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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s250 | supercontig | LSalAtl2s250:514305..525469 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004760 >EMLSAP00000004760 ID=EMLSAP00000004760|Name=EMLSAP00000004760|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=991bp
MDRPLLMDXTXTEDRIRVLEKARVLHSPSSYEEXELDNGEDELLCPRAGC
LGDPQRAALDYLIFRHFRSFSDAISDDKFDPSYIYENETTDEDRNGKNLL
EIALLKSPGGRDRFVETLILHPNATRVDEINELLETSPLHEVARRGDPEL
LRLVLEAGFPYDVNIPDGEGLTPLHVVVESLEEADDAKRTCYLKCMELLL
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LIVVVLMNLLNGLAVSDTGLIREEAEVLGWLSRVELITYTESMLLGDPFY
FLSNWPAIKLLKKLPHCGVCRILYKFPFMRDLLQKVTGGTKXLLFYSCLP
SKRATFFPNKRGKSLFGYKRSLKIDDESRKAPNLYVSTDVLESAKXLILE
KLRRREEEEIAKNQFQKLEMKIDRIESILIKCISSNQAFAS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s250:514305..525469+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004760-700607 ID=EMLSAT00000004760-700607|Name=EMLSAT00000004760|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=11165bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s250:514305..525469+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGATCGACCTCTCCTTATGGATAYAACAAWGACAGAAGATAGGATTCG
GGTATTAGAAAAGGCGAGGGTATTGCACAGTCCATCCTCCTACGAGGAGM
ATGAATTAGACAATGGAGAGGATGAACTCCTCTGTCCCAGAGCAGGATGC
TTAGGGGACCCTCAGGTAATTTTCATTCGTAATTATTGCATCGCTGATTG
GGAATTAAGGAGCTAAGGTATTAATTGTTTCATAATGTCTATTTATATAT
ATGATGTAGGCATTGCGCATGCGTCACTTTCAGAATGCCAGAGTAGGCCT
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TGTTATTTTCTTATCTCCAACTTGATTCCTTTGGTGGTCCCTAATCTCCT
TTTGAGAGATGTTTTCATTAAAAAAAATCATCTGTGGATTAGATGAGACA
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GGATGAGGACCGTAATGGAAAAAACCTTTTGGAAATCGCATTACTCAAAT
CCCCAGGAGGCAGAGATAGATTTGTGGAGACTCTCATTCTTCACCCCAAT
GCAACTCGTGTGGATGAAATCAATGAACTCTTAGAAACGTCTCCTTTACA
TGAAGTTGCACGGAGAGGGGACCCGGAGTTACTTCGACTCGTACTCGAGG
CTGGATTTCCATATGATGTTAATATCCCTGATGGAGAGGGATTGACTCCT
CTACATGTCGTTGTAGAGTCCCTTGAGGTGAGTTGCTGTTTTTTTAAATC
TAATCTTCTTTCTTTTGGGGGGTCCTTTTTAAAAAAGGAGGAAAGGGACT
CGGTAGACTCTACGGGGTTCGTCGGMTTCTTTTCTTGTTGTACTATGACC
ATATAGATACATAAATTGCTTTCCTTATAAGTATGTATGAATATGTTTTG
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GTGAAGAAAACAACAGCATAACAATTAAGATCGCTCCGATCAAGATTTCC
TAAGACTTATGACCTTACATATCAAATTACATACTTGAACTATTTTTTTA
GCCCTGTATGTAAATAGGCTATGATTTTTGAAGGAAGGAACTGCCTCTGT
TATTGCTTCATGCTTAATCTAATATAATGCAAATATTTTTACATCAAAAT
GATTTCATTTTAATAATAATAATATGTATTTACATTCGTTCCACCATGAG
TTCGATGTAGTGCTTATACCACGATTCATAACTAAATACGAAAGAACATG
ATTTGGATATTTAAGGCTATACGGGTATTAATAAAAACCACTCCACGCCT
TAACAAAGGTCAGAAAAGTGTAATTTAATGCTTCATTTGCTTAGAGGCTT
CTTAGATTTTACATCATATTTATTCATTTCTCTAATGTTGTGTCGACTCG
