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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s292 | supercontig | LSalAtl2s292:565959..573639 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000005433 >EMLSAP00000005433 ID=EMLSAP00000005433|Name=EMLSAP00000005433|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=320bp
MSNDLLEFTNQEDSIYGKLENFNVEKRIGKGQFSVVYRAKCKVDKRTVAL
KKVQILEMMDSKARVDCVKEILLLQQLDHPNVVRYLASFIENNELNIVLE
LADAGDLSWMIKYFKKSRKLLPEKTIWKYFVQICSALDYMHSKRIMHRDI
KPANVFITANGEAKLGDLGLGRFFSSNTMAAHSLVGTPYYMSPERIHEEG
YNFKSDIWSLGCLLYEMAALHSPFYGDKMELSSLCQKIEHADYPTLSSEL
YSDSFISLVDETLQKDPSSRPNAHAVHKRAQSMFQKTNPRSSIASAVSFM
ALSAADDASRSVNVSQLKKN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s292:565959..573639+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000005433-701280 ID=EMLSAT00000005433-701280|Name=EMLSAT00000005433|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7681bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s292:565959..573639+ (Lepeophtheirus salmonis)
CGGACATATGAGTGCACTACTACTACTGACGAGGGTATTTCATTGTCGTC
GTGGTTCCTCCTCGTCGCAATACCTTTAGATATAATAATAATAATATTGT
TATTATTATTATTTCTGATATGTATCTGCTATTATGAAGAACAAATTCCC
TCGTATTAGTTGTTCACTGCTAAGTAACTTGTGTGCTGTGGTTGACATCA
TTCCCAATCTTCTTCTTACTTCTTATGTAACTAATAATAATAATAATGGA
TAMAGAAACAGAAAACAACGTTCTCCAATGTGAAATGATTAATAACATCG
TTGATTGGAAGAAGAAGAAGCTTCCTCCGCCTGCTTTCATCTACCCTGTA
GTCGGGAATCCGTGATATGTGTGAGTAATTAATATAACTTAAGATCCCTC
ACTCATTAATAATGATCCAAGATTTGCTTTGGGGGGCGTTGTACATTCAT
AATACTTGTAGTCTCATTCATTGCCTCATATTGCTGCTCAGGGGAAGGAG
AGGAAAAGAAGGAAGAAGGAGGCTGAGACGGAAGAGGGAAAGGAAGGAGA
AACAGCGAAGGAAACCTATTGATTTTATTATTAAAGGCTTTTTTATATTA
AGAGTTAGTACTAGTAAGCTGTATGGATTTATTTTTTGGGTGCATGTTCT
TTTCCGGTCTCCAAAATTATATACTATATATTTTTTACTTTATTCTGCTT
TTCTAATCCTTTTTAATTGTTTAACAACTCCTACTGAGTGTGTTTTTTTT
TCAAACTGTTTTTTTATTATAATTAATAAGATCCTTACTTACAAAAGGAG
AAACGTTTTATTCAAATGTCAATACACATAGATAGATGTATTATCATGGA
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ATGTTGTAGTAGTATTAACCAACACTTACAACATCATGTACAACCAACTC
TTCTCTCTCCCTTCTACCTTCTTCTTACGCAATCACTCTTCTCAAGAAGA
TTAATATATAATGAATGTATATTTCCTTTCAACACGCTCTAATTCCTATA
TAACTTCATACAGTTTCTTGTTATGTTTTGATGATATATATTATTGATAT
