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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s253 | supercontig | LSalAtl2s253:921047..991978 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004808 >EMLSAP00000004808 ID=EMLSAP00000004808|Name=EMLSAP00000004808|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=619bp
MESSSGYFTNDEYGLLNAAKFVKNNMEYNSSLEIVKEXPSLYSNLQVILL AIIMTAMMIVIVIGNMLVVIAIATENNLTNVQNWFIASLAIADMLIGLIV MPFSLADELMGYWMFGEXYCXIHAAVDVLLCTASIMNICLIALDRYWSIT RAIDYLNARTPAKVTIMIITVWILSGLISIPPLLGWKQDQDLTWFTQILV EQGNRTQMEFIQDLQDSGRMNMENFTSTLELVVYPQCGLSQDLGYVLYSA FGSFYIPSCIMVFVYIKIYYAARDRARRNITNKHKKRDKTAKSKEREKRK RQKKEEKLNHKKFRDKHGNTNGNLIPLISHPNGKNESNNGEPPTDKNAVS TISSNNKGETNKLSSTEVHLPLPCGACSSVGGTKHRRSVGVSTYEDNETA TAGNSPKVQVTTTNTTNSTKDECTNSHGDTIERSSSNDSGQVRCIKLTSK YFKTPYLLGSKRRSSKEARQVIDTGKARILKSSSVMDVSLQKPSPTSLTN HSLSPFPLQETEAEREKKRIARKKERRATLILGLIMGSFIACWFPFFFLY SISPICPICEEAEGLDRSESIQQSDGCCVMGWGFSFAFWMGYSNSALNPV IYTVFNQDFRRAFKRILFK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s253:921047..991978- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004808-700655 ID=EMLSAT00000004808-700655|Name=EMLSAT00000004808|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=70932bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s253:921047..991978- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGAATCAAGCTCTGGATATTTCACAAACGATGAGTACGGCCTACTCAA
CGCAGCCAAATTTGTTAAGAACAACATGGAGTATAACTCTAGTTTGGAAA
TCGTAAAGGAATKCCCGTCTCTCTACTCCAATCTTCAAGTCATTCTTCTG
GCCATCATCATGACTGCTATGATGATAGTAATCGTTATTGGGAACATGTT
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GGTTTATTGCGTCATTAGCCATTGCTGACATGCTTATTGGCCTCATAGTG
ATGCCCTTCTCTCTGGCAGATGAGTTGATGGGCTATTGGATGTTTGGNGA
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TGGGCTGGAAACAGGATCAGGACCTTACTTGGTTTACGCAGATCCTTGTC
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TAAATATTTTTATCTATTTAACCTGACAGTCAAAATTAACTTAACAAGCT
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GGAGTCATACCATGACTTCTCCGCAACTTTAGCGACGTGTCTTGTCTTGT
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AATGCACCAGGCTGTGAACCGTAAGTTTGTCCTGAACAACCAAGAAGAAT
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AGTTTGTGTGTGTTTTATTTGTCATAGTATTTCAAAATGCAATAATTAAC
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AACAAAAGTAAAAAATAATGTAAACCCTTTAAAGATTTTTAAATTACAGT
