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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s251 | supercontig | LSalAtl2s251:1649217..1675387 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004784 >EMLSAP00000004784 ID=EMLSAP00000004784|Name=EMLSAP00000004784|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=767bp
MTSKLLIHNLHRDDSALFQCFASNQFGKAVRSIRLVVQEPPEVPNNPHIV SFSSRNANISWSKPYDGRSQITAYIIEYKMEKGTTYFLRFISLSESWREA SKHIVSGTSNWAELQSLAPSHAYEIRMSAENGVGVSGKTPILKLRAKEEI PEGPPTGIRAIANGSQSIIVTWRAPHPELRHGVILGYYLGYKVRNSSEPF RYQTLEMKHRHERRRKESLELILYHLKKYTEYSIVVQAYNGVGAGPRNPE IHIRTDEDVPSSPPSNDYRVFYRPLREWEDNPLVRDLRTSGLKITLYDLD KYQNYTIQNQPYSFWVTCSTIEGQGLESEIVTETPSLPIPASIASFSQSM FGAINEEIFFPCISIGKPKPSISWTFNGEDLRPSSRILVDQTRDNSLWIT ALELSDSGNYSCMVKNHFGSDSILIYLTVKKSRNNGVPPAPPTLSVVQTT PSSITLGWXPSADGGSPLLGYRIHHHREFGDWDRTDINPLNNSFTLKNLR CGTHYQFYIQGVNDFGVGERTETVSARTRGTSPIAPFNEDFISVNSTSIV LKLDAWRMGGCPISSFVVEYRKSEKLLQDSSTSWILVNNNVKMTEDRTFA VLDLSPQTAYSLPTIAPKLMIHSGYGGIGFLLSPGFLFSFFSVILLAVII GVIVRLKWPLFQRSRGSDPNNIMPQHLCSNNESDKQIILPQSISEETRNI QNEYLLDGFCPPSKSYGTLGRKKTYGKPIILQHHHHHVHHPGNFYSEDSN IDPVEDSELEATALYPG back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s251:1649217..1675387- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004784-700631 ID=EMLSAT00000004784-700631|Name=EMLSAT00000004784|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=26171bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s251:1649217..1675387- (Lepeophtheirus salmonis) ATGACCTCCAAGCTACTTATTCATAATCTTCATCGTGATGACTCTGCTCT
CTTTCAATGTTTTGCCTCCAATCAATTCGGAAAGGCAGTTCGCTCCATTC
GACTTGTTGTACAAGAGCCTCCTGAAGTCCCTAATAATCCACATATTGTC
TCCTTCTCTTCGAGGAACGCCAACATCTCTTGGAGTAAGCCCTACGATGG
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AGGGGGATTATATCCCCTCTAGTCCAACCCTTTACGGACGCCCTAACAGA
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GTGGACACCCCTGATATTTAAATTTGTTATTTAAAAATTATTTTTCCCCT
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CGAGTACCAACTTACGAACTTTGACACGCGACACATCACTTTTATTTATT
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TAAAAAGGCTTTAATGGCCATACATATAGTGGTTGAAGGTTTCAATGGTC
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TCACTACTTTAGAACACTTTGTGTTACACTTTTTTAATATCCTGTGACAT
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TTCGCAAGATATGTCAATAATCTTAATACATATTAAATATATTTTATTTG
TCTTCATAAACCATCGATATTTTTATGAAAAATTCCAAGGACCGGTCCTA
AGACTTGACTGCACCNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTCTTTTTTGAAAATC
