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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s247 | supercontig | LSalAtl2s247:287992..301477 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004702 >EMLSAP00000004702 ID=EMLSAP00000004702|Name=EMLSAP00000004702|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=522bp
MSYSSSASSENKDINNIRIILIRDYPSHGKKVIFDSASTFREQLMENSNL DEYDQIYDNYGYKVRISNIDVSQCDSGFFHSESMNLTSFSSISEGSNTSL AYMRRRMSGTNCLIHPLKLRDKKSLTEYSLPENQIFENGKSLSTLPSFKI DSVEFLKSSPSSNHIISDNNSPILALGIIFLTKCRDYILKNNFFLYEFIS FISCETLRAYKRRKEFIHSMYQLSRQVHKDLNNFIEESYFKLEKTAWFLY ASHDQDHTVMSSFVNVLCKLRRRLDTKETNFFFSTFLTGVLTHHLGWIDT IVPNGLDESSFSFSSSNQHLKNFFTLEPFEEHTQFCVSPSSFGTLPYPIE NGLISNNYLNEELQSATIDGVNRIKFGKKVPMPDFDGEIEEEPNQLPCLF LVGKTYMPGCICQGIIQPTSLSSSHFQIYSERNLYKHLLGISSHLSSFIP ELSQVLMHIEDKLKEIYLSSKLLADYLLIDELMDLKTLVYNLDLDYNDVP LLYSVXATHTPKLCKKYGVGLI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s247:287992..301477- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004702-700549 ID=EMLSAT00000004702-700549|Name=EMLSAT00000004702|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13486bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s247:287992..301477- (Lepeophtheirus salmonis) TCCTCAATGAGTTATTCATCGTCTGCTTCTTCCGAGAATAAAGATATAAA
TAATATTAGGATAATTCTCATTCGTGATTATCCTAGTCATGGAAAGAAAG
TCATTTTTGATTCTGCTTCTACATTTCGTGAGCAGTTGATGGAAAATTCA
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AACATCCAACATAATTGATAATATTTGACAGCTCATTAATTGTTTACAAG
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AAAATTAATTAAATCAATGTCCTCATTTTACATTTTTATTTTTTATTTTG
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AATTTGAATACTAATTAGTTTTACCGTCGTTAGGGCATATGACAAAGAAA
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GATATTTTCACCTCGAAAATGGAAGAATAATAATAACAGATTGACAAAAT
AAAATACAAATTCAGGTTGCTAACAAAAACAAAAAGTCAAAAGTAAAACA
AACCTAAATACACTTATTACCCTTTTTTTATTTTTAATATGATGTGCTGA
GCTTTATTTCGTTGCTAAATCTCATTTAAAGTCATATTAATTGTTTTATT
TTGTATATGCACTCCTGTTTTCTTTTCTTTTTTAATATGACGGGTTGAGG
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AGACAAACTTTGTATTATTTAATTTAGAAGATACTGAGGGGAAAACTGAT
TTAGAAAAAATCTAATGTTTCCTTCATTATTTTAAAAACAAATTAGATTA
TAGAAATTTTAGTATCCACATTCCACAGTTCCAACTAAAGTCCTTTTGAA
TTATAAATAACAGCAAAGGAAGCAATTTTTAAATGATTTGACTACCATTT
AAAAAAAATGTGTGGTAGAATGAGAATTTTAATAAAAAAAAGAAAGGNNA
AATTTAGTACAGGCTTGTTCATGCTTCCCAGTTCCTTTGACCATATAAAA
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AAATTGCTGGAATCCTAGTGAGTGTGATTAAAGGGAGTATATCTTAGAAA
CCTGTAAAAAATTGGTAATTTTATTAATTATTCTTTCATGTTTTGAAAAT
TCAAATTATATCAACAGTCAAGGAGCACTACACATTTGTATTGTTAATCT
AAGTTTTTCATCCAAATAACAGTCAATTTACTCAATATTTGGTCACTCAG
TGCTAGAGAAAGTGCTATTTTAAAAAAAAAAATGTGACGTCTATTCTGAT