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TGAACTCCTCTAATTGCATCATATTATGAACTGTATTCATTTTTAGACTT
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ATCCGCATTGTGAATGATAACATATATATATCAGCCCCTTGATGAAAAGC
AAACTTTGTTATCAAGCTGATATAATATATAGTACACACTACAAACTAGA
GAAATCCCTGCGATAACAGCACTTAGCAGCTGCTGCTCATAATAAAATAA
TATGTACCGACTACTATGNAAAAGTTAGAGAAAGAACTTATATATATATA
TATATATATAACGAAAGGAACGGTCGTGTAGAGAATAATTTTCATAGTTC
AAATATGATATATATTATGAAAAGATATAGTTTTGCAGCTGTCTTCATAT
TGTATATGTATATAAATATATATACATGGCCTTAAAAGCAGTAGACGGAA
TGGATTTTTTACGTGTTTTAACCATCTCTCCCTCCCCCCCCCCCCCTTAT
CTCCTTCACTCTTCCACAATAACGACAACCAAATCCTACCTCTGCAAAAA
TAAGGAAAGGAGGTGGCAAATCACTCATTTTGCTCAAGAGTTTTGTGATC
AGGATTTGATGGGCAGGTGTCAGGGAATAATAGTAATATTCCAAGTTGGG
ATTTAAAGCATAAGGGGGGAGTCTAGGAATAAGAAGAAGAATAACAAAAA
CCCAGCTGGGATATGGAAAAAAATATCGTGACAGATGCACTATGCCATGG
TTTTTATTATTTTTATCGGTGATCTTTTAATGTTGGTTGGTTGATAATGA
GGACTGGTGGCTCCTATGTCATGTTGTACACCGAATAACGATAATAATTG
TTTGTCATTGAGTGGCTGAAAAGAGGAAGGAAGGCAGGCTGRGCAGAAAT
TCACTTATATATATATATTCAAGCCTTTTTAATCTGTGTGAGGATCTTCA
TTAGTCACGTCGTTACTTATAGTGTATCATGCAGCCCTTCTTTCGAGAAG
AAACAGGGGAGGGAAGGCCCAAAATCAGTTGGTAGCTGTTAGCCAATTCT
TCTTATTATGGAATTATTATTCAAAAATTGTGGATAATAGTTCAATAAGA
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AAATAGAAATAAAGATAGCTGACAAGAAAATACAGTGTACACTTTTGTGT
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ATATATTTAATGTTTTCTTGTTAAGTGCACTCATCACACTTATGTACTAT
ATATTTCCGTAAATCACTCCACTATATGTACATAAATCCTCTTTACCTAC
TACCTACATGAACGTCTCTGATAAGCCATGGATCATGCAATATATCAATG
TATCACTTTATTTTCTGTTATTATTACATGGCATACGACCATAAAAAATA
ATGAAAACCTGTGGGAATGAAAATGTCCCTTGGATCATTTTCAAGAAAAA
AAAGGTCATTCAATATTTTTTATTCTTTCAGAAAGTGACGGATGACAGGT
TATCCCTCTGTACATACACTCAATCGACTTTATTCAAAGTTTAAAGCATT
GATTGTGGTACATACCGACAACAAAACACAGGGTGAGGAATTATATATTT
TTTTTGTGAACTTTGTGTATTATAAATCTTCAAACCTCAGCAATTATCCC
TTCAATTTAAAATGTTTCTTGTTTGTAGGAGTTTGTAAGCACGAAAATTA
CGAACGTGTTAAAATCTATCTCCTTGTGTCATTTCCTCTACTCCAAACAA
GAATTATTTCAGGTAGGAGAACCTCTTCATTTTGAAAGGGAGCATTCTTA
AGGTTTGAAGATTATAAATGATTCTTACCAAAATAATTCACATAATTAAG
TGTTCATCCCTGATAGATGTGGAAACTCGTCTTAGGGAGGTAACAGTCTA
CTATATCCCTTATGTACTAAAAGAAGGTTGTGTATCACGATTAGCAAAAG
TGTAAAAGTTCCCATGAAGCCTCCCTTATTCCTTATAAATGTAGATACAT
AATAGTATTTCATTCCTCATTTAATATTTTTAATAATTAATGACGATTGT
