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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s247 | supercontig | LSalAtl2s247:383895..431889 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004704 >EMLSAP00000004704 ID=EMLSAP00000004704|Name=EMLSAP00000004704|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1443bp
MTVREHSNLTLECVVGNLQGEIQWSRDGFALGIDQEMVALSCEKCTLMSP ERGYSVLHVQNVLLGEGKEYECQVSPGSKVPPKRVKFEKPKSVVAGNQEI IACTSSSSNPATKLLWYKNEELIQNAELEEEILLGDRPGTYTTVSRIKIR LVKEDNGVFIICVAXQPAIFSRSDREYFQYKSKLNVLYPPERGPIILGDL RPMRTKGEIITLTCLSRGGNPLPDLYWERGPRKINPISMPQLKSIPSTDK NKKEGTSQSILKFVATPRENNISFSCSRSLLNFNCTAFNGNPAPRIEWSL NGDDYVGXSINNHTKLDNRKGGYIFTSQISVHILETDAEEISLACSAISR SYEGEIMKEIDEISITVLKPPSQPRISGLPVSKSLREGERVQLNCSSPDG SPRPRVDWYLGDSPNVIPESVYAKVPIPHSMINLTASRRDNERIYRCSAR NDANVHKPSSTTITLQVFFPPDSVIINVERPQSPKSNIVQSNAVNPYYNN IGFRSRFSPKTTVLEGEFLRVTCQSSSSKPRATIQWHVNGLPHKSQSVSF PSGEFGGTRTVSVIEFKASYMDHGQVFECFAKNIAISETRIVKTNLTLNV LYAPKFDSNIQETYSMVEGETRNISLSAVGNPSEIKYVWDFPSNNFNRSR FIIDGPFLIIQNANRRDAGRYRISASNSYGNFTTSKSVMVNVQYAPSIVE LTPNKTIEELSTVEFHCKVDANPISDQLITWTYEEQHPLGLLKVSTMRTN SHMSNSTSTLTIISAHRGNTGYITCHARNNISKTAIHNRTYLTVNHKPWI FKSPTLNKFAIPKGDPAELTCRSTGVPEVHFKWEKTYNGRTVTVLPIDEY KGETVKPKKEYTGFRFTWDSVLRLDHVRPEYYSTIFRCIASNKFGEDIHT VELVPRGKPDPPINVRFLASNHNSVTLTWDPGFDGGYNQTYFVTVIEERT GNIVGHLLNKLVPRGKPDPPINVRFLASNHNSVTLTWDPGFDGGYNQTYF VTVIEERTGNIVGHLLNVNNIQGNVTTIIGLRPRTPYSFKITAKNKAGIS LPGGELIKKTEAMEHSLPVNDGILSRVAIIGIIIGVIIAFMIFLVFMTCF IKQRKRRRTRRRSSTSSRRNSSSKDKSDNKSVMIERYTPSKYSSAMSDEL FFPSGSFEKQRSNSVCSSIQASNYKELARSFSVPGPGSEDDTESSYNPVL PNGDPFGGKGPTCSKHRTLDYRKRQPMKGWRNISYGNEEEDDEVFGEPRS SAKGFFSRQINKGFRSEEVGLPSLPMPPPHSSSSSNQHPSRFKPNGFIGG RRHNSGGYSLSSETPIFHPRRRESATPSPLPGVGIGIGNSSGLPHMKDCS SAYTLPRKTPNLEFTNLSYFQTAYEDVEKESSFCPPPPRRMLPPPPTMHH SSSHQKSSDSLEDDDDSDMTCPPPPPPPLSTMTGTGRRNFGYK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s247:383895..431889- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004704-700551 ID=EMLSAT00000004704-700551|Name=EMLSAT00000004704|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=47995bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s247:383895..431889- (Lepeophtheirus salmonis) TTACTCGAGGCCTCATACGAGGAACCGGAGGGTAATCAATTCTTTATAAA
AAAGCCAGAAAATATGACGGTGCGTGAACATAGCAATCTAACCCTGGAAT
GCGTTGTGGGTAATTTACAAGGGGAAATCCAATGGAGTCGAGATGGGTTT
GCTCTAGGGATTGACCAGGAAATGGTGGCCTTAAGCTGTGAAAAATGTAC
TCTTATGAGCCCTGAGAGAGGATACTCTGTACTCCATGTACAAAATGTGC
TTCTTGGAGAGGGAAAAGAGTACGAATGTCAAGTCTCTCCTGGATCCAAG
GGTCCAAAGGTGCTNCTTGAGAGCACATGTTTATGTTGAAATTCTTGGTA
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AGTAACATATTTTAAATGCATTTTAAGGTCAAATATTTAACAAAACTAGG
CAAAAGAGGTAAACTTCTTTAATTTTTAATAGGCAGAAGTCTTTATATTT