TCTCTATATCTACTAATTGTAATTAACTTACATAATTTATTGTATTTTTC
AGCTATTGAAAACTTCAAAGGAAGATATCAAATCCTTAGCAGAACTAATG
TATGGAAACTTTCCACTCAAAGATCGTGGTTGTAACTTTAAAGTATAATT
TCTTCTATAGAAACTAGTAAATAATTATATTTTCAAAATAAATTAATTAT
TTACATAATATGCCAGTCCTTAAAATGAATTTGATGCATTCAAAGCTGGG
AAAGCCATTACAGGGRGTTCAGATCAAATTTCTTCCGACTACTACCTAAC
TTAAAAGAACCATCAGACCTTCACACCCCGACTTTTTTTAGGAGACGGGA
GCATTGCTGCTTGATGACGGCAGTTAGAGACGTATTTTTATTACAAGAGG
CTCTGTTGGTAAACTATTCCTTATTATCACAGTCATCAGTTTCCTTAGGG
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GAAGTAGTTGTCCATAAGCGATATCTGAATCTTTTTGGACATGGTCCCCT
AGGCTGAAGAAATTTGATCCCTGTTACCATAACAAGAAGCTTTCCTCAAC
CAACTGGATGAAAAAGTAGAAAAGTCTTTCTTAATATTGTGCCCATCTGG
TTCTTCCCCTTCCTTTCAATGAAAGTTCCTGATATACTTGACCTCTCATG
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GCTTTAACTCTATTATTAATACACTGATCGATGTAAAAAATGAACTGAAG
ATAGCAGTATGTGTACAAACTACACTACTTTAATCTTGTATACAATTATT
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ACGCTCTGTTAATGAATTTTGATGAAAAACATACATCTACAATATTCATT
TAGTAATATCTGTATTTAATTATTATTAATTTCAATCAAGCTACATCTTT
TCGAAAATGAGACAGATTTCATGTGGAGTACGCTTCACAAGTCATCAGAC
ATTTCCATGTTTCTTTCACCGAACGTTAAGCTCTTCCAGTGTAGGATCAT
CCTTTGGGAATAGTATTTCTGGTTTACATCAAGGTAACATTTAAGCGTAT
GTACATTACATTGGTTCTTAAAATATTATTTCTTCAAAATGTTGTGGGAC
ATAGTTTAAAAATGTGAAAAAGTCCATATTTTTATCAAATTATACATTTT
TAGTGAATATTTGATGTTAATGTCTTATCAACAACCATAGTGTTAATCGT
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AGGTTTAGATCTTATGCTATACCTAAAAACGGAACTCTCAACATATGGAA
TGTTCATAAATTTTCCATGGTCCTGAATGGGACATTAGTAATAAATTATA
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AATGTGTATTTTGTAAGTCATTCTTCAAAAGAACCTAGTCAAATAACAGA
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TGGCATTTGCCTTAACTATTAGAATGCTTAAGATTTATAGAATCATTCAT
TTTTGTAATAATTTGTTTGTCATTATATTAAATAGTTGAATATAAATAGA
ATTAAATAAATCCATACCTAAAAAGCAGCATAAAAATTTATAGTCTCTTA
AAATAGTTTCATAATCAATTTAAAAAAATTGAAAAATACACTTACAAGAT
TTGGAAATTGAAAAAATATAGATTTATTATTTTCTGCCTGCATGTTGAGG
GTGTAGACATGATAGATTCGAATAACTAAAGAAAACGTAACGTCACTTAG
GGCATATAGTCCTCCTCGGTTGATTTTCGTTATTATTTTAGTATATGATC
TCTAATTACAAGACCTAATGAAGAAAAAAATGGTTATGTGGTACATAAAT
ATATTTTTTTTCTTTTTTGGATAAACCTAATTATTTTTGGGGAGAGTTAT
TTAATAACTTTTTGAAGATGATGTGTTCATCAACATTAGTGTAACTGCTC
TATATCGACTTTTATTCAAGAACCATTTTCAACGTCTCAACATTGGTTAA
TTTAGCCCAAACTTTATATTCCTTCATTTTTTATTAAATTACATTTTTGG
ACAATACCCTTTCCCAACATTTCGGAAGGAAAATATTTAAAAAAACATTC
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ATTTTATATTTTAGGTATTTCGAATATTGATGTATCGCAATGTGACTCTG
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GAAGGTACGTTTAAAATTTTTTTTTAAATTAAACTATTTGAAATACATTA
TGATTTATGGTAAAATAGGGTCAAATACAAGCCTAGCTTATATGCGACGA
AGAATGAGTGGAACCAATTGTTTAATTCATCCGTTAAAGCTTAGAGATAA
GAAATCCTTGACAGAGTACTCCTTACCAGAAAATCAAATCTTTGAAAATG
