EMLSAT00000005349, EMLSAT00000005349-701196 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000005349
Unique NameEMLSAT00000005349-701196
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s288supercontigLSalAtl2s288:368166..383292 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000005349 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000005349EMLSAG00000005349-688115Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000023354EMLSAE00000023354-732282Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000023355EMLSAE00000023355-732283Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000023356EMLSAE00000023356-732284Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000023357EMLSAE00000023357-732285Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000023358EMLSAE00000023358-732286Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto777051auto777051Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000005349EMLSAP00000005349Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000005349

>EMLSAP00000005349 ID=EMLSAP00000005349|Name=EMLSAP00000005349|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=313bp
MDGKTPHKKRTSRRKTVPNWSPYGCHYFPDISEFPEPKPETIPSLPLSPG
EQYYLDLGGNIRKINHDRKEIVKHLNTCHGKLEHRLLHLEKKTQDQITQL
THSMKEGFDQERVECNDRLERRSIRDRLLQDRHIDARDDIIKGDLSNWLX
NKVSETFCGEKSEDKGIEVLARGAIRGSKRRRKDLISEIASGSLRRAVSQ
DDLLEEEGNELGDDGRGVLGQVPRASSSNTPTNQIMMISYDDDASTYVVR
KSPALPPRRPPPYRPPPHQMPPIKENGLSVLPARLWPNSSPLTLSNGTNS
EGGDSHNDSGHHK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s288:368166..383292+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000005349-701196 ID=EMLSAT00000005349-701196|Name=EMLSAT00000005349|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15127bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s288:368166..383292+ (Lepeophtheirus salmonis)
ACACTGCCACTCGCTATGGACATGCAGGGGTAGCTCGAATCCTTCATTCT GCAAGGTGCAACATAAACGTACAAAATAAGGTAAGAGTGGGAATTAAATA TTCTATATAAAATACAGTATACAGTCAAATCCGCAATAAAGCAACTCCTC AGTTCTAGCAAAAATGTTGATATCATTCGAAGTGAAAAAAAAAAATAATA CTATATATACCTTAAAGGATCAGGGTGTCAACAATGACACACTTTGAAAT ATGATAAATTTGCTAAAATATTCAATTAAATGATACACCAATCATAGTGA TATAAAAGGACATAAGATGAACCTCTCTCGTATTTACAAAAAACGACGTA