GTTGTTGTTGTTGTTGTTGTCTTGACAATTCTTTTACCACAATAGAGAGA
ATTATTGTTAGCAAAGCAAGAGAAAGAGAATTCTGATTAATTATTCAAAG
GATTTCGTTGTTGTTCTAAGTCTGCGGTACATATATTGATTCTTAACGAA
ATGGATTATATAAAAATCCTTGATGGACAGGTAAATATCATTATTATACC
TCTTACTCCTTGTACTCTGCCGCCTTTGCTATGAATAACAGTCACTCAAT
TAATAATTCACTTATCTTATCAATTTCTACTACATACACTTTAGCCGTAT
ATTTATATGCATATATATATATATATATATCCACGTAAACCCTTTTAATT
GAGAGCTATATGTATGTATTCGAGAAAGCTTGATTCCCACTTGTTGTATT
TTGACTACCTTTTTATAGTCTTCATACCTGCAAGAATCGATCTTCTTCCT
CTCCTCTTAAAACAGTAGTAACAACAAAGTTACATGCTTATATATATTAA
ATATTGAAATCTAAGAGAAACTTGATGTATGTATCTACATATATCCTAAT
AACTATTATTGATCAATAATCCCCTCTCCCCTTCTTAAATAGATTATCTA
ATGATGCTTTGTCGAAGGGTTGTTCCTAACCTTAGTAATTAATCATTATT
ATTATTAGACCTATCTCACGGCTACTATTTTTACTTTGCTTACATTGTAT
TTTGTTGTTAGCCGTCGATTAATATTAATATACTTATTATCAATGTTCTG
ATCGGTTGAATTCGAATAAACCTTGCTAAGCTATGAACATTCCTAATTGA
GCTGAATTTTTGTAGACTACTAATAGTGCACGTTTGGCGATTTGTGTATG
TTTTTTGCATGACAATTCCACAACAAAACAAAACACAATAACTTAAAATG
TTTCATTTGACAAAGAAAGACTGGACTAAATATAGACAGGAGTTTTTTGG
ACTTTCCTTGTTTCATTTTGGGGAAGGAANCGTGGAATGATTAAGTTAAC
GACTTGATATCTCTATTTTTCTAAAATTCTCACTAAGAGCCCAACATACA
ACATAGATCTGTCCCACTGCTTACGAAAGGAGCAAATAAATAAAAAAGCA
AGAGAGAAGAAATTTATTATACATGGTGAAAAAACCTCTTTGCAAAGTTA
AGGAAAGCATGGGCTACATGTTATTATTATTAATATCCTGAACCTATTAT
TCTATGCTGCTTTAAAAAAAAGTAGTATATGGGGTGGGAGGGGGAGTTAC
ATACATAATACCTAAAATGTGGAGCACTATAAGTAATACTAAGAGTCCCT
CACTTATTAATTATCATGGTTCTAAGTGAGTCACATTGAATCAGATTCTT
TTTCTTCCAAAGCCTTTGACTCTGTAGTAAGATTTCACGTAAAAATAAAG
AGTTGTAGTGGGGAGGGGGGGGGGGGGGAGAAAGGTAAGGAAAAGGCAGT
CGTAGGGAATAGAGGGGAGGACACAAATCATAATAACCCACTCCAAAAAT
AATAATAGCAAGTCGTCCTCGTCTCTCCTCATAAAATATTCAAACCCTCA
TGTGTATACCAACCACCATTTGGTAGGTAGTGGGTGGTGTTGCTGCTACT
GGAGKGGAGKGTCCAAAACACAATAATAATAATAATAATAAATAAATACA
TACTTGTGGGGACGACTAAAGTGCTTACTAATTTATATCTAATACATAAA
CGCTCTCTTTTTCCTTTTTCGTTGTTGTGTTTGGCTTTCGACTTTTTTTT
CTTCTTTTTTTTATGTGTGTTTTTATTATTATTTTGTTGAATTCTCATAT
CTCATTCTTAAAAAGAGATAGCATTTGTGAATATCCGTGGTTTGTGTGTG
AGTGTCCCTTTTTGAGTCAAGGAAGGGTACTTTAACATTATCTAACTCTA
ATGTTAAATTGAAAGAATACATTTACCTAGAAATAGTAAGTTCATATTGT
ATGTACATAGTAGGGTCACTGGTAACAGAAATAGGTACATGTTATTGGGT
GTGGACTCTGTCAGTAATAGCTTCCCTTTTTTAATACAAAAAATTACACT
CCTCTATTAAGGGGTATTAAAATTCCTCATGCAGCATACAAATACAATAT
CCTCTAAGCAAATAACCACCATGTTTTATTATCATGTATTTGAATATTAT