GGAAATCGTTATCCACTCTCCCATCTTTTAAAATTGATTCTGTGGAATTT
TTAAAATCTTCTCCATCGGTGAGATTGACATATTTTTTTTTTTAAATCGA
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TCAAATCACATCATATCAGATAATAACTCACCCATTCTTGCACTCGGGAT
TATTTTCCTCACCAAATGTAGGGATTACATTTTAAAAAACAATTTCTTCT
TGTATGAATTCATATCATTTATATCCTGTGAGACTTTAAGAGCCTATAAG
AGGAGGAAGGAATTTATTCATTCAATGTATCAACTTTCACGTCAAGTGCA
CAAAGACTTGAATAATTTTATTGAAGAGTCCTATTTCAAACTGGAAAAGA
CTGCTTGGTTCCTATACGCATCTCATGACCAGGATCATACTGTAATGAGT
TCATTTGTGAATGTGTTATGCAAGCTGCGAAGGCGTTTGGACACCAAAGA
GACAAATTTTTTCTTTAGTACATTTCTAACTGGGGTTTTAACGCACCATT
TAGGATGGATTGATACCATTGTTCCGAATGGGTTGGATGAAAGTTCTTTT
TCATTTTCGAGTTCTAATCAACATTTAAAAAACTTTTTCACACTGGAACC
ATTTGAAGAACATACACAATTTTGGTATAATCCTCAAAAACTTCAATATA
TGGATTTACACGGAAAAGTAGGGAAATTATATCCCCTATCAATTATATAT
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TTTTTAAATTTCTTTTTTTACAACATCTACATTATTTAGGGTTATCTAAA
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TGTCTTGTAAAAACTAAATTTACTAAAAATGAAATCTTTCTATAAAAAGT
TTAATAATTATATNATCATAATGATAAAAACTATAGACATGCAACTTTTG
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GTTACTTGCAATTTTTTTATATAATTTTAAACATTTCTGAACCGGTTTCG
TAGTAAAATTKGATCTTGAACCGGTCCTTCCTCATTTATTTTTAGAAAAG
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ATTGGCCAGAAAAATCAGTCTCAGATCGAGTCTGAACAATAGGGCACATC
ATCTAAATCCAAAGGTAATTTTTTTAACTACTGTGATTAATCATAATCTA
ATTTATACATACCATTTAAAGCTCCGTTTTAAAATTTGAGGACACTAGAA
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ATCTATGATTAATTATCCCCAAGAATTAAACTTACAGAATTTAAAAGTTA
ATTTTATATAAAATTAAAAAAGTATATTATTTATACTTCTTCAAAATTAA
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AGTACTTTCGTCTTGCATTAAGATAAATGAAGCCTTTTTACTATCAGCTC
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ATTTCATTCGTTGCTCACTTGTTTATCCTAAAAAGTATGATGATACCCTA
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AATTTTATAAAAATAAATTTAAAAAAGGGATAACTTACAAAAATTATCGT
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TCATATAATTCTGTCCTGGAAATTGTAAGTAAATTATTTATTACTAGATA
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AAATTTTCTTGATACCATTGTCGAATTGGCATCTTTTGGAACGCTACCGG
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TTCAATGGGTGTATTTCGGTTGTCGGTTAATAACTCTTCACTTTAAAAAA
TTATAAATTTCTTTGTTTAATGTAGCTTTATCTAACTGTAAAATTTTAAT
TTATTTAGGTGATTGTGTGTTGTTAATAGAAATATATATCTTAAAAATGA
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AAATTTAGTCAGAACTCTCTAATAGTTTTATTGAATACTGCAAGTCCGGA
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TTTGAACTTCAGAAAAGTTAACTTTATTGTCAAAATAATGATAAGAGTCT
TTAGTAGTGTTGTCACGCTAGTTTGATTTTTTATAGGTGCTCGTTTTGTT
AATATAAAGTTCATTTTTGTCATTGGGATAAAAAATGAGGAATTGAACTC
CTAAAGAGAGGGTCACTTTTGAGGGTTTTGTGTACTTACAAGGCGTTATC