AAATCCTTTCATTTTTAACATTTCTATTTCAAATAAAAAACCAGGGCATT GTAGGCTATGTGTCTTGATCCCTACTCGATATAATTGTCCTCATCCTCTA TCACAGCCTCGATATAGCCTCTGAAGTGGGAGCAGGCCTTGATGACGAGG TCTATGGACATGGATCCGTAGTGCATTTAAAAAAATGAATTTACGACGAC AATTGGTTCCAGGGTGACCCCAAAGAGGGTGTTAATTTCATTCTCGACCC TTGTATATAATTATTACAATTTAATAAAAGCTTTAAAAGTTTTCCATTTT TTTAAAGATTAAAAAAATGGTGTGAAAAAATAAATAATTTGTAATCAAAT AAGTGAAATCATTTCCGATTATGACCAAGGCTAAATTGACTTTGAAAATT CAATGCTGTCAAATATACTATACCTCGGTCATTTTAGTGTTAAATCAGGG ATTCTTGGTTTATTTATTTTTTTCAAAATGACTTTTTTTATAACTGATTG TCATACCCAATATTATATTAAACGAATCTTCTTCGAACAATATTATATTA GAATTGACAAATGATATAAGAAAAACCAAAGGCCCGTGGGAATTTAACGA ATATTTTTTTATCATTCTAATTGGGAATTTTTTTTAAAAATTCTATGCAA AATTAGGTCCAAGAGTAGTCAAAATACTTGAAGTTACTTTTTAGGATCAT GGTACTTTTATGCGAAGAACTTTATGCATAAAAAATTTGTGTATGAGAAC TTTCTTTATCTTATTCGGATTTGACTGTATATTATATAGATCTATGTACC TATGTGGTTAGTATAAGATGTTCATTTAAGAATTTATTAACAAAAGGAAC GATAATTACTATTTCATGTAAATTAATTTTTACTTTGTTTCTCACTCGCC CACTTCTTGTAGTACTCTCAATACTTCAAACACATTCATATTGAATAAAT TATTTATTTTCTGGGCTGTTTTTTGTTTTTTTCATATACCAATATAAATA TTAGTGTTGAGACTCAGATCGAGTGATATTGTTCGAGCAGCCTTAAGTGA TTTTATCTAGACTAATTTCTACGGATATTTCGGCTCAAACCAAAGTTTAG ACTGTGAAAATAATTTTTTTTATGTTGATTTCAAACCTTGGACCGAAATT ATAATCGTACAGATAAATGTTACTAATAAACATATAAATGATTTTTATGG TTTAAAGATGGAACAAGTTGACCGTGCGATATTAACCGGTGGTTGGTGTG ACTTTGTTCAGACGGACAATTTTTTTTTAATCAATATGGAAAGAAAACCA ATGATGGTACAAAAATATATTTCTTGATTAAATGTAGCCAAATAGTTGGT TTTTTTAATTATTCGTTTCATTATTTCGTATTACAGAGTGGGGAACCAAA ACTTGCAGTGACATTTAATTACAATTTTATCCTTCTTATTTTTAATTACA ATGTTTTATTACACAACTAAACGATAGCTGAAACAAAAACAACAAGCTTT GTTTTTATCCCGTGTCTCAAAGTGTAAAATATCAGAGCAACAAAAAATAA GGCAAAGTGGTCTGAAATCTCTTCTGCGTGGGTCTCAGTGCCAAAAAGAC TGCAAAGACTGTTGGCATCTCCATCCGGACTGTTTAACCCATTAACAAGT CCATTACGGCCCAATATAGCCATGAAAAACTATAACTTCTGCGGCAACAA TATGGCAGACTTTTGACTAGCCTCCATGATCTCAATCACCTGGACTTTGC AGTTAGGAGTGTCTTGGAGAAGAATGTCTCCAGCACCTTTCCTCCAAATT TGGATCTAGACTGAAATTGATTCGAATTAGTTAAAATAGGAATATTCTTT TTTTTGGGTCCTCATTCTGTATACATAACACATATCATAACATATCAGTG TCGAAACTCGGTTTAACATTTAATTTTTTGTCGGGTTAGTCGAATTTTTG CTTAGGCGGATTTTCCTTTTCTAATAAAAAAGTTAAATCTTAAAAAAAAC GATATTTATTTTCTTAAAAAAATTATTCATGTAATAGATCCATATTTTTT TTTTTCTTGTTTTTTTTTGTTGACAACATAGTTTTAGAACAAGATTGAAA TGAAAGCGATCTCAAACCCATTTTGCATTGTTTTTAAGACGGAAAACTAA AACTAATAAATATATAAAAGATTGTATAATATCATGAACGAAAAAGGCGA