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GTGTGTCTGAGATTTGTTCATCATTATTGTTGTCTTCCTAAGTGGCCATG
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TTTTATAGCTCTCGGATCAGTCTGGTTTGAAACTCCAATAACTCGTTCAT
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CGTTTGGACGCCGTAGACGGTGGTCCTAGAGATTTCCAGCGTCAATGAGT
GTGGAAATGGATATTCGTTGATCACATTCAAGACTCGTTTTCTCGACTTG
TACGTAAGCTAGAGAACTCATATTTTGTTATAGTAACTAATTGCTTATAT
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ATATATTGAATTAGTAATTTCTTAGATTTCAGTAACCACCCTGTATTTGT
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TGTGTCATTTTGAAAGCGCTCTTCTATGAGTAAGTACTCCTTCACTTAAC
ACTTCTGCACAATATTTATAGACTATTTTCTATTACTTTTTTTAAAATTC
TATTTTCACTTACTTTTGTGTTGTAAAATGAAGGTTTTTATTTATTGGAT
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TTTATGATTTTTTTAGATGTCTATGTATAAAGTTGTAAAAATATGATCTG
AACACATGCAAGATTTTTTAATAACTTGGTTGTGTATAGAGTGTTTTTTT
ATTTTCCAAAGCTTTATTCATTATTCCGGAAAAGTGAACATCTAATAACA
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GGGTAAAATAGTCCTTGTTATACTCAAAGTATGTTAAGGATCAAAATAGT
AGCAATTCATGTCCATGTCCATGCTTATTTCCTTTTCCCCCTCATTGCAG
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GATTACGATATGCATCACTGAGATTATAATTTAGGATCAACAAGGTAGTA
ACTCCTGCCTTAACATATACCCTTGCTGTATACGGAGTTGGATTTTTGTA
TCCTTCCTTCCTCTCACAGCTGCTTGCAGCTAGTTCAATACAACGTCTAG
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ACGTTTATTGTCGGTTCCTTTTATTTTAACATACAGACATTTCATATTTT
ATACAATTCTAGCAATGTATTTTTATAATTTAAAGATTTCTCTATGCTTG
AAAACAAAAGGTTATCCCCCCTCCTTGATTATTTTGTATTTCATTACCTT
TGGGTTAATAAGGGATGTTTCAAGTTTGAAATGAACTAAACTAAACTTGT
GAGGACATTTGTTTAGGAAACTCATCTGAAAATAGTGCTTGGCACAACTT
TGATTCAGAAATATGAACCCTCAGCTCTAATAATTGTCTCAATCCGATGC
CTAAATCCTTTGCAGACTTTGACTATGTTGTCAGACTCTACTTTGGTCCA
ATTCTTCTTGATAGAAGCCCCTAGAGACCGGACACTACTGTGAGGAGTAA
CACACACCCTCTAGTCTAGATGCGTCTATATAGAGTAGTCCAAGAAGTTT
TTGTCTGGAGAGGAAGGCGGCCTTATGTTCAGGGCAAAAAAGTTAAGAGA
ATTGGCCCCCATAAGGCCTGGGTCTTATGGCTAYATGACAAGGAGCTCCG
TTTTGAGTGAAAACAATGTTGTCCCCGAATTTTCTCTGGCCTAAAGTTAC
ACTTTCTTATCCAGAAGTTCCATGTATGTAGATGCATTGAGGCACTCCTT
CCTCTTCTAAAAAAGAGGAGGGAGACTTTGCCTGTTCTGGCCATAGCACC
CAAGACCATGGTGGTGGGGAATAAGTCAATGGCATGATAAACAGTGGTAT
GGCTGSACCTGAACTCCATGGATATGGCCATAGGGGYCATGCTGCGTTAG
AGAAGCTTCAACATTTCACTCTTTTGTTGCTCCATTGAACTCGCTCTCAT
TTGTTTTGTTTTTGATTGATTCGAAACTTTAAACTAGGAATCTTGGGTCA
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ATTATTTGACTCGTCAGTAGATAGAGCTTTTGTTCCAATTATAAAGTATA