GTTGGGTCCATTTTGATATCATATAGGTTACTATATATTTTCCTAATTAT
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AAGTTCCTATGTAACTACATAAACTTTAAAGCCNTTCAAGATATAAAAAA
AATTGGCAAACAGAACACTGTAATTTATAATGAAAGATTTTTATGTCCAT
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TTGGAAAGCTTTAAAGTTTTTCCGAATTTATCAGAAACATCCTGTACCTT
ACACTCATTATTTTAATAATAAAAAAAAGGTCTAATTCGTACTTCCAACT
GCGAATAATTATTAATAGACATAAATATGTAGCATATGAGCAGTGAACAC
AGTGCGTAAAAGCTAAAATCTACACACATGGCTACATGTTTGTAACTACA
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CTACGGTTCTTTCTGTTTCTTGTTGGCACAAATATTACATAAAACTGATA
ACCAAAGCTATCAAATCACTCAAGAAACGCTGTTGTTAGCTTGAATAAAT
AATGGTCGATAAAATAATGTAGAGCTATTAGGGGTTTTTATTTTCATTCT
GATTCATTTCATTCTAAATTTTGACAAATAAGTGTAAGTTTAAATAAATA
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TCCATTTTTGTACAAGACAAAGCATTAATGTTATAAGTATGCAAGTAAAC
GACAAATGTGAAATAACAGGAAAAAAGAAAATTAGTGTAATTTTATATAT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TTCATATATAAAATTAATTATAAAACTTATCAAATAAAAGCAACTACTAA
CTTTTTTTAATTAAATATTATTAAAGCCCGCTCTTTTCGTACACTCAACA
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TAGATCAGTCTACGTAGTAGTTGTCTATGAATTTTTGCATCGCAAGTAGC
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CAAAAACTAAGAAAAATTTAAAAAAGTTATGTTTAAATGTCATTTTCTTG
AACATGTGAAAAAGAAAAATCAATGTTGAACTTTTTTTTTATCATTTGTT
AATGTGGTTAGTTTTTGTTTCTTTTTCTTGTTTGTCGCGCTTTTGTGCTT
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TAAATATACATAATAGGGTTATGGCTGAAATATGAAATACTATAATATTT
AAAATGGATACAATAAATGAACATTATTCTTTATATAAGAATAAAAAAAG
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TTGCACGATATAAATATATGTAGTNGATACATCAACACAAAAGCAAATTT
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TTGTCTCATTTGTAGAGTCTCAAAAATAAATCTGGGCATTTTTTTTTTTG
CTCAAATGAGTAATTTATATGTTTTGTTTAATAATAACCCGTTAATTAAC
TAGCAATAGTTCCAGAAATTGCTCGGAGTTATTAGGCTTCCACGAACAGA
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CGTTGTTACTCAAGTAGTTCTCTCTTCAATAATGAAAGAATAATGATAAC
ATCTTAAGAATTTTTTGTTTTTTTGTTTTAGTTGCCAACAACAACAAAAC
TCAGATTCTCAAAAATCCTTAAGATTTACAGCTCTCTTTTTTCTTTTTTA
ATAAAACTCACTGAGCTATACTAAAGTCACACTCATCATTTATTATTATA
CACATATACATTGTTGTTGAAATGAGTTTTCCTTGGACAGACACACTTTT
CTTTATTAATATTGGTAAAAATAGGATTAAATGGAATATGAAGGTCAATG
TAGCTTCCAGATGCAACAACTATAGATACGCTAAGGTTTGAAATGATATA
CTTTTGCAGGTGCACATTTAATATCAGGCTCCGCTTCTTATCTGCCCTTT
AGATCCTTCTGTCGATATATTTTTGTATATCTTTTTGACCTCATAAACTG
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GAAAGAAAACTAATATATAGAAATATGTGTATCGATTTTCAAGACAATCA
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AAATTGATAAATAAAAACGGAAAAAACATTTTTAGTAGCTCTCTAAATAG
TGTTGTAAATAAAAGACATAAAGTTTTTAGGATGACAAAAAATATTTTGT
TTGAAATTATTATATTATAATAACTTTTTGATAAGTTTTTTTTCGAAGTG
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TTGTTGGGGAGTTATAAGGATAAGTCTTTGGTGGAGTCGAACTAAAATTT
