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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s28 | supercontig | LSalAtl2s28:104302..111162 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005367 >EMLSAP00000005367 ID=EMLSAP00000005367|Name=EMLSAP00000005367|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=257bp
MIESKRLPKELQIKGLADAPDKKIPPLLSKNSKSNSSLKESLSVPQAQQQ
PLNSFGQIPKEPPEVIKKEWADEDEEYGEVYPEPEFMTEDPHPVLQQTNS
EHQHHQHAQAHNLSNLDESYLARLRYRCEECGKRFVTPSKLQRHSYSHTG
LRPYPCSICGKCFSQMANLKTHIRNTHGGENMQIDGTSLGGGLDDDSSDP
HLIHECKHCGKRFPTPSKLFRHELIHTGEKPFACSICLKGFTQLIHLKKH
QQLFHNV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s28:104302..111162- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005367-701214 ID=EMLSAT00000005367-701214|Name=EMLSAT00000005367|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=6861bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s28:104302..111162- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGATTGAATCGAAGAGGTTGCGTGTGGAAGKGTGTTGAAGTTAGTATCA
AAGTGGAAAGTGGATTTATTTACCAAGAGTCAAATCCTGAAAAGAAGTCT
TCAAGGATTGTGTAGAGATTTTCCCAAGGATGGCGCAGCAAGAGGAATTC
CTGCTCAAATGGAATGAGCATCATAATAGTTTCTTTGGCATGCTCCAGGA
GCTCTGCGTTTCTGAATTTATGACGGATGTGACACTGGCTTGTGGAGGTC
AAGTGTTTGAGACTCATAAGCTCATTCTTTGCGTCTGTTCTCCCTTCTTC
AAAAACCTGCTCTCGAAGCAGCGGCCCGGGAAGCATCCCATCATTTTCCT
CAAGAGTGTGAATCCCAAACATTTGGGGCAATTGCTGCAATACATGTACC
GAGGGGAGATCAACGTTCTCCAAGAGGATCTGGGCCCTTKGGTTGAAMCA
GCCAAGGAGTTACAAATCAAGGGTCTCGCAGACGCGCCCGATAAAAAAAT
CCCTCCCCTTTTGTCCAAGAATTCCAAGTCCAATTCCAGCCTCAAAGGTT
TCTAGCTAATGACTTGAACTCTCTCTCCCATNATCTGGGCCCTTTGGTTG
AAACAGCCAAGGAGTTACAAATCAAGGGTCTCGCAGACGCGCCCGATAAA
AAAATCCCTCCCCTTTTGTCCAAGAATTCCAAGTCCAATTCCAGCCTCAA
AGGTTTCTAGCTAATGACTTGNACTCTCTCTCCCATTCATTTCTTCTCTT
TTTCTACCTATCTTACAGAGTCCCTTTCCGTGCCACAAGCACAACAACAG
CCTCTCAACTCATTCGGTCAGATCCCTAAAGAACCACCCGAAGTTATTAA
AAAAGAATGGGCGGATGAAGACGAAGAGTACGGGGAAGTGTATCCCGAGC
CGGAATTTATGACTGAAGATCCTCACCCCGTTTTGCAACAAACCAATTCT
GAGCATCAGCACCATCAACATGCCCAGGTATTTATCTTATATACTTTCAC
CAAGTTGTCATTGATGGGCGTCAATCATTTTGGAATTCATACATCAATTC
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CTTTTTGGACAGATAGACTCAGCTTTGAGTTTTTTCCCTTTTTCATTTTC
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TTAGGGACTGATTAGTGGAGAATTAAATACGATTGGTTCTTAGGATGTAC
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AAAAGAAAATTAAATTTTTAACTTTATAATCATGATTTGAGTAAATATCA
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TTTTTGGGGGTCTCTTATATGATTCTTCTATCTATAATGTGTATGTTGTG
TACTAGTTATTACTAGTTTAAGCAAATTGTACATGAATCGATCCCAAAAA
