|
|
Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s249 | supercontig | LSalAtl2s249:299291..309461 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004731 >EMLSAP00000004731 ID=EMLSAP00000004731|Name=EMLSAP00000004731|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=537bp
MDLVVDXSVIQLKYLFRLRDDVKSLLEEVSAHEMGFSSLLAVSLEFFIQH
LDSNAVSISSMKLDEDLCLYPILSTDKDYQDKICSIQISLDSSEXVDDKL
NNTQGLSLVNVALQKLYATHHIEVNNYFVLLCTFKFILSKRMEIIDYFTL
DNLGSEEESFNDELENEKRLERHGAVCEICGDMDLDPKSFCEVLACGKCI
TFFIAHLDKRLELTCSKLGNCRINDKILDISCKKCRMKRCIALSMIEHYD
FKYRRIVQMMDSACDACDTVGITRVVKGVSLCSDCESFLKSCLKNKDFDG
ESVTQDVSDEGTNYDKEDKSVLLKRFKALGILLSAEERNEEDLKRCIGCD
ACIENNNLIKNELKWNGSLCKTCETFMFMSMTTXARHYYTCSSGELGRLC
EILPNSDNSWSQKCNYCWFRILEMGGVVELWKNNGSIESLMSVMINFISK
SRLATTAGIVGMFFFHENNRREILADSFLETKLKGSISSKKIEDTKKLMG
KCKHACRSVMHENGLPGLFIAVHKDGKLIWEQGKALY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s249:299291..309461+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004731-700578 ID=EMLSAT00000004731-700578|Name=EMLSAT00000004731|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10171bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s249:299291..309461+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGATTTGGTAGTGGATGSCTCTGTTATTCAACTCAAGTACCTCTTTCG
ACTACGAGACGACGTAAAATCTCTCTTAGAAGAAGTTTCCGCACATGAAA
TGGGCTTTTCCTCTCTCCTTGCCGTTTCTTTAGAGTTTTTTATTCAACAC
CTGGATTCGAATGCAGTAAGCATTTCAAGCATGAAGCTGGACGAGGACCT
TTGTCTTTATCCCATCCTATCCACGGACAAGGACTATCAAGATAAAATAT
GCTCCATCCAAATTTCTCTGGACTCCTCTGAAAYGGTTGATGACAAGCTG
AATAACACCCAAGGTCTTTCTCTAGTAAATGTCGCACTCCAAAAGCTCTA
TGCCACCCATCATATCGAAGTCAACAATTATTTTGTTCTTCTTTGCACCT
TTAAATTCATTCTGTCCAAGAGAATGGAAATCATTGATTATTTTACTCTT
GATAATCTAGGGTCTGAAGAGGAGAGCTTTAATGATGAATTGGAGAATGA
AAAGCGATTGGAAAGACATGGTGCTGTATGTGAGATATGTGGAGATATGG
ATTTGGATCCAAAGTCGTTTTGTGAGGTCCTTGCTTGTGGGAAATGCATT
ACCTTTTTCATCGCCCATTTGGATAAAAGACTGGAACTAACTTGTTCAAA
ACTCGGAAACTGCCGTATCAATGATAAGATTTTGGACATATCCTGTAAAA
