EMLSAT00000004557, EMLSAT00000004557-700404 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000004557
Unique NameEMLSAT00000004557-700404
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s238supercontigLSalAtl2s238:336521..351353 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000004557 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000004557EMLSAG00000004557-687323Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000019842EMLSAE00000019842-728770Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000019843EMLSAE00000019843-728771Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000019844EMLSAE00000019844-728772Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000019845EMLSAE00000019845-728773Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000019846EMLSAE00000019846-728774Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776535auto776535Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000004557EMLSAP00000004557Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000004557

>EMLSAP00000004557 ID=EMLSAP00000004557|Name=EMLSAP00000004557|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=476bp
MSLKLILPLCLFGLLASTFGQIDFGADDREEEDRFQKVIEELCKYRPKNE
YFRLSAESNCRDAVRCVGNDFRGGNTLAAVRCPSGLVFDLEQQTCDWASK
VTNCDELTRPRIALPNLKTDEPVCPDGNLQCGDGQCIDKFLFCDSKPDCA
DESDENSCSVEDDPNGAAKCDPSQCILPDCYCSSDGTQIPGDIEVQSVPQ
MMMLTFNGAVNIDNIRVYQNIFQDDLINPNGXSIKGTFFVSHKYTNYSAV
QDLHRKGHEIGVFSITRNEDIKYWSKGTYDDWLAEMAGDRLIIXRFAXIT
DGSVIGIRAPYLRVGGNVQFEMMNDQFFVYDSSIAAPLARVPVWPYTLLY
RHYSTNRAPLSLSFDTAWLVINKGFTKVLQEWIRNKLNTQSDVYFVTQLQ
VIQWMQNPRDVNSLRDYAEWKERCDIKGQAFCSLPNPCPLNTRELPGETI
RLHTCVECPNNYPWLLDPTGDGFSFK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s238:336521..351353-

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000004557-700404 ID=EMLSAT00000004557-700404|Name=EMLSAT00000004557|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14833bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s238:336521..351353- (Lepeophtheirus salmonis)
ACCAAGAAATCCAGAGTTACCTTATTAGAAATGTCACTCAAATTAATTTT ACCACTTTGTCTCTTTGGACTCTTGGCCTCAACCTTTGGACAGATCGACT TCGGAGCAGATGATCGAGAGGAGGAGGATCGATTTCAAAAAGTCATCGAA GAACTCTGTAAATATAGACCCAAGAATGAGTATTTCCGACTCTCGGCAGA GTCAAATTGTCGAGATGCTGTACGATGTGTAGGCAATGACTTCCGTGGAG GGAATACTCTCGCGGCTGTTCGGTGCCCTTCTGGCTTGGTATTTGATTTA GAACAACAAACCTGTGATTGGGCTTCAAAAGTAAGTACAACTTCATATTT