TCATGAATAATTAAGAAAATTCTCCTCCTACCAGGACCCACTAACTCCAT
ATCTTTTATACTTTCTTCAACGTTTAGGAATAAACCTCTTGAAAGAGTCA
CATCAACGTCAAATAAATATATAATATTTATCAAACCTTTTTTCGTAAAT
ACCAATTCTCAACCTATTATTTTTTATCAAGTTAAAATAACTTTCCAATA
CAACAGTCAATATCTAGTTTAAAATTAATAAAAAAATAATAAATGGTTAG
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TTTGGCTTAGTTTTTACAAATCAACACAACCCTAATTCATAAAAAATGAA
TATAAGCTTATACAGCATTTGAAAAGTTTAAATATGTAACTTTCAAACTT
ATTCCAGGATATTCATTAATTAATTGCTTCATTTTAAAAGTAGTTTACTT
TTTGATTGACTTAATTCCATATAAAAAGCTCAAAAGAGTCCTCATAAATT
AGTTTCCACTCTATTTTATGAAAAATAAATAAATAACCCCGATATATGAT
CCAATAATAATAATTTATTACTTATAAACCATTCTCTAAAATAAATGAAG
TCAAATTTATGAATATAGTATTGATCCTCTATGAAAGATATATAAGTCAT
AATATTGACTTAAGAATGTCTTTCATTACTCATGCTGGCTAGAGCATTTA
TTTTTGACATTTTTGTCAATACTTTTATGTTGCTATGGCATTTATATAAC
ATATATGTATATATAATATGTAATCATCGATAGAAACATCTGCAACATTG
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ATACGTCATGTAAAATATGTTTTTTAAGATAAATGAAGGCTCTGAACTAC
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CTTACAATTTACACAAATTTGTCTATGAAATATTGCACTGTATATAAATA
TTGGTTCTAGGAAAATTGCCATTGAGGAAGTTATTATGAAAAATTCCTCG
TCATTTAATTAAAAAATCAAAAATCTTGCTTCAAAACTTGCAAGGCCAAC
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AAGGACGTTGAAAAGGTTAAAAAACCCCACTGCTACTTCACAAAGCATAT
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TTATAGTGAGTTAGGAAGACGTACCGGTTTTACCGTGACTTTACCATTTA
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TTGTTCTTTTGAATCTTTGAGCATAAGGGCTCGCTTTTTATTTTTAAGAA
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TAAGATGGTTTTTGTGTGGACTCACCATATATCTAAATAACTTTGTAAAA
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AAAATCAAACGCTGAAGTTGCCTGTTCACCATCCTTACATAAAGTCATGC
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ATGCTTTCAACATCAACCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TTGGAATGTCTGAGGCCTTCATCAATTACTGGTACGGCATCTTTAGGCCG
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AAACTATAAATAAAAACGCCAAAGAACACGACCACACAGAGGGGGGAAAT
TTGCAACTACAGCATAAATTGATCTTAAGTCCTACTTAATTTCATAGCTA
TTATCAAATTTGTGTCATTTTAGTGCCTATATTTCATAAATTTGAGAATA
CGAGGATCTTCATCCTCTTCTTGCATGGCTTGGTATCTCTCATATGAAAG
CGATGGACATCTGTTAATAAGGTGGTTTGCGTTTTGTGGTTCCTCCATAC
ACATTGCACTTGTATTTTTCCATTTGTTCAAATGGGCCAAAAATGGGCCA
CGACCTATGAACAAGCCAATTCATATTTTGACACGAAAGTTTGAAACTCT
TTTTTTTTTCTTTTTTTTCTTCTACATGTTATGTTTATGTTTCATTTTTT
TATCTTCCTAGTATCTGTTGTACCAAACTTCGAAAAAATAGTCAGCCACC
