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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s260 | supercontig | LSalAtl2s260:1340293..1359092 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000004970 >EMLSAP00000004970 ID=EMLSAP00000004970|Name=EMLSAP00000004970|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=161bp
MFPKPEEGDTLQNMGKDRFKASFDIVSADTTENRKEFYLVVGKKSEEAQG LGIRKISIDFTVVEKALISTTIVMPDSILLNTLINEENNNKDSLRVGSTH RVNSWPTERTXADTYSEDEINELRIGIVSIVIVAILITIIIFLVAYCLFC RKKEFSRVPTK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s260:1340293..1359092- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000004970-700817 ID=EMLSAT00000004970-700817|Name=EMLSAT00000004970|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18800bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s260:1340293..1359092- (Lepeophtheirus salmonis) TACGGAAATCACTTTGTAGAACGTTCTTTTGATGAAAAGGTAAGATTTCT
GTCCTCTTTTAGTTAATAATTATATATTTTCAATATTAGGAAACCATGTT
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TGCCCTCCAGAGTCCAGGAGTCGAGTCTGTCAACATAGACCTACGTACGT
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CAACATACACATTTTCTAGAAAATGCAATTCAATACTTTTTAGAAAGGGA
ATGAATGTCCCATTCTTAGACGAGTAGTTCTATATGTAATACACTTCATT
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GGGGAGGGCTAAATAATTGATCTTTGACCAATAATGTTAAATAAATTGTC
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GACCTGGATCCATAGTCTACCCTCACCCCTTCCTTCTTTTATTTACACCG
TTTGGCAATATATTGCAGTCTAGTCGGTTCTGGTTCTAGCAGTTTAAGAA
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TTGTGGGCCAATTCTTCCTAGACATGCGATTATATTCTATCATTATAATA
GAACTTTTTTTCGTGACGTCATTATTGGGAATGTCGTTCATTTTCATCAA
GTTTTATAGCAATGAAAGCCCTCTTTTCATCAATACTAAGGAAAATAATA
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CTGTCTATAAAAGTTTTATAGGCTTATTTTATTATTATTATTATATATAT
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TTATTTCCATATTGTAGATACAAATCAAGTACTACAATCGAAAGCATAAG
GTATTCTTCTCTAATTATCCTACTATTTGCTTCCCAAATCGATCAAAGAT
TAAATTGTACAAATTCAAATTTAGATATTTCATTTAATTTCATAATTTAA
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GTTTTACATTCGTTTGAATCGAGAAAAAGATTATGGTGACTGTCTTTTGG
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TTCCCCCACAAAATAGTTTTCATTCACGACAATGCACCAGCTCACATCTC
AGCAGTTGTGGTCGCAAAATGAATAAAAATAGGGTTCCAACTCGAGATGC
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GAAACCACTTATAAACTAATCTAATCGAAGGTGCAAAGTCCCCATAAATT