CTTACTTTTAGTTATATGTATATTAAAAGTTTTCCATCACTGCCTGACAA CAGRGAACCGGTATTTTGAATGTCTACGTTATTTTGTCCTTAGTTGTTAT ATATTACGTACAAACCCTGTCATAAAAAAAAACAAAGGGAGAGGAAGGAC TATTAGTAGCCTAATAATACAGTAGCTCTTCTTACTTTTGCACTTATTTT CTCTCTCAATAGCCCGCAAATCCTGTTTTTCACGACTTTCTCTCAGCTGT AACCTTCACATCCTACAGTTAGTTACATAGATACCTATAATCAGGTCATT AACAGTGTTTCATCGTAACCTTGAATTAATAAAATCATTCAATCAATAAG CACCTTTTGAGAGCATCTATTTCCATTCTAATGCATTTATGTAATGTAAT CCTTTAATACGTCATGACGTAATTCTTTAGCGTTGCTGATTGGTCAGTGT ATCCAAGCATTTCACTCGCTCAAATGCACTTGCAGAAAAGGAACAATTAT CATATTTTTTTATTTTAGGTTTTTTGAACAGCTCATTTTTACCGCTCCTA ATAAAAGCAGTCTTATAATAGTATGATTGAAGAAAAAAAAAGAGCCTACT TGAATCAACTTTTTGCGAGCTCCTATCCTCTTCTCAACAGAGTTTAATTT TACCTTTATGTTCCATGTAGATATATACTATATGTATATGTAGGTATAGC CTCAGAAGTGTTAAAATGGAATAACACATTATATGTGTCCGTGATCCTTA TCATAGTAAAATGTATGTAGGTTACTCAGTGGGATTTTTAAAGAATGATA AAAAATAAGTAGATTCTATCTTTATATAAATATAATATATAATTGGAAAT ATCACAAAATTGTATATATATTTAAATATGACCTGTCTACACAAAATCAT GATAGACTGACTTTATCAAAAGTGAGACTAGACCAAATTTGTATTCTTTG ACAAATTACCGTCAATTAAAAAAATATCTTATTAATCCTTTGGTTTAGGT GTAAATTCCACTTAAAGTAACCAAAATTGATTGATTTCACTTAAAAGATC ATATCGGGGGCAAAATAAATATATTTAATCAAATGAAGGTTCTAAATAAT AGCTAAATTAATTGAATATCTAAATTAATTTCATAAATTTGAATAATAAG TAACCAAAATAGGTCTATAAAATATTGGGCTATATGTTGTAAAAAAAAAT AAAAAATCGATTTTCTAATTTTTTTAAATTTCTATGTTGACCTTCCACAT AGGTCCAATAATATTATCTACGACTCTTTGTCAAAGAATTATATATTTGT CAAAGATCCTTCTACTTTCCAACTATTTTTGTAACTTTAATATCGACAAA TCTTCATATTGTTTGAAAAATGATCCACGATCATTTTTTGTGATATATGA GAATATAGCAAAATTGATACACATTTTCTTTTAGATATAGGCACATAGAC CCTGATAATTGAAGGATTCTTTAGTTAACTTTCATAACTGACAAAAAAAA AAGTGTATATACTTTATTATACATACTAAAAAACGAGCATTTTCTCTTGG GTTTTCAACCATCGAAGAATGAAATAAAAAAAAGTATGTATTAAAAGATT AAATTTTAATTGCATCATAACTGGTTCTCTTGAAGAATACGAGTATAGCA GGTAAAGTCCGAGGACTCATATTCTATTCAAGGGGGAGAAAAGAGCGCAT CCTATCATTGAGCATTTTTAAAACTTTCATCAAATTATAGTTTCTTCCTA TAGGGATCATGAAGATTAATCACTTTACATATACAATTTACATGCATATA AGTGGACCTTTATCACAAAAGCTAGCTATAATATTTTTTCTTAATATTGA GTGTAGAGGATATTTTTATTTTTCGATGAGTTAGTATCAATTCATACCAA CAAAATTTTATTATTAACCTATTGGGTGTGCTTCAAAATTGCACTTAAAG TAGTCAAAAAAACTGATTGATTGTATTTGACAACCCATTTTTGGGTCAAA ATAAGCCTACGCAATCAAATTAAGATTTTAAACTATAGTTAAAAATGTTG GGTGTCTTCAATTATGCCGCAAGTTTGAATAAAAGGCCTATTATTTGGTT AAATATTTCTATAAAATATTGGACTGTGTGTATATTTGAAGAAAATAAAT AAGTTCTCCCTTTCTGGATTTTTATTCAAGATTTTTTTTTTTTTCGTTTG AAACATATCATATGTACATTMTCTAATTTGAATTATGAGATTTTATGGAA TACATGGTTTTTCTTTTTTTTGAAAATGGTTGTCTTCGATAAAGTGGCCA