TCCAACTCAAAAAAATGTTTTAGAAATAATTAAAAGATTATTTAAGTCTG
AAAAACATGAACTTACAAAGTTTATTTTATTCTTTTCTAATTTTTTCAAA
CAAAAAATAATATTAAAACATATATCGTAAACAAATATTTTTCGACAAGT
GCCCCAAAGGCCACAGAAGTAAATATTCGGGTTATAAAAATCATTTTCAT
ATTTTTGAAGATAAAATCATTAAGAAGGACAATTTTCTATATCCAAAACT
TAGAATATTANNNNNNTTTTTTTTATGACAAAAGGGTGCTGCAAGTACTG
GTTCAAATATCAATTTAGTACCCCACCGTTTAAAATGCATCAGTACTACT
ATAGTACCGGCATTTTGAAAAAACTAAGTTTTTAGATAACAATGACATAT
TTTCTTTTAATTATCAATTTTTTTAGTGGTGAAMGAAMTGTGTGTACTTA
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TGCTTTTGTAAAATGGGTGTAAGGAAACTTAAAAAAAAATATATTTCCTC
TAGGTAGTGTGACAGTAAGTAGTTTGGAGGCACAAATAAATTAAATAGAA
TATTATTCCTTTTTATTCATTTTTTTTAGCTCCAACTACAATTTAGAATT
TTTTAAATGATAAATATACGAAATATTAATATCATTTAGGGAGTTGTATT
ATTTTGCCACAAGGCTCTTGATCGTTTTTTAAACAAAATAATGTCAATAA
ACAACTCTCATGCTTATTGATAGTTGAAACAGCTTGTAATCTAATAATCA
TTTGAATAGATCACATTATTCATAGGGAGATCCTCCAAACTCAAAAATAT
ACCTTCTTAACCCCACTCTAGGGCACATTGTTATATTTGATTTGTCAAAT
TGTATAATATATTGAAAATATTGTTTTTGGTGTTCCAGGTTTTGATGCAT
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CTATTTACTTATTGATGAATTAATGGATTTGAAAACTTTGGTATATAATT
TAGGTTAGATTTTATTCTTATACAACATAATAGTTATATGATACATATTC
ATTAAGAAGAGCTTAATTAAAGTCTTATGTAATTATTATAAGCTGAAAAT
AAAGTAAATCCTTGTTAATATCATTCTTATGAACTAATATTCAGAATTTA
ACAATTATTTTTTTTCACTCGTTTTACTGTCATATTAAATAAGGTTGTAT
CGGTCCTTAACTCATNACTTATTTTTTGGTTCCTCTATAGTTATTGTCTT
AATATTAATGATTATAACGAAAAGTTAATTATATTAAAATTCCGAACATG
GGTTAGTCAGATTATCCAAGATGGAAACTACGTCTTGGGACAGCAGGACG
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TACTTTTTTGGCTAAAAAGAATGTGGCCTTCCTATAGTCTAGACCTGAAA
CACTGGATTATACTTTATGGTGCATATCCAGTTCAAATTCTATAGAATAT
CAATGCCCTTGATTGGATGTGAGCAATGAGTGTGTCATCAGCGTGTGCAG
TTTACTATGTCTAAGCTTTCTTTAAAAAAGATTCAATATGGATTAATAAA
TCGAAAAGTTAAAAGTAATTATAAAATTAAATTTTTTCACTGCCTCAGGT
GACTACTAAGAGTCTTAATCAATCTTTCCATTTCTGTTTGAAAGTTGATG
TTGTAAGTAAACAAAAAAGGTCTTTATGGTACCGTTTTGGCTTATCCAAT
ACTTTTTATTGGTCCTTGAAAAAGTTCTCAGCTTTAAAGGTCCCTCCACA
AGGTATAATTTCAATTATATCATAGTGATGTATTTGAGTTTACCGATTGA
ATTCGTTCAGTAAAATTATAAATATTTATATTACATTGTTATGTTTAATC
CTTAGATTTTAAACAGACAGAATGTGCAAAAATAGTTTTATATTATTATA
GATTAAGGTTGTATTAAAGTATTTACTATTATTATAACCATTGGGTATTT
ATACCTACAATATAGTTGAGATATCTACTTATAATTATGTCTTTAAGTTT
ATTCTATGGGCCGGATTTTTGTATAATTTGGAAGCGTCTATAAATATTTT
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TAACTATCTCTAATTGATTATTTCAATTAATGGGGGATCTATTCAAAGTC
CTTATTTCAATAAAGCTTCCCTTATGTCAACTTATTTTAAACAAAAGTTG
AAGCCAATTCAAGATATCTTTAAACGAAATACGGAAAAATTTACTTGATA
AATTATCTTTAACCTCAATTACTTACTAATAATAAATTATTAACCAAATG
TAATATTTTTGTAGTAATTATAGTTTTTTTGTTTCATTTTACAGATCTAG
ATTATAATGACGTTCCCTTACTATATTCCGTTSCAGCCACTCATACCCCA
AAGCTGTGTAAAAAATATGGTGTTGGACTTATTTGA back to top
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