AATTAAATGGTTTTAAATCTGAAAAAAATCCCGAATAGAATTCATAATTT
ATTGAGTCGGGTTAGAGTACATATTTGTATCACTAAATCTTATCAAATGA
TGTTTTGAGTTTTGTGACACTGTCCCTAATCCAGGGGAGCCCTGCAAGAT
TATATATATTTTTTTTTTGGAGGGGGGATTAGATTTTGGATATTTTCCGA
AAAAAAAATTAAAATTCTTTTTCAAAAAATTAGAAAAATTATTGCAATTC
AGAAAAATTTCAAAATTTAATTTGTTTTAGAAAAAAAAATTATAAAATTA
AATTTGAAATATATAATTTTAAAAAAAAATCAAAAATTCATCTACAGTAA
ATAAATTTTTTTAAAGAAATTTGAAGAATTTAATTTTTGGAAATTATCAC
AATTTCTAATGTGGTTTTTGAAATCTCTACGGGGACACAACAGTTTTGGA
ACAAATTGGTGCATTTGACAATATGCACGAAATATTTGCATTTTATGTGT
TCATACAGAAAATAAAACCGTAGAAATAGTAGTGTTTTATTTGGCTAGAA
AATATCGGGCTTCAGGCTATGTCAGGCAACAAGGGATCGAGTTTTGGACC
AGCTTCCGGGCTTTCAGGACAAAATATGAGAATATATACAATAAAAGTAC
TCCAATATTTCATCTTGAGAGCTAAATATATTTAAACACCAGAATATAAT
AAATAATTTAATGAAGTCAAATCTCACACAATACGGGTGCTTGCAAGATT
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TCAGAAATAAATATCGGGTTGGAAAGTTTGAACCACAGACTTTTATATGA
TTGTCTACTCTTTTACCCTCTATAAATATTCTTGACGTTGTTGATTCGTT
GAATTCGAATGAGCTCCTTTCATTTGTGAACAATTCTGTAGTTGGGAACA
ATTGGCTAAATAATTACCTACTGATMTTGTGCCGTTCTTCTTTTTCAACC
CTTTCCTGATTGGAAAAAGTACTCAAGTACATTGCTCATTCAGAATAAGG
GAACTCACGGTACGAATAAAAAAAAATTATATGTATATAATATATGAACA
AATCTTAAATAATTTTAATTAAAAAAAAACAAAAAAAAATATGCGAGTTA
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GGGGGGGGGCTTAGGAATTGAGTATAGCTGAATATMAATGTTCACATGAA
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ATACCTCTGACGTTATTGTTTTAAAATCTCTCCCTTTATGGGTATGTACC
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TGATGATGGTGTAATCAGAGGAGGGAGTCTTCTTCCTGTCTTCAAGTCAA
CTACGTTGTTGAACAGACAAATAAGTACTTAGGTAGATATTTGATACTCA
TCACAAAAAGTCGATCTAAGCTTACGTCAAAAAATAAAGTCATAACAAAT
GGATTAAGTCATGCTCAAAAAAACAAGAACTGAGGATTCCATCTAACTGC
ATTTGAATTATTCGTAATGACTGTTTTTAATTTGAGTGATAGCTTGAGTG
TGTTTGGAAGGTAATTGACATTGTTAATTGGGGTTTCAGAGTAAGCACCC
TTGATCAAATCTCCGGATATACACGTTACAACAATATAGTCTTAAGAATA
TTTTTCTTCTTCTTTTTTTTGGTTGTTGAAAATTATGCTATGTAAAAAAA
ATTGATAACTTTTCTAAAATAAAAAAACTGGTTTTTATTTATTTACCAAG
ATGAATTTCGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTGACAACTGCCGTTGTCTT
TTATCAAAAATTTAGTCTGGAAGGATGTAAAATTCCCTATCACCCCAAGT
CATGAGCTTGGGTCGGAAATAAATAGATTTTATGATATGTCAGCCATCAA
ATGGGAATAAGGATATATGTTATTCTAAAATATTGTCTGGATTACTTTAA
TCATGTGGCTGAGCTCACCATTTCTGATATTGAAGAGACTAACATTTTTT
CTTTTATAAACCTTTTAATTGCTCCTATATGATAATAGTAAATTCTAAAA
AAAGTGGGAGTGGCATTGAGTAAAAAAGGTTTGTTCTGGTCCAAAGCTTT
ACTTTAGTATATCAACATAAGCAATAAACACGCATTGTCGAATCGCAACC
TCATCGACTACTTGGGGATGTGTCACTTGACTCCATAGAACTCTCTGTCA
TAACAAACAAACAAAAGCTGTCCAAACACTAGGGTTCATTCATTACACAC
ACAGCGTCATGTGTCAGAAAAAATAAGACGAAATATCTGGCCCATCCATT
CATTGGCCATATACAACTATAATTATGTATAGCAACAACATCATAATTAA
GTACATTATATGTATTTCTCTACCCACCCTAATTATACCCTCACATCATA
AATAATATTTGATGGATGAATAGCTACATATGAATGAGTGAGAAAGGGAA