ACCTTTTTTTATGTAGTAAGGAGGCACTTCCACGCACAAACGATTTTGAC
TTTCAGTACTACTCTTTCCCAGAGAGTCTTCAAATTAGTTTCCTGAATTA
TCTGAATGGCCTTTTCACCAAACAAGATATAGATTTATTTCATATTTTCC
GATACTTCGTATTTCCTTGCACTTCTTATCTATATCACTTTTTGTAAAAG
GATTTAAAATAGTAGGAATTGCCGATTGAGAATCCAATCGAATTATTACA
TTTTTTCGATGGCTTGTCTTATTTAAGTAGAGCTACCGCGTACTGTGTGA
TGTTGATGATTTCTGCTTGGAAGACCGATTTCATGTCACCTTGAGTGATA
GCATCATCCTGCACCTGTGTTGACTTTCTCATCCTTGGATACGGTTGTAT
TTATAATTGTATCAGGGTGTTCAACTTGACAGTTGTCGACTCAAATACGA
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TTATCGTCAAGAAAGCAATGCCCACAACGCCTTTAAAGATCCCCGATACC
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GTTTTGATTGGAGGGKATGAGTTATGCCAAAGAGKATTTTTCTGCTGAAT
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TATAAGATACCACCCATAGGTAATAAAGTGTCTCATCATGGCTTCATAGA
GCCAGAAAACTTTATCTCAGGTTAAATCCCAGTTTTTCCTAATGCTTCCT
TGCCATTCTCCATATACAGGAACACTTCGAAGCTTGTTCTTTTTGATGGT
CGGTCCAAGTGAGACTTTGATCAAAACACACTTCTACGTTCTTCATTATT
GCTGCATATTTTTTAACTTTTCCATCCATATATAATTGTAGAAAGTATTT
AGATCTTAATTTATATGCTGTTTAGAAGTTTATAGTACTTGATTTTGATG
GATTAATGGTGACACCATTTGTTTTCTCCCCATTCCAGAGCCAAATTTAT
TGCATCCTGCATCCCATTGACAAGGGTACTAGGATTTTGACCCCTTATTT
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AACTCGGTGAAGAGGGTATCCATAATTATATTACACATTATTGGAGATAA
AACAAATAATTTGATGCTTTCTGGCAATCTCAGCTTTGTCATTACTGTGT
TTGCTGAGTGAAACTGTATGTAGTCAAACGCATCTGTGCAGTCAAAACTG
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AAGCATGTTAGGGATAACTTCTTCTACTTTCAAGCTACAATTCTTTCGAG
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CGCCAGATTTTTGGTGTATCACTCCATAGAGCTCGGAGATGTAATAGATT
AATTTTTTCCCGAGTTGATGTAGTAGAACTGGTTTAAATCCATCTGGTCC
AAAACTTTTAAAATGTCCTTAGGGTTTGAATGATACTTTGAACCTATTAA
CTTTCAGAAAGTCAATGTTAATGTTGATTTCTTGCAATGGTCTATCACAG
GTGGTATTGATTATACAGTCAGGGAAATGACTTACTATTAGTTTTTATTT
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CCAATTCTGTCTTTGATTGGTTTCTGAACTCTGATCAGTTTTGCAATATC
TTTATCACTTTCAGCTTTACTGAATTACTGAAGCAATCTCTCCATGAATC
TTTTTTCTCCTTTGTGAGTGCTGTACAATATTCGTTTTTTGTTTTTAGAT
ACTCTTCCCTGTGTGTATTATAATTACATTGAGGCTCGAGTTTGTATTTC
ATGATGGCAAGATGTTTTGTCCACCATGGTACTGATTTGGCTTTTGTTGT
TTTTCTAAATCGGAAAGTATTGTCAAACCCCTCGATTATGATATCATATA
TTGATCTATCACTATTGTGCGTTGGAAAGTATTTCAGGTCGTGACTCTTT
TTTTATGTGACGTCTGAATATATCCTAATTTACTCTACCGAAATTTCTTA
TCTGTAATGGGCTTGTACTTTCCAACGTTAAAAATTATGTATCGGTGATC
TGACATTGATAGTCGCAGATCAACATGCCATCCTTTAATCTCAAACTTTT
TAAAATAATGTTGATTCATAATTGTAATTTCAATGCTTGAACTTGCTCGT
