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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s260 | supercontig | LSalAtl2s260:1225161..1287088 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004957 >EMLSAP00000004957 ID=EMLSAP00000004957|Name=EMLSAP00000004957|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=454bp
MIRRIIRVTQLRKSSPFARDVERRLMINTFFESLPDWNGMHHAYDAYIVS AFWTRMILASLFGSKCDKCDLPFSNENEYVMKLQNENKIFHLDCFACLTC GIRLVPGDKFALRNNEELGTALLCIEHYDLLEKRSNEEDLFTLRNDNILQ EGSSGGYHHPSFPEEIIKREENEGGSFEGFLRGERGGGGGGPPFSGGFDE PSSSSSSCSSSTTATPTTAHYKSXSSSKSSNRRVGRVRTVLSEKQLSILN KCYNNNPRPDANVKEQMVEMTSLSHRVIRVWFQNKRCKDKKRQILDSEKE TMVKVLGYGAMPGIPLIASPPVKAENDFANNYGTPIHSYPSGTSWGGGGN TPRQGQGQHHLDGLLMPDKMIYRTNNLSSIPPPPGVYNHMSNDGRTAGPG DPLVRPTSDPSYTLTCLEGNGRLTAGGILMEGDSNGGGGXSGGGSSNLII GSEA back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s260:1225161..1287088- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004957-700804 ID=EMLSAT00000004957-700804|Name=EMLSAT00000004957|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=61928bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s260:1225161..1287088- (Lepeophtheirus salmonis) ATGATAAGAAGAATAATCCGGGTAAGTTTGTAGTAGCATGAATAACACAT
TTTGACGAATTATATTTTTAATTGTAGTTTTGAAAGTTATTTTATATGTA
TGAACTAAATATTCTCTTTTGGGTCTACAAAATAAATAAAAATACACTTG
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AATTATATTCCAAACCTGATTGACCATTCGTTTGTGATCATAAAATAAAA
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CGACATCGAAGTTATTCTAGCAAATCTTTTTCTCCTTCTTCCCTTGGGAC
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GTTGATTTTCCGGTTTTTTTTTAATCATTCCCATTACACACTGGATTTTC
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AAATCAAATATTGGTTCAAATTGGTCTAGAACAGTTGTTCTTAACCTTTT
TGTCTAAATATATTCATCCATTTCATAATCTCAATAAAAGTAATTTTTTT
AGCTCATAAATTTAACAATATCTTTTAATAAAAATTAATTGAATGTTAAT
TCTTTTATACAAGACCTCCACTCCCTCGAATACCTTAAGAGATACCCAAA
AAATCCCTCCTGTACAGTAGTTTCATCAATACTGTAAATAAAACTTGCAA
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ATACAAGTTTCAACTTGTATAAGCAAATTGTACAAGTTGCAACCAAAAAA
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TAAATCCCTGTATTTTGATTTCTTTTTGAAGATATTTTCGATTTATTTTA
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AATGAATGATTTTTTTTCTTAAAAAAACAAAACAAGATATATTGTATGTA
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ATGTTGTTTCTTCCAAGGAAGAAGAAGAGAGATGAGAGCCCCCACCATAT
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TGACATTCACTTATTCATAATGAGATCTGCCTATCTTGATAACCTCGGCC
ACACGGCCCGGAAGCTTTGGCTGGCCCGGGCGACCTCGTGCGGACCCAGC
GTTACCATTTTACAGATAATGGACTTCTTCAGGGCCTCCACAGACGACTT
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GCTGTTTGCAGGCCAAAAAMCCGGGCTCAAGTTTAAGGGTGTTCAAGAGT
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CTCATCTAGTTCGCTCTTTATACGCTTTTACAGATTTTCCAAATTTATCT
GGACCACCCTGTATCAGGCCTACAGAACAATTAGGCTTCCCCGAAATCAG
TATCCCCCTCCCAGTCTTTTCTTTTGTAGATCTGATCTTGTTTAGCGTTC
AACGGTCCTAAGGACATATTATTAATTATAGGTAGAACTTATTTGATATT
TTATGTTCTAGCTATACTTCAGCTGTTGTAGTTATATTAAAAGACCGATA
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AATTTCGTTTAAAAATTGTTATACCTAGTTTTTTCTTTATTAACATCCCC
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TCCTGGATCATCATATCACCATAAAAAAATTCTGAGTCTGATATTATTTT
