EMLSAT00000004693, EMLSAT00000004693-700540 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000004693
Unique NameEMLSAT00000004693-700540
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s246supercontigLSalAtl2s246:281893..300258 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000004693 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000004693EMLSAG00000004693-687459Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000020474EMLSAE00000020474-729402Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020475EMLSAE00000020475-729403Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020476EMLSAE00000020476-729404Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000020477EMLSAE00000020477-729405Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775792auto775792Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000004693EMLSAP00000004693Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000004693

>EMLSAP00000004693 ID=EMLSAP00000004693|Name=EMLSAP00000004693|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=193bp
MSCRSISADVTPDTETVNPKELLHLLPLEDNNASDPRTDTLDFLYISEDF
GHLLSPPDVSLTSISPGEDDRTVAGETPSSHASLILVSPTSANSPSXPPT
PCSSMATASLTQTTITTTTTACSKSTNLSRRRKCRTSPTSSSFSRSSNNG
NNMNNNNNNNIVEYEGRGSVDGKELTHIKKKKESILIYYQGCL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s246:281893..300258+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000004693-700540 ID=EMLSAT00000004693-700540|Name=EMLSAT00000004693|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18366bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s246:281893..300258+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTCATGCCGTAGTATATCTGCCGATGTTACACCTGACACCGAAACCGT GAACCCAAAGGAGCTCCTTCATCTCTTACCTCTCGAAGATAACAACGCCT CAGATCCACGAACAGACACCTTGGATTTCCTTTATATTTCCGAGGACTTC GGTCACCTCCTGAGTCCTCCTGATGTCTCTCTCACCAGTATTTCTCCTGG AGAAGATGATCGTACTGTTGCGGGAGAAACGCCATCTAGTCATGCATCCC TAATATTAGTTTCTCCTACTTCAGCCAACTCKCCCTCAATKCCTCCCACG CCATGCAGCTCCATGGCCACGGCATCACTTACTCAGACAACCATTACCAC GACGACCACAGCTTGTTCCAAGTCCACAAATCTCTCACGTCGTAGAAAAT GTCGGACGTCCCCGACTTCATCCTCATTTTCCCGCTCTTCCAACAATGGA AACAATATGAATAACAATAATAATAACAACATTGTGGAATACGAGGGACG AGGCTCTGTTGATGGTAAGGAATTAACACACATTAAAAAAAAAAAGGAAT CAATCCTTATTTATTACCAAGGGTGTCTTTAGGGGGGGGGGGGTAGAGAG TCTGTAGCCCCATAAATCTGATAAATTTTGCATCACTATCTCTATAAATA ATTATCGTCTTGACAGAAAAAATTTAAATGTCAAAAATTCCTAACCAACT TTTTTTGTCTCTTACAAAAAAAAACAAAAAAACTGATAAACGTAGAGCAT TTTTTAGAAAATGATATTAATGAAATTGTATTTCTTCTCTTTTTTTATGG GCATATTGACGAAGATGACAAAAGTAATGATGAAAGTGAAGACAGTGATG AGGAGATTTTAAATCCCTACTGTTCATGTCTTTGTAATTGGGTTTGTTAT AATGTCCTGATAAAACATTATCAACATATTGTTTTAATTTAGGGGATAGG 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AAGTTTTTAAATTTAATTTTTTTTTTCCATAAAATTTGATTGTCTGTAAA TAGTTATGGATTTTTTTCAATTTCTCCAAAATCTAATATTTAATTTTTTT TTCAAAAAATCTAATATTTAAAATTTAATTTAAGAAATTTTTATCCAAAA AATTTCAGTTTTTTCTGATCAGCTCTAGATTTTTGAAATTTTTTTCAACC CAATTTAATTTCTTAGGAATAGCTATGAATTTGAAACTTTTCTCCAAAAA AATTCATGATTGAAATTTAATTATTCATATTTTTCCAAAAAATTTCATGT TGTGTGAACATCTCTGGATTTTTGATTTTTTTTTAAATTACCGACGATTT TGAATTAATTTTACAAAAAATTTAATTGCCTATAAATGACTTTGGGTTTT TTTTCTAATTTTCCTCGAGAAATTTAATAATTAAAATTAATTTCCAATAA AATTCATATTTGAAATTTTTTTTCAGAAAAAGTTAATTTTCAACTTTTTC CCAAAAAAAATAAAATCCGTTATATTATTTCAAATTTTGTTCCTTGTGAT AAAAGTTAATACGATTGATGAAGTTTGAACTCTTTCTACTAATATTTAGA GGCAATCTGCTACGTTGCAATATTGCAAGTAAAACGTAAATTTTTATTTA TTATAGCTTCCAAGGTTATTTTTTTAAATAATAAAATCATATGTTGTTAA ATTCACATAAATCTTTTATATATTTTCTAAGAATTTTGCTATTGAGCGTT TTCTCTGACATATTAATTGAAGGGAACGTCATTTAGGAGCTCAAAGTTGA TATTTTTACTATATACAATGAACATATTTGCACTAAATCTTCATTAAACA TAATCAGGAACAAAAAAGACTTAACACCTCAATTGAATACCACCGGGCTG TCCATTGAAATCTGAACAGTAAATAATTTATAAAGGTTATGAGATTTACA 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AATTTCAAAATATTAAATTTTCTAGTAACAAGCAAGAAATCATTATTTTG TCTTCGATTTTGTCGTTTTTAAAGATACCGCTAATATTTATAATCAAAAC AATTGAAACTGACTATTAAAATATAATGCAACCACATCTTTGTATAAAAA ATCCTTTCAAAACTCGAGTTATGAGCATTTCTATATGTGTAAATTTAAAT ATGACGCTTGGAGTAGATATGACTACCTCTCAATATTCATAATAATGGTT CAAACTTTGGTATTTGTATTTTTTTAAGCCTTCAAACTGTTTACTTTTTC ACACAAAAAGTTAAATAAATGACACTTTCATAAGGGTATATATGGAATTA GTTTACCCTGCTTTTGCCCATTTTGAGGGGGTTATTGGAATCGGTTGCTA CTTATCGTAAAAATAGCATTAGGTTAATATTAGTAATACAATTATCATGT TATGGATACAATGTATATTACATACATAGATAGACAGATATATATAAACG GAATTGGCCTCTACTAAAATCAAAAAATCAAAACGCTGTTTTGTGCAGTT CCTCGTTTTCCGTAATCCCATCTTTTGATGAGCAATTTCGAAATTTTGGA AACAGGCTATGGGGAAATTTTTTATTTGTAAAAAAGTAAGTTGTGTATTA TATGAGAGCAAGAGATTTGGTTGATCAGACTCACCAATACGAAACATATG AGTAAGCACTCTACAAAAAAAAAATCCGGCCAAGTATTCAAAGTATTTTT TAGGGCTACGATTTTTTTTTCATTTAAATGAAAAAAAGGATTAAATTATG ATGTATCACTTGAGAAAAGGAACTTTAATGAAACTTTTGAAATTCAACAA CATAACTTTAAAATTCAAACTTCTGAATCCCATTACCAATAGAGAATGTC GTTAAAAAAAAGATTAGTCGGTAATTATAAGTGTAAGTCTTTGTTGGAAC 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