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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s28 | supercontig | LSalAtl2s28:751680..888661 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005385 >EMLSAP00000005385 ID=EMLSAP00000005385|Name=EMLSAP00000005385|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=364bp
MFGEIFSNVRYMLKSEDIAIDNWIFKLHYRFSVLILITSSIIGVAKQYFG DPINCQTATGLSSKVMDDYCWIHSTFHLRSEFQGNVGCVVDTVLTGEESR NEAAEETPDTAFYQWVPFTLMFQAMLFYIPRKLWKSFEGKDAKNSVLLPE ECDDNSENALYREAVARKYANFFHSTLHHNNGYFLQFFICEVLNFIVDVS NIYLTDIFLGGRFMLYGSQVLKYYSFSHSRRRDLPNPMCTVFPTVTSCTF HSVGTAAGEQKFNSLCVLSLNIINEKIYVLLWFWLFGVTIATAIHLPTLL MMRARTFKPEDSKSVRRILARCYLGDWWVLYQIGRNSNTHFFRYLLRYID CKFTSIDKAESTNY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s28:751680..888661+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005385-701232 ID=EMLSAT00000005385-701232|Name=EMLSAT00000005385|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=136982bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s28:751680..888661+ (Lepeophtheirus salmonis) ATTATCAAGGGATATATAAAATGATTTGTTTTTTCGCTAAATATTAAAAA
AGTTCCTAATTACACGTAGGTAAGTTTTTAAATCATTATACGGAATAAAC
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GTGGAATATTACATCCAATACTTTTATATATTTTTGGACCTTGACAAAGA
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GACTTTTATTTAAGTCTCAGGACTCTCTATTTAAGACTTGACTTTGAACT
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ACCTCCAATTATTGACTTTGTTATGTGAGGACGACAATTTATGCAAAACA
CCTTCTTCTCTAGTTTTTCTTCAAATTAGCTTAACTGCACCCATATTGAT
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AGTTTTCTATTCTAGTGTGAAGTAATCTGGTGGWTTTTCATTGAAGCCGT
TCCTGATACTTTAGTACATTTTACGGTGAGTATTTATTCTCTTTCGAACT
GGCAGTGAGTGTTGATATAACAAAGTCATAAAGATTTGCGCCTTTCATAT
TCAACACAGTAGACATTCTGGAGTTAATCTGGTTCGCAGATAGTAACAAC
CAATCTACAGTGCTACAAACCTCTTCACAAGTAAAAACTAGACGTGAAAC
ACGTAAATTTATTATATTTTAGTAGGTTTTGATGAACAACCTGGTATTGT
CTGTCTTTGTGTATTTTGAAGCGCCATTAATATCAGTCCCTGTTTTGTTC
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GTGTATTAAGAGCAACATTTTAAAGATAGAATTTATATATTATATGATGC
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GTTAACAGTTTCAATTCTTAACGGGTTTTTTATTAGGGAAACCCCTTAGA
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GAAAAAAAAAATTGAGGTATCCCTTATGAAAAATTCTCTATAATATCAAT
TCTGGGTCACTATAATGAAAACAAAAACATAATATATTGAATTTTGGTGC
ATTTTTGAAAAACGTCTACAATAAAGCTAAATTACTCTAGTGGTAGGAAT
ATCCATGATTCAAAATCAAAGTTACATATATTCAAAAGTATCAATTCAAA
GTATATTTAGTGATAGTTTCGACCTTGGAAAATAGAAATAATATCAGTTT
GCACATCTTTGATGAAAAAAATCAAATTTGAAGAGTTCTAATGCCCCATT
TATTAGCTATACCTCAAAAATAAACATCAATTATAATAGTGTAATGTAAA
GATGAAAATTCATCTATCGTTGTGAGCAACAAAAAAAAAAAATACTGCCT
GTCATTGGACTTAAATGCACTTTTTTTTAATGCATTAAGCCTTTATAATT
TTATTTTAGAATGATAATGAATCATAGTTAATACTTTTCATATTTTTAAC