TTATCAAGCTTCTTTTTAGTCTCCTGAGGCGTTTTGCCTTTCATAAAGTA
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TGAAAATCACTTCCCTTCCTCGATTCAAACAAATACCAAACAGAGATAAA
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AATACGCACCATTAGTGCCATCCCTCGGACTTTTCACAGACATTTCAAGC
GATCCTTGAACTTTGATTATATTCAAATATATCTGTTTATCATTGACATC
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GGACTTTTATCAAGGTTAATTGGGGATTTGTCTATTTATGTACTAAAAAT
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ACGTCAGTGGAAATGCAAAAATTGTTGAGAATTGTTCACAGCTTAAAAGA
TATTCAACCAATCAACTTTTAGAACGCTGATAAGTAGAAAAGAAGTGGGG
CTGTAGCCCCCAACCAAAAAAAAATAATAAAAATCAATATTTTTTTCTTA
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TGAAAAAAAATTTAATATTTTAATCTTAACTTTTAAATTTTTTTCCAAAA
CATTTAATTTTCTGCAAATTGGCACAGATTATGAAAATTTTTCTCTCAAA
ATAGAATATTTGCAATTTAACTTTTGAATTTTTTTTCCAAAAAGAATAAT
TTTTAGTAAACAGCTGTGAATTTTTGAAATTTTTTCACAAAAAATTAAAT
ATTTGATGGATATAACTTTTGTAAACAGCTGTGGATTTTTAAAACTAAAA
TTTAAAAAAAGTTTATATTTGAAATTTAATTTTTGAAATTTTTTGAGAAC
AGCTTTAGGATTTTTGAAATTTTTTTCCAAAAAATCTTATATTTTAAACT
TAGTTTTTTTTAATTTTTTTCCAAAAACCTTAATTTTCTGTAAATAGGCA
TGGATTTTTAAAAATTTTCTCAAAAAAAAAATAATATTTGAAATNNNNTT
TTTTTTTTCCAAAAAAAATGATTTTTATTAAACAGTTGTGGATTTTTGAA
ATTTTTAGGCAAAAAATTTAATATTTGAAATATTAAATAAAAACAATTTT
TGTAAACAGCTCTAGATTTTAAAAAAAAAATCCACCTGACTTATAATTGG
TGTATATATGAGGTAGATCCGTGTCATTTATCAATATAATTAAGTAGAGG
TTTATTTAATACATGAAAAAATCATGCTGCTTAAGGAAATATGTTGAATA
TTATACCTTAATTCCAGATTTTCTTTTCCTAGCTCTTTTAATCAGAATGT
ACATAGATTTCAGTTATTCATATCACTCATAAATTATGAATATGTGTTGC
AAGATAAAACTTTATGTTGTTAATAGTGTTATCTATTCGAGCAAACATGA
AATATGCCTTTGATAGTGTGCCGTGGTAGTGAGTTATATAAAAAACTGAA
GCGGCATCTGCTATAACTGCGTAACCTAATCAATAATATTAGATCAATAT
AATTTTAGAAGTGGTTTTTAGTTGACACAAGTAGAAATACTCAAACTTGT
TCAGGCTTTTTTAAATGAATAACAAGTAATTATTGATTCCTATTAAATTT
GTATTAATAACTAGCAATTAGCACTCTGCATTACCTAGAAGATAACTACC
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GGTTACTCAATAATCAAATGTCCGCAGGAAATTCTACTTAAAGAAGCAAA
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TGGGGCTAAATTAATATTTGCATATATCAAATGAAGGCTCAAGACTATAG
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ACAATTGACCTGAATATTGCTCTTGAATTATTGAGCTGTATGTATAAATT
AAATTGGGGAAAAATAATTTCGTATTATAAGAAGTGTTGAAATCATCCGA
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TCCAACTTTATAATGCCCTTCTCGTTGGGCACTTGCCCCTATTGGCAAAA
ACTCGGACAACCAATTTCCACAGGCTTTTATTGAGGGCAAATTTGTACCC