AATGGGACGAATACATTTAAATGAAGAATTTAGAGTACTATTTGTGATGA
GGATAATGGAATGGGTCATGGATGGTAGATTAAAAATGTAATTTCTGACT
TGAAAAAAGTCAAAATTACAAATTGATCAGACGTATTTTGTCGCACATTA
TAAAGTTCACATGCTCACAGTTTTATTACTCATGAATTCATACTAACCCA
GTCATTTTAAATATCATAAAATGATGATCGTATCGATTGGTAATTGGAAT
AACCAATGTTGCTATTAATTATGTTGTGTTAGACAATAAAATAAAAAAAT
GCTTTTTGCTCAATTTAAATGTATACAATTTTCAACTTGTACATATTGAA
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ATTACATTTTGATGTTGATGATGATAATATAATCAGAGGAGCTTGTTCTC
AAAATTCAATTGACCTTTGTATGTAGTAGTTTGAAAACTTACTTATTAAA
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CTGTTTCTTTTAAATTAATTTTTTTTCTTCATAAATGACTTAAATTTATA
CTCATTCTATTAATATTAATAGACATAGTTTATATTTTTACTATATAAAA
TGGGATACATTTCCTACAAAAATCCTGATGAAACTTCATCAAAAGGATTT
AAACATAAAAACCCATTTAGCTTAGTTTTGGACCAATTATGGACGAGAAA
AGTTGAAAGCTGGAAAAATATCTGATCCTAGCAAATGTAATAGTTAATTT
TTTGCCACCAGTATGTAAATAAGGTTGTATAACATATTTTTAATACATAT
TAGGGTCGGATATATAATAGAGGATTTGTTGATAGACAGTAAGGGTTAAG
CCTTTTTATTTCTTTGTCTAATAGTTGACATCCAATAGATCACTATTTTC
CTTAATATTAACATTACAAGTTAAATTATTTTTGTACAAAGAAAATTAAT
TTTAGGAATATAATATTTTTAAGATGCCCATCATTGACAAAATAAAAATA
AAAATATATAAATCATATCTCTATCTTGACGAAGTTTATAATTGATCTCA
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CTTTATTTAAAAATGGGATTAAATGCAGCATTCCTACAAATCGGAAGAGG
AGGAGGAGGAGGAAAGTATAGAAGGTGGTCATGGTCATGTTAAAATGACA
CGATCATCCAAGAAAGTCGGTAGCAATACTCATCCTTCTTTCTGTAATAA
GGATTTAACTTGTGATGTTTGTTTTAAACAATTTCCTGTTCCTTCTAAGC
TCAATCAACATGCTATTATTCATAGTGGGATAAAGCCATATGTTTGTGAG
ATTTGCCAAATGGCCTTTAATGTCCTTGGCAATCTGAGACGTCATATTAG
AACAAAACATAGACAACCATGAGTTTAATTCGCTCTACTAATACTCTTAT
TATATACCTAGTCTCCTCTCTAGCTGTATATCTCACAATTTTGCAATATA
TTTTGTGTATTCTTTGTAGTAAATAATTGTAATTTTAAAATCCTGAAATG
AAGTCCACTGATGCCCATACCCTACAACCCACAGGCCCACAATCTTTCAA
ACTTGGATGAGTCCTACCTCGCTCGACTGCGCTATCGCTGCGAAGAATGC
GGCAAAAGATTTGTTACACCCTCTAAGCTTCAACGACATTCCTATTCTCA
CACTGGTCTTCGACCTTATCCATGCTCAATATGTGGAAAATGTTTCTCTC
AAATGGCCAATTTAAAAACTCATATTCGTAATACGCACGGTGGCGAGAAC
ATGCAAATAGATGGAACATCTCTTGGTGGAGGCCTGGACGACGATAGTAG
TGATCCTCATCTAATGTAACACACTATATATATATATATATATATATTAT
TGACTGTTCAAAGTGAGATCCTTTTGTTGTACAAGAAAGCAAAATCGTCA
GCTAGCTCCTCCACTTGGGTCAAAGTTGAAGAAGAAGGAGTCATCGTTCT
CTCTCTCTCTCTCTGTATCAATTCAATTCAATAATTAATATTATTCTTTC
AATTTATCCTAATGTAATTAATTAATGAATGAGTCTATAGCCTCATCCTC
ACGTCTTTGATTGCTTCTTCCAAGAATTAGAACAACAATATAATACATAT
ATGGGTGACATTTTTTCACTTCTATTTGTAATTGAGAAGATAAAAAGATA
CTTACAACATATCGGTTAAACCACTAATCCGGGTCATCCCACATTTGACA
ACAAGCTTTTTAGTAAGGTATTATATGTAATTGAACCTTGCTTGTACCGT
TATAAATGTTTAATATTTAGGACTTTTAGCTTGTTAAGTTCTTCTTCAAA
ATGATGTTTTGTGTTTCACTACGTATAGATGTCCATATTAACCCATGTAA