ATCCCGTGATCCCCATTTTCTCAACCACTGCACTAGGTCACTTATGAGTT
CTCGTAGGAATTAATAAAAAGGCATCAACCCCAAAAATCCATATTCTTTT
AACTCTAGAACGTACTTCTTACGTTTCATTTCCCTTTCAGAGTCCTGGAG
AGAGGCCTCCAAGCATATAGTTAGTGGAACAAGCAACTGGGCCGAGCTTC
AGTCCCTTGCTCCCTCTCACGCCTACGAAATTCGAATGTCAGCCGAAAAT
GGAGTGGGGGTATCAGGGAAAACTCCGATTTTAAAGCTGAGAGCCAAGGA
AGAGATCCCAGAAGGACCTCCAACTGGGATACGAGCTATTGCTAATGGGT
CGCAGAGTATTATCGTTACATGGAGAGTAAGTACATTTACCCTTTTTTGG
ATGCCTCCATCATGACATTACATGTTTATTGTGTGGGTTTTGCTTTTTTT
TTTCCTAATTCGTATGTTTTTGTTTTTTTTGTTTTGTATCTAAACTTTTA
TTTTTCTCATTTATGACTATGAGAAGAAAAGGAGGGGGGTGGGGGGGGGA
AGAACAAAAACTTTTAGTTTAAGATTGTAATATATATTTTGCAAATACAT
GCAATCCCATAATTTGATGACAAATTTCATGAAATGATGGTCAAACTTTC
TATCCTGTAAAAGAAAAGGTAGGATATTAATGATACCCGCATTATTACCT
TGAGGATTATACCTAGGGAAGACAGGGGACAGTTGAAACACTTTTTATTA
TTTCGCCGTTAAGCACAGATAGTCTGACTCAAACAACCCGAAATTTGACA
CAAATGACCATACATAAAAATGACAATATGCTCCAGTATGTTTAAATAAG
GAAACAAAAGTTAACTTGGTAATCGTTAAGGGTGATAGAAATACAGGGTT
AGACCATTATTTAATCGGGCCTCCTAGAATTTTCAATTTGACGCCTCGTA
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TAGTCTATGACGTTACTATTGCTATAATTTTTAATTCCTTGTATCTTACC
GACTCCTGCGAAAGAAAGACAGATTTTGACAAAACGCACAACCACTCATA
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CAATTTAAGAATATTGGTATCTTATTATTTCGGAAGAGGTCTCCAATGAG
GAAGAAGTCGATTAAATATTACTGATCCTATAGACATCTATGTTTTATTG
TCTTGATTGAGTCAAGCCCGTCCTCTTTATAGACATTTTGTTAGATAAGC
TGAAAATAGTCGTATGGAACATGTAGCTCAGTGGACAACGCGCTCGGGAG
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GTCAGTTGGAGTAAATGTAATACTATAATTATTTACTTATACTTAATCAA
TGCCACTCCATCTGACTATATAAAGGAACACTAAAAGCATACAGCTGCGA
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CAAGAATTAAAGTGTTGTCGATCTTTACTTCTATTCTGAGTCTAACAAGG
ACACACCTATAAACGCGGCAGATTTAAAACTTACCTATATCCACTTGGAA
GTTTACGGGGGAAATCTTATTAAATTTCATCCTTCACACCCAGCAAGATA
CTTAATATTTTGTGTAAGATTATCCATATTTTTTAAATCGAGATCCTTTG
CCTGTTTTTCGTGATTTTTTTCGTCATTTTTTTCAATTTTAATAAACTTT
TCGTAACTTTATTTTTTTGTCATCGTTTCAAACACTTTTGTTTAAGTGCA
GCCTAGTATTTTGTTGTCCTTTTTTCTAAGAAAGTAATTTTAAACTAAAA
TATTAATTTCACGTCGTTATCTCATCATATCACGCAACCTTTCCTCCAAA
AAGAAATCGAACACAGGCCTGAAATCAGGTGGTACTCAGCCAAATAAGTC
ATTCATACCAACTGTCATTTATCTCTTAAATACTCTCAGACTATTCCTGT
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ACAAAGTATTTTATTTGATACTGTATTATAAAATTGCTTAGTAATGTTTG
ATTAAAAGAGTAGTTATGATTAATATTATATTACTACATACAAATAACAA
AATGGCCAATATGCATATTACATAATCGATGAGGGATAACCAAGAAATTG
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TGTGAGCGAAGTACGGCCTGATTTATATCAGTAAAAGGATACTTTTCTGG
