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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s257 | supercontig | LSalAtl2s257:418585..456624 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004902 >EMLSAP00000004902 ID=EMLSAP00000004902|Name=EMLSAP00000004902|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=882bp
MVISSVYQLLLFSLIVQTQGNDNCVHNYACVAEAGNLIRSYPDGIETVDV CRMLCQKQDGCEHFTWYDENGAFPQSCFLYSYCNRKDNNTCRDCHYSGPK YCRRSFQPCTPIGGDFGGTWFCFPQIESMXEPVPHGTSCIFKCPAHMAFH TCEEGKWSEIPGENQRCMCPSLNQALGKSDGDIICWPPQRDYTSRVPAGT YCLHTCHGHPKHEMRCRHAAWTLRPQQLACENKIPPKSMGQGFKEMIENP ESSDLDMEEVLSKGLSSLIKSNEDEEDLNTYINGETLTMTKVHHSKISND TSLINYKYKFLPGPPKDEIIIDERYKYKLRNGPEDGDKKSTLKELPRRPS PQSLLTYQQYLLRQDRDEYDKEYRKKHITVQTTESPYVSTKNPHHSLKLP YNSKPLPQPYKKDDHIFSDSKSAYLPEVSKYEKKNTKNASPLTPFVRASK EKPDFSALYRENKREIPKRELFVNKLLKKMSKLDTTTDEVENKLELQLLQ ALLPTENRYRSCKRAPKNVKHGHIACRHNRKFSSGSTCILKCFPGYVPEK NSKTKCEDGIWLNEEWLNCVKSIAMLIGGWNPESGLLKNVEIYSPQQHPC SNINVAPLPAPRKGLVANWIDGSVIACGGYNQTAVLNVCWKFVPELNDWK EIRPTEIERHFATSVISGGDFYVLGGRDGKEEPVALGAVERLKSEERTWE LIPEMKLSIERAYHCSIPLSHNSIVLTGGYSWNSILNDVELFNTSEMERG WTKLKGMNTPRYLHSCGVVPNSEDDHNNNPQIIVAGGYSSEYLSSSEIYD FNTGEWRDTGPMMEPRQGAHMLVLNGRPTVIGGFHSTDRYPDVVEQYDLK SGRWVPVSQRIKTRRRYFAAVEIPENLFSPHC back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s257:418585..456624+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004902-700749 ID=EMLSAT00000004902-700749|Name=EMLSAT00000004902|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=38040bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s257:418585..456624+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGCGCCTATCATTGAGACTTCATCAAGCAGCTCTTCGTGCTGGAATATC
CACCTGTGACGTTCTTCTTTCCTTAATTAAAGGATGGAGGACGATATCTG
CTTTTAATGTAAAGAATTATCGGAAATCCATTCAGAATTAAAAATCACGC
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GGTCGGACTTGAGGATTTCCATTATTTTATCCACATCGACAATTAGCCTG
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AATTCAAACTGTTTTTGTATATTTATATTTTTTATCTCACTTGAATAAAA
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TTCTAAATTAAAAAATCACAGTGGATGAGCGTTGTTTAATTCCCTTCCGA
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TTGGGAAAGAATGGATTGCATCTGGTGTCATGATAGTATTTCTAGGAGAC
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GGTTTATCTTTGTAGTCAGGGGTGTCACCTGGATTATATATATATATATA
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NNNNNNNTTTTTTGGGGGGGGGGGCTTAGTTTTTGGATTTTTTTTCCTAA
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TGTTTTTTAGTTTGCTCAACCCTATTATCATAATCACAAGCCGGGGAAAC
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AGAAGGAATTATAGTATTTGCCAAGGAAACAAGTGGCGAGGGTATTCTCG
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AAATCTAAGTTGGGGAGAAAGTTGCGTTAAAAAAAAATACTTTTTTGGCA
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AATACCATAAACAAATGCCTTGACATTAATTGGAAATAGGCTGKGTTGGA
TGAGTCCTAGGACTGCATTCCTAATCCGTCTTTTTTTTCCCCTTTGAGTA
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TTATTAGAAAAAGTTAAGCAACAAGAAAATCGTAGAGCAACCACAACAAA
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AAAATCGGGCATTTAACAAATTGCCTAGTAAAATGTATGTAAAATGCCCG
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ATTGGTGATAAATGTTGAGAGCAACTTAAAAATAGTTTATTCGAATTAAA
CCAATCCACGTGATTACTTTTATTGTATCCCAGAGAAGAAAAAAAGAGGC
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GAGACCATTATTATTAGACTTAGGATTTGTGAGCGATCGCTCAATCACTC
AATAACTGCTCACTTTGAACTTTTTTGAAAAAAAAATGTTCATTTTACCA