CAAGTCTTTTTTCTTGGATAATCATTTGGTTATATACGAAATGTACAGAT
CAAAGCATTTTTTTATATTAGTTTTGTAGGAAAAACTTAAAATCATTTGC
CAAATTTATTTATGATATGCAATTAAGATTTCGTCTTTGAGTAAATTTTC
ACATTAACGAAAATGTATTTACGCTTTTATAAAGATTTCAAAATATTTAA
TATTCAACTTTGTTCGTATTTGATTGTAAACAATGTTTGTTCATTAATAT
CACTCCTAAAATAGACGTCATAAACGATTGGAAAGCAGAAAGCTTAATAA
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AACCAGGATATATATTTGAAATTTTCTAGACCATAGAGATTCGAGACAGA
TTTTCTTTCTTACTTCTGAAGTAAATAAATGAAAATAAATCCTGAGTCGT
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CATATTCAAGAAAAGAAAAAAGAGGGAGCAAGGACTCTACTGGAAAACAC
CCTTTCAAGAAAGATGTTTATCCATTGTTTTAATGTTGACGTACCGTATA
TGCAATGAGGTTTTTTAATCTTTTATTAAATTTCTGTGATCATATTTCTA
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TAATGAAGTAGTTAAAAAAAAAACAAAAAAACATTTCAGACGAAAATCCA
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GTGTCTGTATGAATGAAAAGAAACCTAATTGTTATTTTCTATTGCTCAAT
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TTTCTATTATTTATCTAAATATTTAAATTATAAATTCATCAATTTATCTC
ACATATTTTTTATATTGAATATAATTTTTATTATCAAGGGATGAAGTTTC
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GGTTGAATTCAAGACAAGGATTAAAAGCAAATACTTTTTAATATATTAAT
TTGAACAATATTACCTATCATTTAAAAAAAAATATTCAGCCTTTATTTTA
TTTTTATTGTGTAACAGTCTTCTAAAAGTTTTCCCCTCAGGTGCCCAGAA
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TTTTTATTGTGTAACAGTCTTCTAAAAGTTTTCCCCTCAGGTGCCCAGAA
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TTGATTTTCAAGCATGTTGGCGAGGATTTTGCACCATGTCACACACTTTA
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AGGCTTAATTATTTCTTCATCAAGCAGTGCATGGTGGCTTTACTGCTGTC
AAATTGACAGCCAAGACCATTGAATGTCACCTTGCCTCTTCTACCTTTAA
TGGTGTCTTTAACTACGACAACCAACTTTTTTTGTCTCTTTAGCCTTGAT
CCGTACATTGCAAAAGCTTTTGGAGTCACCCGGTACATACTACAGTTGTC
ACAGCCAAACAATTTATAGATATCTGATGATGATTTTCCACGCCCGGATA
GCTCCATAATTGCAGCTCTGCGTGGCTCCATATTTCTGGTAAGGAGGCTA
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CGCACCATTTAAAAAAAGGTTGATATTTTAGACAAATGGTCCTTAAAATA
TGTATTGACTTCAATTTCCCAAATCAGATGGGTTTATTGTTGTACTGTAA
TGTCTACTTCTACTTAGTAACGGGATTTTTGTAAAGTATGAGGAAAAGGT
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ATAAATAACACAATGTCATTAATTTTGTAATATAATTATTAGAATTATTG
TTCGATTAACATTGTTCACATCAATATCTTTATTTTATATTGTAACCTCA
CCCCCGAAAAGAAACAGAAAAACCCTGAAATCAATTTGTAGTCATTTTTA
AATGATAGTTGATAACTGTTCATAGATTAATAAGAAATAATTCGTATCCA
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ATAGCTGACAACCAAATACAGACAACATTCTTGTGTTTCTGAGGATGGCG
TTACCTTTTTAATCCCCAATAATTCAAAATTTGAGCCTTTTTTCTCCCCG
GATCAGGATTTAGAGGTTTTTAAAGTTTCGGCCATTTAAGAGATAATTGT
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GCCTATAAGGTCAAGAGGTAAATATTTTACATACTGAAAATGCTTAGCAT
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TCTATCAGTCTTGGGGATAGACGGTCGTTCCTTCGGACTGTGAGTACTAG
