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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s270 | supercontig | LSalAtl2s270:285700..294491 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005120 >EMLSAP00000005120 ID=EMLSAP00000005120|Name=EMLSAP00000005120|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=801bp
MWISWWFYFLLWIHSSTSHSFIKTDIFDRIYKQLDRLIHLESNATKSGSG
FNKGHSFITKPNKEAYSKYETSIVLEIATREGGITRLPRNSVPSRCDTLR
CSPSDSYSKLDGACNNLWKNRRWGSRLQPLRRILPSVYNDHISEPKIKSI
NGSYLPNARVVSNAFHQGNRITSRKHNYTLMLMQWGQFLDHDISFTPNVR
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EVKTEEDCFAQCSNHIETTILNDTRENTFILTSYFYLKEIKLGKETAVGI
V back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s270:285700..294491+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005120-700967 ID=EMLSAT00000005120-700967|Name=EMLSAT00000005120|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8792bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s270:285700..294491+ (Lepeophtheirus salmonis)
GAAAATCTTTTCAAAAATAATCTAAATTTCAATAATTCCATTGTTGTTTT
GACTCGATTAATTCTGGAAGATAAACAAAGAACCTGATGAGTGATGCGAT
GCACACTAGCTGTCTTCATGCGTCATTTCTTCAGTTCTGAAATTCTTAAT
ACTTAATTTTAATTAAAAATGTGGATATCCTGGTGGTTTTATTTTTTACT
TTGGATTCACTCCTCCACTTCTCATAGCTTTATTAAAACGGATATCTTTG
ATCGCATCTATAAGCAACTCGATCGTCTCATCCATTTGGAGTCGAATGCC
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TTATCTTTACAGTTACACACTCATGCTTATGCAATGGGGACAATTCCTTG
ACCATGACATATCCTTCACACCAAATGTTCGAGCTCTACGTTCCGGTGAG
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TTTTCCAATTATGATACCAAAAAATGATCCATACTTCCCTGCTCAAGCAC
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TGTTGCAAATGTATTGTAAATATATTTTTATTTAGGTCAATGCCAGGCCA
AAAAAATATTGGAAAGAGGCAACAATTAAATCAAAACTCGGGACTTCTCG
ATGCATCTCATGTTTACGGTAGCTCAATTTGTTCAAGTAATGCCCTGAGA
AAGTTTAAATATGGACATCTAAAAGTTACAAATCATCCTTATCAATCTTA
TTTCAAACCCTTGATGCCCATGAAACAAAATATATTTGAATGTGAATCAC
ATTTTGGAATGTGTTTCCATTCCGGAGATGATCGTAGTAACGAGCAACCA
GGTCTAACGTCCTTACATACATTATTTGTAAGGGAGCATAATTATATTTG
TGATCAATTAAGAATTTATAATCCGAAATGGAGTGACGACACTTTATTTC
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TCCCAAACATGTCAGACTGCGTCACCATTTCAATAATCCAGATATAATGC
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AAATTAAAATCTGTTTATAAGTATGAAAACAGTCAAATGAATAATATTAG
