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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s287 | supercontig | LSalAtl2s287:281236..323990 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005340 >EMLSAP00000005340 ID=EMLSAP00000005340|Name=EMLSAP00000005340|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=269bp
MNCFLYRGFGFVTFSDPNSVDKVLSNGSHDLDGKKIDPKVAFPRRAHPKM VTRTKKIFVGGLSAPSTLEDVKNYFEQFGRIEDAMLMFDKQTNRHRGFGF VTFESEDVVDKVCEIHFHEINNKMVECKKAQPKEVMIPTTIATRTRPVIR GTNGTTPSSYGESHFALPSSTNSSQQSSIPTLSSPSHHIQQQXQQHTNHL QQLQHPTVANSALYRYSPYFIPSSTPSSCFLPPEQHTLIQPPSLNFAKPD LMYSLNDLLSLQQSLQLGF back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s287:281236..323990- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005340-701187 ID=EMLSAT00000005340-701187|Name=EMLSAT00000005340|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=42755bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s287:281236..323990- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAACTGCTTTCTTTACAGAGGCTTTGGATTTGTGACTTTCTCTGATCC
GAATAGTGTGGACAAAGTGCTCTCAAATGGATCACATGATCTAGATGGTA
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AAAATACATTAGATGTCCTCCGAATACGAATGCCCTACAACCATTTTTGT
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AAAAACCAATAACCCACCAGTATCTTTTTCCTTCAAATAAAAGCAATTAT
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ATTGAGAGCTTTTTTATCAGCTAAATGTATATATTTATGTGATGTATATG
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TGTGAGGTCCCAAAAGTACGTAAAATTGTCTGGCAGGACGGCTTGGATCT
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CCGAACTATTTTCTGCCCCAGGGTAGTGCTTTCTTATCCAGAAGTTCGAT
GTAAACTTTTGTATTGAGTATTTTGTCCTCTCCACAAAAATAAGAGGGCA
TAATTTGCCTTTGCTGGCCACTGATTTTTTTTTTCATCGGAAAAGAGCAA
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ATACCATTTTACTATTAAATCAGCTTTCTAATTTCCCTATTTTCAATTTA
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TTCAATTTAGTGTTAGCTAAATTAGTCTTGCTAATGTATTTAGCAATTTT
TTACAACAYCCCCCCCCCTCTACGCTTTTTTGCATACTAGAANNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCAATTTAGTGTTAGCTAAATTAGTCTTGC
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ATACATATATTGTACATTTCGTAAACAATTATTTGAATCATTGAACAATA
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TCTATGGCTTTCCAACCTCCCTCACTCACCAAATAAGATCGTTCTTGTAT
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TTAATAACTTCGCCATCAAAATAAAATAAAAGCAATCCGGAATCAAAGTT
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TCTGGACGTTTTTTTGTGATGTAGCACCTGTTCTGCTTATTCACAGTGAC
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TGTGTTCGATCCCATATTTATGTTTGGGATATTTTTTTAACATCAAAAAG
GTTTTTTTTATTTGCATAAGGTACTTTTGAAATGGTCCTGTCATCAACAT
TTTATGAGGATTAATACTATTATTTTGATTACTTTGTTCGATAGTAATGC
TATTGTCATAGAGAAGGCACAAGTTGCCTTAATATCATAAATCCATGGTA
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GTCGGTGTCATTTTCAAAATGGATTGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGA
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ATTTTTTTTATGAATAGTTGTGGATTTTTTGAACTTTTTTTTCGAAAAAG
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TGAGCATTTTTCGCTAGATGTCGTTAGTGAGCTATTTTTCAAGATTAATA
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TTACAGTTTTGTGTGTTTGGGCAAGGCAGTTGTGTGTTAGAGCGTTTCAA
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GATTGATTCTGTGAATTAAATAATGAAATTGGAAGAAGAAAGCAAGGTCG
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TATGATTTATTATTTAACAATAAAATATCAATAAAGTTAGTATTATAAAT
CGCTGTCTATCTTAGCTCTCTTAACCATTATTATAGCCACTCTTAGCGCC
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CATTACAAGCCTTCCCCTCAACATGCACCCAAAAGATGTAGACGAGGGGT
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GAACTTTAAACACTCATTCAAAAGAGTCCTGCAATGTAAGATATGTTTTT
TTCCTTTCATCATTGCTGGTATCAAAAGTGACCTTTTTACCCTCATAAGG
CTCTTCCCACCCACTTTTTTGATAGCTCTTTGGACAGTCTCCTGTAAAAT