AACCGCTCGATCTGTTAAATGGTTTAATTTATTTGTACATATAATGTATT TATAATTTATATTCAAGCCTTTGGATTTGAGTTTGTTGGCGCATGAAATG ACCTATATTATCATTAATATTCTTATTGTTATTATTTGTTTTTAATTGAT CCTGAAATCCTGTTTTTCCACTCCAGGGGTATTTATTTCCTTCAAAGTAT ATGTACATATTTTGTACCAGGTAGTCGTGTGTGCATTGCATTTAAAATAA CATTACAGACTGCTTTATATCACTAAAATAACATCATATTTAGAATCCAA 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AAGATTAATCGATTTAGAAGGAGCTCCATCCTCTGTGAACGCCGCTGATG TGCTCAATGATTGGGGGTTTCATTGATTTTTGTTTTAACAAAGACTAGGA GTTTTTGGGGCAATATTTCTTTACCCCTACACAAAGATATTTTCTGGAAA TAAGTTTAAGGCCTCGCAAGTGTTTTAAAGCATGGTACAGACCCTTTTAA TTGAGGAAAAATGGTATCTTTGGTAGACAAATTTGGCCATTTGTAAGACT TCTGCAGTCATGATGGATTTGTGCCCTAATTTGTGCACTTAGGATTCATT TTATAAATTACGAGCGTTAGTACTTGGCATTTCCCCCTTACTAGTAGTGT TATGAACGGTGTTGATTGATTGAATGTCAATTAGCTCTTGCAAACTATTC TTAGTAATTTAAATATTCCTAAAAAGTTGGGAAGAATTGTCTTACTACCA ATTGATCTTTTTCTATTGATTTCTGTATGAAAGGTTGCGAAATATAATAA AGTTAAGAATTCGAGGTACACAACAAAACGTTTTTTCTAATTTATAATCA TACAAATAATCATGGACTTTTATGTGTGTCGCTAATGAGCAAGAATCATA ATTAATCACATATTTTATTGGTTTTTTTATAGCGTATAATCTTTTGATAT TTTCTTAATCTCTTTGTGTTAATCAGGAGGAAAACAAAATGACGTAGTGA GGGCTTAGGTGGATTTTTATGATATGGAGGAAGGGATATTGTATCATATT TATGTATTCAAACTTTTTGGGTGAAGAAAAAGAAATTGATTTAAATATGT TAGTCTTTTTGTACTTCATAACTAGAGGAATATGATTAGATTGGTAAATT CTAAGCATTTTTGTAGTTGACAATCTGTGCAGGCTTTATTATTTTTAAAG GATGTTATGATAAGTATTTGATTTGAAGTGAGAAAATGCTACTACTCAAC 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ATTTGTTCTAGAGAAGAGGATGTGGTTTTTCCTAGTTGGTAATCTGAACA TAATTTTATTTCCGAAACTGTAACAATTATTATTTAATTCTTGATAAGGT AACATCTAAGTAAATTACTAGTGCGTCTGCTCATGAAAGACGTTGAGTAA CAATAAGGACTTGCTTCTCGGGAGTGATAATCGCAAGTCCTTGTTGGACT CGGGGGAGAATGTAGGAACGACATCCGAGTAATTTAAACCTAGTATAGGT CATTCCTATATCCGGTTGTGGGATTTGTGTTTTTTTTTTCTTCCTCTCAC AACTACTTGCAGCTGATCTAATCAAACGTAATGAGACTAAGCTGCTCTCC TTTAATACATTCTTCAAAAGGTCAGAATGACCACATTGGACATTGGCAAG AATGACACATAGGAGTTAAATAATAATGACAACAGGTTAGGATAAGAAAC TCCATCGCAAAAAAAGCAGACCAGTTAAAAAATACAGAAGGCTACGTCAC AAGACATAGGCAGAAATTACTTCCTTGTGGAGCATCGCTACTACTCTGAG TTCAAAAGGGACTTACACTAATTATAACTCCAGAACAGTAGAGTATTTGA GGGTCTTTATTTTTGGATCTTTCTTCATCAAGGATTAAATAATTCTGATA AAAGCTAAAATGATTAAAAACCCAGTTTATGTTGCAACTAAAAAAAGTTT CACATGCGTTCCATTTCATATTTTTTACAAATCTAATAATGGTTCACGCT ATAGTATATTATGTTATTTTTTATGATTACAATATTTCTTGTTTTTTTTT