EMLSAT00000004856, EMLSAT00000004856-700703 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000004856
Unique NameEMLSAT00000004856-700703
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s256supercontigLSalAtl2s256:395698..412435 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000004856 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000004856EMLSAG00000004856-687622Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000021258EMLSAE00000021258-730186Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000021259EMLSAE00000021259-730187Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000021260EMLSAE00000021260-730188Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000021261EMLSAE00000021261-730189Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000021262EMLSAE00000021262-730190Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000021263EMLSAE00000021263-730191Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto777241auto777241Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000004856EMLSAP00000004856Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000004856

>EMLSAP00000004856 ID=EMLSAP00000004856|Name=EMLSAP00000004856|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=311bp
MILLIAHTTASPVLPHQRESKRPLSPYLRNYLHVPHFLSVMMIVIRKSWL
PLPKYWILLSSLLFLSCNCLDYENFTFPSTSPDSETGDWESLSQYYNSHL
PHRRDKRFIWLTKEKRIVFPPGTQFVIXPTLAMPLIRWPPPGVDSNFTLS
TPFTIGMDAMGLTDNSHPLGLLPFLNPSLGFFGKRRRRDVPEPNLKPHEI
PGGERFTLYQMAEEMLFKFGLEGKSCLLRAICEMHESPLLGYGFFGEMIE
LFLTASKSPYSKLMEEYIEAEHAGRYEGECWKYFKNCTTSMFKVHNKYSK
EAQLKHNHPRK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s256:395698..412435-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000004856-700703 ID=EMLSAT00000004856-700703|Name=EMLSAT00000004856|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=16738bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s256:395698..412435- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGATTCTCTTGATTGCGCACACGTAAGCCAAATATTGAAAGAGATCAAA TGATTTTTTGTTCATATCAAGCTTGGAGAACCAAGTGTGTATATATATAA CTAAATATTAACCCCCACCATTTAGTTAGTGTCTCTTTGGACGTGTGATT GTGCTGTATTCGATGATAATCATTATTTCCCTCTAAAAATACATACATAA TTTGATACTTTGGAGAACTGCTTCTCCTGTTCTTCCCCATCAAAGAGAGT CTAAAAGGTAAGACGATCATTAATTATATTCATATTTTTGCAAAATATCT TTACCGAAAAACTTATTATATTAATTATTTTTCTGTAAACTTCTACACGA TTCATTTATCAAATTATATATAAAAGACAATTTATTGCATTAATAAAGTA GCACCCTACACAAAATGTTAAAAGTCCATGGAACAAAGGACTATTTTAAG TCATAGTGGGCATATTATATTGCACATTTATAATTAATACATCCTTAAGA AGGGTTAAGTTAAATACTCTAGAGGCATTTACATTGATTTTCTCTCACTT TGTATCTATAAAAACCGATTAAAAACATACTTCACATCTTGGAGTTGATC AAAATGAAATTCAAATGATGTATAATTACTCATTAATATATATATATATA TATATATAATCATAGTTTTCATCTGAATTTCATATTTTTTTGCGGTTTTA TTATAATCTGATCACTGTTTCATTCCTATAAAAAGTTTAACATCTGATGT TTTTCCGAATAATTTATTTTACTTTGTATTAATATAATGTATTTCTTTTA CTGTAAGTAATATAATATCAATATGTACTTACGATGTTGTACGAGTCCTA CATGATGTAGATATATTCGAAGGAAAACGAGTTTTGAATCTCTTCTCTTT CTCAATGATGGCAATGGTTCGATGATGCAATCATTAGGCAATCATATTAT CATTAAAATCATCTGAGAAGTTAGAAACCTGCACTTTACAAATAATAAGA TTAAAAATCTGAGTTCAAATAATATCTCAAGGAGATTCAAATCTGTCATT CTTAATTTACAAAATGTACATATATTTTTGGCTTGAACTGATGATATCTT TGAAAATATATATATGTATGTATGAAATTTTTTATATCCTATGGGAGGAC TAAGGATATGTAGGACTCTATGTCAATGAACTTTTGTCGCAAAAAAAATA AAATAAAAAAAAACGACCCGGGGTTCAATGGAAAATACTCGTTTATTTTT TTGTAAAAATGCCGTAAATGGCTAAGTTTTTTTGTTTTTTTTTAATAAAA AAAATATTTAAAAATGGATGTCTTAAACTTGTTTATAAAAGTATATACTT ATAAGTATGTAAGTATATATACCTAGGTACTACTACACTGAGCTATAAGT ACCTTCTAACTGACTGACTTACTACATATGACCGTTCCTTCTTCAATTTG ATTAAAAACTAATTAAAAATGATGTTATCTTCTACAAAAATCATTAGGAT