCACCATGATTACTGTT ATTTTTGCCCCCCCAATTGCAAAGGAATAGATTTGACAAAAATGTGGTAT CAACAAGACGGTGTCACTTGTCACACAGCACACGTTATAATCGATTTGTT GCGAAGCAAATTTCGTGTGCACATTATTTTGAGAAATGGACCAGTTTATT GGTGCCTTTGGATTATTTTCTATGGAGTCAATTGAAGTAATTGGTCTACA CCAATAATCCAGTGACGTTAAAATAGCTTTAAGAAAAATATCGAAAGCAA AATTGCTGCAAATGGGTCAATTTATTGGGAAAAGTCTAGGAAAATTGGGT TCACCGATTTAACTTCTGTTAACGTGCTCGTGGTGGTCACGCTAGACAAA TCGTTTTTCATACATAAATGTATATGTTTATTATTTCTACTGAAATAATA AATTTGGCGAAATCTTTAACCGTTCGTGTATTATTTAAAAAAGTTGAAGC ACTCTTAATAAAAAATCCTATAAAATAAAAGTATAAGTATTGACACTTTA TTATCTCGGATTTTTGTGAAAGAACCTAGTTTAATTATAAAGAATAAATG ATGTGTAAGGGGGATGGGACTTTAGATAAAGAAGTTGTCGAGGCTAGTTC GGYTTAATTGACAGACCGACCCATTTCAAATGTTATATATTAATTAACAG ATAGCTCTAAATACTTCTAAAGTTATTTATAGAGGATATCGTTGAAATGA TTTACAAACTTTTGATTATTGGTATTATTTGAAGGATATTCAAAGTTGAG CGTGAGATGAGCCAAAGCTATAACTAAATATAACGAGTCCGAGTCAAATA TACTCCAAGATTTCATAACGAATTGTAATTTAATATATTAAATGTTTTAT AGTCCCTTAAATCTAATGAGGCATTCCTTTCTTATTTAAGGTAGGTATAC ATTTTCTTATCACTGAAGTGAAATATCTAAATGAGTAGTTATTGTAAGCT AAGAACAATGAAGGTCATTTGCAAAGAAGTTCATATAATATATGTGCATA AAAGTGGGAACTGCTTTTGTAGTTGGTAATCTTACCTGTAATAAAAGTTG TCATCATTAATTTTTCATTCTCGAAGAAGAAAATATCAAAATCATTTATC AAATATGAATAAGTAACTTTTAACCACTAACTATATATTTATTATACAAC TAATAAACACAGCTATTTATAAAATAAAGACTTAAAAAATTGAATTAAAT CCCTGGATTGCTACTAAAGGAGGTAAAAATGTATGAAGTTAATGACAAAG ATTATAAGTAGGTATTTGGCATATTGTCCTTTTTTGTGTCACCCTGATGT AGTTGATTTAGAAGGTATACAAGGATAACAATTGCTGCTGTAATAGTTAT AATCAAACTTATTATGTGATTTTTTTTACGGCTGAAAAAAGATGATTGGC TTACCTTTTCTCTAAGTATCTTGATAAACAGAAGCAACTTGTGTCATTTA TTTTGTTTTAATCTCTTAAAATAAGTTAGTTTGCTAATACTTTTATATTT TCAAAATAGAGGAGAATAGTTAATATCTTGTGGATTATCAGTATATGTAT ATTGTATACGTACTTTTTCTCAAAATTATTATTGCGTGGATAACGACACT TTTCACATCTCTAAGAATGTACCTATATAATTTAAAAAAAAGACAATAAT ACTAATCGTTTTTCAATGAAAAAAAACTGTACTTTTCTCAACAAAAGTAA ACATCATGGTCAAAATTTCCAAGATATTAAGGTACGCATAGAAATTGCAT GTAAAATACTAATCATACTCATATAATTATTAAATCTACATATATAACAT ATATAAAGACATACAAAAATACTTTGCATATGTATGTAAGCTATTATATC AACTGTTAAACATATAAACGATTGCTTTTATTCCTTTTGTTATCATAAAG AAGCACCTCTTATATAATATAAATAAACAATTTAGGTTAAAAGCTTACAC ATGACACTTTTATCTTGGATAAACGACAAAAAACGAAAAGACAACATATT TTGCTCGGTTGCAGCAACTCGCCTTAAGTTAAACTTTGTACTTATGACTC CAATACATTTAATTTGGAAATGTTCGTCATTGTGGGTAGAGMAAAGAACA