CTTTTTTTATAATTACATTTTTATAGGAACGTGCAAGACATTGATTTATT
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CCTTCGGTTGTATCATTGGCCTTCAATTTAAGCACTTGCGCTACTGTGAT
AGATATTGGTTTGAAAATCCATTTCCTTATATGAGATTTACAAGGGCTCA
ATTACGAGAAATAAAAAAAGTTTCTCTAGCATCCATAGTATGTAGAAATT
GCGATCAACCGAGGAATTTTCAAAAGTAAGATACCTAGGACATAACAGTT
ATTCCATAAAAGTATCATTGATTTCCTTATTAGATTCATAATGGACATGC
CAAACGATCAAAACAATTATAAATTAAAGTGTTCCTCGCACCCAAACATC
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TAGATTTTGTGATATTGAGGGTAGAATTATGGAGGGGGGCGATAAGGATC
TACGTATTTCGGGATGTACACAGTGTTCGTGCCCAGACTCTGGAGGTAAC
GCAATATGTCAGACTATAAATATCAACTCTTGCTCGGAATTAATTAACGA
AATTGGTTTAAACGAAGTCAAGACGGAAGAAGATTGCTTTGCTCAGTGTT
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ACTTCTTAATTATTATTTTATAATCGCATAACGTAAATCATCATTAGGTA
GATTTTAAAATTTGTATCAATTGTGGAATAAATGACTCCTTATTCTGTAA
TGCACTTATAATCAGGCGATTCGTCTACATCTTTGTAATATTATTTTATA
ACTCTACTATAAGACATATGATTTAGAGCTATAATTATGTTGCCTTCGTG
GAGAAAATTACTGCTACATAAGTGGGATAGTCAAGTTCTCAAGTTTGTTA
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TTACAACGTGAAATATTTATTATTTGAGTCGTCGAAATTGAAGAACAATG
CATGCTGCAGAGCAATATAAAAACTAGTTATGACTGAGGCGCTACGAGTT
CAAATAAATAATAGACATATAAAAAAAATGAAGAGTGATGCGTTGTCCTC
TTCATTTAAATAATGAGATAATACTATTAAATATATTAGTTCATTTCAAA
AAAGGAGAATTATATATTATCTGATTCTACTTGTTCATGATATCCAAGAC
TTTTATTATAATAATCAAGCAACCTATAAAAGTTACAATTTACATAACAT
GCAATTACTAAAAGTAACAACTACATAAGGAATAAATTAAGTGATGGAGA
GCAATATATGATTTGTGAAGTTTTGTCGACAAAAATTCAGTATTTTATAG
AGGAAGAGAATGAGGTTGCGTAGAGAATAGTAGAGAAGTCTGTATTTTAT
TATAAATGGGTGCGTAGAGGGCGCTGTATGTGAGGTGTTGACTTTCTCCG
ATTTTTCTTTTAGGTTTCCTTTATAGTTTATACTTACTAGTTACTTTTAT
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TTATTAGAAAGTTAATCATGGGTGAGTTGCGGATTTAGTTATCCGGGTAT
ATATATATATAATTATAATTAATTATTACTGTTTTTTTCCCGTAGAATCT
TTAACATTGGACACTCTTCAAAATTTAAGAGTTGAATTTCAGTCTGATGA
GAAAAATATCATTGCTCAGAACATTGTTACTAAGACTGATCCTCAGCTTG
CCTGTGTAAATCGATCCATCTATGAGAAGAATTACAATCATGTCTTTACA
CATAAGATAACAGATGAAGGGAAACCCGTTTCGAACCAGAAAGCGAGTGG
AAGATGCTGGCTATTTGCTGCCCTTAACGCCATGAGGATTCCTTTCATGA
AGGACTTGAATGTGGAGGAATTCGAGTTCAGTCATGGCTTTCTGTTCTTC
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AATCTATTTGGTCAAGTCAAAATATCAGGGAAATTGACTTTTTCATTATA