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GCTTCTGGAGCGTTATGAGGCCTAGTATTGTCTTGATGAAACACGATTCC
TCTCCTATTCGAGTTTCTTTTTGTATCACGTCTTCTGCCAATGGTTTCAA
ACGGTTTTATGGTTACTGTTCAGCTCCTGGGCATGCTACAACTGCTGACA
GGGCGGTCTATCTCGATATTTTCCATGATTTTATCTACATTTTTGACGAC
ATGCCTGCCGGCGCGTGTTACATCATTAATCGTCACTCCAGTGGAACAAA
ATTGCTCGAACCACTCCCCTGCAAAAATAACCAAAAGAGTATCCACCCCG
TATACATTGCGCATTTTCTTGGTCTCTTTCAATGTGTATTTCCCTTTCAG
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AATGCATTTGTAGTATACATTCACACCGTTACAACTCCTCATCGTATGAT
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AAAATACATCAATCCACTTTTCTTCTTTCTTGATTTTTGCCAAGATTGTT
TTTATGTAAACTCACCACAAACATAGTAAATCAGGGGGAATAACTATGGA
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CCCCACGGTAAACTATGATAAAATATATACACTCAAACATGGTACAAGAG
ATTACCTGCACTAAGCGGTTGCTTTTTCAGTCTTCCCTGCCTGACCGCTT
AATACAGGTTTGATTGTATTTATAAAGATTAAATAATTATTTCATTTTTA
TTTCTTTTATATTTCATTTAGTATAGGAAATTAATTATACATAATATATT
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TTCTTCATAATAACTTCATAATAATTTTTTTGTTTTTTAAAGAGAATAAT
CTGTATAGTTCTCATCCAAGTCATTGGTAAATCAGATAGGTAGAGTCTCT
GTAAGAAAATCGTACCGTTTTTGAAAGTAATATTAAAATCAACCTCATTA
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GTCCATTGAAATCTGACATCTTACTAATTCAATAATTAATTAAGGTTGAG
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TTGACACTTGAACTTGATCCACGAATTTCCATTCGTGCACTCCAAGCAGT
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CCTGGCCAATCCTTTCGAGTCCATAAGGGCCCATGCAAGAAATCCCAAGG
TTTCACACCAAACTGTCTAGAGAGCTATAAAATAACTGAGTAGAAAGAGC
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CCATCTCCTCTATTACAAAACTCTTTAGAATGAGTCTTTTGAACTCTTTG
TTGACACTTTTCGCCCCTTTACAGCCCTGATCCCAACCCCTTCTACTACA
CCTTTTGGGTACAAATTCGAGGGTAAGGTCTGTAGTGCCCTTCATCAAAA
CACTGAAGCCCTCAAAGACACTTTCAGGTAGCACTAGGACTCTATGACAG
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AACACCTAGATGACGTAGTCATTGGATATATCAGCCCACTCTTTGTTAAC
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GTTGATATAATTTCGGTGATAATGATGTACTCCTAAAACTAAATCCATAG
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GTTCTGATATTATTATTATACACCTCTACATTTTTTGACTTTGCAGAAGG
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TAACTTAATTTATAGTATTAAAAAAATGATTTGTGTCATGAAAAAGAACA
GTTTAGTTTTCGTTTTTTCGTCGTGAACTTTTTTCATGGAATCACCTTGC
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GTCTAAAAGATTAATTTATTTCGTGTTTCTGCTCCACGTTTTTCACTCTA