AGTCACAGTCGGATGAAAACCCGTCTCATGCAAAGCACAATGTGTAGTGA TTAAAATCAGGTGTATTTTTTAGCTCGCCCAGTTTTCCAGAATTGGTTAT CTGAATAGTGAATTTTATTTTCCTAAACTGTTTTCATTATTATTTAACTC CTGAGTAGTATCCTTTTCGAATACATTCAATTATATTTAAAACTTGATTG AATATTCGTGTGTGTTCATAAAAAACGAAGAGTAATCTTGAAGATTTGTT GGAGAGTTATAACCCTTAGTTAGTCCTTGTTGGACTTAGAGTGGCTTTGA ATATTAATATTACAGTCAGTCTTGCCAATGTCCTAGACTAATTCCTTCTT CCTCTCCTCCCTTGTCACAGTTTCTTTAAATTTTCTTGGTTACTATGTTG ATTTTCGGTTTCTTTTTTTAACATACCAAAATACACACGATCTTCATCAT TAACTATTAACAATGATGCATACAAAATGTCATGTAAAAATACAAGAAAA CAATCCTAAATTTTTTCACCCTTACAATTAGATTAATGTTTGGGAGAATA GTAACTAGGCAGTCATTACGTTTTCAGCTGCAAACAGCCCCGAAAGGAAC AAAAATAAACCCAAATACCATTTCATATATAGGTAGTTGTACATATAGGC TGGYATTAATCCGATATCGATCTTCATTACAATTCAGACTCCATCAAGGA CTTTCACTTATAACTCCCATACAAACACTCATTGTTACACTTTACATATT ATACTTAGATATTATGTCCTCAAGGATTAAATGATAACGATAGCGGCTTT AGAAAATAAAAAATACAAGTGAATGCAAACTCCCAAATAGAAAAAGCTTT TTAGGACATATTTTATACACCTCTGACTATAGGGAAATAATACAATTTAT AACTATCATAAGAGATTTTATCCTCTCTATTTCTTCTCTAATTAGTTGAA TATTGTCAGCTGTCAATTTCCCCCAATTTTATATATATGTATAATGTAAC AAATTCAATTTATTTAGTAAATTTATATAATTATTCAAATATACAAAAAT ATGTAAATCCTTTTTGGTTGTGATTTAATGCATCCACATAATTTATTCCA TATACTTTTAATCACAACTAAAATTCAATAAAACAAAATACATTTAACAC TAAATTTAGACATTTAAATGTTTTTTCTTTATTTTTTCATGTAGGGGGAA AGTGAAGGGAAGCTAGTTGACATACTTAAGTTCCTACAATTGAGTTTCAG CACTTTCTTAAAATAACCACCTTTGAGTGTCGTTCAGGGTGATGCATATT CTGATGTCTGACACATAAATTATAAAAAATATTAGCTTACTTTCTTATAC CCTCTTATACATAAAAAAATTGGAAAATATTTTATTTTTTTAATCTATTA TGAGAGAGAACAGTAGCACTTGGGCCTTAAATGTTGAAATGGTTGAAAAT TATAAAAGATCATGAATCAAATTCTCTATATTTTTCGTAAATTGAATTTT GTTTCCATTATACAGATAAAACTACACGAAGTACCATTAACAGAGGAAAC ATCAGGAAATTAGCACTTAAATATTTTAAGGTTACAAATCAAAGAGATTT ACAAGTTCTGGAGTGTTGTAACTGAAATAGTTGTAGAGGCACTTCTCGAA ATTGAGATCCAATCCAGGAACGTCCACAGGGTGTGGGCTGGAGGGCTTAA GCCTCCCTCCAATTAAGGAATTTTTGTCGTTATCACTTTAAAAATATATA TTAAAAGTTGCTTGTCTAAAAATAAGTCATTTAGTCAAATACAGGGACGG CCTCAAAATTTTATATAAATTTTTGCAAAAAAAAAAAAAAATACGCCCTC CTCAATAAAATTCTGCGATCACCCCTTCAACCTTTATGGCCGAATACGTT AAATCAACCCAAGTAACCACGACCTCAATAAAATCCTGCAGACGGCCCTT CAATCTTTCTAACAATTTTTTTTTTTGAGTAGTCCATATTATCTGAAGTC CGTATTCCAATTAATCACATAATTTATATCAATTTTTAATTTTTTAGAAA GTTTATTTTAACTTCTATAAAAAACACTGA
back to top
Add to Basket