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GGATTTGTGTATAGGTTCTTTGTTGTCACAGCTGTCCATTTAATAAAACA
TAATAACAGCTAAGTAGCTTTTTCTAAAATATTAGAATAATTATCTGGAT
AACCCGTTAATTTTTGATTTCCTTCTTTTTTACATGCCAACTGACCATAT
TTTCTACAACTCAATATACATATACTAGTGCAGATGTAATTATTCATAAT
AAAGTTATAATTGCCACTCCTGGATAATCAAATTACTCTCCATTCAAAGA
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GGCTTAAGAATAAAAGTGTAGCTATAGATATATAGTATATAAAATAAAAC
AGCAAGACGTTGGCAGAATATTAATTTCATTTTCTATGTATCTCCTAAAT
AAATTCCTATAAATATGTATCTCAAGGCAAAAGCACTGAATACATAAATA
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GTAGTTGTCTAATATCTATATATACATGAGTATTTATTGAAAATGCAATA
AAGGGATACGTCAACATAAAAACAATCACAACAAAGAATATTTTTGCTTC
ATTGATAGAAATACCTCAATATTTTNNNTGACATATTTAACTTCACTAAC
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TTCCTGTGGGAAGAATAGTCCTTTCTTTCTTTCTGTTTCTCTTCGAAGGA
AAGTTTGTGTGATACAAAAAAGGTAATGACGTCGTATATGTATAGTTTAG
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ATTTGAATAATAAAGTGTGCCACTAAATGTCAGTTTATTTTATGTATATA
AGTTTTGTTCAATGGGGATATTAAATGTAATAATTTGCTCTGTAATAAAT
AAAATTTTAAGAAGCACTCATTTATATCCTTCAATTTCTTTTTTCTTTCT
TTTTGGCCTGTCAACAAAAAACCAAGGTACAACGGTTTTACTCAAAATAG
AGTCTGTATTTCGTTTATATATTATGACTTATAATAATCGTCAATTACAA
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TTCTTCGAAAGGCCATATCTAGACCTAATTAATTATCATATATCAAATAA
ATGTTTTAACCAATAGTTAACATTCCTGTGTATCTCAACTCATCCCAAGA
ATTTGAATTTAACGTTTATAACTGACTTAAAGATGACTATAAAAATTATT
TGTACATATAATGTAAATACATTGGGTAATTTCTCTTTTTCTTAATTTTT
GCTCTTGAATTTTGTGTTAAATAATAAATTTTTTTACTCATTTTTAAGTG
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AATAATCAATAAATTACTTGAAAAATATCCTTATAGATAAAGATTTATGT
TTTATTTTGTGCTGAAGGCTGTTTTCAACAATCACGCTTTTTAATACTTG
TTACTATTTTTAATCAAATTTAGATCCTCCGGAAAGAGGTCCCATTATAC
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TGCCTATCTCGTGGGGGAAATCCACTCCCGGATTTGTATTGGGAACGAGG
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GTGGCAACTCCAAGAGAGAACAACATTTCTTTTTCCTGCTCAAGTTTTTC
AAAAGTCCAACCCAAGAGTCTCCACTCTGAGAATAACGCCTCCTTCGTCA
TTGAATGTAAGAACTATCTTAATTATGTTCTTCTGTTATAGTATTTCCAT
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AAAATACTTTTTCGGCTTAAAGTATGAAATATAAATGTCGTTACTGGCAA
TTAAAATCCAATAATCTGATAGATTTTTGTGTGGGTAGTAGAAGGAGGTA
ATTTTTATAAATTTGATGACTTTTAAATTTTTTTATGCAAGGACCGGTTA
TAATATCAATTTATTATTATTCTATCTTCTATATGCGTCAGTAGGTGTTT
TCACTATTGCACCACTATATTGTACAACACACATCTACTTTCAAGAATTT
AAAGTACTTTCCTCCTCTTCACAGTTCCCCCTCGTGATGTCAAAATTGAA
GGACCCCGTGCTGGTCGCGTAGGGTCCCTCTTGAATTTTAATTGTACGGC
TTTCAATGGTAATCCTGCGCCAAGAATAGAATGGTCCCTCAATGGTGATG
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GGAGGATACATATTTACATCACAAATATCGGTTCATATTCTAGAAACAGA
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AATTAATGAGAAAAATGAACTTTTATGTTTATGTCTTTTTTTACTTCATA