TGAGTGACAAAAGTATGTTCAATTTCTTCATTTAATAGTATTAGATTTTG
TTCATCTATTAGGTTTTCATGCATTTCACCACTAATATACGTAATAGACT
CGTTTATTATTAAGCATACTGTGCAAACATCTTTGTCAGATAAATCTGGT
AAAAACCATGCATATAAATGATTAGCAGTTCGAATGCATGCTCTTGGTTT
TGACCCATGTTTAAAATAGATGGTATACCCATTTAGAGCGAGGCTTTTTG
TTTAGCTGTTCCTGAGATATGGTTCTTTTATTAGGGCTATTTGGGATTTT
CGTAGATTTAATTCATGGTTATCTGCTTTGCAGTGCTGAGTATTGATATA
ACAATTACTAATTATTTCCGTTTCTTTTGTTTGGGTCTATCCAATAATTG
GGTTTCGGTGGCCAAATGGAAGAAAATATCTATTTTGGACTAATTTTGTG
CCATCCCGACTTTGTGATTAAATGCTTGAATTTTTCAAGAGTCTTCCACA
CCTGCTGCTTGATTAAGCAAGTCTTTTACAAGATCATCAGATATTCGGTG
GTCCTCAGTATCACTTTTTCTTACMCTGCCAGTTTCCTTAGAGGGCCATG
ATASCAGCCATAAGAAAATATTTTTTTAAATATAAAAAGATATGTCAATA
AAGAATTCTTTGGTAGAGCCTTAATGTTGTACTCCTTTTCATTCTGATTC
ATTTTTCCTTCTTATTCAAAAGTCCTCAATTTCACCTTGCACACTGTTAG
GCAGCAAATTAGTTACCCTTATACCGCTACAAGTGAACCCCATATGAAGA
TAGCTCAAGGGAAGTCCATTATCAACACTTCCTGGAAGAAGAAAAAAATT
ATTACACTTTTATGATTATTTTGAAAAATGAAAGTTCTGTATATTACGTA
CTTCTAACATTAATTATTTTCTAAGTACTCAAAAATACATCTGTGAGTAC
ATGGGGAAAACATTTGTTAATCATGTTCCTCCATGATTGATATCCATATT
TCATTTAACATAAAAAATGAGAAGACTAGAAAGTATATTAAATTAGAAAG
TAGTTTGGTGACTCAGAGGGATAGACATTTCATCATAAGCTTCTTTTATA
AATTAGGGTTGTAATTTTATCAAACATTATAATCACCATATTTAGTGTTG
TTTCAGTCCTTATTTTGTCCGGCCCAATCCAGTCTAAGAACCGATCCTAT
TGGTCCTTGGATCTTAGGACTATCAATACTGGACCTATTAAAAGTAGGAG
AAATAAAGTTGGCTGACGCTACTGAACTCCATAATTTTATGTGACTGATA
TAGAAGACCTAAACAGACTGGACCAAAGCTGAGCTAAATAGTATTTAGTT
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ACTATATAATCCTGAAGATAATAATGTATCTTAACAAAATGGAGCCCCCT
GTCACATATCTAAAAATACCCAAAGATACTGTTTTGAGGTTTTTGGATAA
AATGAATTCTGAGATAAGGAAAAATGCCTCCATCATTACCACAATTCAAG
TCTCACGATTATTATTTTTGAGTGTCTTCGAGAAGAGGATTGTGCAACAC
ATCATCAAATGATGAAACCCTGAATGTCTTCCTTTTACGAGACTGACCTT
CATTTTATCCGGAAATAAGAAAATATAAATATATTTTCAGGTCTCTTTAG
GAGGAATGTGTAACTGGAGAAGGCCGAAAAATAATTATTTAAACTTCTTT
CGTGAAAAACCTTTTTTAACGCAGTTAATGAACTGGGGTTAAACGTAAAC
TCAAATATTACGGGAATTTTATTTCGTGATATACAATTGACAATAACCCA
AAACTAATTGATCTTAACAATTTTCGATTTAGGTATTTACAAGATATAAT
TTGTCACAGTTATAGTTGAAACATTATTATTACATTTTCGATGAAAACTT
CTATGAAGTATAAATTACTTCTTACAAAAATTTAATATTAAAAATATATT
TATTAACTTTGATGAAATTGAGTGTTTATACTGATTAACAACTGTTATTA
CTATGTAGCAACCTGTATACCTTAAATAGAATAAAAAGAATATAGACAAA
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TTATGTGGTACTACCTTATGATTGGAACGCAGAACGGAACGGAAATAATG
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TATCAAAGACAAAATGGAAGGGGTAAGTCAAGTCATTTTTGATTTCTAGG