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GCTTTATTAGTTTTATGACTGTTATGTATGACTGATCTATACCGAACCGA
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AATACTATTTATATATCAATTTTATTAAGCATTTTTAGAATATACATCAA
AGATAGACAAGAATTTTTTCTTTCAAGGGTGATGTGAACACCAGGGGGAG
AAAGACTTATGTTCTCATTGTATAAAATACGTATTTGATTATCAGCTGCC
TGCTTTATTATGATTTTTGAGGGTATAACAAAATTATTTATTAGCAAAAT
GTTTAATAAAAATATACTATGTATAATTGACTTAAACGTTTTTTATCCGT
TACAGTAGATTTGAAAACGTCACACTCCATAAAATTGTAATTCATTATGA
AGCATATTCTCAGAAGAATAACTAATAAAACGACAAAGTAGAGTATTTCA
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GTTGCTATATACAATTGTGCACACGATAGATATATCTCTACCTCTTGTAT
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CTTCTTTTTATGAGTTTTCTGAACACCATTTTTTGGAGATTAGGAACCAT
AGCTAAATATTCATTGACTATGTAATATTGGAAAACCTAATGATCATACC
CAAGTCTTTCAGTAAAGAAAATAGTGTCAGCCAAACTAGTTGCGAACCAT
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CTTGATATATTTAGCTAAAATAGAATCATATTTTATAATTAGATTTGAAA
AAAATGAGTACTTACTGTTAAATAAAAAAAGATCGTTACTTTTCGACTTT
TTCTTTGATTTTGGGGATGACATCATTACCAACATCATCCATAAATTTAA
TGATGGTTCCTCGGAAAGGAACGGGTGTACCCGTGTATTTCTCTATAATT
TTTTTGAACGTAAGATGATTAGCCATGAATAAGGGTATATTCCATGCAAT
AAGCATCTTTGTGAGATCAGAGTTAAAGTCTGACTTGAGTTATTCATCAT
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TAATGAGTGGCGTTTAATTATAGACGTGGGAGTAAACGTGACGTGACGTG
GGAGTGGGGATTATTGCAAGCTCTGCTGGATATTGCAATATCGGACCAAC
TGTTATTGTTTACTCATCTCTACTATGAAAATTTTGAGTGTGTTAGAGTC
ATTTTTTGCAATTTTCTTATGAAAAATGTTGTAAAACACATAATTACCTG
TTGATTTCTAAGAAAATATAGTCCTAGCTGCCACCCTGAGCACACAATAC
GGGAAGAGAATTGAGATAACAGTGCTCGTACGCACGAAATCGTCCCAGAT
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TCATGGATGGAAGACATGTTCTACTCCTGATGGCTACTAGGACAATTTTT
TTCTTAGTAATCGACTACTAATTATGTGTTTTACAACACTGTTCATAGGA
AACTTGTAAAAAAAATAGTCTTAACCTCCCAAAATTTACATAATAGAGAT
ATATAAATAATAACGATTAGCCCGGTATTTCTGACTTGCGTAAGGAAATC
TTTGCAAAGAGTACTCTTTATTTGATATCTTTAAATTTAATAGGACTCTA
ATTACGTTCCCCCTTTATGTAAATAATATTCAAACACTGGATTGTATGTA
ACCAAGTATAGAAAAAATTGTTGTCTATCTCATAAATGAACATTTTCAAA
TATCATCACATCTTTTTGGTCACACATTTTCCTCACTATTTATTAAATAG
CAACATGTATTGAAAAAAATCCTATATCTTCTTTCATTAAAAGGATTTGT
AGATCCATAAAAAAAATACATAACATACAAAATAAAAACAATAAGATAAA
AACCTATTTGAAAGCACATTTAGTTTTAAAAATAGGGATAAGCAAATTTT
GAAAAGTAATGTTTTGCTTTTTGTCTATTAATCGATTATATTTATAAAAG
GAGTGGTTTTTGTGATTTAAGTGGTATACTTAATATTTGGGTCATTTTCA
TAAATAATTATGTTCGTTTTTCATTTGGTAGTGAGGATGATATCCTACTG
TGACCTTGATATGGTTTATATAAAGGAATCAGTATTGATTATATATTTAA
TTGATTTTTTAGAGGAGGGATTAGTTAGAAAAGGATAGAGTTTGAGCTAT
TTCGCATGTGCTATTAATGAAAATGTGTGACAAAATATTACTAACAAGGA
CTATCCAGTTGCATCATCTAAATAATTTACTCAACTCATCATAATTAAAT
ATATTGAAGTTAATAAGTATAAATTGCTACTATTTTGTAATAGTCGAACA
GACAAAGTTTTTGTCAAAATAATATAAGATGACTACTCTCGAAATCCTCA
GTGTAACTTTACATTTTTCTTGAGCACACTTACTCGTTGTTAATGTAACG