AGTGTAGAATGAAACGGTGTATCGCTCTCTCTATGATTGAACATTATGAT
TTCAAATATAGGAGGATAGTCCAAATGATGGATTCTGCTTGTGATGCTTG
TGATACTGTAGGGATTACTCGAGTAGTCAAGGGAGTATCCTTGTGTAGCG
ATTGTGAAAGTTTTTTGAAAAGCTGCTTAAAGAATAAAGATTTCGATGGG
GAATCTGTTACCCAAGACGTTTCAGATGAGGGTACTAATTATGATAAGGA
AGACAAGTCTGTTTTATTAAAGAGATTCAAGGCGCTGGGTATTCTACTTT
CCGCTGAAGAACGGAATGAAGAGGATCTAAAGCGATGTATTGGATGTGAC
GCATGTATTGAGAATAATAACCTAATAAAAAACGAACTCAAATGGAATGG
ATCTCTTTGTAAAACATGTGAAACCTTTATGTTTATGAGCATGACAACAY
CCGCCCGTCATTATTATACATGCTCTTCTGGGGAGCTGGGAAGGTTATGC
GAGATACTTCCAAATAGTGATAATTCATGGTCTCAAAAATGTAATTACTG
CTGGTTTCGAATCTTGGAAATGGGCGGTGTTGTTGAGCTTTGGAAAAACA
ATGGAAGTATTGAATCCCTAATGAGTAATTAAGTGACATACCATCATGAA
AGTTAATTTTTTTATCAGTCCTGTATGTTATGAATCTTCTTGAAAACATA
TTTTAAAATAATTTTTATATCAAATGTATCATTTAGAAAATGGGGACTTC
ATACTTTTATATATATCATTTTGTGTTGTCTTGAATTATTTATTTTGTTT
TTCGAATAAACCCGATACATCTGATGGGTCATCTAAGTTTTTTGTTTATT
TTCTCTCATTATTAATCTTACACATGGAAAAATATGAAATAGTTACCAAT
TCAATGCATTTCTATTTATCTATGCTTAGTATTNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTACATATATATTARAC
TCCMCCGAAATGACAAAAGTTGGGAATTTGGTATCACCGGATATTTTTAT
TTTACATTTTATTCCTCTAAACAAGAAAAGGATCATCAAAAGTGCAAAAA
AAAATGGTCCTTCATGGACGCGTTTTGATTTGAAAATCTGTAAAATGTCA
AAAAAGAAGAAGAAATTTTAGTATTGTTTTATTGAAATTATGGATTTGAA
TCCAGTTACATAATTTTTTATTTATTAAGTAAGATGAAACATATATTTTG
CAACAATATTTCAATAATGTTTCTCTAACTTGCCTCATGTTATACTTATT
TTAGTTCAAATATGTTGCCAAAGAATATATATTCTCTTTTGGTACCGCGT
ATTCCCCACATGTGTTACGATGTTTCTCATCATTTTTATTACTAATTTCT
CATTTTTTTGATACAAAATTTAAAAAATATTATTATTAAATATACTTTGG
TTGTTCATTTATGCCGAATAAGACACTCTATTTCTGCAATTTATAATTTT
GGACTGCAAAAACTGTCAATTAAGCTCTTAAAAATAAGATTATTTATTTA
CTATTCCTTAATTTCTAGTGTTGATTTATTTTTATTTCATCATATTTAAA
TTTTTTAAGTTTGATATTTTTCATTTATTATGAATATTTAATTCCTTTTT
TCGATAACCTTTCAAAAAAGAAACTATGGATAAAAAATTTATTCTAATTA
CTTGTTTGTTTTCTTAATAGGGAAAATTAACCACAATTTTAATTTTGCTC
GATGTATCCCTTGTCCACAAATTTGAGCTGAAGCTTTGGTTACTTCTTCT
ACTGCACGTTCACAACTTTGAGTGTGGGATGGTATTTTTAGAAGTCGAAG