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CAAATCCATAATGAGGATATTCGGTGTTAAATCATACTAATATAAAAGGT
TGTGTGAACAATACACTATAACTTCCACCCCAATTGTTTTGATAACAAAC
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GCAAGGGACACAAGCCCTCTGCTATCTACAAGCTTCTTAACTACCCAAGA
CTACGGTGTACTAGGTCTCAATGCCTGGGAGGTTGAGGGAAAGGTCTGCC
ACAAGGCCCACAACATGAGAAGTGACCGAATCCGCACTCCCCGCTTACTT
GAAGGCCTCTGGAAGTCTATCAAGGCTTCGCCAGGGGCTTCCTTGTCCAG
GTTGGCCCAGAACCGTTGAGTGAAGCAAGCAGCTTGTCACCAAGGATGTG
AATGAGGACCTCGGGTACAGGKCATACCGAATGGCCAAACAACACCCCCT
CACGSCATCCATGAAGGCTCGCCAACGGTAAGCGTCTCCTCAATCACCTG
AAGAGCCATGGAGGAAGAATCATTTACTTCTTCGACGAGAAGAACTTGAC
TGTTGACAGAATCTTCAACGTCCAGAATGACTGGTGGCTTGCCAAGGAGA
GAGAAGAGGTCCCTGCGGTCTTCACCACAAAGTTCTCGGCCTCCGTGATG
ACCCTGGGTGTCATCTGCAGCACCAGTGAGGTGATGCCTCCTTTCTTCTT
CAATCCCAAGAAAAGGATTAACGCGATAAGGTACTGCGAAGTCATGGAGT
TCCTCATCCCCTGGATGAAGGATACAGCCGCCGGGAGGGAGTTCATATTC
CATCATGACTCAGCGCCCGCACACATTGCCATGAGGACCACTAACCTCTT
CAACTCCCACAACATCACTTTCTGGGATCGCAACACCTAGCCCTCCAACT
CACCCGACCTCAATCCGTGTGATTACTACTGGTAGGGGAAGTTGGAGAGG
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TACGAGGGAGTGGAATGCTATCGATTCCGCGGAAGTCATCAGGGCATGCA
AATCCTTTAGCGGCAGGATGGAGAAGATGGTGGCTGCTAAGGGAGGACAT
GTTGAATAAATTTATTGTTTAATAACTTTTTCATATTAACAAATACACTC
CAAATTCCATTTTTATCAAGCAGGTTAAACTTTAAGACAGTTCCCATTTA
TCGTGGACACCCAGTATATCTACAGGTAAGGACACAAAACTTAGAATTCT
CTGCGAGGCTATCTAGCCTTAGTATATAGAAGTCTGACAATTTTTACTTA
ACACCATTGTAAAGAACTGACAAAAAACTACAATTTTGATGTTTGTTTCA
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GTGCAATCTCCTCCACCCACAATTTGGCAAGTTGAAACTATTCTGAAGTG
GAAAATGATCACCTTTAGGCTGAATCAATAGCTCAGATTGGGAGAATCTT
TCTGGACCAAACATAGCTCAGGTAATGGTCCTAAGTGTTGTGGCATCCGA
CGGAACCAAGATGCCTTCCTACTTCTTCATGGCTAATGAAAAAGCAAAAA
TACACGGACGTCTATTACAAGGTCCTCAAGTACCATGTCTTGCCATGGAT
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TGGCACACACGTCCAAGAAGGTGCAACATTTTTGCAAGGAGAATATTGCT
ATCTTTTGGCCCGCAGAGTTTTGGCCTTTGTCCTCGCCCGATCTGAACCC
CCTGGACTTTTCTGTTTTGTGTCTCGGAGGGCAAGACGAACAAGACTTCT
CACCCGAATTTCGATTCGATGCCCTGAAGGCTGTGATTACGGAGGACTGG
AACAACTTGTCCTCAGACTTCACAAAGAATAGCTGTGCTTCTGTTTGTCA
CCATTCAAAATGGAAGGGGGAGTATTGTATAAAAAGTTTAGAAAATTGTT
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TGGTTTTTGAGAAGCTCTCCAAGTGCATAACTATACAAAAGGAACTCCCC
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GCGTGGTGTCTAGTTATTATTCTCCATATTTGCAGGTTCCAGAGAAAAGA
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