CTGTACATTGTACACCCATACTTCACTGTATATAGAGTATTAATATTAAG TATATATAAAAAATATCAAGGTTGTGCTCGGTTTATGTTGAGTAGTTATA ATAGTCCCGCTCTCGGTTCTATCATTTGTAGGGGTTCGGTCTCTGTTTCG GTCTTCGGTTTCAGTTCTTTTTTATACAGGCTCAGTTTGGTAACAGGGAC TTAAAACAAGAAATGATATTAGGTACAAACAGAGGTGCAGCTACCTTACA CGCAGAGTGCATGGTGCAGTTTTCAAAGTGGGAGCCCTGAGGGTAGGCTA GAGGGAGGCGCAGGCATATGGAGAATTGAGGATTGCTTTCAGTCTACACA TACATAGTACACATGTTTCAGCTAAAAATGTATCAGTGTAAGGGGCCTTG ACATAGTAAAGTTTGAGAAACCCTACCTTAAGAATTATTATATTCTAGGG CCTTGATAAGCTTAGTAACGGACCTGGATCCATAATCTACCCACCCCTTC CCTATTTTATTTACACCTTCTGGTGTTTAAAACCCCTTTTCTAGATCCAC AAGAAGCCCTNAGCTATTTAGAACTAAGATACCTCTGTATTACCCTGGCG AAGTAAAATAATTATTGGAAAACGCTGTAATTGCACGTTCCGGTTCTAGT GGTTCAAGAACCGGAATCGCTTGAACCGCTAGACCGATAAAGGCACAACC TTGTATATAGACTTATTGCATTTGTCATGACGAAAGGWTATTASMTKTGT TTCTWTTTCCATTTAATATATTATGTATTTTTTTTTTCAATAGTAAGGAT ATATTATTAGGAATAATGGAAAAAGAAATACAACATATCCTCTAGGGATC GTAAAGAAGTGTACATAATATTTACATAAATGTAACTATGTATTATTCGA ACAAAAAATGAAGGATATTTCAACTAATAAGTAAAGTAGTGGTTTTTATT GAAGAGCCGTTCATATTATTGAAAATTATATATATGTACTTTACAAGGAT GATACAAAATATTCAATAGTATGACTGATCTTACTTTGAGACGAGCCTAT GATTAATGACTATAAACAAGAAAAAATTATTCTACCTAATAATATATGTT AGTCTGATTCTCTTTATATACCATCAATTCTCAATTGGAAATAAATGCCA TATTATATATATTAATGCACGTACATATTATGTGATAATGAAGTAATTAA ACAGTCAACAATAGAGGCTGGMTCAAGGACTACAATACACAGAAGGGGGT TACCTTACATGTTCAGATGTTTTAAATCCAATAATTATTCTTCATAAGGG AATTGGACAGGTATATTTTATATGTTAAGTGGACTCTTGAAGTCTTTTGG AGGACTGAAACATTGATTACCCATTCTTGTTTGACTCTGAGTGGAAATAC ATAACTCAATGGTTTGATTATAATTTTTTGGTCATAACACATAAATAATA AAAATATTTTACTTTCGCAAATATATATGCAATATGTATGCGTTTATATA AATCCTTTGAAGGTCGTCTCAAGTGATAATGATGGCCTTTTTGAATGACC AGAAATTCCTTTTTATGCATATGTAGCTATGAGCTGTTTCGAGGGATTGA GCCATTTGAACCATTGGGAGATGGATAGAGAGAAATATATATTTATTAGT AAAAATAAATTTATCAAATAATAGGGACTTTCACATAATCTAAAAAATTA TTATTTTTTTCGCAATATAAAATGATTTTTCAATGGAGTAGTTTTAAGTA GTAGTTTTTTTTTGTTTGGGTTGTTAGTAACCCAAGCTATATTTATATTT CTTCTAAATATACATATTTTCATTATATTAATATAATATCATATGTAAAA AACAAATCGAGTCGGAATCACCTGTAGACAAGAAAGTCTCTGTTAACATT AATATAATACGTACACCTAGGTTTGCAGATGTCTAATTTTATAAGGCAGA TGGATATTTAATGCCATGGACGACGTCAAACCCTTTTTACGTTAAACATG ATAATAAAATAAAATGTAAAGTGTTTTATGAACAATATAATTATTTTCTT TTTAATTATATCTGTGGAATTCTTACAGATTTTTATAATAAATTTAATTA TTATGTGCTATTTTATTTATGACTGTATAATAATTTATGCAAAAAATAAA GTGTAAATCTGTCATCAGACTAATTTTGATCCACGCTTCATTTAATCATA ACAAATGCAACATAGAAATACTACATGTAATTCATCAGGTTTTAACATAA TTTTCTTCAGTATACTTTATGAGTCAACAAGGAAGTAAAGTAGAAAACGA 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CTTGCGTGCCAGAAAAAATAACATACGGGTTGGAGCCCACCACCATTTCA TATAATATAATCAAGAAATCCATCCACTGTAACCCCAGTTGTGATAACAA CCCAGGGATTGTCTTGCGTGCCAGCACGACTAACACATGTTAGAATCCAC CGCCAAGTCCAAATATGATAATATTATATGAATTGGTGTTGGGTTACAAC CCGTTTGTTAGTCGAGTTCGCACGCAAGACAACCCGTGAGCCGGGATAGA AACCGTGTCTATAGTGGACGCCATTAACGACGATATTACATGAGTTGGCA GTGGGGTACAACATATTTGTTAGTCACGTTGGCACGCAACACAATCCGTG GACTGGGATATGAACTGCAGCAATAGTGGATGSTGACATACATTAGTATA ATAATAGTGAAGGMGATGCATGGMATATGCCGATTTAAAACTTGGAACGT TTTTCAAGGATCGATAACAAGGACGAGAGAGGATGTGGGACAGTAGCAAT TTAAAGTCCCAAATAAAGAACGAACACAACCCTAATAAATATGTGAAATA TCCCGTAAATAATGCTTCATTCTTAAACAAGGTCTTGGAAAAGTAAAATT GCATTTAAGATTGAAATAAAATGTTTCTATATTCACGTTATGTGGCTTTA TTGCAAAAAAACACAAACAAAAACCGATTATATTTATCATCAATGTGGAC TCTAATGTGTACATACATACATAAATCCGTCCACAATGATGTAATACGTT GACCATCTGTTAAATTCATCCTTAAAACAATAAGTCATATTCTGTCCGAT TTGATCATATGTGTAATTATATTATTAATTTAGTCTTAGTAATTAAAAAC TTTAATTACTTGCAAATATTAAAAAAAACAAAAACAACAAGACTTTGTAA TTGAATGGATAAACTGTTTACTACATAATATGAGTAATAGAGTGGTCCTT 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