CGGTGAAGAGACTAAACTAATCAGTTGACTTTGAGGAATGACTACTGTGA
TAAAAGGTCAAGTGGCGTTGTCCCAATCTTGGATATTAACAATTGAAGTA
GCATTGAAGTTAGGTGAACGGTATGGCAGTACACTGATATCTCTCAAATC
ACTTTTATCTCTTATGTCTCTTATTTTTGATATCCTGAATTTTCTATCAT
CTTGCTAAGAGCTGATAGTATAGATAGTAGAACATGGTCAGAGTGAGCAT
GCCACACATCTTTCTCCAAAAATTTCATGGAGATACTTTTTACTTTTTTG
AAAGTGTATCTTTTTTGTATTCATGCTCTGAATTAATTGTATTTGATGTA
ACGTATGTGATGGAACTGTTAAAATATTTAAATCAACTTTGATTTAGAAG
CACATATGGAAGTAAAAATTTACTATGAACTCGACTATAAGGCGCAACTT
TTTTGTTTTATCTCCAGCTTTGAGATTCATAGTTGTACAAAACGACTTTG
CAATATGGCCCATATTGAATGTGAAGCAATGCCGATTTAAATTTTAAGAA
GTTATTTATATGCAATTCCTAATATAATCATTTGTGTAATGCGATAAGCA
TAAAATTGATCATTAGACAAATCATCAACCGTACTTTCAGACATTTCACG
CAGTCGGGAACTTATGCTTATTTTTCTGAATTTATAATTAAATTCGAAGT
CGTGATACCAAAAAAAAGAGACAAAAGAGATGGAAGTGAGTTGGGGGATA
CCAATGTAAGGTCATACTATTCACCTTTTCTCAATCGGGAGGATACTTCA
TTTATTAATATCCAGTATTGGAACAACTACACTTGACCTTTTATCACAGT
AGTCATTCCTCAAAGTCAACTAATTCATTTTATAGAAAAAAAGAATAAAT
TAAGTATTCATAATCRTTGAAAAATATCAAACTTATAGAATATCAAAATA
GAAATATGCTTAAATAACAAATCAACCTTAGAAATTAAGGAATAATAAAA
GAAAGGTAATATTTTTAAGAGTTTAATTGACAGTTTTTGTAGTCCCAAAT
TATAAATTGGTAAAATTGATAGTCTTATTATGGATAAATGAACAAATACG
TGCGCGTAATACGCGGTACCAAAAGATAATATTTATTTGTTGGAAGCTTG
TTCGGAACTAAAATACTCATACCATGAGGCAAGTTAGAGAAAGATTGGAG
AATGCAAAATGTATGTTTGATCTACAATATTTAATAAAATAAAAATCATA
TAACTGGATTTAAATTGATAACTTTCAAGAAGCAACATCAAAATTTCCTT
TTTTTCGACATTTTACAGATTTTTAAATCATAATGCGTCCATGAAGGACC
ATTTTTTTTGGACGTTTGAGGGTTATTTTCTTCTTTAAAGAAATAAAATG
GAGAATAAAAAATATCCGGCGATACCAAATTCCCAASTTTTGTCATCAAG
GCACACTAATAAATATACAGAATGGTCTAGATAAATTTGGAAAATCTTTT
AAGGCTTACAACGAACGAACTAGATGGGGTAGAACTATAATTTTGTTATT
ATTTGAAAGCTATATTTAATTATATTCAATTATTTGTAAAGAGATACGCC
TTTCTTGATAAGCTCGGCCAGACGACGCTGGAAGCTTTTGCATGGCCGGT
GCGWCCTCGTGTTGATCCAGCTTTGTCATTGCAATTGTTCTGGTTTTGCA
CCTTTAAATATCCTCACTTTTGGAGTACAGATTTTTGGCCTGTAAACAGC
CCGGACCTAAAATTATGCGACTTCTATTTCTGGAGTAGGATCGAGCATGA
GGCCTGTACCAAGTATCATTCGTCTGTGAAGGCCCTGAAGAAGTCCATTA
CTTGTACAATGACAAGGGTAGATTTGCACGAGKTCTCCCGCMCCTGCCAA