AATATCCCCTTTTCACCAAACATGTCTTCTCTTTACATCATGTCTCCAGC ATCCGGGGCTTTTTATAAATCCATAAAATGTCTAATTTCATTGAAGACAA AGAATTCCTGATAAAAATGAGAAGTACGGTACAAGTAAATTTATTTCAAG TACAAGTTGAGTTTCAATTKTTTTCTCACCAGCCCAAGTTCTTGAAAATT TACATTGATTTCATTTCGAGTCCTCAGAAAATAAAAGAGACTTGAAAGAG TATGTACTTTATATCCAGTTAAAAATTGAAACGACTTTCGAGTCCCACTC CCTACCTATGTTCAAAATGAACTTAAATAGAAAATATAATTGAAGAAATC CAAAATGTCTTCCCTAAGAAACAAAAAAATAAGATCGAAAAATATCTTTT GTATAAAAAGCAGGCTCCAAAACATCATGTCTAAACAACAAGAATCAAAA ATAATTTATTCTTAAATTTATTTATTTCAAAAGAAAACACTCTAAAAAAA GTGTTCTCTATTTTATAAAATCAAAATATGGTTGACTTAGTGTACGTACA AGCGTCACTGCTCTTAGTTTTTGTATCAAAAGTTGTCTGAAATATCGCCA TACCTTTGTTAAAAAAACATAATCTTATAACTAGGGTTATAGGGATTGAA TATTTTTTAGGGTGTGAGTTTTTTTATGACTGGTAACCTGACAAGGGACT CATTATTTATTTTTTCACAATTAATGAGACAACTTGTAAGTATAAAGTAG TCCTGAAGGATGGATAGTAACATATATTTGGTATCCCCCCCTCCCCCTTG AGGATTTTTAGTGAAGCTCAGAGTATGTTGAGCTCAGAATATAATTGAAG AACGAAAACAAACTAATACCTGCCTTTGTCCTTGCTAGATACAGAGTTGG ATTTTGTGTTTATTTCATTTCTCACATAACTGCTCATAGCTAATTTAGCT AAATATCATAAGAGCTAAGCTGTTCTTCTTTAAACCATTCTTCAAATTGT CAGGGTATTCATCTTAATTTTCGGGTTTTTTTTTACATACCGAAAATGCT CATGAGTTACAACATTACTTATTTTAACTATTTTATTAACTGTTAGTCAT AGCATTCCAAGAAAGGGAATAAGTTAGTAAGATGGTAACCTAAATACTAT GTATATATATATATATATATATACACTCCCCAGATGACTCACTCTTTCTT TCCATGTAGTAGTCAAATCTAGGATTTCTGGTGAACAATGACACATGGTT CTTGCACTTTTTGTTCAGTCTGTAATAGTGACCATGTCTTGAATATCTTT TATATTCCATTATAATATTATTCGTACAGTGCATTTAAACCACAAAAGTT TAACTCTTAATTATTACTTAAAAATAATATTAATATAATTGGATAAAGGA TTTAATAGTGTAGCATAGTATGTCACTTGTAGCTCTGATGTACGTAGGTA GGTATTTCATATGAGGGGAAGGGGTATGTAATTACACTGACCATTTATTT GCTTTGTTTATAGATGTCTACTAGTGTTGGACTGCGTTCTGAGACCTTTA TGACTTTTTGTAAACCAAACTTATTTGGTCCGTCAAAGAAGTTTGATTCG AAACAGCCTAAAAATACTAATTCGGTCTGGATCGCTTTTTCAAAAATCGT TATGGATCGATCTCATTTATGATTCTGTGTATACAGATTCTTTGGATTTT TTATTGATCACGTTATATGTGTTACAAAATGGGGGCTATTTTAAAACAAT TAAATTTTGGTCTACGGAGTCGTCCGGATCGAAATATGGGTTTAACCTAT TTAACTTTATTTCTGGGTCCTTAGACTAGAGTGAATATATAAGGACTAAC ATAACACTTCTAGTAGGTATATTCTAATTAGGGGAGGGGGTTGTCCCTTT ATACTGACCGTTATTATTTATTTTGTTCATACATACCTTCATATTCAACT TGAACAAAGAGGCCTGATCGTGACTTCAACTCTAACATAAGTACATGTCT ATTATTTCGTGATTATTATTTATTAGTTATTTAAAAAAATATCCTTTCGA CTACTGAAGCTTCCAAATACATTAAACATAAAAGAGGAATGGTTGCAGTA ATTGTGATCATTGTTTTCTGTAATTTATTGCAGTTAACATATGTATTATG TATGTATGTAAGAATATAAAATAAAGAGATGCTATTGAATAAACATCCTT GGTTAGTAATACATCTTTGATGTGTTTTTCCATGAAGAAAACCTCTATAA GCAATAGCCTTGCATCTTTTTCCCCCTTTGATTTAACAAAGCATCTGCTC TTTTTCGAAATAAATAAATGACTCTGGACTTGATTTGAAGCATATTTATT