ATAAATAAAGAGGGGGGAAAGATAATAAAAAGAATATGACATANTAATAG
TTTTTCCGTTGTTTTTTGTTTTTTTACCATACCTTGATTGGATNNNNNNN
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TGTATTATATTACCCTTCTATTCTTGAAGAGATAACATCTAAGTTCTATA
AAATAATCACTAGTCTGTTAGAGACAAAGAGTAACTCTCAGATCTTGTTG
TGGAGTTATAACCAGTGCTCGAGAGTTAGGGGAATGGCACTCCCCCCCCC
CCCCACTTATCCYCCTACAATAAAAATGGTAAAGGAGTACGTGACCAGAC
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GAGATGAAACGTAATGAAAGCAAAGATTTTCATCCTTGATAAGGAGGGCT
TTACACCGAGCCAGAGACTTTACTCGATCCAAAGGCTTCAAACCCTTATA
AAGAATTATCTTGTAGACATGAAGGTTTAAGTCTAGCTTTACCAAGTGAC
ACATGGTAGTCTGACTGCTATCAAATTCACGAGACATGCCATTGACGGTC
ACCTTGCCTCTCCTGCCTTCAATGTGGCATTTAACTGCCTCAACCAATTC
TTTTGACCTCTTTATCCTTATCTGGATCTTGTGATATCTTTTGGTGTGCC
TCTCACGGTCACCTGTTGCACAGAAGAGCGGCTACARCCCAGGGCTTTAG
ATATCTCTGATGGKGATTTTCCACGTGTGGATAGCTCCAGAATCGCAGCT
CTGCATTTCTTCATGTTTTTGGTTATGAAGCTCTTAACTCTTGCTTTACT
TTGTTTATTTTTTGTTGACAGTACCTTAATAAAATTGTTTAGAGTAAATT
ATTAGGGTTAAACGTCGAAATATGTCAAATAGTACAAAGGCGCTCCATTT
AAAAAGTCTTACATTTTAAACTGAGGGGCTACTATATAAAAATCGAAGAA
AAAACCCTTAATGTCATTTTGTGTCTCCTCTATAACTACAAATTAAATTA
ATTTCTCTACAAAAACTCATAATTAAATGAAATGAAGTTTTAATGAGACA
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TCACTTGGGTTTCTTATTTGATATAATTAACATATTTTAAATGATGAAAC
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ATGCAATTTAAATAATAATACTATCATCAAGGAGGGGGAAATGGGACGTG
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GAAGTAAGCTAATCTGTATATGATATTTAATATTCATGTGATATTTATTA
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ACCTCAAGGATATTCTGCCTTAAAATATAAATAAATGATGTTGTTACGTG
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AGCTCAAATTGGAAAGTAATTATGATTTCTATGGATACTAAGCCTGATTG
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNATTATTACGTCTCTCAAGTTTAATAATCACTTTTATTTACTTT
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CCGTTGTTTATTGAACATKAAATTAGACTGGAAAGAAAGTAAAKAGTATT
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GTGATTATTTTTTATCCATCTATCGTTTTATTTTGTACTAGTGGTAGTAA
CTTCCATAGCCCGGAGATATAAAGTATCGTTGAACTATCTAAATTTGCCT
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CTCTATAGCACAACCTAATATATGTATGGTATACATCAGGAAGCACTATA
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GTTATTTCTTAGATCAAAAATGTGAACCTATATGAGTATGATATATTTTC
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CTTAAGTTGAATCAATTTTACTTTTTAAAGATGCTTCACGACCATTAGCA
GGATTTTTTCCTACTCAATTCCGTCAAATTGTAATCCCTCATTAAAAACT
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GAATACGCTTTAAGATTGAAGGAAGCAAGTGTTTATGTAATTTTAATTAC