CTTCCAAGAAGCTTAATTTAAATTTACTGTATTTTAAGTGTTTCATCAAG AAATGGTATTTTTTTTTTTTAATTTTTTTTTTCGTTATGCTTCTAATTAG TGTTTTTTTCTCTCTCTTTCCTTCGTTCTTTTTAAATTTGTATGTTAATA 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TTAGTGGGGGAGAAGACCCCAACCTAAATTGCACTTAGGATTTGGATTTA TTATTAATTTAAAACAATCAAGGGCTTTCGTTTAGAATTTGTGTCATTTT ATAAGCTGCCATTGATACTTATTCTGATAAAATTATTGATTCAATCTATA AAATAATCAACATTTGATAACAAGAAAAATTTGTTTTTTTCAAAATCAGT AAGTTTTTAATCCATCTCTTTTTCTCCCTTAGAATGGTGACACACCGCTT CACATTGCCTCTGCCATGGGCAAACGGAAATTAGTAAGGATCCTACTTGA GTCTGGGAGTGATATGAAGCTTCTTAACCTTCAAGGAGAGTCCCCAAAAG ACATTGCCAAACGAAGGAATTGAGTATCATTATTGAGTTACTAGAGAATC CTCCTTGTCTTACTCCCATTGATGATCATTTGGCTCAATCCGTCATGGAT GGAAAAACTCCTCATAAAAAGGTATGCTGCAAGGGCCTTAATTAAGAAAT TAACAAAAAAAAAAAAAGGACTTCGAGGTGTTGCAAACGGGAAGAAATCC CAAAAATAAAAATCTTCCTCAAGGCTTCGTTTACTGTTATGTACATACAT ATTATATCTTTTATGAAGTAGATACGCTAATTATCATGGAGCCCTTTCTT AATAGGAAAATAACAAAATATTAATTATTGCATAGAAATAATTTTAGGGC ATTTAAAAAGTTAAAAAATGTTTACCTTTTTATATATATATTTTTTTTTT CTAGCGAACGAGTCGAAGAAAAACAGTTCCTAATTGGTCGCCCTACGGTT GTCATTACTTTCCTGACATATCCGAGTTCCCTGAGCCTAAACCAGAGACC ATTCCCTCTCTTCCACTCTCTCCAGGAGAACAATATTATCTGGATTTGGG AGGAAACATTCGAAAGGTTTGTTGTTTTATTTCATGTCTATTATATTACT 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TGTAGCCTCCTCTCTAACACAAAAATACCCTATAGCTGTTGATGTCCTCG TTTCACTTGATACGTCATGGATTTTTTATATTTTATTTATTTTTGATAAA TAAACGATGTAATAAGTTATAATAATACCTATGCACTGTTTCCAAAAGGA TAGAAATAATATTTCTTTTTTATCTCTCTTCATATACATATACATTGGCC ATTTTATTATTTATATGAATAAATTTTGGTTATTATGTACAAATAGAAAT GTATAGCTACGCTTATAATAAAATATACCTAAGCAAATTTATCATACAAT ATCAAATGAAATGCTATATAGTATTTTGATATGAATATATACGTAAATGT ATAAACTTGGAGGAATAAATTGCCAATGGATGTATGTAATGTACATAAGA AATAAATAACACTTGGTCTGATTGACTTATTTGGCTAACTACCAGATGAT TTCGGGTTTTGTTTTTTTTTAACTATTTTTTCGAGAAAAAGTTACGTGAT ACAATAAAGGTAACTACGTGATGAGTAAAGCCTTGCTGTAAACAAAGCTA GGACCGTAGAACTGAAAGACCTACGGATCGGTTCTTTGGAGCCCTGAATG ATAAAAAAGTTTGAACTTAATTAAAATAAAAAGACTGAAAGGTTGAGGAA AAAAAAGAATCAGTCCAAGGACTGATCCAAAACTAGTTACAATTCTAATT TTCGTTTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTCTTTTGCAGACGGAAAATGCTTAA GATTTACAACCTTCGTAATATGTACTTTTAGCATAAGTAKAGGGGAAATA TTTAGTGTATGTGTGTAATTGGTAATTAAACCTGTCTTCAGGTATTTATA ACTTTATAAATTATAGGCCATCATAAA
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