TGCTCCTGGTGCCGTGTGGTTGAGATTATCAAGAAAAATGGACCTCATTA
TAAATTATTGAATTTAATTAAATGTAGCTAATAAAAAAATATGGTTCTAC
CCTATCTAGTTCGTTCGTTATATACCTTTAAATAATTTCCAATTTATCTG
GACCACTCTGTATATATTTAAAAAATAAACCTATTCATATAAGTGACTAT
ATTACGGTGTTTTTATAATTTTTGGGGCTAAGCCCACTAACATCAAATGG
TTAAAGTTAACAACACCCCTGGTAGTCTATAAATACAATCATATACATAC
TCATAAGTCGGTTTGAAGTTTTTTTTCCCTAAGGGGGTATTTTACGTTAT
TAATTTTCATGCACCAAGAAATTCTTGTATTTAATTAAATAGACTTCTGG
AAATGATTCATAAAATATTCGTCATTTTCTTTTCTTTTATTATAAAATAA
ATTCCATTTTTGTTACGATACACTCCTCAAAAGTAAGGCTCCCATATTTT
AAGGCAATATCTGCGATAACTATCCAGTTCACATCATGCAAAATATTTTA
ATATTCGTATATTTACACATCTTGAAAAAAATAACCCATTTAATTGTTCT
TTTGGTTTATGCCAATTTTGAATATGGTTTATAAACTTAATCTTATTTAT
TTATATTAACTAGATAGAAGAGTAAAGTAAATTTACTTTCTCTATATTTT
TCTAAATTTACTCTTCAGGATATTTTGAGATATTGMCAGCCATATATATT
TTCTAAACCAATTAATACTAAAACAATAGTTGTTAGGATATAATTGCCTC
AACATATATCTGTTGAAATTTGTTGATAAATAATGTATTTTAAGTTAAAG
TTGGTAATATTTTGATTTCCAAAAAGTGAACATTTGGCATATAGAGAAAG
GTGTTAATATTTAAAATTAATACATTTAAGAAAAAAATTGATTCTTGTGT
TAGTATTCTTCAAAAAAAAAAAATATATTTTTTTGTTTTTCGAAGAAAAT
ATTTTGGAGTTTTGTCTTTCTTTCATTTTAACTTTATTTTCTATTTATGA
CTTAATTTTTAAATTCTTGCATTTCTTCTTCACAAAATCGGACATTTCAT
ACATTTATTTAAGAAGTCCTTGAACTGGTTTTAAAAATAGGACATACACT
GGGAATAGACTCCTCTAGGAGTTATAAAACAATCAATAAGTAAACCTTCA
GCAAGAGGTACATCGTAACTTCAGTATCACTGATAACTAATTACTTTTAC
GCTTAAATCAAAAATTCACCAATATTTCATCATATTTATGCTGTGTACTA
ATTGCAATTTCTTTGTCTTTAAATGCGTCATTTTATTACAAAATTGGCCC
TTCTAATTAAAAACTATCAATTGATAGTATAATTATATTTTAATCTATTA
AAATTACATGGTTAATGTATTTATTAGTAATATAACTTTGGAGATCTGAA
CTTGTTATGTACCACATAATACTTATATTTTAATATTTTGTATAAAAATA
GCCAACATTTACACCATTAATGTATTGATCATCTATGAAATATTTAATTA
TTGCATTATCCTCATCCGAAGTACTGTTAATCTTTCATTTAAGATTATTC
ATCCCATTTTTTGGTTATAACTTGTACAGTTTCCTTATACAAGTTGCAAC
ATGTACACAATATATATATGGTAAAGATAAAGAAAATATATTGATACCAA
ATAAAACTAATCTAGGCAAGGCTGTTCAAATTTATTCTAATCATTGCCCA
TCCATTGACACTCCGACACAAGGCCTTTTAATAAATACAGTTTTTAATAT
ACTAAAATAAGACCTAACAAATTATAAAAATATCATGGAATAATATAAAT
TCTCTATGGTTGGAGAAGAAAGATCTTGAAGGCTAATCTTTGATCAAGTC