TATATAAATCTGTTATATTCTATTTACAATCAATGACTTTCATGTACATA GAATCACATGTATGTATGTCTGTCTCTATTCGGTTTGTGAGACTTACACT GTTGGTTGAACAAAGGGTGATTTCCTCTCTGTTGTTCATTCACCTTTTCT TTAAGAAATACATATCAGATAAAATCCATATCATTTCCGTTAAATCTTGT TTTCTTGTACATTTTATAGRATTATTATTTTTTAAAGAAGAAGATTGTCA TCTGTTATGCAAATCAAAAATCCATCATGAGTTATTTTTCTTTACTCTGT ATTCGTATATTTGTGACAGTCTTACCTCTTTAGCAAAATGATTTAATCTG TATTTTTTTGTCAGACTTCGATTTTTCTGTCCACCTTATGATTCTATTAG TGTTCTGTAGGCTAATTGGCTGAATTAGAATGAGTTCAGCCAATGCTTTA AACTATTATTATATGATAATTATACATTCGGGAAGAATTGGCTAACTACG AACCAGGGCCGGCATCAGACCACTGAAGTTGACAGCCCTCACTTGANGGT AAAAAGTTTAGAAAAAGGTCATTTATTATAAATGAGAAACCCAGTGTACA TGGTTTGGGATCCTTACAATCTATATCGCATAAGGCCTTTTAGTAGGAGA ACAGCTTTGATATCAATTACTTACAGGACTTCTTTTTTGGGGGGAAAGAT TGCGTGATAAAATAGAGGCAAGGATGGGTTTAATGGATTTTAAATTATAT TTATAGATTATCATATAAGTTCCTCTGATACCTATAAGAACATGATTGAT AATATAATTTTGTCAAATTAAGAGGATTCTGTGAATGTTAAATAAGGATC CTTTAAATGATTCCCCTGCTTTCAGCCATGATTCTATATGTAACCATGAA TTTAATTTTGCACATTCCAATGATAAAATGTATTATTTCCTTTTAAAAAA CTTGTTTGTCATTTACTTATTTATATTAATGAACCGGCTTAAATAGATAC CGTCTCACAATATACGACCTTAAATGTGTAACCCCTTTGATTGATTTGAT TTTATTATAATGAATCCTTACTAATAAAACAAATTAATTCTTCCATTTCC AGGTAACGAATTGTGATGAATTAACTCGTCCAAGAATAGCATTACCTAAT TTAAAAACAGATGAGCCCGTCTGCCCAGATGGCAATCTTCAATGTGGTGA TGGTCAATGTATCGACAAGTTCCTTTTCTGTGATAGTAAACCCGACTGTG CTGACGAATCAGATGAAAACTCTTGCTCTGTTGAGGATGATCCTAATGGA GCAGCCAAGTGTGATCCCTCTCAATGTATCCTTCCCGACTGTTATTGCTC TTCTGATGGAACACAGATCCCTGGGGATATTGAAGTTCAATCCGTCCCTC AAATGATGATGTTAACCTTCAATGGTGCTGTTAATATTGATAATATCCGT GTATATCAAAATATCTTCCAAGACGATCTTATTAATCCTAATGGCTGKTC CATCAAAGGAACCTTCTTTGTCAGTCATAAATATACAAACTACTCTGCTG TTCAGGTAAGAGATCTTCTTTTTCAAATATGTATATTTGCCTGGCTTTCG ACCATAGAGTAAGCAGTGTTATTAGATTGCAAAATAAATCACTGGATCGC CATTTACAATTTATATATATATGTATAGGTATAAATAATGTGTATCTTAA AAAGTTATTGAGTGTGATTGAATTCTCTTTGAAGAAGGGTACACCATATA TTTATCTATCAATGTACTACCGCTACAAAGAAATTTAGTTTCTATGAATA TAATATGTGATTATTGACCTTGAAAATAAATGTAAATCTTCACATTTTCT TAATTACGCATCATCAAATAAAATTAAGGCGAAAAAGTATTCATAAATTA TTCTTATGGAGGCGTTTTTTGAAGGCGATGCATATTGGATTTTTTTTGTA TTTAATAATATATTTTTTGTCTTTCCCCTACAGGATCTTCATCGTAAAGG CCATGAAATTGGTGTTTTCTCCATCACAAGGAATGAAGACATCAAATATT GGAGTAAGGGAACTTATGATGATTGGTTAGCTGAAATGGCTGGKGATCGA CTCATTATTKAGAGATTTGCAAAMATTACTGACGGCTCAGTCATCGGKAT TCGTGCCCCTTACCTTCGTGTTGGAGGAAATGTTCAATTTGAAATGATGA ATGATCAATTCTTCGTGTATGACTCCTCTATTGCTGCACCACTTGCACGA GTTCCTGTTTGGCCATATACTCTTTTATACAGGTAAAACAAGCAGAGACT