TTTAATAAAACATTTATTTATTAAGGATGTAACATATTTTCCTACAAAAG
TACATGTTTACTATCTAATCTCATGTTATGGGCTAGCATCAACTGTTTTT
CATAAAACAATAATGAAAATGTGAAAGGATCTGTTTGTCCGTTCACATAA
TGTCTTTTTAAAACAATAGTTAGCCTCCTCAGCAATTAGAGGATATGTTA
TTAGATAATGAAGATATGGTGATTTGTCAGCTTCATTTAAGATGGGATGT
GGACGTAGTGAAGCATTATACAATTTTGATGTGGTTTAACCGATATTATA
TTGGGATACGGCGGATAATTATAAATTTATTTTCAAATAGATTCATATAT
AGAAAATAAATTAAAAAACCCCTCCCAATCCATGTGAGTGAAAGGATCAG
ACCACAACATCAATAGTAGAGCAAGTNCCATTATATTAATAATTACTTTA
GGGAGGATCCATGTAGTAGTTTTTTTTTTTACATTAATTTACAATTAGAT
TTTTAATTTTTAAAATTATATATAAAAACTGTAAAAAAAAAACAAATCTC
AAATAATTTGTACCTGATGACAATTTTATATATTTGTAGTAGGTTATGGC
TATTTCTTTGTAACTTTTCTCCATCTAAAGATTATTTTCCCCTCCTTATT
TACAATACAATTATGTTTTATGATTAATAACACTTAAGATACTGCTTTCT
CCCCCCTCCCCTCCTTCGGTCTGGTTGAATGATTTGTACTCTAATATAGC
TATATTGATACAATTAAAACTAATTTTGTATTGAATCAAAGTATATAACA
TCTATATATATTAGTGTTGTTCCGTATACCGGTATTACGTATAATAGTGA
TACCGGAGTACCTACGCATTGTAAACGGTACTATATAATATCCTAAATTG
GTATTGAAACCGGTACTAGCCGATTCCCTCATAGAGAAATAATATAAATA
TGGCGAGGTATGCAATAGACGGTTTAATTGGCTTCATCTGTTAACTTTGC
TATGCTTTAGGGAAAGCATTTTGCGGAAACAGCCATTAATTTATTTATTG
GCTTATTTTGTCCGACCGGATTTTAACATACAGTGTTTATAACCTGATTT
AACGGCCACCTGATTTATGGGTATCATGGCACTAAGCAGTCATATCTATT
GTTCAAATTTAGAATGACTACAAAATATGAAACTTGGTTCAAGAGGTCAC
CTGCTCTAAGTGGTTGCCTTTTCAGCTTCCTTTGCTCACGGAATAATCAG
GCATGGAGCTTAGCTTGTTTGTCTTTATTTCCTCTCTTGAAGGAATCGAG
TAAAAAATAACTCCTTTTGTATTCCTCTCATGTGGGACTGTTATATCTCA
AATTAAATCAAACTCAACAGCTGTGTCAGGATCATAATAGTTATTATCCT
TCTGCTGCCAACTAAGTCAAGCGCTCAAGTAAAAATCCTTGCCACCTCTC
TGTATATTTTCTTTCTCTGTGGTTTAACTATGGCATAAAAAAACTGATGC
TCACCGGCGATGACGTAATACTTTGAAAGTTGGATTTTTGTAAGGCTGTA
TAAAAATAGTAAGGAAATAATTTTTTATTATAAAAAAAGTCAATCCACTT
CTGATTTTCCTTCCCTCAATCGCCATAAACAAAAACCATCCCTTATGTGC
ACGTCAATTGCCCTTAATGCCATCATTATTTTTTTTTAGCCGAATAAGTA
TTAAAAGTACCCAAGTATTTATACATGTGTATTGGTATCGTGACAACACT
TTTGCGTATTGTATATTTTGTCCTTTACAAGCTTTGTGTTTTTTTAAAAA
TTATTTGTGATATGCATTATATATGCCTTATTCTCTGTATGACACACACC
TAATACTTCATTTGTATAATACTTTAATAATTATAATTCATGTCTTTCTA
CTCTTTTTTTTTTTTGACCCGTTTACAAATAAAATAAACAACAAATGAAT
ATGATTTTTTTTGTATGAGCAGTGTATCATCATTTTTCTTAAAATTTGAC
GATACTTTTCAATATTATATTAGTTATTTAAGTAGTGGTAGTAGCTGTGG
GGMAATGTCAGATGTGTTTCTTTACATGTAACCTTATAATGATTATTATT
TAACGAACGTCAAATTGTTATTCATCACAGGTCTCTTCCCTGCCCGTAAC
AACTCCACCACAACCACCCATCCGACCAAAAAATGATAATAATCGTAGAC
ATGAATGTAAGCATTGTGGAAAACGTTTCCCTACACCCTCCAAACTCTTT
CGACATGAGCTGATTCACACTGGAGAAAAGCCATTTGCATGCTCCATCTG
TCTTAAGGGCTTTACTCAACTCATTCATCTCAAAAAACATCAACAATTAT
TTCATAACGTC back to top
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