TTGGTTCTTATTTTGGACTGAAAACTAGAGTTTTGTCCTGTTCAGTCTGG
TCCTGATCAGTCCTAAAACTTATAAATTTATATAATTGATGACGTCACTC
AAGTATATATATTTAAATCAGTTATATTACTAATATTCTGAAGGACTGGT
GTTTTTAAGGACCGTTCCTAAGACTGGACTGTACTAACTCGAATAAATAA
ATACTGACACAACACTTGTGTTAGAGCTTGGTCTGAAAAGTTTCTGGCCT
CCACATGAAGAAGGTAGCACTCGTAAATACAGTTACTCACCAAAGTTTCA
GCCGTTTTAGACGCGTTGATGTTATATAATAGTTGTTTGAGTGAGTTGAT
GTGAGTGATATGGAGTATAGCTCTGTTGGTGGAGTTTAAGGGGAATAAAT
CCGAGATTCGGCATTGATTAATTACTGTAGATAAGACTGGATATACTATT
ATACAGGTGAAGAAAAAAATACAGTTTAAACAGTGGGCTGCAAATATTTT
TGTCAAATAAAGGGACAGTTACCTTCATGAACATTTGTTTTGCAGGGAAA
AACGCCGARGATTATTACAACGGGTTACAGAGATGGAAGCACCAATGGGA
GAAGTGTGTAGAGTTACAAAGAGACTATGTTAAAAAATAATAAAGTTCAG
GAAAAATATTTTATATCTTTGTTAGGTCCGAATCTTGTCAAACTACCCAT
GTAGATGTTCTCTCCTCAAGAATTAAAGTATAATAATAATCATTAAAGAA
AAAAATAATAGTATTAAATTAGGACTGATGAGCCAGGGAGCATTACCTGG
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TTATACTTGAGTAATTATCGACTCGGTTTGATCCAATTTTGATCTATTTA
TTATCTTTTGCGCATAAAAAAATAAGGAAAAAAAGATTCATGCTACCATC
TGTTTAAGCAAATCGCACAGCCTCAATTAAAATTCCATAGAACCGCTTTC
TGTGCTACAAACTTCTGACCCCGTCATCAACGGACAACTCCTCACTGGAC
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TACCCAGAAGGCCTCTGTTCAGAAGGAGTGGGCTAATATTTCCAATGACT
ACGCCATCAAAGTGTGTGAGGCCTAGACTGGTGGCCGTAGAAAGAGGAGA
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CAGCCAACTTTTCCATTAATTCAACAGAATTGTTAAAATAATTGCTCTTC
TTAAAAAACCCCAATGATTCCTTTTACAGAGGAAATATTATTTCCTTAGA
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CCCTTTATGGTAATCATCATACAAAAATGAAACTAAGATGAAATTGCAAC
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TACATCGATCCAAAAATAAACATTTCATGTCCTTTTTTCAATTTTTCTTG
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GTTATACCCACAAGATCCATTAGATTTTTGAGTAGAAATAGGGATGGTTT
AACGTCCGACATGTGTTGGATCTTGATACACATCGCTAGTATTGCAAAAA
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TGTAGTTTTCAATATATAATCAAAGGATCATTTAACATGTGAATACATCA
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AGCTAGGAAGTAGCTTTGTGTAAAGCGCTACAGGGAGGTTTCTGTAGTCA
GCAGAGGGTACTGGAGATGACTAATGATGAATAAGAGACGTATATTTTTT
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GAAATGTAGAATGGACAAAACATCGACTGGAAAACATTAAATTACAAAGT
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CTTCTAAATTTATATCCAGGAAGTTGGGCTGCTTTCTGGTACCGACCGTT
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GTTAATTCCATTTGGGGGCCTAATGGTAACCCAACACTTGGATGTGCAAA
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GCAAAAGAATAATTTCTTCCGAGTGCGTTGTCCATTAAAAGCTAAGTACC
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TATGAATTTTATTTATATTGAAGTCGTAAATATTTCATAAGATATTATAA
TGTTTCATTTCCTGTCAACGACATGCCTTTGCTTTTAGTGTTGACAAAGT
TATATCGCTGCTTTTCCATCAAATTTATTTGCAAAATACATACATAGTTA
