EMLSAT00000004970, EMLSAT00000004970-700817 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000004970
Unique NameEMLSAT00000004970-700817
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s260supercontigLSalAtl2s260:1340293..1359092 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000004970 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000004970EMLSAG00000004970-687736Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000021767EMLSAE00000021767-730695Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000021768EMLSAE00000021768-730696Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000021769EMLSAE00000021769-730697Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000021770EMLSAE00000021770-730698Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000021771EMLSAE00000021771-730699Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000021772EMLSAE00000021772-730700Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000021773EMLSAE00000021773-730701Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780668auto780668Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000004970EMLSAP00000004970Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000004970

>EMLSAP00000004970 ID=EMLSAP00000004970|Name=EMLSAP00000004970|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=161bp
MFPKPEEGDTLQNMGKDRFKASFDIVSADTTENRKEFYLVVGKKSEEAQG
LGIRKISIDFTVVEKALISTTIVMPDSILLNTLINEENNNKDSLRVGSTH
RVNSWPTERTXADTYSEDEINELRIGIVSIVIVAILITIIIFLVAYCLFC
RKKEFSRVPTK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s260:1340293..1359092-

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000004970-700817 ID=EMLSAT00000004970-700817|Name=EMLSAT00000004970|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18800bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s260:1340293..1359092- (Lepeophtheirus salmonis)
TACGGAAATCACTTTGTAGAACGTTCTTTTGATGAAAAGGTAAGATTTCT GTCCTCTTTTAGTTAATAATTATATATTTTCAATATTAGGAAACCATGTT TGATTTACGTAATTTTTCTAAAAACCTTTTTTTAAAAGGATATTATAACA CATAATTGAGATTTCCGTTCGTTGTTAGTGTCAAAAATTGAAAGCTATTA CGTAAACAGAGGGTTTCAACAATAATATCAATATCTCAGTGTTTCCCTAA CATATCTATATATATATATACATATATTCTGTACACGTTGCAATGTAGAT ACAAGGTACAACTTGTAACAGATCATTGTACAAGTTGTAATTTCTTTATC TTAAAATGCATTATTAAATTACAACATTGGTCACTCCAATTACCAACTAT ACATTGATACAATCATTTCATTTAGATTTATTAAATTTATAGGATTATTA ATTTCCGAGTCGTGCATTAAAATCTGAACAATTTTTAACTTAAACAAGAT ATAATTTATCAATTAACAATAGAATTTCAACAAGCCCTCTTAATCATTAA TCATGCCACCCTTAGTGGCAATGATGCCTCCCAGGTGGTGGCGAAAGGCC TGGCACCCGCTTCAGAGTTAGTCTACTGGCATGGCATCCCAGTTTTGGCG GACAATAGCTTTGATGGACACTTCAGTCCTTCCCCTCGAGATATACTCTA AAGGTTTAGTCGAAGGGTTGGTATCAAGGGATTAGCAGGGCTAAAATTGT CAAAAAAAAACAGTTCAAAAGAGTCTTGTAATTAGTTTATTTCATTCCTG GTATCAAAAGGGACTTCTCCACCCTCACAAAGCTATTTTGAACCACTTTT TTGATAGCTCTTTGCAATATCTGATTTGAAAAACCCAGATCTCTTGCATG GGCCCTCATATACTTGAGGGGATTAGCCTGGACAGTTTTCCTTAACTCCT TCGGATCTAGTTTGGTCTTTTTGACAGAGCCCTTCTTCCTCTCCAACGTT TTGGACTTACTGACAGCGTAGAAGATGGTCCTGGAGACGCCCAAATGCTT GGAGTGCACAAATGGAAATTGGTCAATCACGTTCAAGTTCCTTTTTCTTG ACTAGAACGTAAGCAAGAGAGCTCAAGTTTGTTTTGATTTGTAACGTATT ATTTATGCTTAACTACATCAAAATATGAATTAATTTCAATCCCTCAACCG TCATTATTTATTGAATTTGTGAATGTTCAGATATCAATAGACCCCAGGGT ATCTATGGCTAATATAACCCTGAAAAATTTGAACCATATAACATGCCACC TAATAATACTCTTATATTTATTTGTTTAATTTGTACTAAAATAGTCCAAC ATGACACCATGAATATATTGAGCATCAATGGAATATTCAATTATTGCATG ATTATCACCTCAAGTACAGTAAATCATTCATTTAAAATGATTCAACTCAT TTTTTGGTTGCAACTTGTAGTATTTGCTGATACAGGTTACAACTTGTACA CAATCGTAACGTGTGTACTGCATACAATAGGTGAAGTAAAAAGTTTTCAG CGTTTTTTCGCTTTATATTAACAATTAAATTATCATAGTTAGGATTATCC GATTTAGATGGTTCCAAACGGGTTTTTTAAAGCTAATTTTTAGTTCCTGG ACAACGGAATAAGTGCTCACGGTCCAACTCGGCCCTTTTCTATTATTTAT CGATATTTTCGKCATCCATATTACCAAAATGGAGTCGTTGGAACCACTGC TTTGCTGTTGCATTAGATACTGTATTGAATCCATAAACAGTACTTTTTTT GGGGGCTTCCTGCTACACCTTTTGGCCTTGGTTTTAATGGATCGAATTTT CTATTTTATTACTTCCATCTCGGAACCCTGCAACACACAAGTGGCTTCGC 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CGGAGTTACTAATTCATGTATAATCATTAACATTTTACGTTGTAAACTAA CCCAAAAGTTAATACCCCAAGGGCATCTGCAGGATCATATATATGTGTTT TTTTGGGAGGGGGGGGGGGGTAGCCTTGGTTTTTGATACTATTCACACAA AATTTGAAAAATGAAATTTTTTAGAAAAAAAATTTAAAAATTTAAATTCA GATATTACATTGTCCCGACAAAGAAATATTCTTCTGGAGAAAGGACTGGA TCACTTTGGGATATGTGAGGATTCCATATCCTTCATCCTGCCTTGATAAA TGGGATCAATTTGAACCTCAAATGAATGATGTAGTCGACCTGGCGTGAGT CTGTATCTGGAAAGGAACCAAATCAAGGCTATCTGGAAGATATCTGATTC AACAAATTCCAGAGTGAGGCTGGATTTTTTTGTGATAGAGATGATGTAAG CACCCTCAGGAACATCCCCAAATGACAGACAGATTTTCATCATTGACATA ATCTGAGGTCCTTAATTACTTTAAAACTGTGGGATCTGGAGGAGAATAAC GTTGATATAATTTCGGTGATAATGATGTACTCCTAAAACTAAATCCATAG AGAATGTTTTACTTAATGTTAAAAGTTACCTAGCAAAGAATATAACCATA GTTGCGGATGATATTCCTGCAATTTTAATTTAGGGGGTTGTAAGATACGG AGAGTTCGAATTGAAGATTTCTTAGACGATAGAAAGTGTCTTGGAATGGG GTTCTGATATTATTATTATACACCTCTACATTTTTTGACTTTGCAGAAGG CACTAAAACTTTTTAGAAAGAGCTTGAAGAAACAAGCTAGGCTAAATACA ATTTTGGTTTTAATATTAAAAATTTATATTTTATTGATTTTAGTGGCTTG TTTGTTACTTATTTATTTCTATCTTAACAGGAATTGATATGAGAATTTCT 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