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AGGGTTTTTTGTGGCGTTATCTTAATATATTATTAAAGCAAAATTTGTAT
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TCATTGTGTTCCTGTCCCAAAGGTATTTTCTAATCAATCACTCATTTCCA
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TGACTGATGAGCTTTTTCCACTGCAAATTTTCAAATATTCTAATATACAT
TGCTCTTACAATGGGAGGAGATAATGATTTTAAGACGAGGCAATAGTAAA
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ATTGATGAACGCCCCTGACAATACATCAGAATCCTCAATTAAACATTATT
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TCGTAGCATCACTACTTTAAAAAATAGTTAATGTTTTGTTTTTTTTATCC
TCAAGTTTGAGTATTATTCACATCTAGCACTAATATGTTTAATTTTTTCT
TTGTTTGAAGAAGGATATAAATTAAATATCTTTATTTCTTTTTCTGTCGG
ATTGGATTTAAGTGGTATTTTTTATATTATATTAAATATCTATGAGTGTT
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AGGGAGAGATGTAACGAAAGGATTAGCATATTCAATAAATGCTTTTGTTT
TTATTTTAATAATAAAAAAAAGGATTTAATAATGAGAACGAGGATAACTC
GTGGTGTATATTGATGAATGATAGAAAAGACTTCTCTTATTTAGTAGTTT
TTTTGTAATGTAAGTTAAATTAATTATTAGTATTGTTAGGGTAGACTAGA
TGAGCTGCAAATGTCTCCTCTTACTCCCCCCCCCCCCCCCCTAAAACCAT
AAATAAAAAAAACCTAGAGCAAAAAATATGCATTGCAATGTTCCATAAAA
ACAACCGAAAACAATATGGTAAGAGATGATCATACATTTAGGTTCTCGCC
CCATCGTTCCTAGAGAAAGAAATATATATATAATGTATAAAGACTTCACA
CAAGATTCCTAGGTTATTTTGTTTAATTATCAATGCTTCCATATGATCAA
TTAAAGGAACATTAAAAAAAATCTAATGCCCAATTAGATTATAAAAACTA
TAAAACACAAATCCTACGTTGGGGGGGGGGGGGMATAGCTCCTGCAGCCC
RCATACAAAGGCCCCGCTTATATACTTCATATTGAAAAGGTTTTGTGGAT
CCGTGAAAAACTGATATGTTCTCAATGTAGTGGACTACGAAATTTACCAT
ACCTCCTCTCACCCTAAAAAAAAATCTTGAAATCCGTCAACTGGACGTCA
TGAATAAATCCGTGTCAAATAATAATTGGAGAAAAATATATTATGCTTGC
AAAATGTAATAGTTTTGTGTTTGTCCAAAACTTAAAACCCCACTTCGATT
GGACATCCTTCATTTTTAGATTCCCAACCCCTGTTAGTATTTGTAAAAAA
AAAATATAGAATATATATTGATTATCTTGAAGACCACCGAMCAGGGGCGT
AGGGTTATATTTGGGGGGGGGGGGCGAGGGCATAGCTCAGCTGATGATAA
TATTATTTTCATCTATGGTCATCCTGATGTTTACGTTTTCCTCTCAATCT
TCCCTATTTTTGGTGTAAATTGTTTTTAAATATATATGTATTTAAATATA
ATTATAATATTTTCCTTGTAGTAATGTTATTTTAAATGTAGAAGGTTCTC
AGCTCCTCTTTATACTACCAGTAATCCATTCCTTACTCCCCCAAATCATA
TAACATCATAAGTCTACGTCCGCCTTCCCCTTGCGCTCTCCAAAACTCCC
ATCCCTAAAGATACTTTCTGGTTGTAATTGTTGTATTATTTAACTACTTT
TCATGTGGTACTATTACGGCGAATTCGGTTTTGTTTTTTTGAGAAAATAA
TAGTTTTTAGTAACTATGAGATCGTGGAATTTGTTACGAGTCCCCAGTCT
ATCTGGAGCCTGTTTCATCAGGGATTTCTAATTAAATCACTTTGGGGCAG
CAAGACCATGATGTTTATTCATCCGGCGGACTCCATTTATTAATATTTAT
TTACAAATGGACCTCCTGTGGACGCCCCTGATTATATACTTGTGGTATTA
CTGAACTAAGAGAATTATTAATATCAACTGCCTGTTACATGATTTGGGGG
TAGAAAAGGAATTAATGCTATTAAAAAGAGAACCTTCTACATTTAAAATA
ACATTAGTGGAGGGAAAAATATGATAATATATCTAAATTCATAAAGATTT
ATTTTATTCTACGTTTTTTAAACAATCGCCGCCAAAGATAGGCGATAATA
CTTACTTCAGAGGGAGAGGCTAACACCCCGACGACTTATTATTTGTATTC
AATCTATGGGTTGGAGTTCCCATATCTCTTTTCACTTATTTATTTTTTAG
CTTGAATGGTATTTTTCCCATTCATGAGGGAGTATATATATTTAAAAAAA
ACCCGAAATTAGTTTTTTGATCCATTGTTTGGAAATAACACAATAACCGT
GTCACACTTTGCACAATCACTCACAAACTAAAGCATAGATTGTCATGAAA
TTTTGACAGCTGTCTTTTGAAGGCTGCTACTATCTCAAAATGAGGTGAAT
AATAAAAAAGTCGGCCTATTTATACATGAAGTCTGGGACATTTCAGCCCA
TGTGTTATGCGTAAACCCCCGAGAAAACGGGATTTCGAGAGTTGTTTGTG
CAGTAATTACTTACTCATGTATAGCTAATAAAATATATGTACATAGCTAG
GTATGTTTTTAGTACATTAATAGAAAGGATTAGAGAGTCAACAAAAGAGA
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ACACAAAATCAATGAGAGGGTGCGTTGAGCCACTCTCTTTCTTCCTACTG
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CGGTCCTTAGAATTTTTCCCAAAAAATTCTTAGGTTCATTACATCAAATA
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