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GGGTCGAAAATCAGAATTTGAGAAGTCAATGATGGGAGATATTGGAAAAT
GTGAAATACCATATAAAATTACTCTTTGCCAAATTTCGAGACTCTGGAAC
GTAATTTGATGGTTTCTCATTCCAGTTGAAATTTTATATATTCATATTTT
GAGTATTTTCCTTTTTTTATATTAAAGCCTTCACTGGGTCAGTATTGAAG
ACGTCATCGCAGTTATCGTTAGATGGGATGACGTACAACACTTTCTGTGT
AGCCTTTGTCTCCCTTGTTGATTAAATCTATAATCTTTTTGTGTCTAGGG
CACTGTCCAAGCTATTTTAGGACACACTTCTTGTTGCTATTATCACTAAA
GTTGCAAAGCTTACATAGAAAATACTTTATTTATAAGAAATAAGTCCAAA
TCTTAGTTCTATCGAGCTCCTTATTGAGCACTGAGGGGTACACTATCTTA
GGCATGCTCAATTTAAAAGATGGTATTTCACTTCGAATGAATGTAAATAT
ATTAAAAGAAAATTCTACTAGATGCCTGGTTTTATTTTATGGAGAAATAA
GAGATTGTATAATCAAAATAGCTTTTGTGTGGAGATGGATATAATATATT
TTTTCATATCGGAGTACTTTTCCCTTTATAATTCATGGGGCTGACGGATT
CATCATTTCCTCTGCTTCTTCTCTTCCTCTTAAAATACCCTCACTCAATT
TTCCCTTTACCCCAATATCTAAATATTCAAGTATATATTTAAAAGAGGAT
TTAAAAAAGCCAAGAATTTGAGATACAGTTTAATAAATTTATTTGTTTGA
AAAGACTGAAATTGACCCCATATGGCCCTCCATTTTCCTATTATGACAAT
CAGTTTTACCTACTTTAAGTACGATTTTCAGCACCTACAAAAGGTTAATA
GTAATATTTTATTGATCAAAATGGACCATTATTTGTCGAAGAATACAAAT
GTAAGCTTTCAATTTTGGAAAAAAATCATTCTAGTTTTCTATCTATCGGG
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GTTTCGGAAAGGCCACCGGCTAAAAAATTGTTATTTGAACAATAGAAAAC
GCAAGAGATCTTTAATATTTGGGGATTAATTGTGCAAATTGCATTCAGGT
TCAGGGGTTCTATAGGTCCAGGTTTCAGTTCTTTCATTTCAACAGTTGTG
GTCTCGGTTCAGCTTTATCGATCTTGGTTCTTGGAAACAGGCACTTAAAA
TAAGGGGTATTGCTAGAGAATTCGAGCACAGGAAAATAAATTTGATACAA
ACAGGGCCACAGCTACCTTATACGCAGTGTGTGTAGTCCCCCAAGTTCCA
TCGGGGCCTCCCAAAATAAAAATTGCTTAAACAATGTTTTTCAAAGTGGG
GACCGTAACAGGGCTGGGGGAAGGGCGCAGGAAGATGGAGAATTGAGATT
GCTTTCAGTCTACATATACATAGTACACATGTATTGTAAAAAGGAGACCT
CAGCTACAAATTAATTAGTGAAAGGGGGCTTTGGCAAAGTAAAGTGGGGG
AAACCCCTATTTAACTACAAGATGATTCGGGGCCTTTTTCCTTTTTTCTT
TTCGGAGGAAGGGTGGCGTGATACAATTAAGGTAACGACGTATTTTACTT
AAATAAAGTTATGTGAATGGAACATTTAAAAGTTATAAATATGCCAAGAA
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TGCAGTCTCGGTTCGACTTTCTAAAATCCTCTTTCTAAAGCTCATAAGTT
ACATAAATTATTTTTCTGCCAACATACAACTATTTCCAGATTTGATTAAG
TTGAATAAACGTCATCAAAACGAACCACCCTAATGTACTTATAATATTTT
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TCATGATTTTTTTTCTTCCTCTATACTTATTTTCGTAGTAGACATCTTCA
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AAGAAATTGTATTCCTGTTTTTTTGGAAACGGAGCACATGTATATAATNA
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ATGTGACAATCTCATTATTGTTGCTTCAGATGTTGTCTATTCCGTCTAGT
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TGGGSTGGGGGGCTTGTAGACRCCCCCCCCCCCCAAAAAAGGAATTTTTG
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AGCCTTGGCGGKCGAGCCTACGAGGNTGGCTCTGGAAGTGAAAACGGAAA
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GTGCTTCATGGAGTCACCTAATTTAACATTTCTACTTATTCATTTTGTAT
GTTTTGAAACCTTTTTGAAAGCCAATTATTAA back to top
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