TACTGACAGCCTCACCCCCCCCCCCCCTTGCAAATCATGAATGCTGCCTT
GTTATGACAACTAGTTTAAAAATATTTTTATAATTAGTGATGTAAAATGG
TCAAATCCTTAGGAGTGTAAATTAATAGAAAGAAGATTTTGTCGGTAATC
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TTCCCTCCACAAGATATCAGATGTTAGGATATTAAAGATGACAGTACTTT
AGACAGTGTTGCCTTGATTTTTCTACTTCTTTCCCCTTTTAGAAGGTTCT
GAAGGTTATTGGCTARATGAATTAGAATTAGTTCTGTTWGGCTGTGATCA
ATTCAGAAGGGGTATTAAATACTAATTCCATATTTGGGAATAACTACCAG
CTGATTTCAATCTTTTTTTGTTTCTGTTTTTTTTTATAAATAAAAAGTTG
TAAGATACAATAAATGTAACGATGTGTGTATAGTTTTTTCTCATGACGTA
TGCAATTTTATCTTTCCTTTGCAGAATTAGCCTTCTTAATTCAATTAAGA
GGGTAAATTCATTAAGTTTGTATGTATAGCCTATACAGGTTCGTTAACAA
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AGAGACTAATAAAAAGAATGCCAACAATTTATTTAAATTGTAAACACATC
CACTCCGTACCCCTTCCCGTACTCAGCGGCCTCACCCCAAGATACATAAT
ATTTGAAGGTTGATATGGATATCTGTGTGAACAGTCTCACTTCTTTTGCA
GATTATGTACGCGGTACATAATTTAAAAAATTGTGATGATCAAATCAGGC
TGTTAGGGCTCCCAGAAAACYGGRGAAARAWAATTTAATWTTCTCTTTCT
CCAGTTTTCTGGGAGCACTAMCAGCCTGATATGATCATCACAAATTTTTT
TCTCCTACATCTCATGAAAAAGGGATTTTCATTTTGAGATTCCAAGGGCA
AGATATAATGTGGGAATTTACTGCTCTTGTGAGGGGAAACTTTGTGCAGC
AGACCAATCCTGAGAAATTACACCGAGGGTTGTATTCGTGAAATCTGTTC
CCATCCTTATTCTGGAATATTTGTTTGTTGTTGTAATTGTGCTCCTCCAT
TCCAAGGTTTGATATTTTGCCATATTTATAATTATCTTTATGTAAATTTT
AAGGATTATTTTTGACAGAAGAGAAATTCCTCCACTTAGTTGTGCTCTGG
GTCTTTCAATAGCTTCCAAATAACTTTTATGAAACAATATTGGTATCAAT
TTTTATATTATAAAGGTCAATCCTCATCTTAAGATTAGATCCTCTCCACT
TACTCAACCTCTGATTAATCTGGGAACAAACACGATCCCACTTACGTATA
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AGTAAATATTTACTAATTAGAAAAATAAATTTTCCATAATTTCAACAATG
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TTTGTGAGTCTCTTCACTAGTAAAGTAGCTGAAAGTAACCCCTAAGANNC
AAAAAACTCTAACTACCACTAAACTTTCGCCAAGTTAATTAGGATTTATA
GCTTTAAATGGCTATACTATGCCAAAGGTATATCCTTAATAACGCCCACT
ACATAGAAAATTGGAAGTCAAAGTTCCTTCCTTGGGTAATTAAGCTTGTC
TTGGACGGAAATTAGGTACTGTAACAGGGCGGGTTAATAAGGATTAATAA
CACCCAATAGTGGCTTMAGGAAAATGGAATTTTAAGGTCCAAACCTCCAT
CGCTGAGGCTATGGTTTCGCTGCATATCCAGTTCAAATGCCAGTAAACGA
CTTAATCAGAATATAAACGCAATAAAGTTACCCGTCGGTGACGGGGCAGT
AGCACAAAGTCCATTGCAAGTACTTACAATGCCTTTAGAGGCTGMTCTTG
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ATTTTTTTTGTGTTAAATATTTCCAAAATTGACGAATGAATAAAGAAGTT
GTTAGCAATTATAAAATTTAATTACTTTTCAACGCAACACCCGTTATATC
GGTGGTAAGATACTCATAGAGGGGCTTAAAGGTCTACAGCCTCGTAAAAC
GATCGATTCATCATTAATTCGCTCAGCTACTAATGAGTACGACTTGAGTG
TTTACATTATATATGTAAAAAAAAAATGAAATTTCTTCTTATTGACGAGA
AAATTTATTATTTTATGCTTCTTCAAAAAAAAGTTGTTGACATTTTATTT
GTTTACTTCTTATAGCTATATAGAGAGAGTGAATAGATCTGCTCCCCTGT
CCTAGATTTGTTTTGTATATGTTGAGAAGTTGTTGTACGTACACATTTCT
GAAAATAATCATAAGTATAACAAAAACAAAACAAAAAACCAATTTTCGCT
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AAGAATGAAATATATTTATATACTACATATATTGATGAGTTTGTGATATA