AAATTTTAGGAATCATAAGGATTTCTTTAGGTTTATTATTATTTTTTATG
GCTTKAACTACAAGGGCTCTCAGTTACCTTTTAGGTACCAGATGCATTGG
CTTCTCCAACTCCAGTTTCTTTACTAGTTTGATCACCTTATCTTAAGTCC
CCTAGTACAAAATTTTTAATGAACCATTTTCTTTTGAATAATTTAAAATG
TGATCTTATATATAGCTAACTATTTTATTTTTTAACATTCTCATTTTAGG
CGTCATGATCAATTTCATCAGCAAGTCTCGGTTAGCTACAACTGCTGGTA
TCGTTGGAATGTTCTTTTTCCACGAAAATAATCGCCGTGAAATACTTGCA
GACTCTTTTCTGGAAACCAAATTGTATGTATTAACTTGGGATTAAATATC
TACTCTCTTGCTCAATATTTCAGCTTCTAATTTGAATTATAGATTTTTTT
TCTTCTCAAAATGAGTCATTATTCATTCAGTCACTTAGGTCATTATTGTA
GAATGTGCAGAAAGGCTCAATATACTTAATGCTATAAATAAATCAATATA
CGTGTACCTTAATGTGTTTATATTAATTTAATGTTGGTTAAAGTTATTGA
TTTATGTATCAAGAATGTTTTTACGATTTCTATTCGATGTATTTTATTTG
TAGTTCTACAAAAACGAGATTTTTTGAGTAAAATGATAGAAAAAGTTTAA
TAATTAATCTAAATAAATTAATGCAAATCAACTTTCAATTATAGGAAGGG
AAGCATATCTTCCAAGAAGATTGAGGATACAAAAAAATTAATGGGCAAAT
GTAAACATGCTTGTAGATCAGTAATGCATGAAAATGGTCTTCCAGGCTTA
TTTATTGCTGTTCACAAGGATGGAAAACTCATTTGGGAACAAGGTAAAGC
TCTGTACTAAACTTTGTACCTAATATAAGACAACTTTGATTGAAAATTAA
TCATTATTAATTATTATCAACGGGAGGAATGGGATATAGTGATGTGGAGA
ATCATGTTGTGGCTTCATCCAACTCCGTGCTCCGTATTGCATCAATTTCT
AAATCACTTACTTCTATTCTTGTTGGAAAATTCATCGATGAAGGAAAGCT
ACATTTGGAGGATAAGGTATCTGATTATATTCCTGWYTATCCATATCCAC
AGATATCCATCCGACAACTCTTGAGTCATACTTCTGGGATTCGGCACTAT
GAAAAGAAAAAGAATGAGATTGACAAGCAGGATAAGTTGAAGAATAATAA
GGAGGATGAAGAAGAGTCAGATATCAAGGAATTCCTTTTAAATAAGAAAT
TTAAGACTGTTTCCGAATCGTTGGAATTGTTTAAGAATGATGAGCTTTTG
TGTGAGCCTGGTGAGCTAATTGTTTTTTTATATATAATAAATCATTATAT
ACGTGACCCGTCGGTTATAATAAAACAAGATAGAATGGTTTTTCTCAAAA
TTGAAATTTGATTAAATTTGTGTTGCTTTACTAATTATTGTTCAGATTAA
TCCTTGAACGATTGTTAATTGCACTTAAAGTACAAAAAATTCATTGTCAC
TATGTGAGAATTATAAATGTTATTAGAAACGCCATATCGTTACCAAATTA
AGTCTTATAAATCAAATAAAGTATCTAAACTATACATAACATTCCTGAGT
AAGTCTCAACTTATCCCAGAAATTTGAATTCAAAAGCAATAATTGACCAA
AATAAGTTCATTAAATATTAGTTTGGATGTATATATGATGTAAAAAATAT
ACGTGTGTAAATTGGGAATTTTTACTTTTTTTATTTTTTCAAGATTTTTT
TTTGTGTTGACGCACCACAAACATATGTGCAGAGTACAGTGAATATCAAT