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AAGCCTTGAGCTGATTCTCTACCACCTAAAGAAATACACGGAATATAGTA
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ATCCATATAAGAACTGATGAAGACGTTCCTTCTTCCCCTCCATCCAATGT
GGCGTGTKCTCCTCTCTCCTCCACGAGTCTCCTGATCCTTTGGTCCCCTC
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TCGTCCTTTACGAGAATGGGAAGATAATCCTCTTGTTCGGGATTTAAGGA
CAAGTGGGCTCAAAATCACTCTATACGATTTGGATAAATATCAAAACTAT
ACGATACAAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCTAATGA
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CCCCCCNRCCCCKRWTTTWTAMWWTWTTTTTAAAGAAATATTTTTTAATG
CTTCTCTTATTTTAAGACGACATATACGGGGTGAAGAAAACTAATTGACA
TACACACAAAAACTGAGTCACTAGCAACCTCAGGTTTTTTTTTTTTGTGT
GTGTGCCAATTTTGGCATCAGAGTGGGCCATGAGTCTCAAGATCAGGCCT
TTAATTTGTGCGGGTCACATGTTTATTTCCATATAATTCTCAACGAAAAA
TGTATCTAAATACAAATTATACACTTAATATATATTAGAAAAAGAATGCA
TGACTCATGTGAGGAAAAAAGGACAATAAAATTATATATCAATATACTTC
ATTGCATCCAGGATTCCATGCCTGAGCCACCCTTCGTATCCCTCCGATAT
ATGCATAAATAAAGTGCTACCTTCAACCCATTAAAAATAAAAGATAAATT
ATCATTCGGATATTTATGTTTCTGGCTATCTCGTAAGGCTTTATTAAAGT
AAGATACAATATATTGCTAGACAAAGGCAGTTTATCAAGTCAAAGAAGTT
TGAAGTTAAGAGATAGTCTGTTAACTAGTCCAGGATTAAAATATAGCAGG
ACTCCATAGGGAAGCCCTACATCGAATGTCAGTAAAAGGATAATTTTCAT
TATTAGTGTAGGGTGAATCTTTAATTATGACTGATTAAGACTGAAGTTCC
GTCCAGTTCAGTCGGGCATATCATTCCAAAAACTTATAAATTTCGGCCCT
TGATGACGTCACTCAAGTTATTTTTTATCCGTTCTAGTACTGAGAGTCCG
AAGGACAAACAGTCTTAAGGAACGGTCCTGGACGTGACACAATCGGGACA
GTACCGAATAAATCAGGACTGACACAACACAACAGGGGCGTCCAAAAAAA
TCCTTTCTACTAGAAAATTTCATATTACAAAAAAAGTTTCAAATTTTTTG
TGAAGAGCTGTAGATTTTTGAAACTTTTCTTTCTATAAATTTAATATTTA
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TTTTTTGAAAAAAATTTTATACTCTGTGAATTTTGAAAATCTGTCCGGAG
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AAAATCCATAATTTAACATTTTTGGAAAAAATTGAAAAATTGAATTTAAA
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TAAATTTTGAAAAAAAAAATTCAAAAATGTAATACTGTGTGAATAGCTAT
GAATTTTTGAAATGTATTTAATATTAGAAAAGTAATTTTCCAAATTTTTT
TCAAAGAAATAATCCTGCGGACGCCCCTGCACTAATCATAGTATTAGCCG
ATGAGGACATAATCGTATAGATAAAGAGCTGGTCGACAGTAATGTATATA
GTTTTGTATCAAATAAAAAATATATAAGACGTTCAAGAAACATATGCAAA
CACTGTGACTATAAGTTTTTAGTTTTCACCCTGTACAAAAAGAAACCCCA
AAGAAACGAATATATTCACTGCACGAAATTACATCTTTTTATTTTATATA
TTTTTTTAAAAACATATAAAATAAATAACAACATCGAAGGAGACTTATTT
TAGAGTCCTTTTCCTCATATTTTGATCCCCTTTTTATTATTATGACTACA
TCACACTCACAAACTAACAGACGAAGTCCTTTACAAAGCACATACATGCA
TAGAAGGTATTTTAAATGTGGCAAACCACGCAGTTTCTTTTCTGTCAAAT
TATATTCTTTTTTACAAAAAATGAAAAATAAACAAAGGAATTTACATACA