TTTGACAAAAAATATTTATGTATGATTATTAAATTATTAACTGAATAACA
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TACTCCAAGATGTGTTATGTAATTATGTAGATGTGGAAATATTGGATGGT
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GAGCAGATCGTGACAGTTGCAAGAGTCCCTTTTACTCAAATATCAAAGAA
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TTGAGATGTTGGATGATGCTTATGAGTAAAAGTAATTGTTTTGTATGTTC
AATATTTTTGTTATAGTGGAGTCAGTTTTTAATTGTTTTTGCTGAAGCTT
ATATCATTTGAATAGTTAGTTATCATTATACTCATAGTTGATAATAAGTT
TTAAGAAGACTTAAAAAAATCTCAATTCATCCCTCCTGGTTACGAAACAC
TGGTCTAAAAGATTAATTTATTACCCCCCAACCCCCCCCCCCCAAAAAAA
AACTATATATATATAGTCCTGCAGACGCCCCTGGTCTGTCAAGTTGTCAG
TACTAGGTCTGATTTTTTTAAAAGAATAAAGTTGATTGACGTTGTCATCC
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AACTGAACGGGACTGCATTTTTCAGCCCTAAATAAGGATCATCAACACAA
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TGTGAATGTCAGGTTTTGGTTATTGCAGTCAAACCAGCACGGAGAAATTG
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CCCTACCAATGATGTAAATCCGGTGTGCTTTTCAGCCAGCCCGTTCATTT
GTAATTGGTAATATAAAGAAGAAATTTTCTTTTCCTTAGCAGTTTAATTA
TTAAATTCTTGAGTAGTAAACATCCTTTTTCTAAATATATTCAAAACCGG
ATTGAACATTCGTTTGTGCTCATAAAAGACGGAGCGTAACACTGAAGATT
TGTTGCAGGGTTATAATTGCAAGTCCTTGTTGGACTCAGAGTAGAATTGG
GGATCGGCATTGGAGTAATTCTCCAAAAAATGTCCTTGTTTATATCCTTT
TCTCCTTCCTCTCTTGTAAAAGCTGATTGACGCTGATCTAATAAAACGTC
ATGAGCATTATTCTTCCTCTCCTCCAAAATATTCTTCAAATTGTCAGGGT
GTCCATGTTGATTAGATGTTTCTTTTGCTTAACATGCCCATTCTACACTG
GATTTTCATCATTGTCCCTACTATTAATTCAAAATTGTTTTATTTTATAC
TGTAAATCTTGCTTAAAAGCTTTTTTTTTTTTTTTTGCAATAAAGAAGAG
TAGGATTATCTAGTCTTTTATTGCATGTATGCAATGATTATTAAAGCACA
TTATAGAAGATTGCATAATTTAATACAACCAAATAGTAGTGTTCATACAT
ATTTATTGAATTATTTTCTGTTAATAGGATCACTTCAAAAGTTTGAATGT
CTGGCCACAGGAGAAGATTTGAATGGGAGATTTGTTTGGTCCATTGGAGG
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GCACATCATGACAAAAAGTTGATTTGCAAGTAAGTTTTTGATGGAGTAAA
AAGCTCCTTGAATAAATGGATTTTTATTTAAGAAATGTGATCTTTGCACA
TTTTTACTAATTTAATCAACGGTAAACAGATTTAAAATATTAAAAAAATG
TCAAAAGTGAAACGAATGTTTAAAAAAAAGTCGATCATAAAATGTTTCAA
AACATTTTGTCAAAAAGTGTCAAATTTCTAATATATCTGCACAAAAAATG
TCAAAAAATGAAAATAATAAATGAATTTTTATATCAAAAAATTCATTCAA
TTTTTTGGTGAAAGATGCTCTGAAAAACTGTCAATTTTTTTTTTCAAATA
GTGTCAATTTTTTTCTTAAATAATGGGAATTTTAAAAAAAATTATCAAAT
GGTGTCCAAAATTTGACAAAAAAAAAGAAATTAAAAAAAATAATCCGAAA
AATCTTGGAAACATTATGTTATAAAGTGTCAAATTTTGAAATATATCTGC
TTAAAAAATGTCAAAAATTGAAACAAATGTAATTTTTTTTTTTTGACAAA
ATAAATAAATAAAAAACATTCTTCACAAAATATTGCAAACATTATTTTTG