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GGAAATTCGGGTTCTAGTCAGATTACAGAACAGCTTTTGATGATATTTTT
GAGGAAAAATATACTTGTTTAAACCCTACTTCAATAGGCTCTCTTTTTGG
TTGTAAAATATGTATATGATGAAATCAGGATTACGATTACGTTATCGTAT
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TGGCCCAAAATTGACTGTTGAATAACCCCCATTGAATCTTGCAACAAATG
AGAAATACATTTGCACTAAATTGATCTTCCATTTATGCAAAAGGTTGGAC
GTAATATCAGTTGTGGTGAAAATGAAATGCCTCCATCAAAAAATACTCCT
AACGATCTAGCCAACTTCTAATTTCCTACTTAATTGAACGACTTTTTGTA
TGTTTAAAACTACCAATACTGATCGAAGGCAAAAATTATGGGAAGAAAAT
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TCATTTTTTCAAATTTTAGCGCCTATTTTTTTCTCATTTTGTAGAAAAAA
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ATGTACAAGAATATATAGGAATAGTAAATTAACAACGGACACCTGTTGAA
GTAATTCATTTTTAGATTAATGTACACGGATATATGTTGTCTACAAATAT
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CTAAATATTGCGGTGGTTCCAAAAGACTTTTTGATTTTTGTTTCCTCACT
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CAATAATATAACAAAGCACTGATTTCATTCCATTCCTGTTTATGCTTGAG
TTTCAACAAAGAATATTATTATAAATACATTTATGGAGTGCATCAGCATA
AAAACAATCATGAAAAGTAGATAATCCCTCTTCATTTTTTAGAACATAGG
ATTGTCCATCGATCCCAATACTTAATTGTTATGTTTGAGTCAATTAAAGG
CTTATTACTCATATTTGCGGTATGAGTGAATACGAAATGGTCCATTAAAA
TCTAAACACTTTTAATTTTAGCCTTCAACAAGATATAAATTATTAATTAA
CAATAGGATTTCAACACATTAATAATATAAAAGGATGTATATCTGAGCTC
TCTTAATCATTAATGTAGCCACCCTTAGCGGCAATGATGGCTTCCAGGCA
ATGGCGGAAGGCTTTGACACCCGKTGTGGATGKAGTCCTCTTTTATGGTG
TCCCAGTGCTGGCTGTCAGTGGCTTTGAGGGCCTAGGTGTTTGGATGACA
GTCATTGCAGGCCTTCCTATCGAATAGCACCCAAAAAGAGGAGCCGAGGG
GGGTTAGCAACTGTAGGGGGCCAATAGTGTCAAATAAAAGTTCAAAAGAG
TCTTGCAACGGAAGAGATGGGTTTCTTTCATTGCTGGTATCAAAAGTGGC
CTCTCCCCACATCACAAAGCTCTTTCCACCCACTTTTTTGATAGCTCTCT
GGACAGTTACGTGTGAAACATCGAAATCTCTTGCATAGGCCCTCATGGAC
TTGAGGGAATTAGCCTGAGCCATTTTTCTTGAACTCTTCCAGGTCCAGTT
AGGCCATTTTGACAAAGCCCTTCTTCCTCTCTAACAATTCGGACTTGCTA
ACGGCGTAGACATTGGTCCTGAAGATGCCCAACTCCTTGGAGTGCAGGAA
TGGAAATTCGTCGAAAGCTAGAGGGCTCAGATTTGTTTTGTTTAGTAACT
AATTGTTTATGCGGACGTCATAAATGTATGACCCTTAAGGGAAAATAATG
TAGTGACGTCTTCTGACGTATCATAAAAAGCGACATCTTGCGAGGGGAAA
TGAAACAATGTCATGCTGTTACCTCGCTTATACAAAAATACTTTGCATTT
TTTGTGATCATCAGTTGATTTTTCGGTTTCTTCTCTCCTAATTAGGGTGC
TGAACTTTGATTGGTTGAATTAAAATTCGCTCTTCTAAAACTCTAACCAT
AGTAGTGAAGAATTTGTATAATTGTATTACCGTGTTGATAATTTTTGGGG
CACCGCACACCCTCCACCCCAATGATGAAATCCAGCTACCCCCCTGGTAC
ACAGTTTAATATTACTATTAATATTATTTTTCAAAAAGTATAAAAAGAAA
ACGAGTAACTCAAGCAGCTTATACTAGACACGGCGTAACTTCCCTAAACC
AACAAGGCAGGGGCGTCCACAGGGGGTGGGCTGGAGGGTCTGTAATCCAT
TTCCAAATGAAGGTATTTTTGTAAAATTATCGCTCTAGAAGAAAAAAATT
TAATAAGAAAATTATATAAGCAAATATTTTAATTTTTTTTTCAAAAAAAT
TCCAAAAAACCAAGCCCCACCCCTTTAAAAAAATATAATCCTACGGGCGC
CCCTGAAATATATACTGGGTTTTGTTGCCAGCTGTTGCTATTTTTGCTTC
TTTTCTACTAATCAATGCTCTGAACGTTGATTGATTAAAACAGAATCAGC
CCTTCTTTTAAGCTGAGGACAATTATCTATAGTTTTGAAGAATTGTCTAA
CTATCAAATGGTTTTGGATCATTTTTCCTGTTTCTTTTTGTATGAAAGGT
TGTGTAATAAAATACGCTAATAATGTGATTTATCAAATGACATTATATAT
ATTTTTTTAAAGCAGGTTACATCATATTTCTAGAATTAATTTTTTTTAGA
AATGACCGTCAAGCCTTTGTTGAATAAATTCAACATATTTCATGTTATGA
CTGATAAATCTTCTCAAGCTAACAGGCGCGTTTCTATTCATTGTTTTTTT
TAACTTTGAGCAGGTTATGCTTTAACATTACTCAACTATATTGAGCTGTC
TTATTATTGGCCAAATTTGCAGAAAGTTATTACCTATCGAATTTTCTTTT
TAAATTACTACTTTTTCACGTGTGTGCGTCATTTTGGGATTACGTGACAA
TTAGATCCCTCACAGGTGTAATATTGTACACAAGAAAATATACACAAGGC
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TTATTTACAGGTAATTTATCCATATTTTAATTTTTGCTCTTTAGGCCTCT
TTAATGTAAAATTAATGGCAAACCACATTGAGAAAAAAACAACTAAAAAG
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