AGTAATTCATTCAATTCTTCAAATATAAGACTAGAGAAAAAAAAAAGGCC
TATTCATCATGATTGTCAGCACTCTTCAAGGCTCATTGTTCAATATTCAT
GATATTAGTACATAATATCTATATTTACATAATATTTGCATCTCGTGGAT
GTATCTAGGTTGCATGATCCATTTTCTTACTTTCTTTATAAAGGGTTATC
ATGTGACGTCAGCATTAAAGTTGATGTCGGCCATTTTGGAAAGCTATAAT
CAACCAAAATATTAATTTAATATCGAAATTATCTATGATCGCAGAATCAA
AAATTAATCTCCGTTTATCTTTCAGTCATCTGAATTCAAAAATATCTGGG
ATTATATTAATTCCAAACTATTATCGTTCAGAGTTCTTTTTTACCTTTAC
AACAATCACCAAATTAAAAGTAAGATTAATAAAACTTATTAAAGTGTTTT
TATTTATAGTGTATCTTGTTCTCAATACTTTTAAAAAACACTTTACATAA
ATTTTATTCATCCCACTTTTAACTTGGGGATTGTTTTAAGGGTAAAAAAG
TACTCTGAACAATAATAGTTCGGAATTCATATAATCTCAAATATATCTAA
ATTCAGATAACTGAGAAAAAAACCGAGATCAGTTTCGGATTCTGCCTTCA
AAGATAAATTTATTTTTTTGCTTGAATTCATTTGTATAAAATGTGTGTTC
CAATAATAATCTTTCCAATACTATTTTCAAACCTTTCATCAACTTTCCCA
AAGTAGAACAGTTAACAAAAACTCTTGTAGGTTTTTCTAACTTTTTAACC
CTTCACTTAGTCAAGGTTTAGAATTCGGAAACCATACATCAATGCCTCAA
AACACGTTGCCTGCTCAAAATATCAGCATCAACTTTGGTAAAAAAGTATT
TTAGGACAAAGAACATCCTTAAATGACGTTGAAAAGTTATAGGGCATTAA
ACAGGTTTAAAGTAAAATAGAATCCCTCTAAGGTTAGAGAAAAAAAATAG
GGTACAAAAGAAGGTGGCGTGATTAAAAACACAAAGAAATCAAGGAAAAG
ATCAACCTAAAATGAGTTCCTTAATTTTGATTCAAAAGAGTGGACTTTGA
AAAAGTTGTTAAAAAAAGGATTCAAATTGAATTTATCAACAATCAAAAAT
GAGAACTCTTTTTATAATTTGATAAAAACTGACCTTATTCAGCTATCAAA
ATAAATCATCTAGGTTGCGAGACAACTCCATTTAAAACGGTTTCTCTAAA
TTTAGGATTTAAAAAAAGTTATCTAATCATTCCTACTTAAGAATCCACAC
TAAGCCAACACCAATGGGTCACGTATAAAAAAATATTTCTAACATTTTCC
GACTTTTAAAAGCTGTTTTAAAACTGGAGACTTTTAAAAGAACCAAAAAA
GGGGGTCCCATAGCATGCCACATATTAGGAAGCGATACAACTCTAGGAAA
TACTCAAGTCTTTTTCTCTCTTGTATTTAGTTCCTGGAGCACCTCAAAAT
ATCAAGGCCCTTTCCTTGGATCAACACTCCATCCTAATCTCATGGCTCCC
TTCTCTAACTCCCAATGGAAGGATCATTCACCATAGTGTCTTTATGAAAA
CCATGGAGGAAGGTCGACAATTTACTCAAAATTTTGAAGTGTATCCCCCT
TCAACTACCTACACAATTCGGGGACTTAATCAAGTAACATACAAGGATAC
ACAATGATATACAAGGACACTCTATACATAAAACACCTATTCTTTTATTA
AATACATTTTTTGACCAACTTGAGACTATTTTTTTATTAGTAGTATATGT
ATGACAGCAAATAAAATCAAGCAATCGTGAAATGAATATCCGGTATTGAT
CAGAGTTATAAGACGTCGACAAACAGACAAACTATGTACTCCCCTTTTTT
TATAACACACTGAGCTTTAGCTACACACCTTTGTTGCTACATTGCTATTT
TTTAGATCAAATAGTCTGGCAGATCAAAGATATTAAGTGCACACTCAAAA
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ATTTGATTTAACGTACTTATTTTTTCCATATTTGCATATGAAAAAAGCAC
GTTGGGCCGGAAAAAGACGTATGGTAAACCCATTATACTGCAACACCATC
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GATCCCGTAGAGGATTCAGAATTAGAAGCAACAGTAAGCGATTTTTATTT
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CAGGCATTATATCCCGGATGA back to top
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