TCTAAATACATAAATCTAGTCGAGTTAACCTTGCCGACTATGACCACATT TGATACAAAATCCTATAGCCCCAGGGCTCTAAACTACAGATAATAATAAA AAAATGGTGCAAAATCACCTGTTTCTCTTGAGTCATGTATTTAATGTTCA AACCCATCGGTAAAAGAAATTACTTTTCAAGGCCCTTTTAAATTCAAATT GCCCTTAACTCTTTTTTATGGTATATATATATATATATATAATAATAATA ATCATCATCATCATCATGCTGAGATATCATCTTCAAATCTTTTTATTTTA TTTTTATTTTATTCAAATTGTATTTTTTTTTTGATAAAATATAATTTAAT ATATATGAATTATCTTCGAAATTGTTTTGAAAAAAAAACAATAGATTAAT ACACATTTACTATGATAGAATGAATTTCAAAATACTTAGATTCATATGTA AAACATGGTATATTTTCTTTCAAACGGTTCCATTATTTCTTGACGGCACA TACTCATAGCATATTTATAGAAAATACATTTTTTATTAATGGAATGTAAT GTGTTAAGAGGAATTTTTTGAAATATATGTGTATTAAAATATATATATTG AACAACTTCAAGGTCAAATACTTACTTTTATATATATATATATATATGTA TGAATAGACACAACAAAAGATTATGGGATGGAAATGAATTCAATACCCAC ATAAGCCCTTAGTCTGAACCAACTCTCAGAAGATGATTCAAAACTTCCTT TAGCTATGTACCTAATAGGTATATCAACATACTGATATTATTAATTATAA ATTCATGGTGTATTGTCCCTTCTTAAATTTGCAAGCTAATGAGTTCTCAA GGAAGTGTTTAATATTGTATGATGTATCATCCATTGTTAATTTCAAATCC TCTCTTTCTCCTCAATTAGAATGCCACACAAATGCCACGGAAACGGAGGT AATTGCCCCTCAAGAAGTCATCCTATTTGGGAATTACCCATCAATGAGTT GGATCGTAGGGATGATCCTGGATTCGACGAGAATCTCTCTGGTTGTCATT TGGTCTCATCATGCTCAAATATCTACACTAAAGAACAATTCAGAACACTA TTGGATAATAACTTTGAAAGGTAAATATACAAATTATATATTATAAACGT TAGGGATGTATAAAAGTTCTAAAAATTCGTCCTAAATTTTAAGGGCCCTT CCAAATGAGACATTAAAGTCGTCCTCTAAAATATTATTTATTAAATGATT 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TGGCATAAACCTAATAAATAGATATAAGGGTTAGGGTGGATGGGATTATG AAATGATTACCCTTTTGTTGAATGACTTTACACATAAATAGTTTGTAAGG GTTCTTCCTCTTTTAATGCATTTATATATGTTTGTATTGGACTGAAATGC CTGTCGTGAGAACACTAATTCTAATTACATGCAATTTAAAATGCGATTAT AGGATTATTTAAAACATATGTTGAATGTTCACACTACTCATCAGATCTTT GTCTTATAAATATGCCGTTAAATATGCAAATGAAAACACGACTTTCTAAA TACTGGCATGTATATTAGGGGGGTTTGTTTCTCAACTTTTTTCAAATTTC GATTACGGCTTGTTCAGAAAAGTTGTCATGTAGTAAGATATGCGTGCTAT ACACGGATCATCAAATTGTCTAAACTTTTTTCTCTTTTTTTGTTCCACAG AACAATTTGGAAAAAAACTTTTTTTTACCCCTTTTATAGCTTAGAAACAT GTCAATCATAAAAACTGTTTGTACAAAATAATTAAAACTGTCTTCTTAGT GTCTATATTGACTAAGTAAGAGGTTTTTCTTTTTTTCATTATTTGATCGA GATGTGCTACCTGAAGATGATTTCGTAGGCCAATGCAATTTTTTATTGAT CATTTTCATACAATAGGACAACTTTTCGACACTACCCTCAATCAAAAATT GGAAAAATTTGTTAATGAAACCGCTATTGTGTACATAAATAAGTCAAAAC CTTCAGGGATGAAGGTCTCCATATTGTTAACAATGATAAAGGTGTGTACT CTTAATTAACATCGTAGACATAATAACAAACCTTAATAATTAAATGAAAG TGGGGCGGTTTCATTGGATAAATCAATCATATTTATCTGAAAGAACAAGT ATGTAGGGAAAAAAGAAAGGGGATTGTGGAAAACCTACTTGGAAGTCATT 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