TTTATTTCTTTTTATTTTCTTCATCCCTCACTCACTAGGTTTATGATGTT
CTTAATAGTATATATATCTTAAAACAACCTGAGAACGAGGGACACCTTAT
ATAAAGAAGAGTATGGTTCTCTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTGTATT
CCTTGTTGCTTAAGTCAATGTTTTGTATAAACATAGAATTGCACTTAGAA
CAACGAATCCTAGTACTCCGGGGAAAGATACGCGCTTTTCAACTGTATAT
ACATATATATATTTGATTCGATTTTTTCGTTTGGAAGACTATTGATTTTG
TTGTGTTCGTCTCCTTCTGGTCTCTATATCTATTTATCTCAATATTTAAT
GAACAACAAATCTATAGTCCTCGTCCGAATTCGTTTCTTGATCCATCGTT
TATTTTTATTTTTACTTATTGCATACTACATATTATGTTCAACCTTCGAT
GTAGCTATAGTATTTACTCTCCCTTGTAGGAATGTCAAATGATTTATTGG
AATTTACAAATCAGGAGGACTCCATTTATGGGAAATTGGAGAATTTCAAT
GTGGAGAAAAGGATTGGTAAGGGACAGTTCTCTGTTGTGTATCGTGCTAA
ATGTAAGGTAGACAAACGGACTGTGGCCCTTAAAAAAGTTCAAATCCTAG
AAATGATGGATTCAAAAGCTCGAGTTGATTGTGTTAAGGAGATACTTCTC
CTACAAGTAATACTCATTCATTATATAATAAAGCAGCACACCTAAATAAT
TAATTCATACTTTTGGCCTCCTTCATAATTAGCAACTCGATCATCCGAAC
GTGGTAAGGTATTTAGCTTCTTTTATTGAAAATAATGAACTGAACATTGT
ACTCGAACTGGCAGATGCTGGGGATCTCTCATGGATGATTAAATATTTCA
AAAAGAGTAGAAAACTCCTTCCTGAAAAGACCATTTGGAAATATTTTGTT
CAAATATGCTCTGCCTTGGATTATATGCACTCAAAGAGGATCATGCATCG
AGGTGTGTGGTATTTAAGTTTTTTTTTTTTCCTTTCTTCTTCTCAATCCC
TGTGTTAGTTGTACTCGTATACTACATACAATTTGACCCTGTCTATTAAA
GTTGCTATAGTGATGACTTCCATTTATTATGTATCAACATACATACATTT
AAAGTGGGCTCAACCAATTAATAATTATATACATATGTCAGTTTCCTTCT
TCCTTTTTTTTGTATGCACGATGATTAATTAATTGCTTTCTMCCTCTCTT
TTTATGTAGACATAAAACCAGCAAACGTTTTCATTACTGCAAATGGTGAA
GCCAAATTAGGGGATCTTGGCCTTGGACGCTTCTTTAGTTCTAACACCAT
GGCAGCTCACTCCCTCGTTGGAACCCCTTATTACATGTCACCCGAGAGAA
TACATGAAGAGGGCTATAACTTCAAATCAGACATTTGGAGTCTTGGATGC
CTCCTCTATGAAATGGCTGCACTCCATTCTCCGTTCTATGGCGATAAAAT
GGAACTATCATCTCTTTGTCAAAAAATAGAGCATGCAGACTATCCTACGC
TCTCTTCTGAACTATACTCTGATTCATTTATATCACTGGTTGATGAAACT
CTACAAAAAGATCCCTCTTCACGGCCCAATGCTCATGCTGTCCACAAAAG
GGCTCAGTCCATGTTTCAAAAGTGAGTTGAGTTTTATCAAAAGTAATTAA
AAATTTGATGATAATATACTTTTTAAATTCGTATAGAACAAATCCTCGAT
CTAGTATTGCAAGTGCTGTGAGTTTTATGGCCTTGAGTGCTGCTGACGAT
GCCTCCCGCTCAGTCAATGTCTCCCAATTGAAAAAAAATTGATGATCTTA
TTTTGATATTAAACTACTTATTACTCGAATTATCTATGAAAGTCATATTC
TTACTTGCTTCCTTCATTTATATAATTATGTGTCATTTCATTTTAGATCA
GTTATAAATATTATGTGTCAATGTAACTCTATTTAAATCCATATTATAAT
TTAATTGACAATAAATTGTATTTACGAAGAA back to top
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