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CTATTTTTTTAACTCGTCCGAGTCCACTTTGGTCTTTTTGATAGAGCCAT
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TTCCTCTACTTGTAAATAAGTTAGATATCTCAGGTTTGTTTTGTTTTGAA
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TCAGATTTCCATGTACCACCCGGTAAGATAAAAAAATGTATATATTCAAT
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TTAATTTTGTATATTGAATATCTCTCAAATTAAGAAAATCTTTTGCGAAA
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AATAAAACTGAGGAATCAGATATCAATTCCAGGTTACTCAGTGAGTCTAA
CAAAAGTCTCAATCCAAGATTCAAATAATATGAAATGCTGGTACATTAAA
AAGAAACCAAAAATGAACATGGTAACCCTGATAATTTGATGAATGTTTAG
AAGGAGAGTAGCTTTAATGTATGATGTGTCATTAAATTAGCTGTGAACAG
CTATGAGAAATATGAAAGCAACAACTACGTATGTATCAATGATATAGGCA
GGAATTACTCATATGTCGATTCTCGATTCTTCTTTCAGTGCAACACCGAC
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GCATCAGTGATTACTTTTTATTTATTGCTCTCTCTCTCTCTCTNNNNNNN
NNNNNNTTAATACAAAATTATTTCAAATACCAATTTTTTAAAAAACAGCT
CTATATTAAAATGTCATCTTTTTTAAGCTCTTGGACCCTACCCAATGATT
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TTTTATGTATCAAAATATGAGAAGCTTTGAAATCATGTTTATCTCTAGGA
TGATTTAAAAGAAACACTATGTGACGAATAAAAAGTTTGAAACAAGGCTA
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CTACAAACTGTATAAAATAGTGTCCCAGATCAACATCAACCTCAATATCG
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TCTCCGGGAGACAAGGACATCCAACAACATTGCCCTGTCAATGACCTGGT
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TACACCCCACAGCGTTTTTTAGAGCATTCTCTGCTGAGCTTCATTTCAAA
AATCTCCTCAACGTGAGGGTACCTCATTCTCTGTCACATAGCCAANNNNN
NNNNNNNNGAAAAAGGTGGCCATGATCAAACAGAGACCATACATCCCGGA
TCTCAATCTCTGTGACCGATTTCTACTCTGCAAGCTTAAGCACCTGCTCT
GGAATTACGATTTTTGATAGCCATTATGACTTCCACGTAGCGTTCAGCGG
TTGRTGAAGTTAGTAAACGAAGAGGAGCTCTCCAAGCAGCTGTTGGAGCT
GGAAAACTATTGTCAGGACGTTATTTGAGCTGAAGGAGACTATGTGGCAT
GATTGAGTATTTTTGTAAACGTTTGATTGTAATTTCTTGGCTAAATGAAA
CAGTCTTAATTATTTGGGAACAACCTAATATGTACCTGCCAACCGAATAA
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GATAAGCCCTCATTTTTCAAGTAAAGTAAGAAAATATATAAGAAAATTTA
TGAAAGGCAATATATTATGCCTTTATTTATACTTAGTTACACACTTATAT
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TACTAGAATATATATATATATATATTKATTGTACTAAAAATATGATAATA
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TGACATTTATTCCTAAGTTCATCAAAAAAAGCCAGAGATTAGAAACTATA
GGATATAAAACGTTTTCATGTATACTTAGATACGTGTATACATGTGTTTG
TGTAAATGATTTACGTGAAAGGGAAAAAGATAACTGTTTACCTCTATGTC
ATTTCTGGCAATAAAAGTAATAGGTTGTCTTAGTGGAAGAGAAAACGTAT
TAATAAATCTTGTCAAAACGAGTAAGAAAAATGGGTTAGCGTAGGATATT
ATTTCATTCTTTTACTCGTTTGATTCCAATGGTAGATTATTTGAATAATT
TTTTTGGCTATCTATAGTTCTAGGGCGTATGCAGGGGGTAGGCTGGAGGG
AATGCAGCACCCCACAAATTAAAGAATTTTTGCTATTTACTTTATATATA
CATAGATGAAAAGTGTTCATATTATGCAAAAAATGTAATAATWAACTTTT
TGKGAAMATGTATGGTATTTTYTAAKTTTTTTTTTACCAAAAAAAATTAT
TTGAAATTATTTTTTTGAAATTTGATGTGAATATCTGTAGATTCTTGTAT
TTTTTTTGGAAAAAAAAAATTAATTTTTCTAGAAAACTGTTGATTTTGGA
AAAAAAATTCAAAAAAATCAATTATTCAAATATTTAAAATGAAATTTTTT
TGTGAATTTTGTCAAGTTAAATTGTTTGCTTAACAATGGAGTTCATGACT
AATTTATCAAATCAAAAAAATCTGGAAAATATAATTGATTCTGGAGAGAA
AAGGCAAAAAACTAAAAAAAAACATGTGGACAACAAAGCAAACATTAGAG
GCGGAAATTTTGAACAAATATATATTCTGCAAAATCCAAAACTGATCTCA
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ATAACTGTGGATTTTCCAAATTTTTACCAAATAATGTAATTTCTCAGATC
ATTTAAAAAAAAACTACATATTTTGTGAATATCAGTGGATTCTTAAAATT
TTTGTAAACAACCTGGGATTTTTTAATTTCTTTCCCCAAANNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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YCAAAWGCCCCTTTACTTACTTTCTAATGTAAAAATAAAATCATCCTAGG
TTACAACAAAGTAAAATTTGATCCTATTAACTTGAGGTATATATATTTAT
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ATTAAAAGGATCCAGAAAGTCCTCTCATGAAGGAACGAACAAATTAGTGG
AGGGAGGGGGGGGGGGACAGGGMAGTCATCTAAAGTACAATTTGATAATG
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TATTTAATTAATTTTTTTTTGCCAAAATGTTTCTAATACTTCTTAAAATA
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