AAAGCGTCCAATTTTTAATTACAACTGTATTGTCAAAAAAAGAATCGAAT
GTCGTCAAAAAAAAAAATTATAAATGTTGTCTGGAATAGTGTCAAAATTG
GTATTCGAAGAAAGAAAAATTGGTATCTTTGATACAAAAAATTATCACCC
TGTCATCTACCAAAATAAAAGAACTACTCACATCCCTGAATAAATCCCGC
ATTTTGCCTTTTATCTAGGCCCTGCTGTCGCTAAAACAGCCCTGTTTTTT
TACTCTGTGTAACGCTTTTTATCATTTGATAAAGGAAAATAGTTTTTATT
TTATATAACTGATATTATCAACGTATATATAAATGTTCAAAGTTTATTTC
CAATTTACTTATTTCGCTTACTATTGTAAGTTTTTTAACAAATAAAGGAA
TTTTATCTAATAACATTAAAATTAAGACTTTTGAAAGTGTTCTTTTTTAT
TAGTTGAAGATGTATCTTTTTACTTCTATATAAAGTCTATAAAAATTCCT
AACCGCTAAAGTTAGGAAATTACAATTCTCAAAAGAAAAATATTATTTTT
TCTTTGTATTAGTTACTTTTAAGCAATTTTCTAAAGTTTGGAATTAACCC
ATTACAGGTGATAAGTTAATTACTTTACCAAAACATTTAAGTATGCACTT
ATAATCACTTTGAATTTTAAACTTCAACAATATATAATTTATTAATTAGC
AATATAATTTCAACAAAATTAATACAATAAATAGATGTGTGTATGAGCTC
TCTTAATCATTAATATGGCCGACCTTAGAGGCAATGATGGCTTRCAGGCC
CAGAAGGCCTGGCACAAGCTGCAGATGTAGTCCTCTGTCATGGCGTCCCA
GTTCTGACTGACAGTGGCTTTGAGGGCCTCAGTGTTTGGTTGACGGACAC
TTCAGGCCTTCCCTCGACATACACACAAAATGTATAGTCGAGGACGTTGG
TATCAGTTCCTAAAAAATCCAAAACTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTCAAA
AAATCCACAGCTGTTTACAAAAAATTTCAAAAACCCTTAGCTATGTACAG
AAAATTACATTATTTTGAAAAAAGAATATAAAAAATTTATTTACAAAAAT
TAATTTTTTTTTTAAATTTTTTAAAAAATTTCAAAAATTTAATTTCAAAT
ATTAACTTTTTAGGAAAAAAAGTTCTAAAATACAAAGCTATTCCCAAAAA
TATTACATTTTTTYCTCTGCCGCATAATTTGTACGAATTACCTTTTTTTT
GAGAAAAAAAATATTTCAAGAAAAAATTTTTAAAGAAATTTTCACAATTT
TTATTCGTACTGACCAAAAAAATATCTTGTAAACACCAAAAATTATAGCC
CCTCCAGCCGCCCCCCCCCCCCTCGTGAACACCCCTAAGGACTGAAGGTC
TTAAGAACGTATCTCAAGGACATATAGGACTGGTCTTAAGACGGAACTGC
ACTGGACTAAATAAATAAGGCCTTTGTATCAGTCCTCAAACTTATAAAGC
TCGGTCTTTTTTTTAATGTTCCTTTAAATGGCTAGATGGAGTTACGCTGA
TTTACTATAAATAAACATTATAGTATTACATCGTCTCCGTCTGACCTAGA
AATCTTCTTTTAAGTCCATATAGATTAAGTATATATCCTTCTGTAGGAAC
AACCGCTGTGCAAACCTACCCACATTGAGTTCAAGAGAAAAAGTTTATCC
CAAGTGCGTCGTCCATTGAGCTACGTCGATGTAGTTCTGTCCTTTATGAC
GTCACTCAATGGGATTTCTTCTTTTTTTTTAAATCAGTTCTAGTAATGAC
AGTCCGAAGGATCAACGGCTTTAAGGACCTGTCCCAAGGAATGATACTGG
GGGGTCGTCAGGGTGGGGGATGGATGGGGAGCAGACTTCCAAAATGAAAT
GAATTCATTTTTGTCTTGTCAAAGAAAAATTTTCGATTTGGAGAAAATAT
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AAATCCTGGGGCTAAGTAAAAAAGTTTATTTATTTTTAAAACAACCCTAC
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TACATATTATTCCCTTTGTTTTTTCAGATATGTCAAAACCCTGGATGGTG
ACAGAGTTGAAATCCTAAACGAAGACTCCCTCTCCCTGGCAGTCCATTAT
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