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TATATTTGATTTCTTTAACTAAATTCCCCCCTTCATTTCCATTACAGGAA
GCTGATGATGCAAAAAGAACATGCTACTTAAAATGCATGGAGTTACTCTT
AAATGGTGAGCACATTGAGCCCAATGCAGAGGATCTGAGAGGGAATCTAA
CTCCTCTTCACTACGCAGCCAACATTGGACTACAACAACCCATTCGTCTA
CTATTGGATCGAGGAGCGGATCCCAATTTAGAATTTGAATCCGGAGTGAC
CATTTCGGATGTCATCAAAAGGAAAATTCCAGAGTTCGATCTTGCTGACT
ACGTTTATAAAATCAAGTCTCGTCCTCTTAAAAGTCGACTTTTTGAGTAT
GTTGAGAATGGGGATATTCGTGGATTAGAATCTGTCAAGGATGAGGCTTG
TGAGCTTTGGAACTCGGACAATGGAAGTTTGACTTTACTTCAAATGGCAT
GTGTTAAGGGGTATGATGGAGTTGTTCGTTGGCTTCTCACAGTTGGAGGA
GCAGATCCCAATGCTAGATCCGGTGGAGAACCAAGGACTCCCATACTCAT
TGCAGCTCATCATGGATACTACAGAATCCTTCGTATTTTTAGAGATGAAG
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TGACCCTTTAAGGAACCAAGTAATAAATCGACTCCAGAGTCTTCACGAAT
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CCTTTTTTCTTCTCCTTTTTTTTTCTTTTTAAATAAAAGATTAAGTTTTT
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AAATTCGGATCCATCACAAATGGATAGAAGACCTTTGCCAGAAACAGAAC
CTCTATGGTACATGAGTATGGCCTCAAAAGAACACCGAATGCTTCTCAAA
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TTACTTTTATATCAATCTCTTTCTTTATTTCACATTCGTTGTATTATTGA
CCGCCTTTATTTTCCTAAAATACGGAGGTGGCATTGTTCCTAAAAACGAG
GATGGAACTCCCGTTCAAGTCGTTGACACAGTAAACATCATTTTACAAAT
ATTTCTCTCTGGACTATTATTAGTACTCTTCTGTCGAGAGCTCTTTCAAA
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CTCACCGTCATCGCCTTATCCATCACAATTATATTTGGATCAAATTCAAC
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TGATGCATTCCAATGGAGGGGAAAATAAGTTTTTTGAGTCTGTGAGCCTT
TCTCTACTCAAAACATCAACCATGTTTGTCGGAGAGCTCGAATTCTCCGA
CATCCCCTTTTCAAACAATGCTCTCTCCTATCTTATTTTTGTTTCCTTCA
TTTTCCTCATCGTAGTCGTTCTAATGAATCTACTCAACGGTCTTGCTGTA
TCAGACACTGGACTCATAAGAGAAGAAGCGGAGGTCCTGGGGTGGCTCTC
AAGAGTCGAACTCATTACATACACAGAGTCCATGCTTCTGGGCGATCCCT
TCTATTTCCTCAGTAACTGGCCTGCCATCAAACTACTTAAGAAATTGCCT
CATTGCGGAGTTTGTCGCATCCTATACAAATTCCCCTTTATGAGGGACCT
TCTCCAAAAAGTGACGGGCGGCACCAAGATKCTCCTTTTCTACAGCTGCC
TTCCATCCAAACGAGCAACTTTCTTTCCCAATAAGCGAGGGAAATCCCTC
TTTGGATATAAAAGAAGTCTCAAGATAGACGATGAGTCCAGAAAAGCTCC
TAACCTCTATGTCAGTACGGACGTTCTAGAGTCAGCAAAGAGMCTAATTC
TTGAAAAACTGCGACGGAGAGAAGAAGAAGAAATTGCAAAGAATCAATTC
CAGAAATTGGAAATGAAAATTGATCGAATTGAGAGTATTCTCATAAAATG
TATTTCATCCAATCAAGCCTTCGCATCATAAGACTGTAACTATCCATGTT
TATAAACCATAGGTTAACTGTTTTTGCGATTCTGTTTCTTGTAAATCACT
TGTTAAAGGAAGTTATATTTTATTTGGTACTCCTCCATGGGTATACTCCT
TACGTAGGTACTCGTAAAAATTTGTTATATGCTTTTTATACTCGCTTTAT
TGAACCATAAATTATGTATCAAGGATCTCAGTTAATACACAAATCAAGAT
AAATAAATATATGTATTGATTCTAGATAAATTTGTAAGTGAAAAACCCAT
TTAATTTATTTACTAATGCTTATTATAGTATTCATGTCGTAGATAGGTAG
TGTTATAGGTATATT back to top
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