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AATATTTCCTACCTGTATCTTTTTTTATCAAATATAATAATGAAACAGAA
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AAAAATACAAACCACATTATTTTTTTCCTTTGTACATATATAAATATGGG
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AAAATATTGTCATAGAACCAATATTTTCGTAGGATTTTAATACTTTTTCC
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ATCAAACAAATATATATATATTAAAATATTTTCCTCCAAATAATGTTATT
TTAAGTGTTGAAGTTTCTCCTCTTTCTGCCTGTATTTAATTTTTTATTTC
TCCCCTTATTCTTCAATCATTATTATAACATCCTGTTAATTTTAACAAGG
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GATTTGGATCCAGTTTAGGATACTTTAATTAAATCCATTTGACAAAATAA
TAGTACAAAAACTTACTAGATGCAATTGCAAATGTATCATTAATGGGTCA
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AATTTCAACAAAATCTAATTTTATAATTATTGAATGTTTTATTTGTTTAT
AAATTTTCAACTCTTCCATTTCTGGCCAAAATATATATTCGTTTTGAAAG
ATTAAAATTTCGAACTTTCCATTTTTGTTTTTAGAAATTAACAATAATTA
TAATTTCAAAATATCTTAAATGTAACACATCAACCTAGTGGTTGTTATAT
AGTGTTGTGCAATTCAGATGCACTTATATAGAATGGAAAATTAAGAAATT
TGAAAGGAATAGAGGAACACTTATGATTTGTTAGGGAAGTTATGAGTGCA
AATCCTTGTTGGAATTGTAAGATCGATATCGAACACTTCATGAAAGCTAA
GCTACTCTCTTCCAAAATTTTGGGACCATCATTGTATTTTTGCTTTATTT
TTGTAGTAACCGTCATTCCATATAATTTAAAACTCTATCTATAATACCGG
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AAAAATATCTCCAAAAAAATATATACATGTATTTATTCATCTTCACAAAT
AATCAAGAATTTAATTATACATCTTTATTTGTTGTATTTCTTTAAAAAAT
CGATTTAATATCAATACTGAATTTTGTATTCAATATTATTTTTTTTGATT
CGTTTGTTTTTATAAATTGAAAAATGATAGTAATTTTGTATTCTTTATTT
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ATATATAAACATGTTGGTAAAAAAAACCAACAAACAACCAAAAACCATTG
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CCTTGCAGAGCCACCATCACAGCCTCGTATATCGGGACTTCCAGTGAGTA
AGTCCCTTCGTGAAGGGGAAAGGGTTCAATTAAACTGTAGTTCACCTGAT
GGTTCTCCACGCCCACGTGTGGACTGGTATTTAGGAGATAGTCCAAACGT
TATTCCAGAATCCGTCTATGCTAAAGTTCCAATTCCTCATTCCATGATCA
ACCTCACGGCATCAAGAAGGGATAATGAGAGAATATATAGGTAAGATTAA
TTCTTCAATCTTATTTTGATTGTCATATGGGAATTATATTGTCCATATAA
CTAATTTTTTTTAAATTGATACTATTATTTTTACTTACTATATTCTTAAG
AAAAAATTATAATCACTTTTGTTGGAAATTTGACAAGAAGTGACCATTTT
TAAAAATGTTACTAACCAAAATAGTTAAAAAATAAAATAATTAGATCGAT
TTTTGGTGGAGCAATGAGTAAAATAGAACTATTCCTCATTGCCCTTCCAA
ATTGCCGGTATCCTTTGTTGTTGAGTCTTTAGGCCATTTTTTGGAGGAGT
ATTGGGAAAAGAGGCAAAGTACAACAATGACATCATACTCCACCAAATCC
ACGAACAACGATACAGTCCATATCACAATAAAGGATATTTTTACTTTCTC
TTTGATCCACCAAAAGTCGACCTAATATTTAAAATAAAAAGAATAAGTGA
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TATTTCCAAAAGTTTTTTTTCTATACTTTATTTTAATAGATATTATAGTT
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TTAAAATTTTGGGTAAGAAAATTTGAGATATTGTTTGCATACGAAACTTG
CTTGTTTGTACTATACCATTTAAAGTTTGCAAAATAACTTTCAAAATTTA
GTTTAGAGTAGAAAAAGTTCAGAAATAAAATACATATTGCTTACATCGAA