ATTTTTGTATTGAATATGTCATACATAATTTTGGAACACCTCTACAGGCG
TAAACGTTATGTCGATTATTGAGGAATTAAAAAGACATTAAAACAATAAT
GATTTGATAAAATGATATATAATTTCTATAAATAATTTACTATTATTATT
TTGCTTCATGAAGTTTTCAATGATTTCATTGAAAATATTCAGCCATTAAA
GTCATTTATCATAATTTTAATATGTAATCTATTACATTTAAAAATGGAAA
ATAATACACTGAACAGTGTTTTATGTACAAATAAAAATAAAATTGAAAAA
TGATACCATATTGCAAAAAATAATAGGATTCGATTATAATTACAGGTGAG
AAATACTCATATACAACACATGGATTCACTCTTTTATCCGCAATTATCGA
GGAGGCTGAAAAAAAGCATTTGAAAAAATTAAAAAAAGATGAACAACAAA
AAAATGTCAAATTTGCAACTTTGATGAAGAGAATGTTCAAGGATTTGGGC
CTCAAAAATACATATTTGGATGAGAATGACCCTATCATATATAATCGTAC
AAGGTTCTTTAGAAAGCGCCTTCTTTTAAGTACTTTACTAATGATGTATG
CCTCCACAGGTTCTACGTTCGAGATAAAAACCACAAACTCAAAAACTCTC
CACACGTTGATAACTCGTACAAATGGGCTGGAGGTGGCTTTCTTTCCTCT
GTCAGGGATCTGTGTAAATTTGGAGATATTGTTCTGTATTCTTTTCAACA
TGAGGATGGGTATATTACACAAAGCACAGCAAATAAATTGTGGTCAGGTG
TCGTTAAAACAAATCCGGATCGTTCTCAAAATGAATATGGATTGGGATGG
GCTGTAACACCTGAACATGAAGTTTGCAAAATGTGTAGAAAAGATTATTT
TTCTGTGGAGCACACTGGAGGAGCAGTGGGTGCTTCTTCCATTCTCTTTA
TTCGTCCTTTCAAGAATAGTAGTGATTCAAGGGATAAAAAGGGAGAAGGA
ATCAATGGAATGGTGATTGCAATCATCACAAATATGGAAAATGTTGGACT
AAGGGAACTTGCAAGAGAAATAGCGCAATTATTTGAGGATAACMAAGACG
TGGTCTACRAARAAAAACMAAGCCTCTCTTAATATTTTTCCATGGCTTGC
AAACATAAATCTTGATATACCTCAAAAAGGATTCAATGTACATAGAATAT
ATTCACATGTTATATATATTTATCTTTGTTAAGTGAAGGATTGTTATTTT
TTGATTATCTTCTATTTTTAGATTTAATGAAGACATGCGTATCTTTAATT
AAAAAAGCCAATCATTTATTAATTAATTGTAATTATATCTTAATATTTAA
TATCTCACATGGGCTGAAAAGTATCGGGCTTGATTTTTGTAAATTAACCT
CACTTTCAGTTAGCTGTCGATTTCCTCGTCTCATTTGATCACGTCGTTAC
CTTTATTGTATCAGACAMCCTTTTCTTWAAAAATAGTARAAAMAAGCCTC
GAAATCATTTTTTAGTTAGCCAAATCAGTCAATAATCACTGTAATTGATA
TTTATCCCATAAGTACTCACAGACTATCATTTGTCATATTATTTATCCAC
AATTTAAAAAAAAAGTTAGGTACATAAATATACTTTATAGTAACATTAAT
ATCCTACATAGTATTATATTCGATACTGTATATTTTATTAAAAGCGTAGC
TATACACTGGTATTTCTATTAGATAGTCAAAATTTCTTCATATAAACAAT
AAGATACCCAGTTTATATATATACGAGGGTTGTTTGAAAAGTCCGTGAGT
GTTCTTTCATGAGATGCTACCAACTAAACATAACCTCGATACGCACACGT
AGTCCCATCTCTCGGACTTTG back to top
|