AAAAACTTAAAATTCAATAGGATTAATAAGTTAATCAAAAATAACACTTT
TAATTTCAGGGAAATTTATTTACTCATCTTATAATGTGAATCCCTTATTT
TTAACCATAGAAATAGTATATTATTCTGTTTAGCCTAACAGTCTTGTAAT
TGAATTTTTTACTTTTCTATTCGGCTTTTATATAAAAAAAGGTTATTCGG
TCATATTTAACTCTATATTAATTCATTTTAAACATTCAACCTTCATATTT
TTTGGTCTCAATTTATGTGGTTTATATACAAATTTCATGCATTCACAATT
CAATCACTTTTGAGGGATGTTAATTTTTTTTTTAAACGAAGATACGAGAA
CAGTAAAAATAGTCTTGTTAGATTTAATATCTTGACGCATTAATTACAAA
TAGTTAATTAGTTTTTTCATATCAAATTTCATTTTCAAGAATTTGTATCC
TTTTTATAGGCTTGAACAATAAAAAAAATCAATAATCTACATAAAAATAT
AGCTATTTTCTAGCAAAATTGATTCTAATTTCGATTATAGGTGTATATTT
CAAGTGGATTCATCCAATCCTGAAAAAAAAATCACTCTAAAAGGAAAAAA
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AATATATATATATATATAGTTTTGCTTATAAAAGAATAATGACCCAGTTT
GTATGTGCCTAAAGGTTGCGGCATTAATAATTGGTGTTTTTTTTATTATC
TAATTTTTTGCTTCTAAAATGTCTCTGCCATATTGATTTTATTTTACCAA
AAATGACTCAAAGTTTATTTTAAAACCCCCATTGTTTTACCTATTCGTAT
TTATTTATTTCCTTTTTTGAACATGATAATGAATTATATCATGTTTTAAA
AGTTTCAGCAATTAATCCCTGGAAATTTTTGTAATAAAGAAATGTACATT
AATTGGTATGAAAATACATAAAATTGGTGATATATGTTTATTTTTATGTA
GATTAATGATTTTTTTTGTTCTATTCTTATATATACTTAAAAGATGTTCA
ATTAATTTCACATGTTTTTAAATCATTGTTTGATAATTTATTTTTATAAA
AAAAATTTACTATTATTTTATTTTTCGTTAATCATTATTCTAGATTGAAA
GAGCTAACTTTTTCCTGAATAAAATAGTTGAAATTTGTGAAAAAGACCCT
AATGTTGAGCCATCGGGTAGACTTTTAAGTTATCTACTGAAAGAACCACT
CGCGGACGGTGGCCAATGGGGAATGGGTTGTTCTATAATTGAAAAGTATG
GAGMAATACCTAAAAAAATGTTTCCCTGAGACATTTTCGTCTGAGTCCTC
GTATAGAATGAATAATATGCTTACTTCTAAGCTTAGACAGTTTTCAAAAA
AATATCATTACTATGTCGAAAAAAGGAACTGCTAAAGAAGATATACTTAA
AGAAATAGATGGGTACATGAAAATTATTTACAGGTACGTTCTACTTTTAC
TTTAAAAATAGGTTTTTAATTATCGTTGTTATATTTAATCCCAATTAGAA
TTATAGCCATATGCCTTAGTATTCCTCCAGAAAGTTTTGTCTGGGAATAT
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ATTTTATCAGAAATATGTCAAGCCTTTATGGAATGTTAGTGAACATATTT
GTCTTGTGTCAGATCCTAGACCTGAAAATCCAATTGGTAAAGCCTATACA
GTTGATTACTTAGGTAATACCATAGGAGGATTACCGATTATATACAATAA
TCAGTCCATAGATACATTACTATCTATATCTGCGAAGTCGATAAAAGACG
GAAGTGCTGTCTGGTGTGGCCTAGATGTAAGAATACAACTTTTTATACCT
ACTCTGTAAATTTAATCACATTTGTTTAACATTTTAGATGACAATGTTCC
ATAAGAGCAAAGGTATAATGGACTTGGACCTATTTGACCATGAGCTTATG
TTTGGAACTAAGCTTGTTCTTGGTATGGAAAAAGCGGATCGATTGCGTTA
TTTTGACTCTGCTATGGGCCATGCAGTTAATCTTACAGGAGTTAGTTTTG
ACGTAAGTTGACAATGTGTTTTTATTTATCTAAGTACTATCTTTAAATTT