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GTTAATCTTCTCGATCCTGTCTCTATAAAATAAAAATTTCTTATCATATT
TAGCCAAATAATTGATGTAATTATATTTAATTTCAAAATGCAACCTTACA
TTGCATATATGTAAATTAAATATTCTCTATGAAAACTAAGTGTTGAACAG
AAAAAAAATCGAACTTTTTTGACGGTAACACTTTTTAAGTTGTAGTAAAG
TTTATCCTTTATTTTTAGCTATAATATAAAGCAATAAAAAAAAGATTTAT
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ACAAAATATATATACTTAAAAAAATATTCAAGGCTAAACCTACAACAAAT
GAATTTCTCAATGTTAATTTTTGTGTTCAATGATTTAAATAATAATAACA
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TTATCATATTTTGTCTTTTCTTTATTTGTCAAGAAAAGAAAATATTTTTT
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TTATTGGCATGCAAAAAATATTCGTTTGCAAATACATTTGGTCTAGCCAT
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TGAAGATATATCTATGTACAGTGAGCAAGGTTAAATTTTGGACGTTTTGA
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GCTCATTAATAATGCACTCGGAAGAAGTTGTTCTCGCATAGAGTAAATCA
GACATTACTTTAAAGAACATACTGTAGTATTTTAAAATATGCACCCTAAA
GTAATCTAGATTAGTTTTAATGTAAGCCAACAATTTTAACTTGCACACTG
TATATTGATAGAGATTCCATTCTCTTCTGAAGATAAACAATCCCCCAATA
TGATTTGAAATGTTTTTCACTATTGGATTGGATTGTACATAGTTTTTTTT
TATATAGTATATAAATTAATTACTTTTTGACAAACAAAAATTGATTTTTT
TAATACATGTATTAGTTATTAGTATGTCTTATTTATGTAAGTGCGTTTTT
TTGTGCTTCTACTGACTTATATTATTTTTCCTAAAAAATAATATTCTTGT
GTAAAAGAAAATTGTTGTTTTTTTTTTTTTGTCCCGTTTTTTTTTTTTTT
TTGCTTTCTTATTGTAAGCTAAAGCTTTTTAATACTAAATAATTGAAACA
ATTTTTTTTACGTACATTTGTAAGCCTAGACACATCTCTCTGCCTTTGTA
CAATTAAGAAATTCCATGTTAAGGTTAATTTAAAGCTTTTTAATTGAACT
AATGCATTATTTAATTCTTACGTTAAAAAAATACATAAATTTGCATGTTG
AAGCAATATCAAGGGATTGTTCCAATGCAATGGAGTTGAGTTGTTCTTAA
TCACTCATTTAGTTATAAGAAGAGGGAGACCGGGGAAGTTTTGTCACAGT
TACTGCAAGCTGATTTGAGTTAGATTCACCCGGTTTTAACAAAACATACT
TACAAATGTCTACGATTGTTATACTCTATCTAAACCTTGATGGAATGACA
TAGCTCAGTATCCAGCCCACCTGGGAAAAATTATTATATTGAAATTAATG
TACAAAGCTTTGATGCCCAGTCCCTTTTAGAGAATGAAACATAATCTGTA
ATGACTTCAAAAACAATTCCTAGCTCAGACAAAATCATTGAAGTACAATA
TTTTTTATGCATATATACAGTAAAACTCCATCTGATCAATTTAAGTATAA
ATTTAATATTTTTTAAATGTTAATACTATTTAAGTTTTTCCAGAAATTGC
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ATTAGAAATTTGAAAATTAGACCTAATATTAATTTCTAACTATAATAATG
TTGAATTACGACAGATTAAGATTTATATTACAGATCACTGATTACTAATG
TAGTTCAGATAAGTTTCTAATCTAAAACCTCTTTAGATCCCTGCTCTAGC
TAGAAACCATGTTGTCTGTTAAATTTAATATCATAAAATAATAAAGAAGA
ATAAAAAATGTAAAGAAAATTATTGATTGCACTTTGTCTACAAAAATCTG
CATTGTACTATACATTCCTAATGTAAGCTGTATGGATGTAGATTTCTTGA
TATTCTAAGAAAGGAACTTTTACAACTGCCCCCTGTTGCAACAGTACCTG
TATTCCTTAAATATATACACACAAAAAATTGCTAGTTAAGACAAGAGCAT
TTCTTTAACTTATTGTGTGTTTCTTTATAGTAAATGCTATTATCAAAAAG
AAATTGTTTTTGTTTGTTTTTATTTTTAAAGTGCAGCACAATCTCTTTAT
CCCTATTGATACATTATTTTAAAAAGAAGTTATTAGCAGCACTTTATGGT
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GAGAGCCCATTTTAGTTTTCTAGAGTTACTCTACCTAGAAAAAAATGGAA
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