GGATCTTTTTGTACAGGATAATGGTGAACCTTCTAAATGGAGAATTGAAA
ATTCATGGGGTAAAGACTTTGGTGAAGACGGTTACCTGTCTATGACTAAT
GAGTGGTTTAGAGAGTTCGGGTTTGAAGTAGTGGTAAAGAAAGAATATGT
TCCACAAGAAATAATTGATGTTTTCAAAATGGAGCCAATAGTATTACCTG
CTTGGGACCCAATGGGTGTTTTGGCTTAGATACGTTTTTTATACATATTC
AGTCAACAAAATTAAGAGTGATGCATTTGATGGATAAACTACTAATAATA
ATAATTTATTCAATATGAAATCAAAATAAAATTCAACAAAATCTGTTTGT
ACTCGTATTGTATATTCTTTACTTGATCTGTTTTCGCTCTTTGGACAGCT
TCCACGAGTACTGAAGTTTGGACCAAATACCTCTAGTCATCGTTAGAATC
TTTAGGTCAGGAGATTTAGATTTCTTCCAAAAGTTATACACTGATAGCAA
TATTTGCCTAGCTTTACATAGTTCATTTCTTTGTATCAGACTAAGAGCTA
GATAGAGCTGACATTTAGAAACTAATGATGGATCTTCTAGAAGGGATACT
AATTTCATTTGTTGCAAGGCATTTTCCCCAGCTCTCACAGCCTTGAATGA
TAAAATGAATGACACAATATTTAACAATATAAATTTGCTATATTTGACAA
ATATAAGAAGGAAATATAAATGGATAAATTTACTCACCCAATTGCTAGAA
TGTTCACCCAAATTTGAAAAAGCACCTCCAAGAGAGGATAACCAGTAGAG
AGCATGCTCCATGTCAATGGCCCTATGAAGAACACCAGCAGTGAGACGAT
ATCTAAATTTCATAGAAACATTATTCAATTTACATATTCAAAGGAGCAAA
TTATTCTCAACTCACGATGCATAAGATACTTCTTCCCTACAGGCAATTGG
ATAAGTGATGTCTTGATCTATTAAATATTTTTTAGTAGGGCTCTTTTCAT
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TTTACAAAGAGAAGATTCTGTTAGACCAAAGCTCTTAAGAGAATTGAGAG
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TTTTTCACGAAATACAGCTCCAAGATGAGGTAATAAGTCCTCAAATTCTT
CAACTGTTAACGAACTAGGAGAAGATGATTTATTAGCTGAAGTAAGTGCA
ATGGGCTCTCCAGTCGCTCGACACACTTCTCGAACAAAAGGGTGATTAGG
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TTTCTTGACGTTTAAAAATCAGAGTTACAGGGCCGGGAAGAAGTTGCTCA
AGGAGTTCCTTTGGGACAGTAACGTGAGCCCAAGTGTAAATGTCTTGAAT
TTCTGCTAGACAAATAGCAATGGGTTTGACGAAAGCTCTCCCTTTAATTT
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AAGTTCCTTGAGTTAGACTTGAAAAGAGAGTTGCAATTCAAAATCAAGTG
AATGAGAGGGATTTGGGGATTGGGATGGAGAAAGAAGTAACCTGTAGAAG
CTGATCCGCAGCCGTCCGAATGAGAAACTGTGGAAGAGAGCTTTGTTTTA
GAGAGTGGATGTCGTAAATGGAGGAGTTGGATGTGGTGGATGTTTTCATG
GCCGCTTTCCTCCTTATTCTCTCCAGCGATGTCCGCAAGAGACGCATTTA
TAAAAAGTGGTCATGGGCTCGTCGGCGGAACGTGTTTGGATCTGCATGAA
ATAGGCACGGTGATGATCACAATTGGGGCAAGTCTCCTCAGTGGAGTCCA
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AGGCCGATAATTAATAAATATTACTACTACTCACTATATTCAAGTAGGGA
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TCCGCTAAATCCGCCAAACTAGCTTTAAAATAAGTACACAAA back to top
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